LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
James Little/Mass Spec Interpretation Services
James Little/Mass Spec Interpretation Services
Mým hlavním zájmem je identifikace organických sloučenin hmotnostní spektrometrií v organických směsích.
Tagy
Video
Akademie
Webináře
Logo of LinkedIn

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

Út, 23.3.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Vyhledávání struktury v NIST

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V páté části se podíváme na:

Prezentaci k páté části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction of Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series Topics
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software in General is “Windows Compliant”
  • Session Topics and Choice of Drawing Program
  • Critical Settings for Similar Structure Searches
  • Critical Settings for Exact Structure Searches
  • Critical Settings Turn Off Any Filtering Options Initially
  • Obtaining Structure from Drawing Program
  • Pasting Structure into NIST Search
  • Search for Similar Structures after Inserting Clipboard Structure
  • Search for Exact Structures
  • Tips for Displaying Similar and Exact Search Result with DeltaMass
  • Reverse Process: Sending Structures from NIST to Drawing Program
  • Using Compare Window to Display Multiple Spectra
  • Sending Structures Directly to Drawing Program
  • Live Demo YouTube Presentation
  • Presentation References (Internet Links)
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

James Little/Mass Spec Interpretation Services
Logo of LinkedIn
 

Mohlo by Vás zajímat

Ohmic iR drop

Aplikace
| 2025 | Metrohm
Instrumentace
Elektrochemie
Výrobce
Metrohm
Zaměření

Enhanced calibration precision: Leveraging RSE and WLS for optimal function optimization

Technické články
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Software
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření

Fast analyses of anions in water with microbore columns using a compact ion chromatography system for reduced eluent use

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Improving the Purification Workflow With MaxPeak™ Premier OBD™ Preparative Columns: Isolation of Compounds From a Vitamin Beverage

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC kolony, PrepLC, HPLC
Výrobce
Waters
Zaměření
Potraviny a zemědělství

PFAS Analysis in Food Packaging Using an Agilent 6495D Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT
Článek | Produkt

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT

Watrex Praha přichází s inovativními řešeními v podobě systémů xTrovert™ XT a xTrovert™ FLEX-O™, které posouvají hranice efektivity při přípravě vzorků a extrakci DNA/RNA.
Watrex Praha
tag
share
more
Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů
Článek | Věda a výzkum

Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů

Vědci zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů v ČR a SR (30 000 let zpět) podle původu pazourků a rohovců. Spolupracují s MZM a AV ČR, projekt podpořila GAČR.
Univerzita Palackého v Olomouci
tag
share
more
Altium: Akční nabídka únor - duben 2025
Článek | Produkt

Altium: Akční nabídka únor - duben 2025

Společnost Altium International s.r.o. představuje akční nabídku platnou od února do dubna 2025, zahrnující širokou škálu laboratorního vybavení a spotřebního materiálu se slevami až 35 %.
Altium International
tag
share
more
SeBiChem 2025 (Program)
Článek | Nejbližší akce

SeBiChem 2025 (Program)

Ve dnech 27. - 28. února 2025 proběhne druhé setkání odborníků z oblasti biologie a chemie vodních ekosystémů na akademické půdě UJEP v Ústí nad Labem.
SeBiChem
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Ohmic iR drop

Aplikace
| 2025 | Metrohm
Instrumentace
Elektrochemie
Výrobce
Metrohm
Zaměření

Enhanced calibration precision: Leveraging RSE and WLS for optimal function optimization

Technické články
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Software
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření

Fast analyses of anions in water with microbore columns using a compact ion chromatography system for reduced eluent use

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Improving the Purification Workflow With MaxPeak™ Premier OBD™ Preparative Columns: Isolation of Compounds From a Vitamin Beverage

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC kolony, PrepLC, HPLC
Výrobce
Waters
Zaměření
Potraviny a zemědělství

PFAS Analysis in Food Packaging Using an Agilent 6495D Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT
Článek | Produkt

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT

Watrex Praha přichází s inovativními řešeními v podobě systémů xTrovert™ XT a xTrovert™ FLEX-O™, které posouvají hranice efektivity při přípravě vzorků a extrakci DNA/RNA.
Watrex Praha
tag
share
more
Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů
Článek | Věda a výzkum

Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů

Vědci zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů v ČR a SR (30 000 let zpět) podle původu pazourků a rohovců. Spolupracují s MZM a AV ČR, projekt podpořila GAČR.
Univerzita Palackého v Olomouci
tag
share
more
Altium: Akční nabídka únor - duben 2025
Článek | Produkt

