ION MOBILITY-ENABLED METABOLITE IDENTIFICATION OF TIENILIC ACID AND TIENILIC ACID ISOMER
Postery | 2019 | WatersInstrumentace
Ion mobility separace spojená s vysokým rozlišením hmotnostní spektrometrie hraje klíčovou roli v identifikaci a strukturálním potvrzení metabolitů, zejména u sloučenin s halogeny jako tienolidová kyselina a její isomer, které se liší mechanismy hepatotoxicity.
Ion mobility HRMS se osvědčila jako efektivní přístup pro detailní charakterizaci a potvrzení struktur metabolitů tienolidové kyseliny a jejího isomeru. Hybridní model CCS zvyšuje důvěru v identifikaci, což přispívá k rychlejší validaci metabolických profilů v toxikologii.
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Ion mobility separace spojená s vysokým rozlišením hmotnostní spektrometrie hraje klíčovou roli v identifikaci a strukturálním potvrzení metabolitů, zejména u sloučenin s halogeny jako tienolidová kyselina a její isomer, které se liší mechanismy hepatotoxicity.
Cíle a přehled studie / článku
- Analyzovat metabolické dráhy tienolidové kyseliny (TA) a jejího isomeru (TAI) v moči potkanů po dávkách ve 2, 6 a 24 hodinách.
- Využít kombinaci LC-HRMS a ion mobility separation pro identifikaci a kvantifikaci metabolitů.
- Srovnat experimentálně získané hodnoty collision cross section (CCS) s predikcemi z ML modelů SVR a hybridního gradient boosting modelu.
Použitá metodika a instrumentace
- Chromatografie: ACQUITY UPLC I-Class s kolonnou HSS T3 1.8 µm, gradient 0.1% kyselina mravenčí ve vodě a acetonitrilu.
- MS: Vion IMS QTof, ESI+, LE 6 eV, HE ramp 35–55 eV, rozsah 50–1200 m/z, proud N2 jako drift plyn.
- Data processing: UNIFI Scientific Information System, WebMetabase, CCS predikční modely (SVR a hybrid).
Hlavní výsledky a diskuse
- Identifikováno několik klíčových metabolitů včetně hydroxylace, O-dealkylace, acetylace, glukuronidace, konjugací s glycinem a unikátní cysteinové konjugace u TAI.
- Halogenové izotopové vzory a charakteristické fragmenty usnadnily lokalizaci modifikací na molekulách.
- Experimentální CCS hodnoty ukázaly silnou korelaci s predikcemi, kde hybridní model dosáhl R2≈0.96 oproti SVR modelu.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšená jistota v strukturálním potvrzení metabolitů díky kombinaci IMS a MS/MS.
- Rychlejší a cílenější identifikace metabolitů pro toxikologický výzkum a vývoj léčiv.
- Možnost aplikace v QA/QC laboratořích pro sledování metabolitů i stopových látek.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Další zdokonalování ML modelů pro přesnější CCS predikci a strukturální návrh.
- Integrace IMS s datově nezávislou akvizicí (DIA) pro komplexnější profilaci metabolitů.
- Rozšíření na lidské klinické vzorky a farmakokinetické studie.
Závěr
Ion mobility HRMS se osvědčila jako efektivní přístup pro detailní charakterizaci a potvrzení struktur metabolitů tienolidové kyseliny a jejího isomeru. Hybridní model CCS zvyšuje důvěru v identifikaci, což přispívá k rychlejší validaci metabolických profilů v toxikologii.
Reference
- Bonierbale E. et al. Chem Res Toxicol 1999, 286–296.
- Coen M. et al. Chem Res Toxicol 2012, 2412–2422.
- King A. et al. J Chrom B 2018, 142–148.
- Grant I. Thesis, Imperial College London, 2016.
- Zhou Z. et al. J CBPA 2018, 34–41.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
CHARACTERIZATION OF DIFFERENTIAL METABOLITES OF TIENILIC ACID AND ITS 3-THIOPHENE ISOMER WITH ION MOBILITY ENABLED MASS SPECTROMETRY
2019|Waters|Postery
CHARACTERIZATION OF DIFFERENTIAL METABOLITES OF TIENILIC ACID AND ITS 3-THIOPHENE ISOMER WITH ION MOBILITY ENABLED MASS SPECTROMETRY Lauren Mullin1, Giorgis Isaac1, Adam King1, Ian Wilson2, Muireann Coen2, Nathan Anderson1, Robert Plumb1 1 Waters Corporation, 34 Maple St, Milford, MA 01757…
Klíčová slova
tai, taihydroxylation, hydroxylationglucuronidation, glucuronidationconjugation, conjugationdihydro, dihydrotienilic, tienilicbiotransformations, biotransformationsadministered, administeredcleavage, cleavagecysteinyl, cysteinylccs, ccsglycine, glycinehydroxylated, hydroxylatedacetylation, acetylationhybrid
Ion Mobility-Enabled Metabolite Identification of Tienilic Acid and Tienilic Acid Isomer Using Mass-MetaSite and WebMetabase
2020|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] Ion Mobility-Enabled Metabolite Identification of Tienilic Acid and Tienilic Acid Isomer Using Mass-MetaSite and WebMetabase Lauren Mullin, 1 Giorgis Isaac, 1 Ian Wilson, 2 Adam King, 3 Nathan Anderson, 1 Russell Mortishire-Smith, 3 Robert Plumb 1…
Klíčová slova
tienilic, tienilicwebmetabase, webmetabasemetasite, metasiteacid, acidmobility, mobilityisomer, isomerims, imsmass, massmetabolite, metabolitevion, vionunifi, unifienabled, enabledtai, taiion, ionqtof
Metabolite Identification: Working with Large Preclinical Multispecies Data Sets
2017|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] Metabolite Identification: Working with Large Preclinical Multispecies Data Sets Mark Wrona, 1 Sherri Naughton, 1 Yun Alelyunas, 1 Russell Mortishire-Smith, 2 and Jayne Kirk 2 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA 2 Waters Corporation, Wilmslow, UK…
Klíčová slova
mobility, mobilitymetabolite, metabolitevion, vionims, imsmetabolites, metaboliteshrms, hrmsapplication, applicationion, ionnote, noteqtof, qtofbiotransformation, biotransformationtools, toolspreclinical, preclinicalidentification, identificationdrug
APPLICATION NOTEBOOK - STRUCTURAL ELUCIDATION
2015|Waters|Příručky
[ APPLICATION NOTEBOOK ] STRUCTURAL ELUCIDATION 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Traditional Herbal Medicine Structural Elucidation using SYNAPT HDMS with Time-Aligned Parallel…
Klíčová slova
mobility, mobilityorientin, orientinhdms, hdmsccs, ccswave, waveims, imsflavonoids, flavonoidsion, ionstructural, structuralelucidation, elucidationherbal, herbalsynapt, synaptisoorientin, isoorientinions, ionstof