Multiple ion chromatogram (MIC) for direct quantification of intact proteins using Q-TOF mass spectrometry
Aplikace | 2020 | ShimadzuInstrumentace
Přímá kvantifikace intaktních proteinů hraje klíčovou roli při výrobě, charakterizaci a klinickém výzkumu proteinových produktů. Tradiční metody založené na enzymatickém štěpení jsou časově náročné a mohou vést ke ztrátě informací o kompletní struktuře proteinu. Metoda multiple ion chromatogram (MIC) využívající Q-TOF MS nabízí rychlý, citlivý a přímý přístup k měření intactních proteinů bez nutnosti předchozího trávení.
Cílem této studie bylo vyvinout, optimalizovat a ověřit MIC na systému Shimadzu LCMS-9030 Q-TOF pro přímou kvantifikaci vybraných intactních proteinů. Studie se zaměřila na:
Separace proběhla na koloně ProteCol-G C8 (100 × 2,1 mm, 3 µm) s gradientem 20–80 % acetonitrilu v 0,1 % TFA. Analýza byla provedena na LCMS-9030 Q-TOF s horkou ESI ionizací (300 °C, interface 4 kV) a detekcí v m/z 1000–3500 v režimu pozitivních iontů.
Metoda dosáhla vysoké liniarity (R² > 0,997) v rozsahu 5–200 µg/mL pro většinu proteinů (20–200 µg/mL pro některé glykoformy, 2–50 µg/mL pro inzulín). LOD se pohybovaly mezi 0,32–5,40 µg/mL a LOQ mezi 1,13–17,99 µg/mL. Přesnost (RSD < 15 %) a věrnost (chyba < 20 %) byly v rámci akceptovatelných mezí. V séru a moči byl zaznamenán signifikantní iontový enhancement, což vyžaduje průběžné monitorování matrických efektů.
Očekává se rozšíření na multiplexní kvantifikaci více proteinů v komplexních matricích, implementace automatizace přípravy vzorků a vývoj pokročilých softwarových nástrojů pro zpracování dat. Další perspektivou je kombinace MIC s doplňkovými detekčními technikami (UV, fluorescence) a rozšíření na analýzu posttranslačních modifikací.
Metoda MIC na LCMS-9030 Q-TOF představuje efektivní, citlivý a přímý přístup ke kvantifikaci intactních proteinů. Splňuje požadavky na linearitu, citlivost, přesnost a precizitu a je vhodná pro rutinní implementaci v bioprocesní kontrole kvality a klinickém výzkumu.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníProteomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Přímá kvantifikace intaktních proteinů hraje klíčovou roli při výrobě, charakterizaci a klinickém výzkumu proteinových produktů. Tradiční metody založené na enzymatickém štěpení jsou časově náročné a mohou vést ke ztrátě informací o kompletní struktuře proteinu. Metoda multiple ion chromatogram (MIC) využívající Q-TOF MS nabízí rychlý, citlivý a přímý přístup k měření intactních proteinů bez nutnosti předchozího trávení.
Cíle a přehled studie
Cílem této studie bylo vyvinout, optimalizovat a ověřit MIC na systému Shimadzu LCMS-9030 Q-TOF pro přímou kvantifikaci vybraných intactních proteinů. Studie se zaměřila na:
- výběr standardních proteinů (ribonukleáza B s pěti glykoformami, lysozym, β-laktoglobulin A, inzulín),
- optimalizaci chromatografických a spektrometrických podmínek,
- stanovení liniarity, citlivosti, přesnosti, precizity a matrických efektů v séru a moči.
Použitá metodika a instrumentace
Separace proběhla na koloně ProteCol-G C8 (100 × 2,1 mm, 3 µm) s gradientem 20–80 % acetonitrilu v 0,1 % TFA. Analýza byla provedena na LCMS-9030 Q-TOF s horkou ESI ionizací (300 °C, interface 4 kV) a detekcí v m/z 1000–3500 v režimu pozitivních iontů.
- Průtok: 0,3 mL/min, vstřik: 5 µL,
- plyny: N₂ pro nebulizaci (3 L/min) a sušení (15 L/min),
- teploty: interface 300 °C, heat block 400 °C, DL 250 °C,
- výběr iontů: tři nejintenzivnější středy nabití (+6, +7, +8) s tolerancí 5 ppm pro MIC.
