<div><div>Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR (ÚOCHB) vyvinuli průlomovou technologii pro efektivní vývoj aptamerů. Nová metoda propojuje několik biochemických a bioinformatických kroků a otevírá cestu k novým diagnostickým a terapeutickým aplikacím. Mezi ně patří například nositelné senzory schopné v reálném čase sledovat hladiny vybraných biomarkerů v těle a včas upozornit na blížící se zdravotní komplikace. Výsledky zveřejnil časopis Nature Communications.</div></div><div>Aptamery jsou krátké řetězce DNA nebo RNA, které dokážou velmi přesně rozeznat a navázat konkrétní cílovou molekulu. Podobně jako protilátky je lze využít k detekci nebo ovlivnění funkce těchto molekul. Na rozdíl od protilátek jsou však mnohem stabilnější, lze je vyrábět synteticky a přesně chemicky upravovat podle požadovaných vlastností. Díky tomu mohou získat vlastnosti, kterých nelze u protilátek dosáhnout.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_2_81e99b9900.jpg" alt="ÚOCHB: Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek: Chemicky upravený DNA aptamer navázaný na cílový protein." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_2_81e99b9900.jpg 228w," sizes="100vw" width="1343" height="916">S rostoucí poptávkou po přesných a rychlých diagnostických nástrojích jsou aptamery v mnoha případech vhodnější než samotné protilátky. Jejich vývojový proces je však experimentálně a časově náročný a vyžaduje experty z několika vědních oborů. Tým vědců z ÚOCHB vedený dr. Markem Ondrušem a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://hocek.group.uochb.cz/">prof. Michalem Hockem</a> nyní vyvinul technologii, která celý vývojový proces výrazně zkracuje.„Vývoj aptameru často připomíná hledání jehly v kupce sena. Ve směsi bilionů různých DNA sekvencí se snažíme najít jedinou, která se silně a specificky váže na cílovou molekulu. Náš nový přístup umožňuje nejdřív nalézt ‚aptamerové rodiny‘ – stovky sekvencí s jistou podobností a následně identifikovat člena rodiny, který vykazuje nejlepší experimentální vlastnosti. Tento prvek přispívá ke zkrácení vývoje z několika měsíců na dny,“ říká Marek Ondruš.<blockquote>Video: <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.youtube.com/watch?v=-aoGvOKqORo">Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek&nbsp;</a></blockquote>Výzkumníci zároveň rozšířili možnosti využití aptamerů. Jejich stavební bloky totiž chemicky upravují – připojují k nim nové funkční skupiny, které můžeme přirozeně najít například v aminokyselinách. Takto vzniklé molekuly kombinují výhody DNA i protilátek: pořadí jednotlivých stavebních bloků je dané pořadím písmen v DNA a díky rozmanitosti připojených chemických modifikací se výrazně rozšiřují možnosti aptameru rozpoznávat biologicky významné cíle a napodobovat interakce typické pro proteiny, které jsou základem mnoha biologických procesů.&nbsp;Potenciál nové metody ukázali vědci na lidském inzulinovém receptoru, klíčovém proteinu zapojeném do regulace hladiny cukru v krvi. Vyvinuli aptamer, který se na receptor specificky váže, a pomocí kryoelektronové mikroskopie detailně popsali molekulární mechanismus vzájemné vazby.„Ukázali jsme, že chemicky zavedené funkční skupiny mají zásadní význam nejen pro rozpoznání a vytvoření komplexu aptameru s proteinem, ale také pro stabilizaci samotné struktury DNA aptameru. Naše výsledky poskytují nový pohled na to, jak lze pomocí chemicky upravených nukleových kyselin napodobovat vlastnosti proteinů,“ shrnuje Marek Ondruš.Technologie by v budoucnu mohla doplnit nebo v některých aplikacích dokonce nahradit diagnostické nástroje založené na protilátkách. Výzkumníci spolupracují na dalším rozvoji technologie se společností <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://iocbtech.cz/">IOCB Tech</a>, která pomáhá přetavit objevy z ÚOCHB do praxe.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_9694c21671.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek: Dr. Marek Ondruš, první autor studie, a prof. Michal Hocek, vedoucí vědecké skupiny Bioorganická a medicinální chemie nukleových kyselin, ÚOCHB" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_9694c21671.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><blockquote><h4>Původní článek</h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41467-026-73676-y">Expedient single-round selection of hyper-modified aptamer targeting insulin receptor from over-represented dually nucleobase-modified DNA libraries</a></h4>Pablo Alberto Franco-Urquijo, Marek Ondruš, Jaroslav Kurfürst, Jana Škerlová, Irena Selicharová, Lucie Mužíková Čechová, Hana Šváchová, Alena Semerádtová, Anatolij Filimoněnko, Adéla Fejfarová, Jiří Homola, Tomáš Kouba &amp; Michal HocekNat. Commun., 2026<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41467-026-73676-y">https://doi.org/10.1038/s41467-026-73676-y</a>&nbsp;<h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">CC-BY 4.0</a></h6></blockquote><h4>Abstrakt</h4>Objev funkčních nukleových kyselin z knihoven náhodných sekvencí se obvykle opírá o několik časově náročných iterativních kol in vitro selekce s nízkou mírou úspěšnosti. V této práci představujeme strategii selekce v jediném kole, která umožňuje rychlý screening několika nadreprezentovaných DNA knihoven s modifikovanými nukleobázemi a různých selekčních podmínek a dokáže identifikovat modifikované aptamery s vysokou afinitou. Dvojitá separace následovaná amplifikací eluovaných sekvencí, analýzou NGS a klastrováním umožňuje rychlou identifikaci kandidátních aptamerů. Screening modifikovaných DNA knihoven obsahujících modifikované adeninové a uracilové nukleotidy nesoucí hydrofobní aromatické fenylové a indolové skupiny vedl k vývoji aptameru, který se váže na lidský inzulinový receptor se subnanomolární afinitou a mimořádnou specificitou. Struktura stanovená kryoelektronovou mikroskopií odhaluje význam každé aromatické modifikace, a to buď při stabilizaci sekundární struktury, nebo při zprostředkování interakcí s povrchem proteinu. Tento přístup překonává hlavní omezení selekce aptamerů a má potenciál pro vysokokapacitní screening i urychlení vývoje aptamerů nové generace pro diagnostické nebo terapeutické aplikace.</div>

Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek

<div><div>Nadace Experientia podpoří tříletým start-up grantem vycházející hvězdu organické chemie Petru Vojáčkovou. Mladí talentovaní vědci Tereza Edlová a Ladislav Prener vycestují na zahraniční stáže.</div></div><div><div><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/start-up-granty/vyvijime-nove-strategie-pro-stavbu-molekul">Petra Vojáčková </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.uni-muenster.de/en/">University of Münster</a>&nbsp;založí svoji výzkumnou skupinu na <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.muni.cz/">Masarykově univerzitě</a> v Brně, kterou od ledna 2027 podpoří start-up grant Nadace Experientia ve výši 6 600 000 Kč. Se svým týmem bude vyvíjet nové strategie pro stavbu molekul tak, aby vznikala výhradně jejich žádoucí zrcadlová podoba.<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/zahranicni-staze/chceme-zefektivnit-vyzkum-v-oblasti-novych-materialu-i-leciv">Tereza Edlová </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.vscht.cz">VŠCHT Praha</a> díky stipendiu ve výši 1 260 000 Kč vycestuje na roční stáž na britskou <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.manchester.ac.uk">University of Manchester</a> do skupiny prof. Igora Larrosy, kde se bude věnovat projektu, který může zefektivnit výzkum v oblasti materiálů i léčiv.<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/zahranicni-staze/nase-metoda-by-mohla-urychlit-vyvoj-novych-leku">Ladislav Prener </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.uochb.cz/cs">ÚOCHB AV ČR</a> získal stipendium ve výši 1 200 000 Kč a zamíří na německou <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.rwth-aachen.de/cms/~a/root/?lidx=1">RWTH Aachen University</a> do skupiny prof. Leonoriho. Na své roční stáži bude vyvíjet metodu, která by mohla urychlit vývoj nových léků.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Nadace_Experientia_Nadace_Experientia_zna_drzitelku_start_up_grantu_a_stipendisty_pro_rok_2026_c96fdf9a4f.jpg" alt="Nadace Experientia: Nadace Experientia zná držitelku start-up grantu a stipendisty pro rok 2026" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Nadace_Experientia_Nadace_Experientia_zna_drzitelku_start_up_grantu_a_stipendisty_pro_rok_2026_c96fdf9a4f.jpg 234w," sizes="100vw" width="600" height="400"><blockquote>Nadace Experientia od roku 2012 podpořila už 27 nadějných mladých vědkyň a vědců, kteří díky stipendiu dostali šanci vycestovat na roční stáž na špičková zahraniční vědecká pracoviště. Díky programu start-up grantů si mohlo dalších 6 mladých vědkyň a vědců založit po návratu ze zahraničí vlastní výzkumnou skupinu v ČR. Celkem už na podporu mladých vědkyň a vědců vyčlenila Nadace Experientia více než 73 milionů korun.</blockquote></div></div>