Altium: Akční nabídka únor - duben 2025

Společnost Altium International s.r.o. představuje akční nabídku platnou od února do dubna 2025, zahrnující širokou škálu laboratorního vybavení a spotřebního materiálu se slevami až 35 %.
Altium International
tag
share
more
SeBiChem 2025 (Program)
Článek | Nejbližší akce

SeBiChem 2025 (Program)

Ve dnech 27. - 28. února 2025 proběhne druhé setkání odborníků z oblasti biologie a chemie vodních ekosystémů na akademické půdě UJEP v Ústí nad Labem.
SeBiChem
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Ohmic iR drop

Aplikace
| 2025 | Metrohm
Instrumentace
Elektrochemie
Výrobce
Metrohm
Zaměření

Enhanced calibration precision: Leveraging RSE and WLS for optimal function optimization

Technické články
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Software
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření

Fast analyses of anions in water with microbore columns using a compact ion chromatography system for reduced eluent use

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Improving the Purification Workflow With MaxPeak™ Premier OBD™ Preparative Columns: Isolation of Compounds From a Vitamin Beverage

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC kolony, PrepLC, HPLC
Výrobce
Waters
Zaměření
Potraviny a zemědělství

PFAS Analysis in Food Packaging Using an Agilent 6495D Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT
Článek | Produkt

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT

Watrex Praha přichází s inovativními řešeními v podobě systémů xTrovert™ XT a xTrovert™ FLEX-O™, které posouvají hranice efektivity při přípravě vzorků a extrakci DNA/RNA.
Watrex Praha
tag
share
more
Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů
Článek | Věda a výzkum

Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů

Vědci zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů v ČR a SR (30 000 let zpět) podle původu pazourků a rohovců. Spolupracují s MZM a AV ČR, projekt podpořila GAČR.
Univerzita Palackého v Olomouci
tag
share
more
Altium: Akční nabídka únor - duben 2025
Článek | Produkt

Altium: Akční nabídka únor - duben 2025

Společnost Altium International s.r.o. představuje akční nabídku platnou od února do dubna 2025, zahrnující širokou škálu laboratorního vybavení a spotřebního materiálu se slevami až 35 %.
Altium International
tag
share
more
SeBiChem 2025 (Program)
Článek | Nejbližší akce

SeBiChem 2025 (Program)

Ve dnech 27. - 28. února 2025 proběhne druhé setkání odborníků z oblasti biologie a chemie vodních ekosystémů na akademické půdě UJEP v Ústí nad Labem.
SeBiChem
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Ohmic iR drop

Aplikace
| 2025 | Metrohm
Instrumentace
Elektrochemie
Výrobce
Metrohm
Zaměření

Enhanced calibration precision: Leveraging RSE and WLS for optimal function optimization

Technické články
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Software
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření

Fast analyses of anions in water with microbore columns using a compact ion chromatography system for reduced eluent use

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Improving the Purification Workflow With MaxPeak™ Premier OBD™ Preparative Columns: Isolation of Compounds From a Vitamin Beverage

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC kolony, PrepLC, HPLC
Výrobce
Waters
Zaměření
Potraviny a zemědělství

PFAS Analysis in Food Packaging Using an Agilent 6495D Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT
Článek | Produkt

Nová definice efektivní automatizace u Vás v laboratoři s xTrovertem™ XT

Watrex Praha přichází s inovativními řešeními v podobě systémů xTrovert™ XT a xTrovert™ FLEX-O™, které posouvají hranice efektivity při přípravě vzorků a extrakci DNA/RNA.
Watrex Praha
tag
share
more
Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů
Článek | Věda a výzkum

Vědci pomocí určení původu pazourků zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů

Vědci zmapují mobilitu pravěkých lovců mamutů v ČR a SR (30 000 let zpět) podle původu pazourků a rohovců. Spolupracují s MZM a AV ČR, projekt podpořila GAČR.
Univerzita Palackého v Olomouci
tag
share
more
Altium: Akční nabídka únor - duben 2025
Článek | Produkt

Altium: Akční nabídka únor - duben 2025

Společnost Altium International s.r.o. představuje akční nabídku platnou od února do dubna 2025, zahrnující širokou škálu laboratorního vybavení a spotřebního materiálu se slevami až 35 %.
Altium International
tag
share
more
SeBiChem 2025 (Program)
Článek | Nejbližší akce

SeBiChem 2025 (Program)

Ve dnech 27. - 28. února 2025 proběhne druhé setkání odborníků z oblasti biologie a chemie vodních ekosystémů na akademické půdě UJEP v Ústí nad Labem.
SeBiChem
tag
share
more
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.