Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 8: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven

Čt, 15.7.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
Jedná se o bezplatnou alternativu přístupu k vyhledávání pomocí NIST knihoven MS/MS (tandemových). Sedm příspěvků v této sérii Vás naučí používat k identifikaci neznámých látek vyhledávací software NIST.

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V osmé části se podíváme na:

Prezentaci k osmé části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction of Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series Topics
  • Introduction to Approach
  • Origin of Term “Known Unknowns”
  • Overall Process Including NIST Library Searches of EI and Tandem Spectra
  • ChemSpider Internet Searches
  • CAS Registry Using SciFinder and STN Express
  • Summary Comparing ChemSpider and CAS Registry Approaches
  • Example 1: SciFinder Search of CAS Registry for UV Additive in Polymer
  • Example 2: SciFinder Search of CAS Registry for More Obscure Compound
  • Example 3: ChemSpider Identification of Additive in Polymer by Monoisotopic Mass
  • Live Demo YouTube Presentation
  • Presentation References (Internet Links)
  • Acknowledgements

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

James Little/Mass Spec Interpretation Services
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.