Zpracování dat pro vyhledávání NIST MSMS pomocí softwaru Thermo Freestyle (ukázka typu vyhledávání NIST)

Tato série webinářů ukazuje použití softwaru Thermo Freestyle 1.8 SP2 QF1 pro zpracování LCMS hmotnostních spekter produktových s iontů pomocí programu NIST 23 Mass Spectral Search Program (v.3.0). Spektra se snadno exportují ze softwaru Freestyle do programu NIST Search pro identifikaci jednotlivých složek s využitím knihoven NIST MSMS a všech dalších dostupných uživatelských, veřejných a komerčních MSMS knihoven. Freestyle je velmi pohodlný softwarový balík pro zpracování dat získaných pomocí přístrojů LCMS Orbitrap. V jedné analýze lze získat spektra MS1 i MS2 v režimu pozitivních i negativních iontů. Lze také snadno zobrazit PAD a UV-VIS data pro zaměření požadovaných látek z LC analýz.

Poznámky pro celou sérii

• Část 1: Můj oblíbený režim zpracování ve Freestyle
• Část 1A: Používání vylepšeného režimu zpracování „Nearby Precursor“ v aplikaci FreeStyle
• Část 2: Alternativní režimy zpracování ve Freestyle
• Část 3: Nastavení základních nastavení ve Freestylu a vyhledávání NIST
• Část 4: Demonstrace různých vyhledávání NIST MSMS
• Část 5: Zpracování prvků v Thermo Freestyle

Část 4: Zpracování dat pro vyhledávání NIST MSMS pomocí softwaru Thermo Freestyle (ukázka typu vyhledávání NIST)

Vybavení a software

• Thermo Orbitrap MSMS
• Software Thermo Freestyle
• Tandemová knihovna NIST 2023

Zjednodušení zpracování dat pro hmotnostní spektrometrii

Hmotnostní spektrometrie je mocným nástrojem pro identifikaci sloučenin, ale její efektivita do značné míry závisí na způsobu zpracování a analýzy dat. Využitím softwaru Thermo Freestyle Software v kombinaci s aplikací NIST MSMS Search mohou výzkumní pracovníci zvýšit přesnost a rychlost spektrálních identifikací.

NIST MSMS Search v3.0 - Zjednodušené a vylepšené řešení

NIST MSMS Search verze 3.0 přináší vylepšené rozhraní, díky němuž je nastavení vyhledávání intuitivnější. Tato verze umožňuje:

• Flexibilitu importu spekter - více způsobů importu a zpracování spekter

James Little: Typická nastavení pro NIST MS Search 3.0 (tandemový režim)

• Různé režimy vyhledávání
  • Identita MS/MS: vyhledává spektra s omezením podle prekurzorového iontu a jeho zadaného m/z
  • Identita/Vysoké rozlišení: Žádný prekurzor, pouze porovnává celkovou shodu neznámých spekter s referenčními spektry
  • Podobnost/Hybridní MS/MS - velmi užitečné, pokud je v referenčních knihovnách přítomna příbuzná sloučenina, ale skutečná sloučenina přítomna není

James Little:Různé režimy vyhledávání v NIST MS Search 3.0

• Pokročilé možnosti filtrování - odstranění iontů s nízkou intenzitou a elektronického šumu
• Přizpůsobitelná nastavení - uživatelé mohou ukládat konfigurace pro budoucí vyhledávání

Konfigurace nastavení vyhledávání pro dosažení optimálního výkonu

Aby uživatelé získali co nejpřesnější výsledky, měli by:

• Vybrat příslušnou MSMS knihovnu - NIST 2023 obsahuje základní databáze

James Little: Výběr vhodné MSMS knihovny

• Nastavit toleranci m/z prekurzorů - Zajistit kompatibilitu s hmotnostním spektrometrem.
• Použít možnost „Best Matching“ - Zjednodušuje výsledky filtrováním pouze nejlepších spekter pomocí čísla CAS jako filtru.

James Little: Další nastavení pro NIST MS Search 3.0 (tandemový režim)

• Uložte konfigurace vyhledávání - Vyhněte se obnovování parametrů pro každou novou relaci.

⚠️ Důležité! Uložte svá nastavení pro budoucí vyhledávání pomocí možnosti Save Configuration (Uložit konfiguraci) a v případě potřeby je obnovte, abyste zachovali konzistenci svých analýz.

James Little: Důležité! Uložte si nastavení pro budoucí relaci.

Závěr

Využití vyhledávání NIST MSMS Search v3.0 v rámci softwaru Thermo Freestyle umožňuje rychlejší, přesnější, a přizpůsobitelný přístup k identifikaci sloučenin. Výběrem vhodného typu vyhledávání a optimalizací nastavení mohou výzkumní pracovníci zvýšit spolehlivost svých pracovních postupů hmotnostní spektrometrie.