Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR pronikají do detailů genové transkripce. Popsali dosud neznámý molekulární mechanismus, kterým může začínat přepis genetické informace z deoxyribonukleové kyseliny (DNA) do ribonukleové kyseliny (RNA). Zaměřili se na zvláštní molekuly nazývané alarmony, které se vyskytují v buňkách napříč organismy a jejichž hladina se často zvyšuje při buněčném stresu. Výsledky výzkumu zveřejnil prestižní vědecký časopis Nature Chemical Biology.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Hana Cahová, vedoucí vědecké skupiny Chemická biologie nukleových kyselin." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><div>RNA molekuly mohou nést na jednom konci různé chemické modifikace, označované jako tzv. „čepičky“. U eukaryotních organismů, kam patří i lidské buňky, je nejznámější čepička, která se podílí na stabilitě RNA a regulaci jejího dalšího osudu. V posledních letech se však ukazuje, že existují i alternativní, nekanonické RNA čepičky, jejichž vznik a mechanismus připojení k RNA se zatím vymyká lidským znalostem. Mezi ně patří například tzv. alarmonové čepičky, tvořené molekulami dinukleosidpolyfosfátu, alarmonů, které chrání buněčnou RNA ve chvílích, kdy je buňka v ohrožení.Tým <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cahova.group.uochb.cz/cs">Dr. Hany Cahové</a> se ve své studii zaměřil na RNA polymerázu z bakterií a sledoval, jakým způsobem může tento enzym zahájit transkripci za využití dinukleosidpolyfosfátů (NpNs) místo běžných stavebních bloků RNA. Vědci vůbec poprvé popsali na atomární úrovni, jak může vznikat RNA s alarmonovou čepičkou přímo při zahájení přepisu genu. Navíc pozorovali, že se NpnNs vážou jiným typem párování, než je obvyklé.Na práci se zásadně podílely Valentina Serianni z týmu Hany Cahové, která prokázala schopnost dinukleosidpolyfosfátů zahajovat přepis genu, a Jana Škerlová, která se zaměřila na strukturální analýzu RNA polymerázy a na základě dat z kryogenní elektronové mikroskopie ukázala, jak se molekuly dinukleosidpolyfosfátů váží do aktivního místa RNA polymerázy, tedy do srdce enzymu, kde se genetická informace přepisuje. Jejich studie pomáhá odhalovat procesy, které provázejí přepis genetické informace z DNA do RNA.Hana Cahová k tomu dodává: „Popisujeme něco, co se v buňkách skutečně děje a co nyní dokážeme pozorovat přímo na úrovni jednotlivých molekul. Získáváme tak odpovědi na zásadní otázky týkající se buněčných procesů, například jak se buňky přizpůsobují stresu. Právě RNA totiž přenáší kaskádu informací, které stojí za jakoukoli buněčnou reakcí, např. na stav ohrožení způsobený nedostatkem živin či teplotním šokem.“<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Tomáš Kouba, vedoucí core facillity skupiny Kryogenní elektronová mikroskopie." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><div>Klíčovou roli v projektu sehrála kryogenní elektronová mikroskopie (cryo-EM), kterou vedl Dr. Tomáš Kouba, jeden z autorů článku. „Kryoelektronová mikroskopie umožňuje zmrazit biologické molekuly skoro v jejich přirozené formě a následné získat trojrozměrnou strukturu takových molekul. Díky tomu můžeme nahlédnout přímo do aktivního centra enzymů a sledovat jejich fungování až na atomární úrovni,“ vysvětluje Tomáš Kouba.ÚOCHB vloni otevřel nové <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cryoem.group.uochb.cz/cs">centrum cryo-EM</a>, které je v českém prostředí unikátní. Špičkové kryogenní elektronové mikroskopy našly zázemí ve speciálně navržené budově a umožňují studium biologických procesů s mimořádnou strukturální přesností.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg" alt="ÚOCHB: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Tato práce ukazuje, jak malé molekuly NpnN pomáhají bakteriím zahájit přepis genetické informace. Detailní zobrazení pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhaluje, jak se vážou na genetickou šablonu a fungují jako nekanonické „čepičky“ RNA." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg 245w," sizes="100vw" width="2000" height="1077"><blockquote><h4>Původní článek</h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41589-025-02134-5#citeas">Molekulární vhled do 5′ zakončení RNA pomocí NpnNs zprostředkovaného bakteriální RNA polymerázou</a></h4>Valentina M. Serianni, Jana Škerlová, Anna Knopp Dubánková, Anton Škríba, Hana Šváchová, Tereza Vučková, Anatolij Filimoněnko, Milan Fábry, Pavlína Řezáčová, Tomáš Kouba &amp; Hana Cahova&nbsp;Nat. Chem. Biol. 21 (2026)<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5">https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5</a><h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">CC-BY 4.0</a></h6></blockquote><h4>Abstrakt</h4>RNA zakončená dinukleosidovými polyfosfáty byla u bakterií i eukaryot objevena teprve nedávno. Pravděpodobný mechanismus tohoto specifického typu zakončení RNA spočívá v přímém začlenění dinukleosidových polyfosfátů RNA polymerázou jako nekanonických iniciačních nukleotidů. Dosud však nebylo známo, jakým způsobem se tyto sloučeniny vážou do aktivního místa RNA polymerázy během zahájení transkripce. V této práci jsme in vitro studovali iniciaci transkripce za použití série DNA templátů v kombinaci s dinukleosidovými polyfosfáty a modelovou RNA polymerázou z bakterie Thermus thermophilus. Zjistili jsme, že místo zahájení transkripce se může lišit v závislosti na kompatibilitě konkrétního templátu a použitého dinukleosidového polyfosfátu. Struktury iniciačních transkripčních komplexů s dinukleosidovými polyfosfáty získané pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhalily, že obě nukleové báze v molekule mohou párovat s DNA templátem. První kódovaný nukleotid se páruje kanonickým Watsonovým–Crickovým způsobem, zatímco druhá nukleová báze se váže nekanonicky prostřednictvím reverzního Watsonova–Crickova párování. Tato práce tak poskytuje strukturní vysvětlení mechanismu, kterým dinukleosidové polyfosfáty zahajují transkripci RNA.</div></div>

Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace

Falšování potravin je fenomén s dlouhou historií, který v dnešní době díky globalizaci potravinových řetězců a vysokým ekonomickým tlakům nabývá na významu. Ať už jde o ředění olivového oleje levnými oleji, přidávání cukru do medu, nebo skryté používání náhražek v bílkovinových doplňcích, výsledkem je ztráta důvěry spotřebitelů a v některých případech i ohrožení zdraví. Analytická chemie zde hraje klíčovou roli: poskytuje metody a technologie, které dokážou identifikovat a kvantifikovat cílové látky i nechtěné impurity v rozsáhlém spektru potravinových matrik.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Watrex_Praha_Falsovani_potravin_a_jak_ho_odhali_analyticka_chemie_6912db5492.jpg" alt="Watrex Praha: Falšování potravin a jak ho odhalí analytická chemie" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Watrex_Praha_Falsovani_potravin_a_jak_ho_odhali_analyticka_chemie_6912db5492.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="900"><h4>Role chromatografie ve forenzní potravinářské analýze</h4>Chromatografie, zejména kapalinová chromatografie (HPLC), je mezi analytickými metodami jedním z nejefektivnějších nástrojů pro separaci komplexních směsí molekul.Umožňuje:<ul><li>kvalitativní identifikaci jednotlivých složek ve vzorku,</li><li>kvantitativní stanovení jejich koncentrací,</li><li>detekci nečistot a nečekaných složek, které mohou signalizovat falšování.</li></ul>V praxi se často kombinuje HPLC s různými typy detektorů (UV/VIS, DAD, refraktometrické detektory) nebo dalšími technikami (např. hmotnostní spektrometrií) pro zvýšení selektivity a citlivosti.<h4>Izokratické vs. gradientní eluce</h4>Při analýze potravinových vzorků se chromatografické metody volí podle cíle analýzy:<ul><li>Izokratická HPLC používá jednu konstantní mobilní fázi během celé analýzy – je jednoduchá, robustní a ideální pro rutinní rutiny s dobře definovanými cílovými analyty (např. stanovení cukrů nebo vitamínů).</li><li>Gradientní HPLC mění složení mobilní fáze během separace – umožňuje lepší rozlišení složitých směsí s širokým rozsahem polarity látek (např. peptidů nebo fenolických sloučenin).</li></ul>Gradientní metody jsou obzvláště užitečné, když analyty mají velmi rozdílné vlastnosti a je potřeba dosáhnout vysoké účinnosti separace.<h4>Watrex Praha a přínos moderních systémů pro potravinářskou analytiku</h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://watrex.com/?utm_source=labrulez&amp;utm_medium=propagace&amp;utm_campaign=labrulez_clanky_HPLCsystemy">Watrex Praha, s.r.o.</a> patří mezi významné české výrobce a distributory systémů a přístrojů pro kapalinovou chromatografii, s dlouhou tradicí sahající do roku 1990. Firma úspěšně transformovala svou roli z distributora na výrobce vlastních HPLC a příbuzných technologií, přičemž klade důraz na modulární systémy robustní konstrukce vhodné i pro náročné analytické úlohy.Jejich <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?manufacturerItems=93&amp;search=streamline">řada Streamline™</a> zahrnuje několik koncepcí HPLC systémů vhodných pro potravinářské aplikace:<ul><li>Izokratický HPLC systém – jednoduchá, ale přesná konfigurace s jedním čerpadlem, kolonovým termostatem a UV/VIS detektorem; vhodný pro rutinní stanovení známých analytů (např. základní sacharidy, přídatné látky).</li><li>Binární gradientní HPLC systém – disponuje dvěma čerpadly a umožňuje tvorbu gradientů mobilní fáze, což zvyšuje separační schopnost při analýze komplexních směsí (např. fenolické profily vína, složky aromatických extraktů).</li><li>GPC/SEC systém (gelová permeační chromatografie) – specializované řešení pro stanovení makromolekul a polymerů, avšak i relevantní pro analýzu vysokomolekulárních složek v potravinách (např. polysacharidů).</li></ul><blockquote>👉<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.labrulez.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Watrex_catalog_2024_ba97395f92.pdf">Produktový katalog ZDE</a></blockquote>Díky modulární povaze těchto systémů mohou analytici snadno přizpůsobit konfiguraci specifickému analytickému problému, od jednoduchých rutinních analýz až po komplexní charakterizace potravinových vzorků.<h4>Praktické příklady falšování odhalené HPLC</h4><ul><li>Detekce ředění olivového oleje: Pomocí HPLC lze separovat a kvantifikovat charakteristické triacylglyceroly a mastné kyseliny; neobvyklé vzory pak ukazují na příměsi levnějších olejů.</li><li>Odhad přídavku cukru v medu: Izokratické HPLC s refraktometrickým detektorem může stanovit profily cukrů (glukóza, fruktóza, sacharóza), které ukazují na ředění nebo přidání cukerných sirupů.</li><li>Identifikace aromatických adulterantů ve víně: Gradientní HPLC s PDA detektorem odhalí fenolické a aromatické profily, které mohou být narušeny přídavkem syntetických látek.</li></ul><h4>Závěr</h4>Falšování potravin je stále aktuálním problémem, který vyžaduje spolehlivé a citlivé analytické metody. Kapalinová chromatografie a zejména moderní HPLC systémy , představují jeden z nejúčinnějších nástrojů pro odhalování nežádoucích přídatných látek, nečistot či nečekaných složek v komplexních potravinových vzorcích. Výrobci, jako je <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://watrex.com/?utm_source=labrulez&amp;utm_medium=propagace&amp;utm_campaign=labrulez_clanky_HPLCsystemy">Watrex Praha</a>, nabízejí flexibilní chromatografické platformy, které pokrývají široké spektrum analytických úloh: od jednoduchých izokratických až po pokročilé gradientní a GPC/SEC aplikace, a tím podporují analytiky při zajišťování kvality potravin a ochraně spotřebitelů.<blockquote>Zaujal Vás článek? Pro více zajímavých témat sledujte <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://watrex.com/?utm_source=labrulez&amp;utm_medium=propagace&amp;utm_campaign=labrulez_clanky_HPLCsystemy">Watrex Praha </a>na jejich sociálních sítích (<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.linkedin.com/company/watrex/?viewAsMember=true">LinkedIn</a> a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.facebook.com/WatrexPrague">Facebook</a>).</blockquote>

