CHARACTERIZATION OF DIFFERENTIAL METABOLITES OF TIENILIC ACID AND ITS 3-THIOPHENE ISOMER WITH ION MOBILITY ENABLED MASS SPECTROMETRY
Postery | 2019 | WatersInstrumentace
Tienilová kyselina (TA) a její 3-thiophenový izomer (TAI) představují farmakologicky významné sloučeniny s rozdílnými mechanismy hepatotoxicity. Vymezení jejich metabolických cest je klíčové pro pochopení jejich toxikologického profilu a pro vývoj bezpečnějších terapeutik. Využití vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie v kombinaci s iontovou mobilitou navíc umožňuje přesnější identifikaci a strukturální charakterizaci metabolitů.
Hlavním cílem bylo prokázat schopnost HRMS-IMS detekovat společné i odlišné metabolity TA a TAI v moči potkanů po jednorázové intravenózní dávce. Součástí bylo také ověření shody experimentálně naměřených CCS hodnot s predikcemi z modelu strojového učení pro podporu strukturálních návrhů.
Vzorky moči od Sprague-Dawley potkanů po aplikaci 250 mg/kg TA nebo TAI byly odebírány ve 2, 6 a 24 hodinách.
Zpracování:
Chromatografie:
Hmotnostní spektrometrie a iontová mobilita:
Byly identifikovány běžné biotransformace obou látek (hydroxylace, konjugace s glycinem, glukuronidace, acetylace). U TAI se navíc objevily unikátní cysteinové konjugáty, svědčící o tvorbě reaktivních meziproduktů. Porovnání experimentálních CCS hodnot s predikcemi z hybridního ML modelu ukázalo vynikající korelaci (průměrná odchylka ~1,74 %), což potvrzuje validitu navržených struktur metabolitů.
Metoda HRMS-IMS s podporou prediktivních CCS hodnot nabízí:
Očekává se rozšíření strojového učení pro predikci CCS u širší škály xenobiotik a jejich metabolitů. Integrace IMS s DIA režimy a dalšími dimensiony separace může dále zvýšit hloubku metabolomických i toxikologických studií a podpoří vývoj bezpečnějších léčiv.
Studie prokázala efektivitu kombinace HRMS a IMS pro detailní charakterizaci metabolitů TA a TAI. Unikátní metabolomy TAI byly identifikovány díky cysteinovým konjugátům a validovány souborem expertních a prediktivních CCS hodnot. Tento přístup rozšiřuje možnosti strukturální klarifikace v toxikologickém výzkumu.
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Tienilová kyselina (TA) a její 3-thiophenový izomer (TAI) představují farmakologicky významné sloučeniny s rozdílnými mechanismy hepatotoxicity. Vymezení jejich metabolických cest je klíčové pro pochopení jejich toxikologického profilu a pro vývoj bezpečnějších terapeutik. Využití vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie v kombinaci s iontovou mobilitou navíc umožňuje přesnější identifikaci a strukturální charakterizaci metabolitů.
Cíle a přehled studie
Hlavním cílem bylo prokázat schopnost HRMS-IMS detekovat společné i odlišné metabolity TA a TAI v moči potkanů po jednorázové intravenózní dávce. Součástí bylo také ověření shody experimentálně naměřených CCS hodnot s predikcemi z modelu strojového učení pro podporu strukturálních návrhů.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky moči od Sprague-Dawley potkanů po aplikaci 250 mg/kg TA nebo TAI byly odebírány ve 2, 6 a 24 hodinách.
Zpracování:
- Ředění vzorků vodou (poměr 9:1).
Chromatografie:
- UPLC ACQUITY I-Class s kolonkou HSS T3 (1,8 μm).
- Mobilní fáze A: 0,1 % kyselina mravenčí ve vodě, B: 0,1 % kyselina mravenčí v acetonitrilu.
- Doba běhu 12 minut.
Hmotnostní spektrometrie a iontová mobilita:
- Vion IMS QTof, ionizace ESI+.
- LE kolize 6 eV, HE ramp 35–55 eV.
- Rozsah měření 50–1200 m/z, driftový plyn N2, rychlost vlny 250 m/s, výška rampy 20–55 V.
Hlavní výsledky a diskuse
Byly identifikovány běžné biotransformace obou látek (hydroxylace, konjugace s glycinem, glukuronidace, acetylace). U TAI se navíc objevily unikátní cysteinové konjugáty, svědčící o tvorbě reaktivních meziproduktů. Porovnání experimentálních CCS hodnot s predikcemi z hybridního ML modelu ukázalo vynikající korelaci (průměrná odchylka ~1,74 %), což potvrzuje validitu navržených struktur metabolitů.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda HRMS-IMS s podporou prediktivních CCS hodnot nabízí:
- Rychlou a spolehlivou identifikaci metabolitů v komplexních biologických maticích.
