Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8-mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydané v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

Ve čtvrté části se podíváme na:

Prezentaci ke čtvrté části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

• Introduction of Presenter, James Little
• Table of Contents
• Series Topics
• Help Files for NIST Search
• NIST Software in General is “Windows Compliant”
• Abbreviations Used in Text and Useful Keyboard Sequences
• Methods for ImportingSpectra Directlyin MSP Format to NIST
• Mass Spec Manufactures Current Use of NIST Search
• Example of Capability Utilized by Agilent
• Example of Imported Agilent Spectrum
• Example of Mult-Spectra Import of Agilent Spectra
• Importance of Proper Settings in NIST Spectrum Import Options
• Importing Spectra Manually Indirectlyin MSP and Other Formats
• Exporting Spectra Manually in MSP and Other Formats
• Example of Typical NIST Entry in *.MSP Format
• Live YouTube Demonstration
• References with Internet Links
• Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

• Část V: Hledání struktury v NIST
• Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
• Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
• Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven