Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR pronikají do detailů genové transkripce. Popsali dosud neznámý molekulární mechanismus, kterým může začínat přepis genetické informace z deoxyribonukleové kyseliny (DNA) do ribonukleové kyseliny (RNA). Zaměřili se na zvláštní molekuly nazývané alarmony, které se vyskytují v buňkách napříč organismy a jejichž hladina se často zvyšuje při buněčném stresu. Výsledky výzkumu zveřejnil prestižní vědecký časopis Nature Chemical Biology.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Hana Cahová, vedoucí vědecké skupiny Chemická biologie nukleových kyselin." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><div>RNA molekuly mohou nést na jednom konci různé chemické modifikace, označované jako tzv. „čepičky“. U eukaryotních organismů, kam patří i lidské buňky, je nejznámější čepička, která se podílí na stabilitě RNA a regulaci jejího dalšího osudu. V posledních letech se však ukazuje, že existují i alternativní, nekanonické RNA čepičky, jejichž vznik a mechanismus připojení k RNA se zatím vymyká lidským znalostem. Mezi ně patří například tzv. alarmonové čepičky, tvořené molekulami dinukleosidpolyfosfátu, alarmonů, které chrání buněčnou RNA ve chvílích, kdy je buňka v ohrožení.Tým <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cahova.group.uochb.cz/cs">Dr. Hany Cahové</a> se ve své studii zaměřil na RNA polymerázu z bakterií a sledoval, jakým způsobem může tento enzym zahájit transkripci za využití dinukleosidpolyfosfátů (NpNs) místo běžných stavebních bloků RNA. Vědci vůbec poprvé popsali na atomární úrovni, jak může vznikat RNA s alarmonovou čepičkou přímo při zahájení přepisu genu. Navíc pozorovali, že se NpnNs vážou jiným typem párování, než je obvyklé.Na práci se zásadně podílely Valentina Serianni z týmu Hany Cahové, která prokázala schopnost dinukleosidpolyfosfátů zahajovat přepis genu, a Jana Škerlová, která se zaměřila na strukturální analýzu RNA polymerázy a na základě dat z kryogenní elektronové mikroskopie ukázala, jak se molekuly dinukleosidpolyfosfátů váží do aktivního místa RNA polymerázy, tedy do srdce enzymu, kde se genetická informace přepisuje. Jejich studie pomáhá odhalovat procesy, které provázejí přepis genetické informace z DNA do RNA.Hana Cahová k tomu dodává: „Popisujeme něco, co se v buňkách skutečně děje a co nyní dokážeme pozorovat přímo na úrovni jednotlivých molekul. Získáváme tak odpovědi na zásadní otázky týkající se buněčných procesů, například jak se buňky přizpůsobují stresu. Právě RNA totiž přenáší kaskádu informací, které stojí za jakoukoli buněčnou reakcí, např. na stav ohrožení způsobený nedostatkem živin či teplotním šokem.“<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Tomáš Kouba, vedoucí core facillity skupiny Kryogenní elektronová mikroskopie." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><div>Klíčovou roli v projektu sehrála kryogenní elektronová mikroskopie (cryo-EM), kterou vedl Dr. Tomáš Kouba, jeden z autorů článku. „Kryoelektronová mikroskopie umožňuje zmrazit biologické molekuly skoro v jejich přirozené formě a následné získat trojrozměrnou strukturu takových molekul. Díky tomu můžeme nahlédnout přímo do aktivního centra enzymů a sledovat jejich fungování až na atomární úrovni,“ vysvětluje Tomáš Kouba.ÚOCHB vloni otevřel nové <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cryoem.group.uochb.cz/cs">centrum cryo-EM</a>, které je v českém prostředí unikátní. Špičkové kryogenní elektronové mikroskopy našly zázemí ve speciálně navržené budově a umožňují studium biologických procesů s mimořádnou strukturální přesností.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg" alt="ÚOCHB: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Tato práce ukazuje, jak malé molekuly NpnN pomáhají bakteriím zahájit přepis genetické informace. Detailní zobrazení pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhaluje, jak se vážou na genetickou šablonu a fungují jako nekanonické „čepičky“ RNA." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg 245w," sizes="100vw" width="2000" height="1077"><blockquote><h4>Původní článek</h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41589-025-02134-5#citeas">Molekulární vhled do 5′ zakončení RNA pomocí NpnNs zprostředkovaného bakteriální RNA polymerázou</a></h4>Valentina M. Serianni, Jana Škerlová, Anna Knopp Dubánková, Anton Škríba, Hana Šváchová, Tereza Vučková, Anatolij Filimoněnko, Milan Fábry, Pavlína Řezáčová, Tomáš Kouba &amp; Hana Cahova&nbsp;Nat. Chem. Biol. 21 (2026)<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5">https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5</a><h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">CC-BY 4.0</a></h6></blockquote><h4>Abstrakt</h4>RNA zakončená dinukleosidovými polyfosfáty byla u bakterií i eukaryot objevena teprve nedávno. Pravděpodobný mechanismus tohoto specifického typu zakončení RNA spočívá v přímém začlenění dinukleosidových polyfosfátů RNA polymerázou jako nekanonických iniciačních nukleotidů. Dosud však nebylo známo, jakým způsobem se tyto sloučeniny vážou do aktivního místa RNA polymerázy během zahájení transkripce. V této práci jsme in vitro studovali iniciaci transkripce za použití série DNA templátů v kombinaci s dinukleosidovými polyfosfáty a modelovou RNA polymerázou z bakterie Thermus thermophilus. Zjistili jsme, že místo zahájení transkripce se může lišit v závislosti na kompatibilitě konkrétního templátu a použitého dinukleosidového polyfosfátu. Struktury iniciačních transkripčních komplexů s dinukleosidovými polyfosfáty získané pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhalily, že obě nukleové báze v molekule mohou párovat s DNA templátem. První kódovaný nukleotid se páruje kanonickým Watsonovým–Crickovým způsobem, zatímco druhá nukleová báze se váže nekanonicky prostřednictvím reverzního Watsonova–Crickova párování. Tato práce tak poskytuje strukturní vysvětlení mechanismu, kterým dinukleosidové polyfosfáty zahajují transkripci RNA.</div></div>

Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace

Falšování potravin je fenomén s dlouhou historií, který v dnešní době díky globalizaci potravinových řetězců a vysokým ekonomickým tlakům nabývá na významu. Ať už jde o ředění olivového oleje levnými oleji, přidávání cukru do medu, nebo skryté používání náhražek v bílkovinových doplňcích, výsledkem je ztráta důvěry spotřebitelů a v některých případech i ohrožení zdraví. Analytická chemie zde hraje klíčovou roli: poskytuje metody a technologie, které dokážou identifikovat a kvantifikovat cílové látky i nechtěné impurity v rozsáhlém spektru potravinových matrik.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Watrex_Praha_Falsovani_potravin_a_jak_ho_odhali_analyticka_chemie_6912db5492.jpg" alt="Watrex Praha: Falšování potravin a jak ho odhalí analytická chemie" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Watrex_Praha_Falsovani_potravin_a_jak_ho_odhali_analyticka_chemie_6912db5492.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="900"><h4>Role chromatografie ve forenzní potravinářské analýze</h4>Chromatografie, zejména kapalinová chromatografie (HPLC), je mezi analytickými metodami jedním z nejefektivnějších nástrojů pro separaci komplexních směsí molekul.Umožňuje:<ul><li>kvalitativní identifikaci jednotlivých složek ve vzorku,</li><li>kvantitativní stanovení jejich koncentrací,</li><li>detekci nečistot a nečekaných složek, které mohou signalizovat falšování.</li></ul>V praxi se často kombinuje HPLC s různými typy detektorů (UV/VIS, DAD, refraktometrické detektory) nebo dalšími technikami (např. hmotnostní spektrometrií) pro zvýšení selektivity a citlivosti.<h4>Izokratické vs. gradientní eluce</h4>Při analýze potravinových vzorků se chromatografické metody volí podle cíle analýzy:<ul><li>Izokratická HPLC používá jednu konstantní mobilní fázi během celé analýzy – je jednoduchá, robustní a ideální pro rutinní rutiny s dobře definovanými cílovými analyty (např. stanovení cukrů nebo vitamínů).</li><li>Gradientní HPLC mění složení mobilní fáze během separace – umožňuje lepší rozlišení složitých směsí s širokým rozsahem polarity látek (např. peptidů nebo fenolických sloučenin).</li></ul>Gradientní metody jsou obzvláště užitečné, když analyty mají velmi rozdílné vlastnosti a je potřeba dosáhnout vysoké účinnosti separace.<h4>Watrex Praha a přínos moderních systémů pro potravinářskou analytiku</h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://watrex.com/?utm_source=labrulez&amp;utm_medium=propagace&amp;utm_campaign=labrulez_clanky_HPLCsystemy">Watrex Praha, s.r.o.</a> patří mezi významné české výrobce a distributory systémů a přístrojů pro kapalinovou chromatografii, s dlouhou tradicí sahající do roku 1990. Firma úspěšně transformovala svou roli z distributora na výrobce vlastních HPLC a příbuzných technologií, přičemž klade důraz na modulární systémy robustní konstrukce vhodné i pro náročné analytické úlohy.Jejich <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?manufacturerItems=93&amp;search=streamline">řada Streamline™</a> zahrnuje několik koncepcí HPLC systémů vhodných pro potravinářské aplikace:<ul><li>Izokratický HPLC systém – jednoduchá, ale přesná konfigurace s jedním čerpadlem, kolonovým termostatem a UV/VIS detektorem; vhodný pro rutinní stanovení známých analytů (např. základní sacharidy, přídatné látky).</li><li>Binární gradientní HPLC systém – disponuje dvěma čerpadly a umožňuje tvorbu gradientů mobilní fáze, což zvyšuje separační schopnost při analýze komplexních směsí (např. fenolické profily vína, složky aromatických extraktů).</li><li>GPC/SEC systém (gelová permeační chromatografie) – specializované řešení pro stanovení makromolekul a polymerů, avšak i relevantní pro analýzu vysokomolekulárních složek v potravinách (např. polysacharidů).</li></ul><blockquote>👉<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.labrulez.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Watrex_catalog_2024_ba97395f92.pdf">Produktový katalog ZDE</a></blockquote>Díky modulární povaze těchto systémů mohou analytici snadno přizpůsobit konfiguraci specifickému analytickému problému, od jednoduchých rutinních analýz až po komplexní charakterizace potravinových vzorků.<h4>Praktické příklady falšování odhalené HPLC</h4><ul><li>Detekce ředění olivového oleje: Pomocí HPLC lze separovat a kvantifikovat charakteristické triacylglyceroly a mastné kyseliny; neobvyklé vzory pak ukazují na příměsi levnějších olejů.</li><li>Odhad přídavku cukru v medu: Izokratické HPLC s refraktometrickým detektorem může stanovit profily cukrů (glukóza, fruktóza, sacharóza), které ukazují na ředění nebo přidání cukerných sirupů.</li><li>Identifikace aromatických adulterantů ve víně: Gradientní HPLC s PDA detektorem odhalí fenolické a aromatické profily, které mohou být narušeny přídavkem syntetických látek.</li></ul><h4>Závěr</h4>Falšování potravin je stále aktuálním problémem, který vyžaduje spolehlivé a citlivé analytické metody. Kapalinová chromatografie a zejména moderní HPLC systémy , představují jeden z nejúčinnějších nástrojů pro odhalování nežádoucích přídatných látek, nečistot či nečekaných složek v komplexních potravinových vzorcích. Výrobci, jako je <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://watrex.com/?utm_source=labrulez&amp;utm_medium=propagace&amp;utm_campaign=labrulez_clanky_HPLCsystemy">Watrex Praha</a>, nabízejí flexibilní chromatografické platformy, které pokrývají široké spektrum analytických úloh: od jednoduchých izokratických až po pokročilé gradientní a GPC/SEC aplikace, a tím podporují analytiky při zajišťování kvality potravin a ochraně spotřebitelů.<blockquote>Zaujal Vás článek? Pro více zajímavých témat sledujte <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://watrex.com/?utm_source=labrulez&amp;utm_medium=propagace&amp;utm_campaign=labrulez_clanky_HPLCsystemy">Watrex Praha </a>na jejich sociálních sítích (<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.linkedin.com/company/watrex/?viewAsMember=true">LinkedIn</a> a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.facebook.com/WatrexPrague">Facebook</a>).</blockquote>