Nadace Experientia zná držitelku start-up grantu a stipendisty pro rok 2026

V týdnu od 29. června na Vás čekají v oblasti kapalné fáze a především HPLC a LC/MS následující webináře.<blockquote><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.lcms.cz/webinars">👉 DETAILY A REGISTRACE V SEKCI WEBINÁŘE</a></h4></blockquote><blockquote>👉 Vyhledávejte a filtrujte v největší globální databázi s více než 5 500 GC, HPLC, MS a spektroskopickými webináři.</blockquote><h5>1. Thermo Fisher Scientific: Insights from an IC Specialist: To Be Suppressed or Not Suppressed?</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 09:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6310">Registrace</a></li></ul>Zjistěte, jak technologie supresorů ovlivňuje citlivost, selektivitu, spolehlivost i nároky na údržbu v iontové chromatografii. Webinář představí výhody i omezení potlačené a nepotlačené vodivostní detekce a nabídne praktické tipy pro řešení běžných problémů.<h5>2. SCIEX: Advancing Proteomics with ZenoTOF: From Single-Cell Analysis to Plasma Biomarker Discovery</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 11:30 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6311">Registrace</a></li></ul>Objevte možnosti hmotnostní spektrometrie ZenoTOF pro proteomiku jednotlivých buněk i analýzu plazmatických biomarkerů. Přednáška ukáže, jak vysoké rozlišení a citlivost urychlují biologický výzkum a objevování nových biomarkerů.<h5>3. Agilent Technologies: Measuring Diverse Samples with UV/VIS Spectrometers and Integrating Spheres</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 20:30 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6052">Registrace</a></li></ul>Naučte se správně měřit difúzní transmitanci a reflektanci pomocí UV/VIS spektrometrů s integrační koulí. Webinář představí praktické využití systému Cary 60 při analýze široké škály materiálů.<h5>4. Waters Corporation: Informatics Series #33: Tips, Tricks and Best Practices</h5><ul><li>Čt, 2.7.2026 11:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6315">Registrace</a></li></ul>Interaktivní lekce zaměřená na software Empower představí užitečné funkce, klávesové zkratky a osvědčené pracovní postupy, které pomohou zrychlit každodenní práci a zvýšit efektivitu zpracování chromatografických dat.<h5>5. Waters Corporation: Unlocking Therapeutic Peptide Characterisation (GLP-1RAs) with Cyclic IMS</h5><ul><li>Čt, 2.7.2026 15:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6313">Registrace</a></li></ul>Zjistěte, jak cyklická iontová mobilita rozšiřuje možnosti charakterizace terapeutických peptidů a analogů GLP-1. Webinář ukáže přínosy této technologie pro vývoj léčiv, kontrolu kvality i regulatorní dokumentaci.<h5>6. Agilent Technologies: Spectral Flow Cytometry Masterclass – Session 1</h5><ul><li>Pá, 3.7.2026 07:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6316">Registrace</a></li></ul>První část odborné série představí principy spektrální průtokové cytometrie, návrh experimentů a praktické aplikace v imunologii, onkologii i výzkumu vakcín.

