Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST | LabRulez LCMS

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Čt, 25.2.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Vyhledávací software a knihovny NIST

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

Ve druhé části se podíváme na:

Prezentaci ke druhé části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction to Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series of Talks: LCMS Unknown Identifications Using MSMS Libraries
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software in General is “Windows Compliant”
  • NIST Tandem Quick Start Guide
  • Overview: NIST Mass Spectrometry Software and MSMS Libraries
  • Limitations of MSMS Searches for Unknown Identifications
  • Three Basic Types of NIST MSMS (Tandem) Searches
  • Overall Description for Searching Libraries and Displaying Results
  • NIST MSMS (Tandem) Libraries 2020 Release
  • Minimizing Number of Results After Search Performed
  • Two Types of Ions Filtered with MSMS Hit List Filter Option
  • Setting Default Parameters for Similarity Search (7 Steps)
  • Setting Default Parameters for Identify MS/MS Search (8 Steps)
  • Setting Default Parameters for MS/MS Hybrid Search (9 Steps)
  • Searching Demonstration (Live YouTube)
  • Presentation References (Internet Hyperlinks)
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část III: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání
  • Část IV: Import MSMS Spekter
  • Část V: Hledání struktury v NIST
  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven
James Little/Mass Spec Interpretation Services
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---

Quantitative Determination of Fat-Soluble Vitamins in Infant Formula by LC-MS/MS Method with Supported Liquid Extraction (SLE)

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---

Quantitative Determination of Fat-Soluble Vitamins in Infant Formula by LC-MS/MS Method with Supported Liquid Extraction (SLE)

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---

Quantitative Determination of Fat-Soluble Vitamins in Infant Formula by LC-MS/MS Method with Supported Liquid Extraction (SLE)

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---

Quantitative Determination of Fat-Soluble Vitamins in Infant Formula by LC-MS/MS Method with Supported Liquid Extraction (SLE)

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

V první části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se obecně podíváme na software a možnosti jeho základních uživatelských nastavení.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

V šesté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS korelovat struktury neznámých látek pomocí MSMS iontů.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 7: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven

V sedmé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme jak v LCMS vytvářet a používat další MSMS knihovny.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.