Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Čt, 11.3.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Import MSMS Spekter

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

Ve čtvrté části se podíváme na:

Prezentaci ke čtvrté části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction of Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series Topics
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software in General is “Windows Compliant”
  • Abbreviations Used in Text and Useful Keyboard Sequences
  • Methods for ImportingSpectra Directlyin MSP Format to NIST
  • Mass Spec Manufactures Current Use of NIST Search
  • Example of Capability Utilized by Agilent
  • Example of Imported Agilent Spectrum
  • Example of Mult-Spectra Import of Agilent Spectra
  • Importance of Proper Settings in NIST Spectrum Import Options
  • Importing Spectra Manually Indirectlyin MSP and Other Formats
  • Exporting Spectra Manually in MSP and Other Formats
  • Example of Typical NIST Entry in *.MSP Format
  • Live YouTube Demonstration
  • References with Internet Links
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část V: Hledání struktury v NIST
  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven
James Little/Mass Spec Interpretation Services
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved Separation of RNA Nucleotides, Nucleosides, and Nucleobases on Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC kolony, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Quantification of THC and CBD in Gummies and Hard Candies

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Detection and Quantitation of Nitrosamine Impurities in Drug Substances by LC-HRMS on LCMS-9030

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved Separation of RNA Nucleotides, Nucleosides, and Nucleobases on Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC kolony, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Quantification of THC and CBD in Gummies and Hard Candies

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Detection and Quantitation of Nitrosamine Impurities in Drug Substances by LC-HRMS on LCMS-9030

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved Separation of RNA Nucleotides, Nucleosides, and Nucleobases on Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC kolony, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Quantification of THC and CBD in Gummies and Hard Candies

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Detection and Quantitation of Nitrosamine Impurities in Drug Substances by LC-HRMS on LCMS-9030

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved Separation of RNA Nucleotides, Nucleosides, and Nucleobases on Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC kolony, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Quantification of THC and CBD in Gummies and Hard Candies

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Detection and Quantitation of Nitrosamine Impurities in Drug Substances by LC-HRMS on LCMS-9030

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.