Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení | LabRulez LCMS

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

St, 17.2.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část I: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V první části se podíváme na:

Prezentaci k první části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction of Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series Topics
  • NIST MS Software and MSMS (Tandem) Libraries
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software Windows Compliant Features
  • Saving and Restoring User Configurations
  • Main Functions on Toolbar
  • View of Search Options Employed
  • Main Window in Lib Search View
  • Tabs for Other Functions Accessed at Bottom of Main Library Window
  • Names Search Tab
  • Setting Up search Parameters for MSMS Searches
  • InChiKey Field Link to PubChem on Web
  • Molecular Formulae for Fragments Shown in High Resolution Spectra
  • Live Demo on YouTube of Software
  • References (Internet Links)
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část II: Vyhledávací software a knihovny NIST
  • Část III: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání
  • Část IV: Import MSMS Spekter
  • Část V: Hledání struktury v NIST
  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven
James Little/Mass Spec Interpretation Services
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.