Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení | LabRulez LCMS

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

St, 17.2.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část I: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V první části se podíváme na:

Prezentaci k první části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction of Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series Topics
  • NIST MS Software and MSMS (Tandem) Libraries
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software Windows Compliant Features
  • Saving and Restoring User Configurations
  • Main Functions on Toolbar
  • View of Search Options Employed
  • Main Window in Lib Search View
  • Tabs for Other Functions Accessed at Bottom of Main Library Window
  • Names Search Tab
  • Setting Up search Parameters for MSMS Searches
  • InChiKey Field Link to PubChem on Web
  • Molecular Formulae for Fragments Shown in High Resolution Spectra
  • Live Demo on YouTube of Software
  • References (Internet Links)
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část II: Vyhledávací software a knihovny NIST
  • Část III: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání
  • Část IV: Import MSMS Spekter
  • Část V: Hledání struktury v NIST
  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven
James Little/Mass Spec Interpretation Services
 

Mohlo by Vás zajímat

Exploring the Impact of Part Per Billion Mass Accuracy for Metabolite Identification using Multi Reflecting Time of Flight MS with UPLC Part B

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Metabolomika

LC-MS/MS Analysis of Immunosuppressant Drugs in Whole Blood using the Xevo TQ Absolute with the Capitainer® B Device for Clinical Research

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Fat- and Water-Soluble Vitamin Analysis in Foods and Supplements (Consumable Workflow Ordering Guide)

Příručky
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Simultaneous Analysis of 20 Steroid Hormones and High-Sensitivity Analysis of Estrogens

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza

Determination of tetrafluoroborate, perchlorate, and hexafluorophosphate in an electrolyte sample for lithium-ion battery production

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
 

Mohlo by Vás zajímat

Exploring the Impact of Part Per Billion Mass Accuracy for Metabolite Identification using Multi Reflecting Time of Flight MS with UPLC Part B

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Metabolomika

LC-MS/MS Analysis of Immunosuppressant Drugs in Whole Blood using the Xevo TQ Absolute with the Capitainer® B Device for Clinical Research

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Fat- and Water-Soluble Vitamin Analysis in Foods and Supplements (Consumable Workflow Ordering Guide)

Příručky
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Simultaneous Analysis of 20 Steroid Hormones and High-Sensitivity Analysis of Estrogens

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza

Determination of tetrafluoroborate, perchlorate, and hexafluorophosphate in an electrolyte sample for lithium-ion battery production

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
 

Mohlo by Vás zajímat

Exploring the Impact of Part Per Billion Mass Accuracy for Metabolite Identification using Multi Reflecting Time of Flight MS with UPLC Part B

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Metabolomika

LC-MS/MS Analysis of Immunosuppressant Drugs in Whole Blood using the Xevo TQ Absolute with the Capitainer® B Device for Clinical Research

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Fat- and Water-Soluble Vitamin Analysis in Foods and Supplements (Consumable Workflow Ordering Guide)

Příručky
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Simultaneous Analysis of 20 Steroid Hormones and High-Sensitivity Analysis of Estrogens

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza

Determination of tetrafluoroborate, perchlorate, and hexafluorophosphate in an electrolyte sample for lithium-ion battery production

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
 

Mohlo by Vás zajímat

Exploring the Impact of Part Per Billion Mass Accuracy for Metabolite Identification using Multi Reflecting Time of Flight MS with UPLC Part B

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Metabolomika

LC-MS/MS Analysis of Immunosuppressant Drugs in Whole Blood using the Xevo TQ Absolute with the Capitainer® B Device for Clinical Research

Aplikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Fat- and Water-Soluble Vitamin Analysis in Foods and Supplements (Consumable Workflow Ordering Guide)

Příručky
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Simultaneous Analysis of 20 Steroid Hormones and High-Sensitivity Analysis of Estrogens

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza

Determination of tetrafluoroborate, perchlorate, and hexafluorophosphate in an electrolyte sample for lithium-ion battery production

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.