Quantification of mammalian gDNA
Aplikace | 2020 | Unchained LabsInstrumentace
Quantifikace genomické DNA (gDNA) ze savčích vzorků je nezbytná pro spolehlivou molekulárně-biologickou analýzu a zajišťuje kvalitu výsledků v aplikacích jako PCR, sekvenování a klonování.
Popisuje se využití DNA mammalian aplikace na platformách Lunatic a Little Lunatic k selektivnímu stanovení gDNA pomocí Unmix algoritmu, který rozlišuje jednotlivé komponenty UV/Vis spektra vzorku.
Unmix aplikace prokázala schopnost korigovat vliv absorbujících nečistot a nabízí hodnoty dsDNA blíže referenčnímu PicoGreen testu než klasické A260 měření.
DNA mammalian aplikace na Lunatic platformách umožňuje spolehlivé a efektivní stanovení dsDNA ve vzorcích s různou mírou kontaminace. Jejím využitím lze zvýšit přesnost a reprodukovatelnost kvantifikace v širokém spektru laboratorních postupů.
UV–VIS Spektrofotometrie, Charakterizace částic
ZaměřeníProteomika
VýrobceUnchained Labs
Souhrn
Význam tématu
Quantifikace genomické DNA (gDNA) ze savčích vzorků je nezbytná pro spolehlivou molekulárně-biologickou analýzu a zajišťuje kvalitu výsledků v aplikacích jako PCR, sekvenování a klonování.
Cíle a přehled studie / článku
Popisuje se využití DNA mammalian aplikace na platformách Lunatic a Little Lunatic k selektivnímu stanovení gDNA pomocí Unmix algoritmu, který rozlišuje jednotlivé komponenty UV/Vis spektra vzorku.
Použitá metodika a instrumentace
- Systémy Lunatic a Little Lunatic se softwarem Unmix DNA mammalian
- Analýza UV/Vis spektra a dekonvoluce na dsDNA, nečistoty (RNA, soli, fenol atd.) a pozadí (turbidita, hemoglobiny)
- Výpočet koncentrace dsDNA z A260 s faktorem 50
- Referenční metoda: Quant-It PicoGreen assay (Thermo Fisher Scientific)
- Extrakční postupy: QIAsymphony DNA Kit (Qiagen), chemagic DNA cell kit (PerkinElmer)
Hlavní výsledky a diskuse
Unmix aplikace prokázala schopnost korigovat vliv absorbujících nečistot a nabízí hodnoty dsDNA blíže referenčnímu PicoGreen testu než klasické A260 měření.
- Vzorky z krve: identifikace a kvantifikace residualních solí při 230 nm
- Vzorky z buněk: rozlišení dsDNA a vysokého obsahu RNA
- Parametr RRSE indikuje kvalitu fitu a detekuje nestandardní vzorky
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a bezbarvivová kvantifikace dsDNA
- Integrovaná korekce interference nečistot
- Snížené nároky na přípravu vzorku
- Uplatnění v QA/QC, rutinních laboratořích a výzkumu
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření metodiky na další typy nukleových kyselin
- Integrace do laboratorních informačních systémů (LIMS)
- Aplikace v režimech GMP/GLP
- Automatizace a kombinace s dalšími analytickými technikami
Závěr
DNA mammalian aplikace na Lunatic platformách umožňuje spolehlivé a efektivní stanovení dsDNA ve vzorcích s různou mírou kontaminace. Jejím využitím lze zvýšit přesnost a reprodukovatelnost kvantifikace v širokém spektru laboratorních postupů.
Reference
- Quant-It PicoGreen assay, Thermo Fisher Scientific
- QIAsymphony DNA Kit, Qiagen
- chemagic DNA cell kit, PerkinElmer
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Quantification of total nucleic acids from unknown sources (DNA eq)
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of total nucleic acids from unknown sources (DNA eq) Introduction In this note, we describe how to use the Nucleic Acids (DNA equiv.) application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, appdna, dnanucleic, nucleicdetailing, detailingvis, visreported, reportedunknown, unknownacids, acidsbackground, backgroundspectral, spectralrrse, rrsethreshold, thresholdtotal, totalsources
Quantification of purified PCR samples
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of purified PCR samples Introduction In this note, we describe how to use the Purified PCR application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis spectral shape of the sample to isolate…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, apppcr, pcrpurified, purifiedquantification, quantificationnucleic, nucleicspectral, spectralimage, imagesamples, samplesrrse, rrsevis, visshown, shownfluorescence, fluorescenceunderestimates, underestimatesphage
Quantification of total nucleic acids from unknown sources (RNA eq)
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of total nucleic acids from unknown sources (RNA eq) Introduction In this note, we describe how to use the Nucleic Acids (RNA equiv.) application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, appnucleic, nucleicrna, rnadetailing, detailingvis, visreported, reportedunknown, unknownacids, acidsbackground, backgroundspectral, spectralrrse, rrsethreshold, thresholdtotal, totalsources
Fast & accurate DNA quantification with Lunatic
2020|Unchained Labs|Technické články
Technical Note Fast & accurate DNA quantification with Lunatic Introduction A Fluorescent dye-based assays are one of the predominant methods for quantifying nucleic acids, but they’re bogged down by a lot of steps. If anything goes wrong along the way,…
Klíčová slova
lunatic, lunaticdna, dnanucleic, nucleicquadruplicate, quadruplicatefluorescent, fluorescentqubit, qubitpicogreen, picogreenunmix, unmixdsdna, dsdnaspectrum, spectrumvis, visquantification, quantificationacid, acidline, lineconcentration
