LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Ion Mobility-Enabled Metabolite Identification of Tienilic Acid and Tienilic Acid Isomer Using Mass-MetaSite and WebMetabase

Aplikace | 2020 | WatersInstrumentace
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Metabolomika
Výrobce
Waters

Souhrn

Význam tématu


Analýza metabolitù léčiv poskytuje klíčové informace o mechanismu biotransformace a potenciálních toxických metabolitech. Využití vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie doplněné iontovou mobilitou umožňuje zlepšenou specifičnost, retrospektivní analýzu a spolehlivou identifikaci metabolitù, které by mohly ovlivnit bezpečnost a účinnost léčivých látek.

Cíle a přehled studie


Cílem aplikacní studie bylo demonstrovat workflow pro rychlou identifikaci metabolitù tienicové kyseliny (TA) a její isomerické nebezpecné formy (TAI) v moči potkanù po intravenózním podání. Studie provázela zisk dat pomocí LC-IMS-HRMS a jejich hromadné zpracování v softwaru Mass-MetaSite a WebMetabase za účelem porovnání metabolických profilù obou strukturálně príbuzných sloucenin.

Použitá metodika a instrumentace


Pro separaci byl použit systém ACQUITY UPLC I-Class PLUS a kolona HSS T3. Analytický separacní gradient kombinoval vodu a acetonitril s formicnou kyselinou při prutoku 0,5 mL/min. Detekce probíhala na Vion IMS QTof s technikou HDMSE (data-independent acquisition se synchronizací driftového casu). Iontová mobilita byla kalibrována pro výpočet kolizních průrezu CCS. Pro zpracování dat sloužil UNIFI Scientific Information System ve verzi 1.9.4 a následne vendor-neutralní software Mass-MetaSite a WebMetabase (verze 4.0.1) pro automatizovanou identifikaci a vizualizaci metabolitù.

Hlavní výsledky a diskuse


  • Spolehlivá detekce a potvrzení hydroxylace (M+16) pro TA i TAI, v souladu s publikovanými studiemi.
  • Identifikace glukuronidových konjugátu TA: hydroxylace + glukuronidace (M+192) a ketoredukce + glukuronidace (M+178).
  • Přítomnost neobvyklé acetylace a hydroxylace (M+58) u TA potvrzená fragmenty thiophenu.
  • Pro TAI unikátní N-acetylcysteinová konjugace po redukci (M+163) detekovaná ve vzorcích 6 hodin po podání.
  • Iontová mobilita umožnila rozlišení dvou glukuronidů s téměř identickými retenčními casy (diference 0,66 %) díky odlišným CCS hodnotám (průměrná diference 2,58 %), což zvyšuje jistotu identifikace i pri možné zmene chromatografie.

Přínosy a praktické využití metody


Implementace HDMSE a iontové mobility zvyšuje analytickou specifičnost zejména pri koelujících slouceninách a zajištuje čisté drift-zarovnané spektra. Automatizované hromadné zpracování v Mass-MetaSite a WebMetabase umožňuje rychlé porovnání metabolických drah vícerých látek a retrospektivní analýzu, když se objeví nové analytické otázky.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Rozšíření CCS databází pro více typù metabolitù a komodit.
  • Integrace strojového ucení pro predikci míst biotransformace a potvrzení struktur.
  • Cloudové platformy pro kolaborativní sdílení a prohlížení detailních HDMSE dat.
  • Vyšší throughput v režimu online real-time screening metabolitù.

Závěr


Studie ukázala efektivní workflow kombinující UPLC-IMS-HRMS a pokročilé softwarové nástroje pro identifikaci metabolitù tienicové kyseliny a její isomerické formy. Iontová mobilita a CCS doplňují m/z a RT jako nezávislý parametr, což zvyšuje robustnost a spolehlivost metabolitických studií.

