Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V první části se podíváme na:

Prezentaci k první části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

• Introduction of Presenter, James Little
• Table of Contents
• Series Topics
• NIST MS Software and MSMS (Tandem) Libraries
• Help Files for NIST Search
• NIST Software Windows Compliant Features
• Saving and Restoring User Configurations
• Main Functions on Toolbar
• View of Search Options Employed
• Main Window in Lib Search View
• Tabs for Other Functions Accessed at Bottom of Main Library Window
• Names Search Tab
• Setting Up search Parameters for MSMS Searches
• InChiKey Field Link to PubChem on Web
• Molecular Formulae for Fragments Shown in High Resolution Spectra
• Live Demo on YouTube of Software
• References (Internet Links)
• Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

• Část II: Vyhledávací software a knihovny NIST
• Část III: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání
• Část IV: Import MSMS Spekter
• Část V: Hledání struktury v NIST
• Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
• Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
• Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven