Identifikace neznámých látek v LC/MS pomocí MSMS knihoven - Část 6: MS Interpreter korelace struktury pomocí MSMS iontů

MS/MS (tandemová) spektra lze použít k identifikaci neznámých látek pomocí vyhledávání v knihovně. Toho je dosaženo v podstatě stejným způsobem, jaký se používá pro EI GC-MS s vyhledávacím softwarem NIST. Součástí nejnovějšího vydání NIST knihovny 2020 je také vylepšená verze NIST Search 2.4.

V této 8mi dílné sérii tréninkových webinářů se pokusím se seznámit uživatele s používáním vyhledávacího softwaru NIST verze 2.4 využívajícího NIST, Wiley, “crowd-sourced (MoNA)” a uživatelských knihoven pro identifikaci neznámých látek.

NIST má ambiciózní program na rozšíření svých již tak komplexních a vysoce kvalitních databází MS/MS.

Podívejte se na následující odkaz: NIST Pipeline for Extending MS/MS Libraries

To zahrnuje velmi komplexní proces výběru a nákupu příslušných sloučenin a jejich následné analýzy. Problém s variabilitou spekter se snižuje analýzou vzorků na různých přístrojích a na různých energetických úrovních (20 kroků). Kromě toho je charakterizováno mnoho různých prekurzorových iontů a fragmentových iontů (MSⁿ). To již vedlo k dostupnosti rozsáhlé a vysoce kvalitní knihovny přesných hmotnostních MS/MS spekter ve verzi vydáné v roce 2020 (31K sloučenin/1,3 M spekter) a úsilí dále pokračuje.

V šesté části se podíváme na:

Prezentaci k šesté části naleznete v knihovně LabRulezLCMS.

• Introduction of Presenter, James Little
• Table of Contents
• Series Topics
• Help Files for NIST Search
• NIST Software in General is “Windows Compliant”
• Session Topics
• Adding a Structure to a Spectrum
• Sending Spectrum with Structure to MS Interpereter
• Processing Data in MS Interpreter
• Suggested Default Settings
• Displaying the Propose Substructures Correlated to Ions
• Stepping through More Than One Proposed Structure
• Lassoing Structures Manually
• Processing Any Entry in NIST Search with structure/spectrum
• Direct Structure Paste in MS Interpreter
• Processing MS/MS Spectra Containing Isotopic Clusters
• Live YouTube Demonstration
• References with Internet Links
• Acknowledgements

Dalších částech se zaměříme na:

• Část VII: Používání a vytváření dalších MSMS knihoven
• Část VIII: Identifikace neznámých látek pomocí „Spectraless“ knihoven

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

• Část 1: Seznámení se software a možnosti uživatelských nastavení

• Část 2: Vyhledávací software a knihovny NIST

• Část 3: Podrobnější diskuse o hybridním MSMS vyhledávání

• Část 4: Import MSMS Spekter

• Část 5: Vyhledávání struktury v NIST