Glycosylation Analysis of Human Serum Transferrin Glycoforms Using Pellicular Anion-Exchange Chromatography
Aplikace | 2002 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Glykozylace a sialylace bílkovin hrají klíčovou roli v biologické funkci a diagnostice onemocnění. Profilování glykoform lidského sérového transferinu (HST) umožňuje sledovat změny ve stupni sialylace spojené s patologiemi jako rakovina, revmatoidní artritida či alkoholová hepatopatie.
Studie představuje postup frakcionace a analýzy sialylovaných glykoform HST. Hlavním cílem bylo rozdělit transferin na populace odlišné stupněm sialylace pomocí pelikulární anion-výměnné chromatografie a charakterizovat uvolněné oligosacharidy prostřednictvím HPAE-PAD.
Ultrarychlá frakcionace:
Frakcionací HST na semipreparativní DNAPac PA-100 byly izolovány tři hlavní populace (F1, F2, F3) s rozdílnou retencí. Reversed-phase HPLC potvrdila chemickou podobnost proteinového jádra napříč frakcemi. PNGase F uvolnil oligosacharidy, které HPAE-PAD ukázala jako:
Protokol umožňuje rychlou frakcionaci glykoform z malých i větších vzorků, poskytuje kvantitativní odhad distribuce sialylovaných druhů a lze jej aplikovat v klinické diagnostice či farmaceutickém vývoji pro sledování glykozylace.
Metoda může být rozšířena o hyphenované techniky hmotnostní spektrometrie pro detailní strukturální analýzu. Potenciál vidíme v automatizaci, vyšším rozlišení i v aplikaci na jiné klinicky významné glykoproteiny.
Kombinace pelliculární anion-výměnné chromatografie a HPAE-PAD je efektivní pro detailní profilaci sialylace HST. Postup poskytuje reproducibilní frakcionaci a kvantitativní analýzu glykoform s potenciálem širokého průmyslového a klinického nasazení.
Iontová chromatografie
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Glykozylace a sialylace bílkovin hrají klíčovou roli v biologické funkci a diagnostice onemocnění. Profilování glykoform lidského sérového transferinu (HST) umožňuje sledovat změny ve stupni sialylace spojené s patologiemi jako rakovina, revmatoidní artritida či alkoholová hepatopatie.
Cíle a přehled studie / článku
Studie představuje postup frakcionace a analýzy sialylovaných glykoform HST. Hlavním cílem bylo rozdělit transferin na populace odlišné stupněm sialylace pomocí pelikulární anion-výměnné chromatografie a charakterizovat uvolněné oligosacharidy prostřednictvím HPAE-PAD.
Použitá metodika a instrumentace
Ultrarychlá frakcionace:
- Pellicularní anionměnič DNAPac PA-100 (analytická 4×250 mm, semipreparativní 9×250 mm).
- Gradientní pumpa GP50 a detektory AD20 (UV, 215 nm) a ED40 (pulsní amperometrie).
- Autosampler AS3500, řídicí software PeakNet.
- PNGase F pro odštěpení N-vázaných oligosacharidů.
- Neuraminidáza pro odstraňování terminálních sialových zbytků.
- HPAE-PAD na CarboPac PA-100 kolóně pro rozlišení mono-, di- a trisialylovaných oligosacharidů.
- Zvrtně-fázová HPLC na Zorbax RP300-C18 pro potvrzení integrity proteinu.
Hlavní výsledky a diskuse
Frakcionací HST na semipreparativní DNAPac PA-100 byly izolovány tři hlavní populace (F1, F2, F3) s rozdílnou retencí. Reversed-phase HPLC potvrdila chemickou podobnost proteinového jádra napříč frakcemi. PNGase F uvolnil oligosacharidy, které HPAE-PAD ukázala jako:
- F1: ~30 % monosialylovaných, 70 % disialylovaných druhů.
- F2: >95 % disialylovaných druhů.
- F3: ~10 % trisialylovaných, 90 % disialylovaných druhů.
Přínosy a praktické využití metody
Protokol umožňuje rychlou frakcionaci glykoform z malých i větších vzorků, poskytuje kvantitativní odhad distribuce sialylovaných druhů a lze jej aplikovat v klinické diagnostice či farmaceutickém vývoji pro sledování glykozylace.
Budoucí trendy a možnosti využití
Metoda může být rozšířena o hyphenované techniky hmotnostní spektrometrie pro detailní strukturální analýzu. Potenciál vidíme v automatizaci, vyšším rozlišení i v aplikaci na jiné klinicky významné glykoproteiny.
