Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání | LabRulez LCMS

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

Čt, 4.3.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James Little
Ve třetí části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme hybridní skóre odpovídající fragmentům a neutrálním ztrátám.
Video placeholder

Mass Spec Interpretation Services/James Little: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

Ve třetí části se podíváme na:

Prezentaci ke třetí části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

  • Introduction to Presenter, James Little
  • Table of Contents
  • Series of Talks: LCMS Unknown Identifications Using MSMS Libraries
  • Help Files for NIST Search
  • NIST Software in General is “Windows Compliant”
  • Presentation Topics
  • Program Description and My Personal Experience
  • Comparison to Standard versus Neutral Loss Spectrum
  • Hybrid Search Results for Example
  • Using DotProduct Instead of Score for Viewing Results
  • DeltaMass Table
  • Simple Examples Using Structures to Show DeltaMass
  • Viewing Peak Matching Results by Sorting in Hybrid Search Results
  • Merging Hybrid with Peak Matching Results
  • Detailed Explanation of Hybrid Head to Tail Display
  • Alternate Neutral Loss Comparison in Head to Tail Format
  • Other Things to Consider with Hybrid Search for Unknown Identification
  • Setting Up CriticalDefault Parameters for MS/MS Hybrid Search
  • Live Searching Demonstration YouTube Video
  • Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

  • Část IV: Import MSMS Spekter
  • Část V: Hledání struktury v NIST
  • Část VI: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů
  • Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
  • Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven
James Little/Mass Spec Interpretation Services
 

Mohlo by Vás zajímat

Determination of inorganic anions in saturated lithium carbonate solution

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie

Targeted MS Imaging Solution with DESI XS and XEVO TQ Absolute

Brožury a specifikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
MS Imaging, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
---

Agilent Revident LC/Q-TOF system: Intelligence That Inspires Insight

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Agilent 6495 triple quadrupole LC/MS system: Intelligence That Inspires Confidence

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Quantification of Six Porphyrin Biomarkers in Urine Using LC-2050C with Fluorescence Detection

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
 

Mohlo by Vás zajímat

Determination of inorganic anions in saturated lithium carbonate solution

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie

Targeted MS Imaging Solution with DESI XS and XEVO TQ Absolute

Brožury a specifikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
MS Imaging, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
---

Agilent Revident LC/Q-TOF system: Intelligence That Inspires Insight

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Agilent 6495 triple quadrupole LC/MS system: Intelligence That Inspires Confidence

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Quantification of Six Porphyrin Biomarkers in Urine Using LC-2050C with Fluorescence Detection

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
 

Mohlo by Vás zajímat

Determination of inorganic anions in saturated lithium carbonate solution

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie

Targeted MS Imaging Solution with DESI XS and XEVO TQ Absolute

Brožury a specifikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
MS Imaging, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
---

Agilent Revident LC/Q-TOF system: Intelligence That Inspires Insight

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Agilent 6495 triple quadrupole LC/MS system: Intelligence That Inspires Confidence

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Quantification of Six Porphyrin Biomarkers in Urine Using LC-2050C with Fluorescence Detection

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
 

Mohlo by Vás zajímat

Determination of inorganic anions in saturated lithium carbonate solution

Aplikace
| 2023 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Průmysl a chemie

Targeted MS Imaging Solution with DESI XS and XEVO TQ Absolute

Brožury a specifikace
| 2023 | Waters
Instrumentace
MS Imaging, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
---

Agilent Revident LC/Q-TOF system: Intelligence That Inspires Insight

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Agilent 6495 triple quadrupole LC/MS system: Intelligence That Inspires Confidence

Brožury a specifikace
| 2023 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
---

Quantification of Six Porphyrin Biomarkers in Urine Using LC-2050C with Fluorescence Detection

Aplikace
| 2023 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Klinická analýza
 

Podobné články

Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

Ve druhé části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme proces a typy vyhledávání, nastavení parametrů a použití knihoven.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 4: Import MSMS Spekter

Ve čtvrté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter si rozebereme import MSMS spekter.
Video | Akademie

Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 5: Vyhledávání struktury v NIST

V páté části série o použití softwaru NIST Search pro identifikaci neznámých látek pomocí tandemových (MS/MS) spekter se podíváme na vyhledávání struktur.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.