Falšování potravin a jak ho odhalí analytická chemie?

🎤 Přednášející: Michal Belianský<h3>VIZE 2025: Empower Method Validation Manager</h3><h4>Empower Method Validation Manager (MVM): moderní přístup k validaci chromatografických metod</h4>Validace analytických metod je klíčovým požadavkem regulovaných laboratoří v oblasti farmacie, biotechnologií i kontroly kvality. Software Empower Method Validation Manager (MVM) od společnosti Waters představuje komplexní nástroj, který umožňuje provádět validaci chromatografických metod systematicky a plně v souladu s požadavky lékopisů a regulačních autorit.MVM je rozšířením chromatografického datového systému <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/627">Empower</a>, díky čemuž propojuje vývoj, validaci, zpracování dat i reporting do jednoho uceleného workflow.<h4>Automatizované výpočty a System Suitability</h4>Jednou z hlavních výhod Empower MVM je využití automaticky generovaných chromatografických parametrů, jako jsou:<ul><li>rozlišení (Resolution),</li><li>faktor symetrie a tailing,</li><li>počet teoretických pater (Plate Count),</li><li>výška a šířka píku,</li><li>poměr signál/šum (S/N).</li></ul>Tyto parametry jsou vyhodnocovány v souladu s požadavky USP, EP i JP a mohou být přímo použity v rámci testů System Suitability, čímž se minimalizuje riziko manuálních chyb a zvyšuje konzistence výsledků.<h4>Podpora chemických struktur a specifických aplikací</h4>Empower MVM nabízí také rozšíření Chemical Structures, které je integrováno ve spolupráci s ACD/Labs. Díky tomu lze přímo v prostředí Empoweru:<ul><li>kreslit a upravovat chemické struktury,</li><li>vytvářet knihovny sloučenin,</li><li>vkládat struktury do tabulek komponent a zahrnovat je do reportů.</li></ul>Další specializovaná rozšíření pokrývají například:<ul><li>Dissolution – automatizované vyhodnocení disolučních testů včetně výpočtů f1, f2 a Q faktoru,</li><li>GPC/SEC pro polymerní analýzu – výpočty molekulových hmotností (Mw, Mn, Mp, Mz) a kombinaci dat z RI a LS detektorů,</li><li>Sample Weight Importer – přímý přenos hmotností ze vah do Empoweru s plnou auditní stopou.</li></ul><h4>Validace metod krok za krokem v MVM</h4>Empower Method Validation Manager strukturuje validaci do tří hlavních fází:<ol><li>Validation Protocol Definice validačních požadavků, akceptačních kritérií, typů testů a schvalovacích procesů.</li><li>Validation Study Řízení celé validační studie v jednom projektu – akvizice dat, jejich zpracování, statistické výpočty a průběžné hodnocení souladu s kritérii.</li><li>Reporting Automatizovaná tvorba validačních reportů z předdefinovaných šablon, včetně elektronických podpisů a plné sledovatelnosti změn.