Peptide Mapping of Monoclonal Antibody (mAb) Using LCMS-9030 (Q-TOF) Mass Spectrometerwith a Shim-pack GISS-HP Column
Aplikace | 2019 | ShimadzuInstrumentace
Monoklonální protilátky představují významnou třídu bioterapeutik, která vyžaduje precizní kontrolu kvality. Peptidové mapování umožňuje potvrdit primární strukturu protilátky, ověřit chemické modifikace i konzistenci výrobního procesu.
Cílem práce bylo zkrátit dobu běhu peptidového mapování monoklonální protilátky (biosimilárního bevacizumabu) z původních 120 minut na pouhých 45 minut a zároveň zachovat úplné pokrytí aminokyselinové sekvence. K provedení optimalizace byla použita kombinace UHPLC systému Nexera X2 a kvadrupólového časově-oflightového (Q-TOF) hmotnostního spektrometru LCMS-9030.
Vzorek biosimilárního bevacizumabu (5 mg/mL) byl připraven v 50 mM Tris-HCl (pH 8,0) a podroben denaturaci, redukci (DTT) a alkylaci (iodoacetamid). Po naředění následovala noční trypsinová digesce při 37 °C a zastavení kyselinou trifluoroctovou. Analýza probíhala na:
Díky úpravě gradientního programu a použití UHPLC kolony se doba analýzy snížila ze 120 minut na 45 minut. Opakovatelnost retence (<0,1 % RSD) a ploch vrcholu (<3 % RSD) byla výborná. Celkem bylo identifikováno 19 peptidů z lehkého a 42 peptidů z těžkého řetězce. Měřené hmotnosti se od teoretických lišily o méně než 3 ppm. Dosáhnuto bylo 100 % pokrytí sekvence lehkého řetězce a 99,8 % u těžkého, přičemž jedinou odchylkou bylo ořezání C-terminální lysinu u jednoho peptidu.
Optimalizovaný postup nabízí:
V budoucnu lze očekávat integraci s automatizovanými platformami, využití multiplexních značkovačů pro kvantitativní analýzu a rozšíření aplikace na monitorování posttranslačních modifikací v reálném čase.
Studie prokázala, že kombinace UHPLC Nexera X2 a LCMS-9030 Q-TOF umožňuje rychlé, reprodukovatelné a vysoce přesné peptidové mapování mAb s praktickým významem pro vývoj biosimilárů a kontrolu kvality.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Monoklonální protilátky představují významnou třídu bioterapeutik, která vyžaduje precizní kontrolu kvality. Peptidové mapování umožňuje potvrdit primární strukturu protilátky, ověřit chemické modifikace i konzistenci výrobního procesu.
Cíle a přehled studie
Cílem práce bylo zkrátit dobu běhu peptidového mapování monoklonální protilátky (biosimilárního bevacizumabu) z původních 120 minut na pouhých 45 minut a zároveň zachovat úplné pokrytí aminokyselinové sekvence. K provedení optimalizace byla použita kombinace UHPLC systému Nexera X2 a kvadrupólového časově-oflightového (Q-TOF) hmotnostního spektrometru LCMS-9030.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorek biosimilárního bevacizumabu (5 mg/mL) byl připraven v 50 mM Tris-HCl (pH 8,0) a podroben denaturaci, redukci (DTT) a alkylaci (iodoacetamid). Po naředění následovala noční trypsinová digesce při 37 °C a zastavení kyselinou trifluoroctovou. Analýza probíhala na:
- UHPLC: Shimadzu Nexera X2
- Kolona: Shim-pack GISS-HP C18, 3 µm, 150 × 3,0 mm
- Mobilní fáze: voda s 0,1 % FA + 0,01 % TFA (A) a acetonitril s 0,1 % FA + 0,01 % TFA (B)
- Gradient: 0–2 min 0 % B → 15 % (10 min) → 35 % (23 min) → 45 % (30 min) → 75 % (35–40 min) → návrat na 0 % (40–45 min)
- Tok: 0,5 mL/min, teplota kolony 40 °C, objem injekce 20 µL
- MS: Shimadzu LCMS-9030 Q-TOF, Heated ESI (pozitivní mód), rozmezí m/z 100–2000, TOF analyzátor
Hlavní výsledky a diskuse
Díky úpravě gradientního programu a použití UHPLC kolony se doba analýzy snížila ze 120 minut na 45 minut. Opakovatelnost retence (<0,1 % RSD) a ploch vrcholu (<3 % RSD) byla výborná. Celkem bylo identifikováno 19 peptidů z lehkého a 42 peptidů z těžkého řetězce. Měřené hmotnosti se od teoretických lišily o méně než 3 ppm. Dosáhnuto bylo 100 % pokrytí sekvence lehkého řetězce a 99,8 % u těžkého, přičemž jedinou odchylkou bylo ořezání C-terminální lysinu u jednoho peptidu.