Falšování potravin a jak ho odhalí analytická chemie?

🎤 Přednášející: Michal Belianský<h3>VIZE 2025: Empower Method Validation Manager</h3><h4>Empower Method Validation Manager (MVM): moderní přístup k validaci chromatografických metod</h4>Validace analytických metod je klíčovým požadavkem regulovaných laboratoří v oblasti farmacie, biotechnologií i kontroly kvality. Software Empower Method Validation Manager (MVM) od společnosti Waters představuje komplexní nástroj, který umožňuje provádět validaci chromatografických metod systematicky a plně v souladu s požadavky lékopisů a regulačních autorit.MVM je rozšířením chromatografického datového systému <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/627">Empower</a>, díky čemuž propojuje vývoj, validaci, zpracování dat i reporting do jednoho uceleného workflow.<h4>Automatizované výpočty a System Suitability</h4>Jednou z hlavních výhod Empower MVM je využití automaticky generovaných chromatografických parametrů, jako jsou:<ul><li>rozlišení (Resolution),</li><li>faktor symetrie a tailing,</li><li>počet teoretických pater (Plate Count),</li><li>výška a šířka píku,</li><li>poměr signál/šum (S/N).</li></ul>Tyto parametry jsou vyhodnocovány v souladu s požadavky USP, EP i JP a mohou být přímo použity v rámci testů System Suitability, čímž se minimalizuje riziko manuálních chyb a zvyšuje konzistence výsledků.<h4>Podpora chemických struktur a specifických aplikací</h4>Empower MVM nabízí také rozšíření Chemical Structures, které je integrováno ve spolupráci s ACD/Labs. Díky tomu lze přímo v prostředí Empoweru:<ul><li>kreslit a upravovat chemické struktury,</li><li>vytvářet knihovny sloučenin,</li><li>vkládat struktury do tabulek komponent a zahrnovat je do reportů.</li></ul>Další specializovaná rozšíření pokrývají například:<ul><li>Dissolution – automatizované vyhodnocení disolučních testů včetně výpočtů f1, f2 a Q faktoru,</li><li>GPC/SEC pro polymerní analýzu – výpočty molekulových hmotností (Mw, Mn, Mp, Mz) a kombinaci dat z RI a LS detektorů,</li><li>Sample Weight Importer – přímý přenos hmotností ze vah do Empoweru s plnou auditní stopou.</li></ul><h4>Validace metod krok za krokem v MVM</h4>Empower Method Validation Manager strukturuje validaci do tří hlavních fází:<ol><li>Validation Protocol Definice validačních požadavků, akceptačních kritérií, typů testů a schvalovacích procesů.</li><li>Validation Study Řízení celé validační studie v jednom projektu – akvizice dat, jejich zpracování, statistické výpočty a průběžné hodnocení souladu s kritérii.</li><li>Reporting Automatizovaná tvorba validačních reportů z předdefinovaných šablon, včetně elektronických podpisů a plné sledovatelnosti změn.</li></ol>Software podporuje všechny klíčové validační testy, jako jsou linearita, přesnost, správnost, specificita, LOD/LOQ, opakovatelnost, mezilehlá přesnost, robustnost či stabilita metody<h4>Integrace, migrace dat a monitoring systémů</h4>Součástí ekosystému Empoweru jsou i nástroje pro migraci dat z jiných CDS (např. Agilent ChemStation/OpenLab, Thermo Chromeleon, MassLynx) pomocí modulu Waters Data Converter.Díky platformě <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/1544">waters_connect</a> System Monitoring mají uživatelé přehled o stovkách chromatografických a LC-MS systémů, mohou sledovat jejich stav v reálném čase, dostávat automatické notifikace a efektivně plánovat využití přístrojů, což významně zvyšuje produktivitu laboratoře.<h4>Závěr</h4>Empower Method Validation Manager představuje robustní a regulatorně připravené řešení pro validaci chromatografických metod od A do Z. Automatizace výpočtů, jednotné řízení validačních studií, pokročilé reportingové nástroje a hluboká integrace s CDS Empower činí z MVM silný nástroj pro laboratoře, které kladou důraz na kvalitu dat, efektivitu práce a plnou shodu s regulačními požadavky.