</li></ol>Software podporuje všechny klíčové validační testy, jako jsou linearita, přesnost, správnost, specificita, LOD/LOQ, opakovatelnost, mezilehlá přesnost, robustnost či stabilita metody<h4>Integrace, migrace dat a monitoring systémů</h4>Součástí ekosystému Empoweru jsou i nástroje pro migraci dat z jiných CDS (např. Agilent ChemStation/OpenLab, Thermo Chromeleon, MassLynx) pomocí modulu Waters Data Converter.Díky platformě <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/1544">waters_connect</a> System Monitoring mají uživatelé přehled o stovkách chromatografických a LC-MS systémů, mohou sledovat jejich stav v reálném čase, dostávat automatické notifikace a efektivně plánovat využití přístrojů, což významně zvyšuje produktivitu laboratoře.<h4>Závěr</h4>Empower Method Validation Manager představuje robustní a regulatorně připravené řešení pro validaci chromatografických metod od A do Z. Automatizace výpočtů, jednotné řízení validačních studií, pokročilé reportingové nástroje a hluboká integrace s CDS Empower činí z MVM silný nástroj pro laboratoře, které kladou důraz na kvalitu dat, efektivitu práce a plnou shodu s regulačními požadavky.

Waters VIZE 2025: Empower Method Validation Manager

Potraviny

Přednáška

Věda a výzkum

Video

Článek

Produkt

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Firmu Waters založil v roce 1958 pan James Waters. Od té doby se společnost Waters specializuje na kapalinovou chromatografii a hmotnostní spektrometrii. Divize TA Instruments působí na poli termální analýzy. V České republice je Waters zastoupen přímou pobočkou, která sídlí v Praze.

Waters Gesellschaft

Watrex Praha je přední český výrobce a distributor systémů a příslušenství zejména pro kapalinovou chromatografii. Distribuujeme produkty mnoha chemických firem a máme vlastní řadu systémů za rozumnou cenu.

Watrex Praha

Agilent Pathway architect

Integrovaný panel nástrojů pro analýzu metabolických cest a biologickou kontextualizaci.

Geny a proteiny interagují v biochemických drahách, které navozují biologické procesy spojené s patologickými poruchami. GeneSpring 13.0 poskytuje možnosti modelování, které výzkumníkům umožňují tyto sítě rychle generovat a zkoumat.
Prostřednictvím algoritmů a databází druhově specifických interakcí můžete vytvořit širokou škálu typů sítí zahrnující cílové dráhy a regulátory, transkripční regulátory, biologické procesy, event. Hledání nejkratších propojení mezi entitami. Sítě mohou být také vytvořeny i na základě uživatelem zadaných MeSH podmínek.
<ul>
<li>Multi-omická analýza</li>
<li>Zdokonalené vizualizace</li>
<li><a href="https://www.agilent.com/en/products/genomics-agilent">Další funkční prvky</a></li>
</ul>
<a href="http://genespring-support.com/">GeneSpring Support Portal</a>

Agilent Spectrum Mill

Pokročilý software Spectrum Mill pro Mass Hunter Workstation umožňuje rychlejší a přesnější identifikaci proteinů.

Charakterizace proteomu velkého rozsahu má často své meze v interpretaci dat a jejich revizi. Software Spectrum Mill provádí rychlou identifikaci proteinů a peptidů pomocí rychlého prohledávání databáze s použitím automatické či manuální validace shody a unikátních algoritmů, které minimalizují falešně pozitivní identifikace.
Také nabízí možnost &quot;de-novo&quot; interpretace spekter pro proteiny, jenž nejsou v databázi.

Thermo Scientific Proteome Discoverer Software

Identifikujte a kvantifikujte peptidy a proteiny v komplexních biologických vzorcích pomocí softwaru Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™.

<h3>Komplexní, rozšiřitelná a inteligentní platforma</h3>Identifikujte a kvantifikujte peptidy a proteiny v komplexních biologických vzorcích pomocí softwaru Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™. Software Proteome Discoverer zjednodušuje širokou škálu proteomických pracovních postupů, od identifikace proteinů a peptidů přes analýzu PTM až po izobarické hmotnostní značení a kvantifikaci SILAC i bez značení. Podporuje více algoritmů vyhledávání v databázích a více disociačních technik. Přejděte od vyhledávání k objevování s inteligentním INFERYS™ Rescoringem a inteligentním vyhledávacím algoritmem CHIMERYS™ od MSAID, který podstatně zvyšuje počet jedinečných identifikací peptidů.Software Proteome Discoverer podporuje více disociačních technik, kvantifikačních technologií a algoritmů pro vyhledávání v databázi pro komplexní identifikaci, charakterizaci a kvantifikaci proteinů.<h3>Hlavní výhody</h3><h5>Přizpůsobte si analýzu dat</h5>Pomocí editoru pracovních postupů založeného na uzlech si můžete přizpůsobit analýzu dat pro maximální pokrytí a jistotu. Integrujte výsledky vyhledávání v databázích z různých vyhledávačů, jako jsou SEQUEST™ HT, Mascot, MSAmanda, Byonic™ od společnosti Protein Metrics a software Thermo Scientific ProSightPD. Zvyšte důvěru v identifikaci a kvantifikaci peptidů pomocí INFERYS Rescoring a umožněte hlubší vytěžování dat DIA, DDA nebo WWA pomocí inteligentního vyhledávacího algoritmu CHIMERYS.<h5>Provádějte relativní kvantifikaci</h5>Měření a vykazování relativních hladin exprese izotopicky značených peptidů pro:<ul><li>TMT SPS MS3</li><li>Identifikace a kvantifikace glykopeptidů</li><li>Identifikace a kvantifikace fosfopeptidů</li><li>Proteomika shora dolů</li><li>Síťování</li></ul>S jistotou a efektivně interpretujte svá data pomocí integrovaných statistických a vizualizačních nástrojů pro rychlejší dosažení smysluplných výsledků.<h5>Rozšiřitelné nástroje pro pracovní postupy</h5>Využijte uzly třetích stran a zabudujte přizpůsobení pomocí uzlu pro skriptování při zachování plné integrace do softwarového rámce Proteome Discoverer, abyste mohli využít nástroje pro vizualizaci, statistickou analýzu a biologickou interpretaci a posunout svou analýzu na vyšší úroveň.

Agilent VistaFlux Software

VistaFlux software je určen k analýze dat v metabolomických studiích využívajících izotopově značených markerů. Tento software nabízí možnost tvorby cílených seznamů, extrakce sad izotopologů a vizualizaci toku značek stabilních izotopů. Namísto týdnů manuálního vyhodnocení strávíte jen několik hodin práce s automatizovaným workflow.

Rozšiřte možnosti metabolomického výzkumu o studium dynamiky metabolických drah.
<ul>
<li>Efektivní zpracování dat izotopologů pomocí jednoduchého “workflow”</li>
<li>Rychlá tvorba cílených seznamů, extrakce sad izotopologů a vizualizace výsledků na metabolických drahách</li>
<li>Revize a editace dat pomocí intuitivního uživatelského rozhraní</li>
<li>Interpretace výsledků a komunikace s kolegy s využitím obrázků metabolických drah a videí kvalitativního toku</li>
<li>Snadný import obsahu KEGG a BioCyc databází pro tvorbu modelů metabolických drah</li>
<li>Statistické zpracovaní dat izotopologů (t-test a ANOVA)</li>
</ul>

Thermo Scientific™ SimGlycan™ Software

Software SimGlycan zpracovává a interpretuje vícestupňová/sekvenční (MSn) data produkovaná hmotnostními spektrometry Thermo Scientific™, což je schopnost nezbytná pro stanovení heterogenity glykanů a izomerních forem.

