Thermo Scientific™ SimGlycan™ Software

Urychlete charakterizaci komplexních glykanů pomocí softwaru SimGlycan™ od společnosti PREMIER Biosoft. Software SimGlycan zpracovává a interpretuje vícestupňová/sekvenční (MSⁿ) data produkovaná hmotnostními spektrometry Thermo Scientific™, což je schopnost nezbytná pro stanovení heterogenity glykanů a izomerních forem.

Software automaticky porovnává experimentální hmotnostní spektra s rozsáhlou databází a vytváří bodovaný seznam kandidátních struktur. 

Komplexní analýzy

• Podporuje všechny přístroje Thermo Scientific na bázi iontových pastí a Orbitrap™ provádějící charakterizaci glykanů
• Zpracovává data MSⁿ pro řešení heterogenity glykanů, vzorců větvení a izobarických struktur. K rozlišení strukturních izomerů glykanů může být zapotřebí až sedm úrovní fragmentace MS
• Obsahuje databázi více než 22500 glykanů pro zpracování a ověření struktur
• Poskytuje množství relevantních biologických informací pro pravděpodobnou strukturu glykanu, včetně třídy glykanu, reakce, cesty a enzymu
• Vyhledává glykany s různými chemickými deriváty používanými pro modifikace redukčních konců, a to i v případě, že daný derivát není v databázi k dispozici
• Charakterizuje sodné, lithné, hořečnaté, draselné a formiátové adukty a jejich kombinace, např. Na⁺ + H⁺, Li⁺ + H⁺ apod.
• Identifikuje složité glykosaminoglykanové struktury, i když jsou modifikovány substituenty, jako je sulfát, fosfát a ethanolamin
• Určuje zkřížené a dvojité glykosidické štěpení pomocí kombinace permethylderivatizace a MSⁿ dat

Výkonné podávání reportů

• Vytváří reporty, které obsahují charakteristiky glykanů, jako je ID, sekvence, název, složení, hmotnost, prekurzorový ion m/z, třída, reakce, cesta, obraz glykanu a teoretické fragmenty s odpovídajícími hodnotami hmotnosti a m/z
• Exportuje obrázky glykanových struktur, fragmentů a spekter jako soubory JPEG nebo PNG