Waters VIZE 2025: Empower Method Validation Manager

Potraviny

Přednáška

Věda a výzkum

Video

Článek

Produkt

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Firmu Waters založil v roce 1958 pan James Waters. Od té doby se společnost Waters specializuje na kapalinovou chromatografii a hmotnostní spektrometrii. Divize TA Instruments působí na poli termální analýzy. V České republice je Waters zastoupen přímou pobočkou, která sídlí v Praze.

Waters Gesellschaft

Watrex Praha je přední český výrobce a distributor systémů a příslušenství zejména pro kapalinovou chromatografii. Distribuujeme produkty mnoha chemických firem a máme vlastní řadu systémů za rozumnou cenu.

Watrex Praha

Separation Science

Agilent Technologies

Phenomenex

Thermo Fisher Scientific

Evosep Biosystems

Waters Corporation

Contaminants in the sample matrix can create chromatography issues, system downtime, and unreliable test results. Having clean samples can help prevent most of these problems. There are many options for sample cleanup.
We’ll discuss the following options:
<ul>
<li>Solid phase extraction (SPE), which provides the cleanest sample.
</li>
<li>“Targeted” filtration, which can remove specific interferences from the sample matrix and provides clean samples.
</li>
</ul>
In this talk, we’ll discuss tips for selecting, developing, and implementing SPE methods. We’ll also discuss newly developed targeted filtration options and their benefits.
<blockquote>
Presenter: Golnar Javadi (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Golnar Javadi is an applications engineer providing online applications assistance and technical support for LC columns and supplies, Sample Preparation products, and Spectroscopy supplies.
</blockquote>
<blockquote>
Before joining Varian and then Agilent, Golnar worked in the pharmaceutical and nutraceutical industries on method development and quality control. She also taught college level chemistry courses for a few years.
</blockquote>
<blockquote>
Golnar then joined Varian as a technical support specialist, providing customers with method development assistance and technical support on Sample Preparation (SPE, SLE, and Filtration), HPLC, GC, ToxiLab and DAT. After the Varian-Agilent merger, Golnar joined Agilent Technologies as an Applications Engineer. She provides technical support to customers on Sample Preparation products, Liquid Chromatography columns, and Spectroscopy supplies.
</blockquote>

Agilent Technologies: Sample Cleanup: Method Development for Solid Phase Extraction and Beyond

Sample Cleanup: Method Development for Solid Phase Extraction and Beyond

We’ll discuss tips for selecting, developing, and implementing SPE methods. We’ll also discuss newly developed targeted filtration options and their benefits.

Sample Cleanup: Method Development for SPE

We invite you to join a hybrid event on October 15th to explore the latest solutions and workflows for overcoming environmental and food contaminant testing challenges.This event will be broadcast live from the laboratory at Thermo Fisher Scientific Customer Solutions Center (CSC) in Paris. You can join in person at one of our many 'satellite' venues worldwide, where we will offer an extended agenda, or participate remotely through the live broadcast.During the live stream broadcast, you will meet our Customer Solution Centre specialist team and leading industry expert, John Quick, as they discuss innovative solutions to meet the ever-evolving testing demands. There will be plenty of time to ask these experts your questions.The following sessions will be streamed all over Europe and beyond:<ul><li>Detecting PFAS in drinking water to meet regulations across Europe – New automated sample preparation high-resolution MS solution to achieve parts per trillion detection limits. Aristide Ganci,&nbsp;Senior Product Application Specialist, Thermo Fisher Scientific; Valérie Thibert, Senior Product Application Specialist, Thermo Fisher Scientific; Bénédicte Gauriat, Senior Product Application Specialist, Thermo Fisher Scientific</li><li>New ready-to-go pesticide residue solution for faster, more confident results Zoe Julian, Product Marketing Specialist, Manager; Bénédicte Gauriat, Senior Product Application Specialist, Thermo Fisher Scientific; Julie Moriceau, Senior Product Application Specialist, Thermo Fisher Scientific</li><li>Low-level contaminant testing in environmental water matrices&nbsp;– High-Resolution Accurate Mass GC-MS approach to meet future regulations John Quick, Principal Scientist, ALS Environmental Ltd</li></ul>After the live stream concludes, 'satellite' locations offer a unique program onsite. Take this unique opportunity to connect with industry professionals, or join us to explore, network, and collaborate on your future projects. Scroll below to the venue of your choice to discover the individual agenda.Participation is free of charge, registration is required.For any questions about this event or regarding your registration, please email <a href="mailto:CMDEvents@thermofisher.com">CMDEvents@thermofisher.com</a>.<h3>Preliminary agenda</h3><h5>10:15 Live streaming of this event to ‘satellite’ locations and online audience</h5><h5>10:30 Introduction</h5><ul><li>Jeff Stubbs (Business Development Manager, Environment and Food Safety, Thermo Fisher Scientific)</li></ul><h5>10:55 Detecting PFAS in drinking water to meet regulations across Europe - New automated sample preparation high-resolution MS solution to achieve ppt detection limits</h5><ul><li>A Ganci, V Thibert and B Gauriat (Senior Product Application Specialists, Thermo Fisher Scientific)</li></ul><h5>11:35 Break</h5><h5>12:05 New ready-to-go pesticide residue solution for faster, more confident results</h5><ul><li>Z Julian, Product Marketing, B Gauriat, and J Moriceau (Senior Product Application Specialists Thermo Fisher Scientific)</li></ul><h5>12:45 Low-level contaminant testing in environmental water matrices – high-resolution GCMS approach to meet future regulations</h5><ul><li>John Quick (Principal Scientist, ALS Environmental Ltd)</li></ul><h5>13:15 Closing comments</h5><h5>13:30 End of live streaming</h5><div><div container-id="cq-colctrl-lt7" comp-id="B1"><div><div><div><div><div><div><blockquote><h3>How to attend?</h3>3 ways of attending:Customer Solution Centre (in-person event):&nbsp; Join the heart of the event at our Customer Solution Center in Paris, where the main agenda will be hosted and live-streamed worldwide to our ‘Satellite’ locations and our audience.Join a ‘Satellite’ location (in-person event):&nbsp; Our in-person ‘Satellite’ events will broadcast the main agenda live-streamed from our Customer Solution Center in Paris and supplement the day with local presentations, lab tours, or workshops. Take this opportunity to meet your Thermo Fisher representatives and industry experts from the region. Discover the individual agenda for your ‘Satellite’ location of interest.Online attendees (remote):&nbsp; Unable to travel to a ‘Satellite’ event? Not a problem! You can register to attend conveniently online from your desk or anywhere else through the live stream from our Customer Solutions Center in Paris.</blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div>

Thermo Scientific: Solutions for environmental and food contaminant testing

Solutions for environmental and food contaminant testing

New and advancing workflows to meet and exceed European regulations.

This comprehensive webinar will equip you with the knowledge and skills needed to excel in N-glycan analysis, from sample preparation to data interpretation.Enhance your understanding of the latest tools Agilent offers to address your biotherapeutic characterization needs.<h4>By attending this webinar, you will:</h4><ul><li>Understand the significance of N-glycans &nbsp;</li><li>Learn about the latest N-glycan sample preparation techniques &nbsp;</li><li>Understand how to select the right columns and perform HILIC separations &nbsp;</li><li>Analyze data with the new Glycan Peak Assignment Tool</li></ul><blockquote>Presenter: Tom Rice (Bioconsumables Product Manager, Agilent Technologies)Tom Rice is the Bioconsumables Product Manager at Agilent Technologies, coming to Agilent through the acquisition of ProZyme in 2018. Prior to joining Agilent, he held various sales and marketing roles within ProZyme beginning in 2014. Much of Tom’s work, both at ProZyme and Agilent, has been focused on bringing innovative glycobiology solutions to biopharma customers. Tom is based in California and holds a B.S. from Sonoma State University.Presenter:&nbsp;Randall Robinson (Research and Development Scientist, Chemistries and Supplies Division at Agilent Technologies)Randall Robinson is a Research and Development Scientist in the Chemistries and Supplies Division at Agilent. Prior to joining Agilent in 2021, Randall completed his PhD in food chemistry with a focus on developing analytical techniques to characterize bioactive oligosaccharides in milk and dairy streams. Since joining Agilent, he has contributed to the design of numerous products utilized for N-glycan analysis, including the HILIC column described in this presentation.</blockquote>

Separation Science: Streamlining N-Glycan Analysis: A Complete Workflow from Agilent

Streamlining N-Glycan Analysis: A Complete Workflow from Agilent

Learn about the latest N-Glycan sample preparation techniques.

Streamlining N-Glycan Analysis: A Complete Workflow

LC/MS has played a critical role in bringing new monoclonal antibody-based therapies to market, enabling comprehensive characterization. However, sample preparation continues to remain a bottleneck as it is both time consuming and can introduce variability in LC-MS studies.In this webinar, you will learn how you can leverage the Andrew+ Pipetting Robot to automate sample preparation prior to LC-MS studies of monoclonal antibodies.Examples discussed will include:<ul><li>Monoclonal antibody purification &nbsp;</li><li>Monitoring mAB oxidation at the subunit level &nbsp;</li><li>Glycan profiling</li></ul>By automating sample preparation prior to LC-MS studies, Scientists can focus on experimental design and data analysis while eliminating a major source of variability.<blockquote>Presenter: N. Dilip Padliya, PhD (Principal Product Marketing Manager, Laboratory Automation, Waters Corporation)N. Dilip Padliya recently joined the Laboratory Automation division of Waters, focused on automating sample preparation in LC-MS, Bioanalysis, Proteomics, Lipidomics, and Metabolomics. His prior work experience includes running a Proteomics research group at Celgene (now part of Bristol Myers Squibb). He has authored 7 peer reviewed publications and is a co-inventor on 10 patents.</blockquote>

Waters Corporation: Automated Sample Prep Prior to LC-MS Studies of Monoclonal Antibodies

Automated Sample Prep Prior to LC-MS Studies of Monoclonal Antibodies

How you can leverage the Andrew+ Pipetting Robot to automate sample preparation prior to LC-MS studies of monoclonal antibodies.

