Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 8: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V osmé části se podíváme na:

Prezentaci k osmé části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

• Introduction of Presenter, James Little
• Table of Contents
• Series Topics
• Introduction to Approach
• Origin of Term “Known Unknowns”
• Overall Process Including NIST Library Searches of EI and Tandem Spectra
• ChemSpider Internet Searches
• CAS Registry Using SciFinder and STN Express
• Summary Comparing ChemSpider and CAS Registry Approaches
• Example 1: SciFinder Search of CAS Registry for UV Additive in Polymer
• Example 2: SciFinder Search of CAS Registry for More Obscure Compound
• Example 3: ChemSpider Identification of Additive in Polymer by Monoisotopic Mass
• Live Demo YouTube Presentation
• Presentation References (Internet Links)
• Acknowledgements

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

• Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

• Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

• Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

• Část 4: Import MSMS Spekter

• Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

• Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

• Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven