Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven | LabRulez LCMS

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

Čt, 27.5.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V sedmé části se podíváme na:

Prezentaci k šesté části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction to Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series of Talks: LCMS Unknown Identifications Using MSMS Libraries
  • Read This Before Utilizing Handout
  • Philosophy on Incorporating User and Commercial Libraries in Identifications
  • User Libraries Converted and Approach
  • NIST Lib2NIST Utility for Library Conversions
  • Accessing Lib2NIST Utility
  • Quality of MoNA and Converting to NIST format
  • Low Resolution (lr_) versus High Resolution MSMS NIST Libraries
  • Problems Converting and Searching User Libraries and “Work-Arounds”
  • Composition of the MoNA Libraries and Structures in MoNA GCMS Library
  • Conversion of Wiley Commercial Libraries with Lib2NIST
  • Conversion of Personal User Library with no Precursor_m/z field
  • PowerShell Script for Adding Precursor_m/z to Personal User Library
  • Creating/Adding User Library within NIST Search Program
  • What If My Imported Library Spectrum Contained No Precursor_m/z Field?
  • What IF I Need to Add Several Different Fields for a Set of Spectra?
  • “Re(Index)” Library Indices After Additions or Creating New Library
  • Automatic Distribution of Eastman Libraries Over Network
  • Live Demo on YouTubeWebinar References (Internet Links)
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

James Little/Mass Spec Interpretation Services
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.