Automated Sample Prep Prior to LC-MS Studies

<h4>The Waters 2024 Virtual Summer School - An Educational Journey to Master Food &amp; Environmental Analysis</h4>Unlock the full potential of LC-MS techniques with our immersive and educational sessions at the Waters Virtual F&amp;E Late Summer School 2024. From September 24th to 26th, engage with leading experts and discover cutting-edge methods for environmental and food analysis.<h5>Why attend?</h5><ul><li>Comprehensive Learning: Dive deep into advanced LC-MS techniques and gain practical knowledge to enhance your laboratory's analytical capabilities.</li><li>Expert Insights: Learn from industry leaders and gain firsthand experience through detailed modules on chromatography, mass spectrometry, and sample preparation.</li><li>Regulatory Compliance: Stay ahead with the latest insights on EU regulations for PFAS analysis in food and water, ensuring your lab meets stringent standards.</li></ul><h3>Episode #6: Automated Sample Preparation | F&amp;E Summer School - Day 2 - Module 2</h3>This Module builds on the previous one by adding automation to the sample preparation methods. The Andrew+™ pipetting robot offers fully automated liquid handling using electronic pipettes and labware holders called Dominos for a full walk-away automation solution.Creating the connected laboratory, Andrew+ is part of the OneLab™ ecosystem, executing laboratory protocols designed in OneLab software. This flexible architecture enables you to effortlessly transition from laborious manual pipetting procedures to error-free, fully-robotized lab workflows – without any knowledge of programming, laboratory robotics or automation engineering. and explains processes the Andrew+ pipetting robot can take over in your lab.The European Union has adopted Commission Recommendation (EU) 2022/1431 to monitor PFAS in fruits, vegetables, milk and baby food. To achieve quantification at lowest levels of PFAS in food matrices, sample preparation is required which comprise of many pipetting steps and can be time-consuming and error prone. We will demonstrate an automate workflow for the analysis of PFAS in milk using a pipetting robot and stacked dual-phase SPE cartridges to meet EU 2022/1431 levels.<h5>What you'll learn:</h5>Possibilities to automat liquid handling processes in LC and LC-MS e.g.<ul><li>Serial dilution</li><li>Calibration curve</li><li>Solid Phase Extraction (SPE)</li></ul><blockquote>Presenter:&nbsp;Xavier Rodríguez (Business Development Manager Chemistry Group, Southern Europe, Waters)Xavier is part of the European Market Development Team. He works as an Application Specialist with focus on sample prep and has more than 20 years of experience in solving sample prep challenges.Presenter:&nbsp;Daniel Ng PhD (Principal Scientist, Waters Corporation)Daniel Ng received his PhD from the University of Manchester in mass spectrometry proteomics. He worked for 5 years at the Waters mass spectrometry headquarters in Wilmslow, UK, as a service support development engineer specializing in mass spectrometry instrumentation. In 2019, he took up a new role as a principal scientist at the International Food and Water Research Centre (Waters) in Singapore focusing on using advanced instrumentation to answer analytical challenges in the food and water industry. Since 2023, Daniel has lead the Food, Environmental and Material Science Analytical Professional Service team in the Asia-Pacific Region, developing analytical solutions to meet key challenges that customers face.</blockquote>

Waters Corporation: The Waters 2024 Virtual Summer School

Automated Sample Preparation

The Andrew+™ pipetting robot offers fully automated liquid handling using electronic pipettes and labware holders.

In this session, we explore how cutting-edge technology can detect the early signs of infectious disease with precision and speed. Early identification of disease markers can significantly enhance patient care by allowing for faster, more effective treatments.Learn how Evosep One’s robustness, sensitivity, and efficiency are helping laboratories and clinicians stay ahead of disease progression, providing key insights that lead to better health outcomes.Accurate and early detection of mycobacterial pathogens is critical for improving patient outcomes. We developed and validated multiple novel diagnostic methods. First, an immuno-affinity liquid chromatography–tandem mass spectrometry (ILM) assay that quantifies Mycobacterium tuberculosis CFP10 peptides and HIV-1 p24 in serum, showing high sensitivity and specificity in both adults and children. This method allows early detection of HIV and TB and monitors treatment responses effectively. The second approach involves an automated peptidomics pipeline that rapidly identifies mycobacterial species and subspecies from early growth cultures, including drug-resistant strains, significantly reducing diagnosis time compared to current clinical practices. These methods present significant advancements for managing the mycobacterial diseases.<blockquote>Presenter: PhD. Tony Hu (Center for Cellular &amp; Molecular Diagnostics, Tulane Cancer Center Translational Oncology Research Program Leader)Presenter:&nbsp;Aaron Scott (Infection Medicine (BMC) – Faculty of Medicine, Lund University)</blockquote>

Evosep: Tracking early signs of infectious disease with Evosep One to improve patient outcomes

Tracking early signs of infectious disease with Evosep One to improve patient outcomes

Learn how Evosep One’s robustness, sensitivity, and efficiency are helping laboratories and clinicians stay ahead of disease progression.

