Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST | LabRulez LCMS

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

Po, 22.3.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Vyhledávání struktury v NIST

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V páté části se podíváme na:

Prezentaci k páté části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction of Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series Topics
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software in General is “Windows Compliant”
  • Session Topics and Choice of Drawing Program
  • Critical Settings for Similar Structure Searches
  • Critical Settings for Exact Structure Searches
  • Critical Settings Turn Off Any Filtering Options Initially
  • Obtaining Structure from Drawing Program
  • Pasting Structure into NIST Search
  • Search for Similar Structures after Inserting Clipboard Structure
  • Search for Exact Structures
  • Tips for Displaying Similar and Exact Search Result with DeltaMass
  • Reverse Process: Sending Structures from NIST to Drawing Program
  • Using Compare Window to Display Multiple Spectra
  • Sending Structures Directly to Drawing Program
  • Live Demo YouTube Presentation
  • Presentation References (Internet Links)
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

James Little/Mass Spec Interpretation Services
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Pharmaceuticals and Personal Care Products (PPCPs) as Contaminants in Drinking Water by LC/MS/MS Using Agilent Bond Elut PPL

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Quantification of eight antimycotics in human plasma by liquid chromatography-tandem mass spectrometry for clinical research

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific, RECIPE
Zaměření
Klinická analýza

LC-MS for detection of SARS-CoV-2 viral and host proteins

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Klinická analýza

Průvodce řešením problémů v kapalinové chromatografii - Shimadzu HPLC Troubleshooting

Příručky
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
---

Waters Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Brožury a specifikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Waters
Zaměření
---
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Pharmaceuticals and Personal Care Products (PPCPs) as Contaminants in Drinking Water by LC/MS/MS Using Agilent Bond Elut PPL

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Quantification of eight antimycotics in human plasma by liquid chromatography-tandem mass spectrometry for clinical research

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific, RECIPE
Zaměření
Klinická analýza

LC-MS for detection of SARS-CoV-2 viral and host proteins

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Klinická analýza

Průvodce řešením problémů v kapalinové chromatografii - Shimadzu HPLC Troubleshooting

Příručky
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
---

Waters Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Brožury a specifikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Waters
Zaměření
---
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Pharmaceuticals and Personal Care Products (PPCPs) as Contaminants in Drinking Water by LC/MS/MS Using Agilent Bond Elut PPL

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Quantification of eight antimycotics in human plasma by liquid chromatography-tandem mass spectrometry for clinical research

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific, RECIPE
Zaměření
Klinická analýza

LC-MS for detection of SARS-CoV-2 viral and host proteins

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Klinická analýza

Průvodce řešením problémů v kapalinové chromatografii - Shimadzu HPLC Troubleshooting

Příručky
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
---

Waters Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Brožury a specifikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Waters
Zaměření
---
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Pharmaceuticals and Personal Care Products (PPCPs) as Contaminants in Drinking Water by LC/MS/MS Using Agilent Bond Elut PPL

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Quantification of eight antimycotics in human plasma by liquid chromatography-tandem mass spectrometry for clinical research

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific, RECIPE
Zaměření
Klinická analýza

LC-MS for detection of SARS-CoV-2 viral and host proteins

Aplikace
| 2021 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Klinická analýza

Průvodce řešením problémů v kapalinové chromatografii - Shimadzu HPLC Troubleshooting

Příručky
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
---

Waters Atlantis Premier BEH Z-HILIC Columns

Brožury a specifikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Waters
Zaměření
---
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.