Reference


  1. Bonierbale E et al. Chemical Research in Toxicology 1999;12:286–296.
  2. Coen M et al. Chemical Research in Toxicology 2012;25:2412–2422.
  3. Rademacher PM. Diss. University of Washington, 2011.
  4. Dansette PM et al. Biochemical Pharmacology 1990;39:911–918.
  5. Grant IJ. Imperial College London, 2016.
  6. King AM et al. Journal of Chromatography B 2018;1087:142–148.
  7. Schadt S et al. Drug Metabolism and Disposition 2018;46:865–878.
  8. Paglia G et al. Analytical Chemistry 2014;87:1137–1144.
  9. Kirk J et al. Waters Application Note 2018.
  10. Nye LC et al. Journal of Chromatography A 2019.
  11. Righetti L et al. Analytica Chimica Acta 2018;1014:50–57.
PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
ION MOBILITY-ENABLED METABOLITE IDENTIFICATION OF TIENILIC ACID AND TIENILIC ACID ISOMER
ION MOBILITY-ENABLED METABOLITE IDENTIFICATION OF TIENILIC ACID AND TIENILIC ACID ISOMER Lauren Mullin1, Giorgis Isaac1, Ian Wilson2, Gordon Murray3, Nathan Anderson1, Robert Plumb1 1 Waters Corporation, 34 Maple St, Milford, MA 01757 Computational and Systems Medicine, Imperial College, London UK…
Klíčová slova
hydroxylation, hydroxylationtai, taitienilic, tienilicccs, ccsconjugation, conjugationglucuronidation, glucuronidationacetylation, acetylationmetabolites, metabolitesmetabolite, metabolitedealkylation, dealkylationcommon, commonthiophene, thiophenesvr, svrmethylation, methylationacid
Somatostatin Analogue Catabolite Screening and Identification  Using Vion IMS QTof with WebMetabase
[ APPLICATION NOTE ] Somatostatin Analogue Catabolite Screening and Identification Using Vion IMS QTof with WebMetabase Mark D. Wrona, 1 Jayne M. Kirk, 4 Ismael Zamora, 2 Tatiana Radchenko, 2 Anna Escola, 3 Antoni Riera, 3 Russell J. Mortishire-Smith4 Waters…
Klíčová slova
webmetabase, webmetabasesomatostatin, somatostatinvion, vioncatabolite, cataboliteims, imsmetasite, metasiteqtof, qtofanalogue, analoguemobility, mobilitypeptide, peptideidentification, identificationdata, datahelm, helmscreening, screeningenabled
Metabolite Identification of Complex Cyclic Peptides Using WebMetabase, Ion Mobility-Enabled DIA, and Product Ion Confirmation
[ APPLICATION NOTE ] Metabolite Identification of Complex Cyclic Peptides Using WebMetabase, Ion Mobility-Enabled DIA, and Product Ion Confirmation Mark Wrona Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■ Ability to screen metabolism from The incorporation of unnatural amino acids,…
Klíčová slova
dalbavancin, dalbavancindaptomycin, daptomycinhdms, hdmslanreotide, lanreotideyes, yesims, imsmetasite, metasitemsms, msmsvion, vionquanrecovery, quanrecoveryhdmse, hdmsewmb, wmbnote, noteapplication, applicationwebmetabase
ROUTINE METABOLITE IDENTIFICATION FOR COMPLEX PEPTIDES BASED ON IMS ENABLED QTOF DIA DATA ACQUISITION AND MASS-METASITE DATA PROCESSING
ROUTINE METABOLITE IDENTIFICATION FOR COMPLEX PEPTIDES BASED ON IMS ENABLED QTOF DIA DATA ACQUISITION AND MASS-METASITE DATA PROCESSING Authors: Yun W. Alelyunas, Nathan Anderson, Mark D. Wrona Affiliations: Waters Corporation, Milford, MA, USA INTRODUCTION In therapeutic peptide drug discovery and…
Klíčová slova
webmetabase, webmetabasemetasite, metasiteims, imsdalbavancin, dalbavancindaptomycin, daptomycinpeptides, peptidesenabled, enableddata, datacyclic, cyclicoritavancin, oritavancinhdmse, hdmselanreotide, lanreotidepeptide, peptideanidulafungin, anidulafunginccs
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.