Urychlete charakterizaci komplexních glykanů pomocí softwaru SimGlycan™ od společnosti PREMIER Biosoft. Software SimGlycan zpracovává a interpretuje vícestupňová/sekvenční (MSn) data produkovaná hmotnostními spektrometry Thermo Scientific™, což je schopnost nezbytná pro stanovení heterogenity glykanů a izomerních forem.Software automaticky porovnává experimentální hmotnostní spektra s rozsáhlou databází a vytváří bodovaný seznam kandidátních struktur.&nbsp;<h3>Komplexní analýzy</h3><ul><li>Podporuje všechny přístroje Thermo Scientific na bázi iontových pastí a Orbitrap™ provádějící charakterizaci glykanů</li><li>Zpracovává data MSn pro řešení heterogenity glykanů, vzorců větvení a izobarických struktur. K rozlišení strukturních izomerů glykanů může být zapotřebí až sedm úrovní fragmentace MS</li><li>Obsahuje databázi více než 22500 glykanů pro zpracování a ověření struktur</li><li>Poskytuje množství relevantních biologických informací pro pravděpodobnou strukturu glykanu, včetně třídy glykanu, reakce, cesty a enzymu</li><li>Vyhledává glykany s různými chemickými deriváty používanými pro modifikace redukčních konců, a to i v případě, že daný derivát není v databázi k dispozici</li><li>Charakterizuje sodné, lithné, hořečnaté, draselné a formiátové adukty a jejich kombinace, např. Na⁺ + H⁺, Li⁺ + H⁺ apod.</li><li>Identifikuje složité glykosaminoglykanové struktury, i když jsou modifikovány substituenty, jako je sulfát, fosfát a ethanolamin</li><li>Určuje zkřížené a dvojité glykosidické štěpení pomocí kombinace permethylderivatizace a MSn dat</li></ul><h3>Výkonné podávání reportů</h3><ul><li>Vytváří reporty, které obsahují charakteristiky glykanů, jako je ID, sekvence, název, složení, hmotnost, prekurzorový ion m/z, třída, reakce, cesta, obraz glykanu a teoretické fragmenty s odpovídajícími hodnotami hmotnosti a m/z</li><li>Exportuje obrázky glykanových struktur, fragmentů a spekter jako soubory JPEG nebo PNG</li></ul>

Thermo Scientific Ardia Platform

Platforma Ardia, vytvořená s využitím cloudové technologie, centralizuje informace včetně vědeckých dat a výsledků, maximalizuje využití přístrojů a urychluje analýzu dat, aby se vědci mohli přiblížit pravdě.

<h3>Přeneste svou laboratoř do nové éry konektivity s platformou Ardia</h3>Digitální transformace je cesta vedená snahou o zásadní zlepšení pracovních postupů v laboratořích s využitím nejnovějších pokroků v oblasti IT. Thermo Scientific™ Ardia™ Platform umožňuje laboratoři využívat stejné technologie.V době, kdy laboratoře nekompromisně usilují o efektivitu, roste poptávka po softwaru, který hladce propojuje data, přístroje a vědce.Platforma Ardia, vytvořená s využitím cloudové technologie, centralizuje informace včetně vědeckých dat a výsledků, maximalizuje využití přístrojů a urychluje analýzu dat, aby se vědci mohli přiblížit pravdě.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Thermo_Scientific_Ardia_Platform_2_4c83f21ef8.jpg" alt="Thermo Scientific Ardia Platform." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Thermo_Scientific_Ardia_Platform_2_4c83f21ef8.jpg 200w," sizes="100vw" width="1440" height="1127"><h5>Centralizace</h5>Revolučně změňte správu dat tím, že spojíte všechny zdroje, formáty a aplikace dat do jedné platformy. Díky centralizovaným datům získáte bezprecedentní kontrolu, dostupnost a efektivitu, což vám umožní s jistotou přijímat rozhodnutí založená na datech.<h5>Sjednocení</h5>Rozlučte se se složitou správou dat rozptýlených v různých systémech a na různých místech. Platforma Ardia se integruje s rostoucím seznamem softwarových nástrojů a aplikací pro přímý přístup k datům a automatizovaný přenos dat, což vám umožní využít sílu jednotné platformy a pomůže odstranit datová sila.<h5>Zefektivnění</h5>Eliminujte časově náročné manuální přenosy dat pomocí automatizovaných pracovních postupů prostřednictvím nástroje Data Sync platformy Ardia. Automaticky přenášejte data do úložiště a z úložiště pro aplikace, které ještě nejsou připojeny, aby se uživatelé mohli soustředit na to nejdůležitější.<h5>Spolupráce</h5>Spolupráce přesahuje rámec pouhé centralizace dat a integrace softwaru. Díky jediné platformě můžete snadno sdílet data, přistupovat k nim a spolupracovat na nich. Aktualizace dat v reálném čase, sdílené řídicí panely a nástroje pro spolupráci usnadňují efektivní týmovou práci, zrychlují časový harmonogram projektů a podporují inovace.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Thermo_Scientific_Ardia_Platform_57590fecf7.jpg" alt="Thermo Scientific Ardia Platform." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Thermo_Scientific_Ardia_Platform_57590fecf7.jpg 245w," sizes="100vw" width="1022" height="450">

Thermo Scientific™ BioPharma Finder™ Software pro charakterizaci bioterapeutik

Zjednodušte komplexní charakterizaci bioterapeutických atributů pomocí pokročilých funkcí, které zvyšují produktivitu a důvěryhodnost v propojeném prostředí.