Webináře LabRulezLCMS týden 27/2026

Webináře

Popularizace

Věda a výzkum

Video

Článek

Podporujeme mladé vědkyně a vědce z oboru organické, bioorganické a medicinální chemie na zahraničních stážích i zde v ČR díky tzv. start-up grantům Nadace Experientia.

Nadace Experientia

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Vše ze světa analytické chemie na jednom místě. Propojujeme lidi při řešení jejich problémů. U nás naleznete všechny potřebné informace snadno, rychle a přehledně. Přestaňte hledat a začněte nacházet.

LabRulez

Waters/Wyatt ViscoStar viskozimetrický HPLC detektor

Nová generace online diferenciálního viskozimetrického HPLC detektoru pro charakterizaci biopolymerů, syntetických polymerů a dokonce i proteinů a peptidů.

Vysoce citlivý on-line diferenciální viskozimetr používaný ve spojení se SEC-MALS ke stanovení velikosti a konformace všech typů biopolymerů, syntetických polymerů a dokonce i proteinů a peptidů.
<h4>Několik nových technologií</h4>
Waters/Wyatt ViscoStar detektor využívá několik nových technologií, které zajišťují nejvyšší citlivost, stabilitu a kompatibilitu s rozpouštědly ze všech dostupných viskozimetrů pro GPC. Díky snadnému použití a servisu je dokonalým doplňkem pro detektory DAWN® a Optilab® společnosti Waters/Wyatt.
<h3>Další cesta k charakterizaci polymerů a proteinů: SEC-MALS-IV</h3>
Ve spojení s vylučovací chromatografií (Size Exclusion Chromatography) a koncentračním detektorem, jako je Waters/Wyatt Optilab™, lze pomocí vizkozimetrického detektoru ViscoStar zjistit vnitřní viskozitu (IV) polymerů.
Vnitřní vizkozita, která je sama o sobě cennou fyzikálně-chemickou vlastností, se nejlépe využívá spolu s informacemi o molární hmotnosti z detektoru na bázi víceúhlového rozptylu světla (SEC-MALS-IV) k odvození hydrodynamického poloměru, konformace a poměru větvení makromolekuly v roztoku.
<h3>Hlavní výhody přístroje ViscoStar</h3>
<ul>
<li>Vysoká citlivost, ekvivalentní 100 ng polystyrenu o hmotnosti 100 kDa v THF při 1,0 ml/min natřik na standardní GPC kolonu.</li>
<li>Vysoký dynamický rozsah více než 135 000:1. Plný rozsah měření odpovídá více než 13 mg/ml 100 kDa polystyrenu v THF.</li>
<li>Teplotní rozsah od 4 °C do 70 °C pro polymery nebo proteiny</li>
<li>Potlačení pulzů čerpadla pod 4 Pa (samotný hardware) nebo 1 Pa (hardware + software) bez ztráty chromatografického rozlišení</li>
<li>Zvýšená teplotní stabilita s driftem &lt;2,5 Pa/hod.</li>
</ul>
<h3>SEC-IV bez MALS?</h3>
Ano, i když máme MALS pro optimální analýzu polymerů rádi, je pravda, že existují případy, kdy se prostě nehodí.
Univerzální kalibrace je paralelní technika k SEC-MALS pro stanovení molekulové hmotnosti, která se běžně používá k charakterizaci lineárních polymerů. Univerzální kalibrace sice překonává některé problematické otázky spojené s kalibrací kolony pomocí referenčních molekul, ale nezohledňuje neideální chování kolony způsobené chemickými interakcemi mezi roztokem a kolonou nebo hyperbranchingem.
<h5>Univerzální kalibrace je zvláště vhodná k nahrazení MALS pro:</h5>
<ul>
<li>silně fluoreskující polymery, zejména ty, které nejsou dostatečně charakterizovány přístrojem DAWN™ s laserem o dlouhé vlnové délce (785 nm) nebo standardním přístrojem DAWN (685 nm) s filtry blokujícími fluorescenci.</li>
</ul>
Slabě rozptylující systémy polymer/rozpouštědlo s velmi nízkými hodnotami dn/dc.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_diferencialni_refraktometricky_HPLC_detektor_Specifikace_produktu_1d19df67ef.jpg" alt="Waters Corporation: Waters diferenciální refraktometrický HPLC detektor - Specifikace produktů"/>

Waters/Wyatt microViscoStar viskozimetrický HPLC detektor

Online diferenciální viskozimetrický HPLC detektor pro charakterizaci polymerů, proteinů a peptidů.