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda dosáhla vysoké liniarity (R² > 0,997) v rozsahu 5–200 µg/mL pro většinu proteinů (20–200 µg/mL pro některé glykoformy, 2–50 µg/mL pro inzulín). LOD se pohybovaly mezi 0,32–5,40 µg/mL a LOQ mezi 1,13–17,99 µg/mL. Přesnost (RSD < 15 %) a věrnost (chyba < 20 %) byly v rámci akceptovatelných mezí. V séru a moči byl zaznamenán signifikantní iontový enhancement, což vyžaduje průběžné monitorování matrických efektů.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá přímá analýza intactních proteinů bez potřeby štěpení,
- vysoká citlivost a selektivita díky kombinaci více nabitých forem,
- aplikace v QA/QC biotechnologických procesů i klinickém výzkumu,
- možnost sledování dynamiky proteinů v reálných matricích.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření na multiplexní kvantifikaci více proteinů v komplexních matricích, implementace automatizace přípravy vzorků a vývoj pokročilých softwarových nástrojů pro zpracování dat. Další perspektivou je kombinace MIC s doplňkovými detekčními technikami (UV, fluorescence) a rozšíření na analýzu posttranslačních modifikací.
Závěr
Metoda MIC na LCMS-9030 Q-TOF představuje efektivní, citlivý a přímý přístup ke kvantifikaci intactních proteinů. Splňuje požadavky na linearitu, citlivost, přesnost a precizitu a je vhodná pro rutinní implementaci v bioprocesní kontrole kvality a klinickém výzkumu.
Reference
- Mao Y, Moore RJ, Wagnon KB, Pierce JT, Debban KH, Smith CS, Dill JA, Fuciarelli AF, Analysis of α2u-globulin in rat urine and kidneys by liquid chromatography-electrospray ionization mass spectrometry, Chem. Res. Toxicol. 11 (1998): 953-961.
- Wang EH, Combe PC, Schug KA, Multiple Reaction Monitoring for Direct Quantitation of Intact Proteins Using a Triple Quadrupole Mass Spectrometer, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 27 (2016): 886-896.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Direct Quantitation of Intact Proteins By Multiple Ion Chromatogram Method on Q-TOF Mass Spectrometer
2019|Shimadzu|Aplikace
Application News Protein Quantitation / LCMS-9030 Direct Quantitation of Intact Proteins By Multiple Ion Chromatogram Method on Q-TOF Mass Spectrometer No. AD-0192 Yonghai Lu and Zhaoqi Zhan Application Development & Support Centre, Shimadzu (Asia Pacific), Singapore ❑ Introduction With the…
Klíčová slova
ave, averibonuclease, ribonucleaselysozyme, lysozymemic, micinsulin, insulinloq, loqlactoglobulin, lactoglobulinintact, intactproteins, proteinssuperposed, superposedarea, arealga, lganews, newscharged, chargedmultiple
Developing High Resolution HILIC Separations of Intact Glycosylated Proteins Using a Wide-Pore Amide-Bonded Stationary Phase
2015|Waters|Aplikace
Developing High Resolution HILIC Separations of Intact Glycosylated Proteins Using a Wide-Pore Amide-Bonded Stationary Phase Matthew A. Lauber, Scott A. McCall, Bonnie A. Alden, Pamela C. Iraneta, and Stephan M. Koza Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L…
Klíčová slova
hilic, hilicamide, amideintact, intactbeh, behseparations, separationspore, poreglycosylated, glycosylatedbonded, bondedstationary, stationaryrnase, rnaseglycoprotein, glycoproteinphase, phasedeveloping, developingproteins, proteinsglycan
No. SSI-LCMS-116 Liquid Chromatography Mass Spectrometry No. LCMS-116 N-Linked Glycans Analysis of Monoclonal Antibodies, Biosimilars, and Glycoproteins with High Resolution Mass Spectrometry and Fluorescence Detection using Restek’s Raptor Polar X Column and Protein Metrics’ Software Suite ■ Introduction Therapeutic antibodies…
Klíčová slova
asn, asnglycans, glycansglycan, glycandetached, detachedavastin, avastinmannose, mannoseraptor, raptorlinked, linkedglcnac, glcnacrestek, restekrnaseb, rnasebreleased, releasedmetrics, metricspolar, polarfluorescence
Characterization of the Interactions Between High Mannose Glycans and a Novel Prokaryotic Lectin Using Mass Spectrometry-Based Approaches
2025|Waters|Postery
CHARACTERIZATION OF THE INTERACTIONS BETWEEN HIGH MANNOSE GLYCANS AND A NOVEL PROKARYOTIC LECTIN USING MASS SPECTROMETRY-BASED APPROACHES Lindsay Morrison, Johnny Zhu, and Kevin Wyndham Waters Corporation, Milford, MA RESULTS: CAR-MS Characterize the specificity, affinity constants, and kinetics of the binding…
Klíčová slova
glycan, glycanrpl, rplmannose, mannoseglycans, glycanslectin, lectinlectins, lectinsconstants, constantscomplexes, complexesdissociation, dissociationcatch, catchbinding, bindingglycoform, glycoformrelease, releasewere, wererelatively