Zjednodušte komplexní charakterizaci bioterapeutických atributů pomocí pokročilých funkcí, které zvyšují produktivitu a důvěryhodnost v propojeném prostředí.<h3>Klíčové výhody</h3><ul><li>Jistá charakterizace: Prozkoumejte řešení pro jistou charakterizaci sekvence animokyselin pomocí modulu Peptide Mapping Analysis s novým algoritmem predikce MS2.</li><li>Přizpůsobená podpora sekvencí nukleotidů: Využijte možnost vytvářet vlastní nukleotidové sekvence na podporu konfirmace pomocí modulu Oligonucleotide Analysis s vylepšeným modelem fragmentace MS2 (k dispozici v softwaru BioPharma Finder verze 5.3).</li><li>Efektivní zpracování dat: Pomocí modulu Intact Mass Analysis se můžete pohybovat v obrovském množství dat s pozoruhodnou efektivitou. Díky inovativním dekonvolučním algoritmům a funkcím můžete bez námahy vytvářet multikonzistentní zprávy, které poskytují komplexní přehled o výsledcích.</li><li>Bezkonkurenční průzkum modifikací a flexibilita: Modul Top-Down Analysis vám umožňuje prohledávat rozsáhlou škálu modifikací, a to i na úrovni jednotlivých píků. Díky několika režimům fragmentace a algoritmu zpracování napříč maticemi máte možnost podrobněji prozkoumat své vzorky.</li><li>Bezproblémová integrace: Zjistěte, jak snadné je přejít od sofistikované charakterizace pomocí softwaru BioPharma Finder k jisté kvantifikaci v <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/76">softwaru Chromeleon CDS</a> s výhodami přidanými <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/1821">platformou Ardia</a>, včetně propojení přístrojových dat, podpory globálního přístupu a centralizace zpráv BioPharma Finder.</li></ul>

Thermo Scientific™ Chromeleon™ XPS

Thermo Scientific™ Chromeleon™ XPS poskytuje zjednodušené a snadno použitelné rozhraní pro Thermo Scientific™ Chromeleon™ CDS, přičemž zachovává veškeré možnosti softwaru CDS.

V moderních laboratořích jsou velmi žádané chromatografické techniky a použití detekce pomocí hmotnostní spektrometrie (MS). Donedávna byly MS detektory považovány za sofistikované detekční nástroje, které mohl obsluhovat pouze vysoce kvalifikovaný odborník. V současné době se hmotnostní spektrometry stále častěji používají jako jednoduché detektory pro chromatografii.Současně s tímto přechodem k rutinnímu používání MS dochází k neustálému propouštění pracovníků v laboratořích, což způsobuje, že zkušených chromatografistů je nedostatek. Výsledkem je značný počet běžných vědeckých pracovníků a operátorů procesů, kteří musí sami generovat chromatografické výsledky pomocí pokročilé instrumentace.Řešením je nástroj s otevřeným přístupem, který uživatelům umožňuje jednoduše přijít a pomocí velmi jednoduchého rozhraní využít plný výkon systému chromatografických dat (CDS), aniž by museli používat samotný software CDS. Thermo Scientific™ Chromeleon™ XPS poskytuje toto zjednodušené a snadno použitelné rozhraní pro <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/76">Thermo Scientific™ Chromeleon™ CDS</a>, přičemž zachovává veškeré možnosti softwaru CDS, jako je ovládání přístroje, zpracování dat, reportování a nástroje pro zajištění shody.

Thermo Scientific LCQUAN Kvantitativní Software

LCQUAN je robustní software pro kvantitativní LC-MS/MS analýzy, navržený pro bioanalytické laboratoře. Splňuje 21 CFR Part 11 a podporuje kompletní správu dat ve vývoji léčiv.