Tracking early signs of infectious disease with Evosep One

Researchers in early antibody and protein drug development are now harnessing the power of automation to transform traditional purification techniques into high-throughput, automated processes.This game-changing approach lets them explore protein expression, stability, and functionality before scaling up to larger volumes. While protein scientists excel in engineering and purification, the complexities of automation bring new challenges that can significantly impact workflow and performance.Join us for an exciting webinar by Biotage, where we’ll dive into the evolution of major automated, small-scale protein purification platforms over the past 20 years. By focusing on screening and process development applications, you’ll gain invaluable insights that will help you choose the perfect automation platform for your needs. We’ll cover everything from entry barriers (such as time and cost) to automation efficiency, downstream compatibility, and overall performance. Plus, we’ll present comparative performance data across platforms, highlighting key metrics for optimizing protein purification such as yield, concentration, consistency, and purity.<h4>What you will learn:</h4><ul><li>Valuable insights into how automation platforms are used in screening and process development applications &nbsp;</li><li>Tips on selecting the appropriate automation platform for your specific needs &nbsp;</li><li>Understanding the time and cost barriers to adopting automation &nbsp;</li><li>Evaluating the efficiency of different automation platforms and assessing how well they integrate with downstream processes &nbsp;</li><li>Comparative performance data across the platforms – protein yield, concentration, consistency, and purity</li></ul><h4>Who should attend:</h4><ul><li>Protein Scientists: Those involved in protein engineering and purification</li><li>Biotech Researchers: Professionals working on antibody and protein drug development</li><li>Research Scientists: Individuals focusing on high-throughput screening and process development</li><li>Lab Managers: Those overseeing laboratory workflows and looking to integrate automation</li></ul><blockquote>Presenter: Gabrielle Kerkow (Application Scientist, Biotage)Gabrielle Kerkow earned her Bachelor of Science in Biological Engineering and Psychology from Louisiana State University and is currently pursuing a Master of Biotechnology at San Jose State University. Having experience with chromatography, she joined Biotage as an Application Scientist, focusing on automating protein and plasmid purification on liquid handlers. Her role involves method development, programming for high-throughput purification, and evaluating the performance of protein purification.</blockquote>

Separation Science: Elevating Protein Purification Efficiency: Transitioning from Manual Techniques to Automated Platforms

Elevating Protein Purification Efficiency: Transitioning from Manual Techniques to Automated Platforms

The complexities of automation bring new challenges that can significantly impact workflow and performance.

Elevating Protein Purification Efficiency

<h4>Key Learning Points:</h4><ul><li>Identify the common challenges associated with solid phase extraction methods &nbsp;</li><li>Understand and troubleshoot the recovery, contamination and reproducibility issues &nbsp;</li><li>Learn how to find and apply solutions to develop robust and reproducible extraction methods for their sample preparation needs</li></ul><h4>Who Should Attend:</h4><ul><li>Any scientists who wants to learn about solid phase extraction and it’s associated challenges, common troubleshooting steps and solutions to develop robust and reproducible extraction methods for their sample preparation needs</li></ul><blockquote>Presnter: Namrata Saxena (Technical Manager, Phenomenex)Namrata is the Technical Manager for the Asia-Pacific region in Phenomenex and is based in Sydney, Australia. As a member of the global technical team, she is responsible for assisting external customers as well as internal marketing and sales teams of Phenomenex for multifarious technical queries. She specifically support company’s bio-products portfolio through external and internal seminars/webinars, trainings and also contribute in biologics related technical content creation.Before joining Phenomenex she had worked as a Product Specialist and spent several years in stationary phase chemistry, column manufacturing and method development groups in a German company Bischoff Chromatography GmbH.Namrata has a post graduate degree with specialization in Analytical Chemistry. Her competence and focus lies in biotherapeutics characterization through liquid chromatography, antibodies and oligonucleotide chemistry, gene therapy and new bio-therapeutic modalities.</blockquote>

Phenomenex: Solid Phase Extraction Troubleshooting Tips and Tricks

Solid Phase Extraction Troubleshooting Tips and Tricks

Identify the common challenges associated with solid phase extraction methods.

Our guest speakers will discuss automation within their lab and how the Andrew+ liquid handling robot has helped streamline their sample preparation workflows for proteomic analysis.Automation is fast becoming a priority for labs who are looking to improve liquid handling pipetting procedures for simple, yet critical, protocols. The automation of liquid handling procedures allows labs to streamline workflows, helping to improve.<ul><li>Reproducibility - Laboratory automation eliminates most human errors resulting in more reliable data and improved productivity.</li><li>Productivity - Andrew+ combines the flexibility of single channel pipetting (0.2 μL to 10 mL) with the higher throughput of multichannel pipetting.</li><li>Health in the Lab - Pipetting requires repetitive movements (of up to 500 times per day for the average user) that can lead to Musculo-skeletal disorders like repetitive strain injury. The use of automated liquid handling reliefs users from this high throughput pipetting burden, helping to improve health within the lab setting.</li></ul><h4>Testimonials from our guest speakers</h4><h5>Dr Harry Whitwell, Imperial College London</h5>Andrew+ has been a huge asset to the group and is used continuously to support routine sample prep from protein assay to digestion, desalting, peptide assay, sample-standardisation, plate formatting and study reference generation, helping to substantially minimise batch-variation. Data from repeated dilution series across months shows excellent reproducibility in pipetting accuracy and stability with inter-assay CV &lt;5% and R2 above 0.99.<h5>Dr Pavel Shliaha, MRC</h5>In our lab, we use automation in attention-heavy workflows, e.g. concentration normalisation and SPE. The main workflows that we are using the Andrew+ is for concentration normalisation for proteomics. We also plan to use it for SPE for proteomics. My favourite things about the Andrew+ robot are as follows: user interface, great technical support, ability to easily switch pipettes, without the necessity for calibration.<h5>Dr Colleen Maxwell, University of Leicester</h5>We previously found it a major challenge to find sample preparation solutions to match the large scale required for our large cohort clinical proteomics studies without compromising on flexibility – we used to rely on laborious protocols requiring manual pipetting steps in small batches, we have found that these are no longer suitable, and are likely to introduce unwanted batch effects over the long term. Andrew+ has revolutionised our workflows, offering versatility beyond standard bottom-up proteomics digestion and clean-up. Andrew+ is such an adaptable system, so has had a transformative impact on all aspects of experimental design, and has been adopted throughout all our bottom-up proteomics workflows at the van Geest Multiomics Facility in the University of Leicester.<blockquote>Presenter:&nbsp;Dr Harry Whitwell (Lecturer and Proteomics Platform Lead, Imperial College London)Dr Harry Whitwell has been proteomic lead at the National Phenome Centre at Imperial College London since June 2020. Alongside this position, he was appointed Lecturer in Proteomics and Integrative Data Analysis in October 2023. Building on funding MRC, EPSRC and BBSRC, he has established a far-reaching facility, supporting projects across the UK. His research focuses on combining multiple analytical modalities to understand disease including mass spec-imaging, proteomics and network-based data analysis techniques.Presenter:&nbsp;Dr Pavel Shliaha (Head of Proteomics and Metabolomics, MRC, Laboratory of Medical Sciences)Dr Pavel Shliaha completed his Ph.D. in proteomics at the laboratory of Professor Kathryn Lilley in Cambridge, UK, focusing on organelle proteomics. He then pursued a postdoctoral project in Professor Ole Jensen's group at the University of Southern Denmark, concentrating on histone PTM profiling and intact protein analysis. Pavel briefly worked at Memorial Sloan Kettering Cancer Center as a postdoc before moving to MSD (New Jersey). Throughout his career, Pavel has been interested in automation and high-throughput sample processing. In particular, he has experience working with Hamilton Star, Opentrons, and Andrew+ systems.Presenter: Dr Colleen Maxwell (Postdoctoral Researcher, University of Leicester)Colleen is a post-doctoral research associate at the Leicester van Geest Multiomics Facility at the University of Leicester. She completed her undergraduate studies in Chemistry at Imperial College London, graduating in 2019. During this time, she spent a year working in a pharmaceutical company, where she gained her initial exposure to analytical chemistry and mass spectrometry. Motivated by her interest in this field, Colleen pursued a PhD at the University of Leicester, focusing on the use of shotgun and targeted proteomics to develop and validate multiplexed biomarker panels for coronary artery disease. After completing her PhD in 2023, she continued her research as a postdoctoral associate, expanding her work to include new projects that integrate deep cardiac MRI phenotyping with proteomics in collaboration with the cardiac imaging team at Leicester. Colleen is passionate about the automation and standardisation of proteomics to ensure highly reproducible and high-throughput biomarker studies in large clinical cohorts</blockquote>