- Silnou podporu strukturálním návrhům díky validaci geometrie iontů v plynném stavu.
- Možnost rozlišit isomerní a reaktivní metabolické produkty.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření strojového učení pro predikci CCS u širší škály xenobiotik a jejich metabolitů. Integrace IMS s DIA režimy a dalšími dimensiony separace může dále zvýšit hloubku metabolomických i toxikologických studií a podpoří vývoj bezpečnějších léčiv.
Závěr
Studie prokázala efektivitu kombinace HRMS a IMS pro detailní charakterizaci metabolitů TA a TAI. Unikátní metabolomy TAI byly identifikovány díky cysteinovým konjugátům a validovány souborem expertních a prediktivních CCS hodnot. Tento přístup rozšiřuje možnosti strukturální klarifikace v toxikologickém výzkumu.
Reference
- Bonierbale E. et al. Chem. Res. Toxicol. 1999;286–296.
- Coen M. et al. Chem. Res. Toxicol. 2012;2412–2422.
- King A. et al. J. Chromatogr. B. 2018;142–148.
- Grant I. Thesis, Computational and Systems Medicine, Imperial College London, 2016.
- Bouwmeester R. ASMS proceedings, 2019.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
ION MOBILITY-ENABLED METABOLITE IDENTIFICATION OF TIENILIC ACID AND TIENILIC ACID ISOMER
2019|Waters|Postery
ION MOBILITY-ENABLED METABOLITE IDENTIFICATION OF TIENILIC ACID AND TIENILIC ACID ISOMER Lauren Mullin1, Giorgis Isaac1, Ian Wilson2, Gordon Murray3, Nathan Anderson1, Robert Plumb1 1 Waters Corporation, 34 Maple St, Milford, MA 01757 Computational and Systems Medicine, Imperial College, London UK…
Klíčová slova
hydroxylation, hydroxylationtai, taitienilic, tienilicccs, ccsglucuronidation, glucuronidationconjugation, conjugationacetylation, acetylationmetabolites, metabolitesmetabolite, metabolitedealkylation, dealkylationcommon, commonsvr, svrthiophene, thiophenemethylation, methylationacid
Ion Mobility-Enabled Metabolite Identification of Tienilic Acid and Tienilic Acid Isomer Using Mass-MetaSite and WebMetabase
2020|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] Ion Mobility-Enabled Metabolite Identification of Tienilic Acid and Tienilic Acid Isomer Using Mass-MetaSite and WebMetabase Lauren Mullin, 1 Giorgis Isaac, 1 Ian Wilson, 2 Adam King, 3 Nathan Anderson, 1 Russell Mortishire-Smith, 3 Robert Plumb 1…
Klíčová slova
tienilic, tienilicwebmetabase, webmetabasemetasite, metasiteacid, acidmobility, mobilityisomer, isomerims, imsmass, massmetabolite, metabolitevion, vionunifi, unifienabled, enabledtai, taiion, ionqtof
Metabolite Identification: Working with Large Preclinical Multispecies Data Sets
2017|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] Metabolite Identification: Working with Large Preclinical Multispecies Data Sets Mark Wrona, 1 Sherri Naughton, 1 Yun Alelyunas, 1 Russell Mortishire-Smith, 2 and Jayne Kirk 2 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA 2 Waters Corporation, Wilmslow, UK…
Klíčová slova
mobility, mobilitymetabolite, metabolitevion, vionims, imsmetabolites, metaboliteshrms, hrmsapplication, applicationion, ionnote, noteqtof, qtofbiotransformation, biotransformationtools, toolspreclinical, preclinicalidentification, identificationdrug
Integrating Ion Mobility into Routine Drug Metabolite Identification Studies Using the Vion IMS QTof Mass Spectrometer
2017|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] Integrating Ion Mobility into Routine Drug Metabolite Identification Studies Using the Vion IMS QTof Mass Spectrometer Jayne Kirk, 1 Russell Mortishire-Smith, 1 and Mark Wrona 2 1 Waters Corporation, Wilmslow, UK 2 Waters Corporation, Milford, MA,…
Klíčová slova
ims, imsvion, vionmobility, mobilityqtof, qtofmetabolite, metaboliteintegrating, integratingion, ionroutine, routineccs, ccsstudies, studiesidentification, identificationdrug, drugspectrometer, spectrometernefazodone, nefazodonemetabolites