<h4>Software splňující požadavky normy 21 CFR část 11 pro kvantitativní sběr a správu dat LC-MS/MS</h4>Kvantitativní software Thermo Scientific™ LCQUAN™ je robustní datový systém splňující regulační požadavky, který je přizpůsoben bioanalytickým laboratořím provádějícím LC-MS/MS analýzy. Software LCQUAN byl vyvinut v úzké spolupráci s odborníky z farmaceutického průmyslu a poskytuje všechny nástroje potřebné pro sběr, zpracování, kontrolu a bezpečné řízení kvantitativních dat v rámci globálních pracovních postupů vývoje léčiv.<h3>Klíčové vlastnosti</h3><h4>Soulad s předpisy</h4><ul><li>Plně vyhovuje požadavkům FDA 21 CFR část 11 pro elektronické záznamy a podpisy</li><li>Umožňuje bezpečné předkládání elektronických dokumentů regulačním orgánům, včetně FDA</li></ul><h4>Komplexní pracovní postup</h4><ul><li>Provádí uživatele krok za krokem procesem sběru, vývoje metod, kontroly dat, zpracování, reportování a exportu</li><li>Podporuje import sekvenčních informací z externích systémů</li><li>Zefektivňuje interakci s Thermo Scientific™ Watson LIMS™ pro bioanalytické studie v souladu s GLP</li></ul><h4>Bezpečné řízení dat</h4><ul><li>Umožňuje zpracování dat v síťových systémech, včetně zabezpečených vzdálených disků</li><li>Centralizované ukládání dat ve formě sešitů pro snadnou archivaci a vyhledávání</li><li>Víceúrovňová uživatelská oprávnění – od plného přístupu k systému až po režimy pouze pro čtení</li></ul><h4>Hladká integrace LIMS</h4><ul><li>Obousměrná komunikace s Watson LIMS usnadňuje sledování studií, kontrolu chromatogramů, audit a dodržování předpisů</li><li>Optimalizováno pro regulované farmaceutické pracovní postupy od objevu až po klinické zkoušky</li></ul><h4>Osvědčená platforma</h4><ul><li>Součást integrované sady řešení Thermo Scientific LC-MS/MS, včetně hmotnostních spektrometrů řady TSQ a technologie rozhraní FAIMS</li><li>Zajišťuje vysokou citlivost, robustnost a reprodukovatelnost regulovaných bioanalytických testů</li></ul>

Thermo Scientific TraceFinder Software

Software Thermo Scientific TraceFinder, poháněný výkonnou a intuitivní sadou nástrojů pro sběr a zpracování dat, poskytuje rychlý přístup k výsledkům a zvyšuje výkonnost celé laboratoře.

<h3>Zjednodušení vysokokapacitního screeningu a kvantifikace</h3>Software Thermo Scientific TraceFinder, poháněný výkonnou a intuitivní sadou nástrojů pro získávání a zpracování dat, poskytuje rychlý přístup k výsledkům a zvyšuje výkonnost celé laboratoře. Zvyšte svou produktivitu díky vestavěné inteligenci, kterou poskytuje software TraceFinder pro akvizici a zpracování dat.Inteligentní označování vzorků, flexibilní prohlížení dat a generování vlastních reportů odstraňuje překážky spojené s prohlížením dat a zjednodušuje analýzu vzorků v každém kroku procesu. Software TraceFinder umožňuje ovládání LC, LC/MS, LC/MS/MS a LC-HRMS systémů, jakož i IC a GC systémů. Toto ovládání pomáhá zefektivnit a standardizovat provozní postupy, minimalizovat požadavky na školení a zjednodušit provoz laboratoře.<h3>Hlavní výhody softwaru TraceFinder</h3><h5>Maximalizace produktivity</h5><ul><li>Možnost přizpůsobení, ať už se jedná o požadavek na analýzu nebo preferenci uživatele, umožňuje rychlejší a spolehlivější sestavení metody a přezkoumání dat.</li><li>Přizpůsobitelné uživatelské rozhraní umožňuje analytikům zobrazovat pouze požadované parametry dat a výstupy a ukládat ty, které nejsou potřebné.</li></ul><h5>Minimalizace rizika</h5><ul><li>Automatizované nástroje pro revizi dat, pro identifikaci složek nebo vzorků, které vyžadují další zkoumání, jsou nezbytné pro důvěru v kvalitu dat.</li><li>Díky vlastnímu označování, třídění a filtrování tabulek a přizpůsobitelným sestavám lze výsledky upřednostnit pomocí vizuálních pokynů, které umožňují zaměřit přezkum dat tam, kde je to nejvíce potřeba.</li></ul><h5>Podpora flexibility pracovních postupů</h5><ul><li>Díky řízení akvizice a zpracování dat pro systémy LC, GC, IC, QQQ a HRAM, lze pracovní postupy standardizovat v rámci jediného softwarového balíčku.</li><li>Používání jediného softwarového řešení v celé laboratoři umožňuje konsolidované školení a větší provozní flexibilitu díky zefektivnění procesů.</li></ul><h5>Zlepšení kvality</h5><ul><li>Screeningové testy těží ze zahrnutí a začlenění vysoce kvalitních spektrálních knihoven.</li><li>Plná integrace se špičkovou spektrální knihovnou mzVault s vysokým rozlišením MS2, stejně jako možnost používat vlastní knihovny, přináší vynikající možnosti vyhledávání a potvrzování a nejlepší kvalitu ve své třídě.</li></ul>

Produkty z kategorie Zpracování GC, LC a MS dat - strana 1

Mohlo by Vás zajímat

Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace

Waters VIZE 2025: Empower Method Validation Manager

Falšování potravin a jak ho odhalí analytická chemie?