Přínosy a praktické využití metody
Optimalizovaný postup nabízí:
- Výrazné zrychlení analýzy peptidového mapování
- Vysokou reprodukovatelnost a přesnost měření hmotností
- Komplexní potvrzení primární struktury mAb pro výzkum i kontrolu kvality
Budoucí trendy a možnosti využití
V budoucnu lze očekávat integraci s automatizovanými platformami, využití multiplexních značkovačů pro kvantitativní analýzu a rozšíření aplikace na monitorování posttranslačních modifikací v reálném čase.
Závěr
Studie prokázala, že kombinace UHPLC Nexera X2 a LCMS-9030 Q-TOF umožňuje rychlé, reprodukovatelné a vysoce přesné peptidové mapování mAb s praktickým významem pro vývoj biosimilárů a kontrolu kvality.
Reference
- Shimadzu (Asia Pacific), Peptide Mapping of Monoclonal Antibody (mAb) Using Nexera Bio with Q-TOF Mass Spectrometer for Full Sequence Confirmation, Application News No. AD-0176, 2018.
- MacLean B. et al., Skyline: an open source document editor for creating and analyzing targeted proteomics experiments, Bioinformatics, 26(7):966–968, 2010.
Podobná PDF
Peptide Mapping of Monoclonal Antibody (mAb) Using Nexera Bio with Q-TOF Mass Spectrometer for Full Sequence Confirmation
2019|Shimadzu|Aplikace
Application News AD-0176 Biopharma / Nexera Bio & Q-TOF LCMS-9030 Peptide Mapping of Monoclonal Antibody (mAb) Using Nexera Bio with Q-TOF Mass Spectrometer for Full Sequence Confirmation Udi Jumhawan, Wan Tung Liw, Jie Xing and Zhaoqi Zhan Application Development &…
Klíčová slova
nexera, nexerapeak, peaktryptic, trypticbio, biobiosimilar, biosimilarbevacizumab, bevacizumabpeptide, peptideantibody, antibodyuhplc, uhplcdigests, digestsigg, iggmin, minnews, newsmapping, mappingbiosimilars
Disulfide Bond Characterization of Monoclonal Antibody (mAb) Using Q-TOF Mass Spectrometer
2019|Shimadzu|Aplikace
Application News Biopharma / LCMS-9030 (Q-TOF) Disulfide Bond Characterization of Monoclonal Antibody (mAb) Using Q-TOF Mass Spectrometer No. AD-0214 Yonghai Lu and Zhaoqi Zhan Application Development & Support Centre, Shimadzu (Asia Pacific), Singapore ❑ Introduction Monoclonal antibody (mAb) is emerging…
Klíčová slova
disulfide, disulfidebond, bondnovo, novobiosimilar, biosimilarchain, chainpeptide, peptidemab, mabsequencing, sequencingreduced, reducednews, newsbevacizumab, bevacizumablinkages, linkageslcms, lcmsadduct, adductbonds
In-depth Peptide Mapping of Monoclonal Antibody (mAb) by A de novo Peptide Sequencing Method on Q-TOF Mass Spectrometer with Data-independent Acquisition
2019|Shimadzu|Aplikace
Application News No. AD-0217 Biopharma / LCMS-9030 (Q-TOF) In-depth Peptide Mapping of Monoclonal Antibody (mAb) by A de novo Peptide Sequencing Method on Q-TOF Mass Spectrometer with Data-independent Acquisition Yonghai Lu and Zhaoqi Zhan Application Development & Support Centre, Shimadzu…
Klíčová slova
peptide, peptidedia, diamab, mabnovo, novomapping, mappingbevacizumab, bevacizumabchain, chainsequencing, sequencingalpapiek, alpapiekpeptides, peptidestryptic, trypticnews, newsdial, dialmonoclonal, monoclonalheavy
Data-independent Acquisition (DIA) Approach on Q-TOF Mass Spectrometry for In-depth Peptide Mapping of Monoclonal Antibodies
2020|Shimadzu|Postery
MP 117 A Data-independent Acquisition (DIA) Approach on Q-TOF Mass Spectrometry for In-depth Peptide Mapping of Monoclonal Antibodies Yonghai Lu1, Wesgie Oh Wen Qi2, Zhaoqi Zhan1 1, Shimadzu (Asia Pacific), Singapore. 2, National University of Singapore, Singapore. 1. Overview 4.…
Klíčová slova
peptide, peptidedial, dialbevacizumab, bevacizumabnovo, novosequencing, sequencingdia, diamabs, mabsdrugbank, drugbankproposed, proposedantibodies, antibodiesmonoclonal, monoclonalmapping, mappingnumbers, numbersindependent, independentalpapiek