Vysoce citlivý, on-line diferenciální viskozimetr používaný v konfiguracích SEC-MALS-IV ke stanovení velikosti a konformace polymerů, proteinů a peptidů separovaných pomocí UHPLC.
<h5>Více nových technologií</h5>
Waters/Wyatt MicroViscoStar™ obsahuje několik nových technologií, které zajišťují nejvyšší citlivost, stabilitu a kompatibilitu s rozpouštědly ze všech dostupných viskozimetrů pro UHPLC. Díky snadnému použití a servisu je dokonalým doplňkem pro UHPLC detektory MALS microDAWN™ a microOptilab™.
<h3>Další cesta k charakterizaci polymerů a proteinů: SEC-MALS-IV</h3>
Ve spojení s vylučovací chromatografií (Size Exclusion Chromatography) a koncentračním detektorem, jako je Waters/Wyatt Optilab™, lze pomocí vizkozimetrického detektoru ViscoStar zjistit vnitřní viskozitu (IV) polymerů.
Vnitřní vizkozita, která je sama o sobě cennou fyzikálně-chemickou vlastností, se nejlépe využívá spolu s informacemi o molární hmotnosti z detektoru na bázi víceúhlového rozptylu světla (SEC-MALS-IV) k odvození hydrodynamického poloměru, konformace a poměru větvení makromolekuly v roztoku.
<h3>Hlavní výhody přístroje ViscoStar</h3>
<ul>
<li>Vysoká citlivost, ekvivalentní 100 ng polystyrenu o hmotnosti 100 kDa v THF při 1,0 ml/min natřik na standardní GPC kolonu.</li>
<li>Vysoký dynamický rozsah více než 135 000:1. Plný rozsah měření odpovídá více než 13 mg/ml 100 kDa polystyrenu v THF.</li>
<li>Teplotní rozsah od 4 °C do 70 °C pro polymery nebo proteiny</li>
<li>Potlačení pulzů čerpadla pod 4 Pa (samotný hardware) nebo 1 Pa (hardware + software) bez ztráty chromatografického rozlišení</li>
<li>Zvýšená teplotní stabilita s driftem &lt;2,5 Pa/hod.</li>
</ul>
<h3>SEC-IV bez MALS?</h3>
Ano, i když máme MALS pro optimální analýzu polymerů rádi, je pravda, že existují případy, kdy se prostě nehodí.
Univerzální kalibrace je paralelní technika k SEC-MALS pro stanovení molekulové hmotnosti, která se běžně používá k charakterizaci lineárních polymerů. Univerzální kalibrace sice překonává některé problematické otázky spojené s kalibrací kolony pomocí referenčních molekul, ale nezohledňuje neideální chování kolony způsobené chemickými interakcemi mezi roztokem a kolonou nebo hyperbranchingem.
<h5>Univerzální kalibrace je zvláště vhodná k nahrazení MALS pro:</h5>
<ul>
<li>silně fluoreskující polymery, zejména ty, které nejsou dostatečně charakterizovány přístrojem DAWN™ s laserem o dlouhé vlnové délce (785 nm) nebo standardním přístrojem DAWN (685 nm) s filtry blokujícími fluorescenci.</li>
</ul>
Slabě rozptylující systémy polymer/rozpouštědlo s velmi nízkými hodnotami dn/dc.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Waters_diferencialni_refraktometricky_HPLC_detektor_Specifikace_produktu_1d19df67ef.jpg" alt="Waters Corporation: Waters diferenciální refraktometrický HPLC detektor - Specifikace produktů"/>

Produkty z kategorie Viskozimetrické detektory - strana 1

Mohlo by Vás zajímat

Webináře LabRulezLCMS týden 27/2026

Nadace Experientia zná držitelku start-up grantu a stipendisty pro rok 2026

Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek