Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Čt, 4.3.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

Ve třetí části se podíváme na:

Prezentaci ke třetí části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction to Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series of Talks: LCMS Unknown Identifications Using MSMS Libraries
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software in General is “Windows Compliant”
  • Presentation Topics
  • Program Description and My Personal Experience
  • Comparison to Standard versus Neutral Loss Spectrum
  • Hybrid Search Results for Example
  • Using DotProduct Instead of Score for Viewing Results
  • DeltaMass Table
  • Simple Examples Using Structures to Show DeltaMass
  • Viewing Peak Matching Results by Sorting in Hybrid Search Results
  • Merging Hybrid with Peak Matching Results
  • Detailed Explanation of Hybrid Head to Tail Display
  • Alternate Neutral Loss Comparison in Head to Tail Format
  • Other Things to Consider with Hybrid Search for Unknown Identification
  • Setting Up CriticalDefault Parameters for MS/MS Hybrid Search
  • Live Searching Demonstration YouTube Video
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část IV: Import MSMS Spekter
  • Část V: **Hledání struktury v NIST **
  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven
James Little/Mass Spec Interpretation Services
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Edible Fish Tissue

Instrumentace
Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Seznámení s přístroji Wyatt Technology

Instrumentace
GPC/SEC
Výrobce
Waters
Zaměření
---

Your Essential Guide to Sugar Analysis with Liquid Chromatography

Instrumentace
Příprava vzorků, Spotřební materiál, Software, HPLC, LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Potraviny a zemědělství

GPC/SEC Troubleshooting and Good Practice

Instrumentace
GPC/SEC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Speciation of Iron in Lithium Iron Phosphate (LFP) Cathode Material by LC-ICP-MS

Instrumentace
HPLC, ICP/MS, Speciační analýza
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Průmysl a chemie, Materiálová analýza
 

Podobné články


Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
 

Podobné články


Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
 

Podobné články


Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
 

Podobné články


Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.