Závěr
Kombinace pelliculární anion-výměnné chromatografie a HPAE-PAD je efektivní pro detailní profilaci sialylace HST. Postup poskytuje reproducibilní frakcionaci a kvantitativní analýzu glykoform s potenciálem širokého průmyslového a klinického nasazení.
Reference
- Rohrer J., Avdalovic N. Protein Expr. Purif. 1996, 7, 39–44.
- Rohrer J. J. Chromatogr. 1994, 667, 75–83.
- Townsend R.R., Hardy M.R. Glycobiology 1991, 1, 139–147.
- Rohrer J.S., Cooper G.A., Townsend R.R. Anal. Biochem. 1993, 212, 7–16.
- Weitzhandler M. et al. J. Biol. Chem. 1993, 268, 5121–5130.
- Schade A.L., Caroline L. Science 1946, 104, 340.
- Spik G. et al. FEBS Lett. 1975, 50, 296–299.
- Dorland L. et al. FEBS Lett. 1977, 77, 15.
- Wong K.-L., Regoeczi E. Int. J. Pept. Protein Res. 1977, 9, 241.
- Spik G. et al. FEBS Lett. 1985, 183, 65–69.
- Campion B. et al. Eur. J. Biochem. 1989, 184, 405–413.
- van Eijk H.G. et al. Clin. Chim. Acta 1987, 165, 141–145.
- Storey E.L. et al. Lancet 1987, 1, 1292–1293.
- Townsend R.R. et al. Anal. Biochem. 1989, 182, 1–8.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Preparation of peptide N-Glycosidase F digests for HPAE-PAD analysis
2018|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
APPLICATION UPDATE 176 Preparation of peptide N-Glycosidase F digests for HPAE-PAD analysis Authors Introduction Pranathi Perati and Jeffrey Rohrer Thermo Fisher Scientific, Sunnyvale, CA Glycosylation is one of the most important post-translational modifications in eukaryotic cell proteins. Glycoproteins are involved…
Klíčová slova
pngase, pngasetransferrin, transferrindenaturation, denaturationsialylated, sialylatedoff, offpad, padoligosaccharides, oligosaccharidescarbohydrate, carbohydrateoligosaccharide, oligosaccharideglycoprotein, glycoproteindigests, digestsdetergent, detergenthpae, hpaeprotein, proteinquad
Evaluating Protein Glycosylation in Limited-Quantity Samples by HPAE-PAD
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Deanna Hurum, Lipika Basumallick, and Jeffrey Rohrer Thermo Fisher Scientific, Sunnyvale, CA, USA Key Words Prostate-Specific Antigen (PSA), Transferrin, N-Glycans, O-Glycans, Dionex CarboPac Column Introduction Changes in protein glycosylation are frequently studied in cancer research to identify potential biomarkers. Factors…
Klíčová slova
glycans, glycanspsa, psaglycan, glycantransferrin, transferrinpngase, pngaseprotein, proteinprostate, prostateglycosylation, glycosylationmonosaccharide, monosaccharideneutral, neutraloff, offreleased, releaseddionex, dionexfucosidase, fucosidasehuman
Analysis of Exoglycosidase Digestions of N-Linked Oligosaccharides Using HPAE-PAD
1995|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Technical Note 36 Analysis of Exoglycosidase Digestions of N-Linked Oligosaccharides Using HPAE-PAD INTRODUCTION Analysis of protein glycosylation is an important part of glycoprotein characterization. Oligosaccharides can be linked to a protein through a serine or a threonine as O-linked glycans,…
Klíčová slova
oligosaccharides, oligosaccharidesmannosidase, mannosidaseoligosaccharide, oligosaccharideexoglycosidase, exoglycosidasechitobiose, chitobioselinked, linkeddigestions, digestionshpae, hpaefucosylated, fucosylatedpad, padneuraminidase, neuraminidasemannose, mannosefucosidase, fucosidaseglcnac, glcnacgalactosidase
Separation of Asparagine-Linked (N-Linked) Oligosaccharides from Human Polyclonal IgG Using the CarboPac PA200 Column
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 215 Separation of Asparagine-Linked (N-Linked) Oligosaccharides from Human Polyclonal IgG Using the CarboPac PA200 Column Introduction High-performance anion-exchange chromatography with pulsed amperometric detection (HPAE-PAD) is a widely used technique for determining an extensive set of carbohydrates including, but…
Klíčová slova
oligosaccharides, oligosaccharideslinked, linkedpolyclonal, polyclonaligg, iggoligosaccharide, oligosaccharidehuman, humanpngase, pngaseoff, offneuraminidase, neuraminidaseasparagine, asparaginereleased, releasedpad, padamperometric, amperometricdigest, digestpulsed