Waters Corporation: Streamlined Proteomics with the Power of Andrew+

Streamlined Proteomics with the Power of Andrew+

How the Andrew+ liquid handling robot has helped streamline their sample preparation workflows for proteomic analysis.

Measurement of FT4 and FT3 is typically performed by immunoassay, however these can be prone to suffer from interferences and a lack of selectivity. Currently, the accepted gold standard for the measurement of FT4 and FT3 is using equilibrium dialysis (ED) and combined with the use of LC-MS/MS can overcome the issues with immunoassay in the measurement of FT4 and FT3. However, the equilibrium dialysis procedure can be quite time consuming and often being performed overnight.Here, we describe a simple clinical research method to perform ED using a commercially available device followed by sample preparation by solid phase extraction (SPE) and UPLC-MS/MS analysis using the Waters™ ACQUITY™ UPLC and analytically sensitive Xevo™ TQ Absolute Mass Spectrometer for clinical research. Data analysis and review has been simplified with the use of the waters_connect™ with QUAN Review Software. This has allowed for the complete workflow including equilibrium dialysis to be performed within a typical working day.Simplified Equilibrium Dialysis for the UPLC-MS/MS Analysis of Free Testosterone (FT) for Clinical ResearchHistorically, the measurement of free testosterone in human serum has presented a challenge for laboratory scientists, with such a large portion bound and the complexity and time involved in “gold standard” equilibrium dialysis. With a simple, fast, workflow combined with the analytical sensitivity afforded by the Waters Xevo™ TQ Absolute Mass Spectrometer, a newly developed, precise, accurate and selective clinical research method will be presented.<blockquote>Presenter: Robert Wardle (Senior Clinical Scientist, Waters Corporation)Robert Wardle is currently a Senior Scientist employed at Waters Corporation in Wilmslow, UK, performing research and development of applications and products for Clinical Research. His primary area of research is vitamins and in particular vitamin D metabolites, steroid hormones and in-depth knowledge of offline and online automation.Robert joined Waters in 2010 as a Clinical Validation Scientist, playing a key role in verification activities for the MassTrak XE Immunosuppressants kit available in the EU. He moved into his current role as a Senior Scientist in 2013, where he developed clinical research methods for a range of applications including vitamin D metabolites, estrogens, a large panel of steroid hormones and more recently this application on free T4 and free T3.Presenter: Stephen Balloch (Senior Clinical Scientist, Waters Corporation)Stephen Balloch graduated from the University of York (UK) with a Master’s degree in Chemistry, which included a strong focus on analytical chemistry. Subsequently he worked as a laboratory scientist in a GLP compliant research facility, progressing to Study Director. And, since 2010, he has been part of the clinical team at Waters (Wilmslow, UK). His principal focus has been on the development and validation of bioanalytical methods according to CLSI guidelines, with a focus on therapeutic drug monitoring. Additionally, he has supported newborn screening, vitamin and steroid analysis, including this clinical research method for free testosterone</blockquote>

Free Testosterone and Free T3/T4

Simplified Equilibrium Dialysis and SPE Method for the UPLC™-MS/MS Analysis of Free Thyroxine (FT4) and Triiodothyronine (FT3) for Clinical Research.

LCMS webináře se zaměřením na Příprava vzorků - strana 12