LipidQuan Method Reference Guide: Analysis of Lipids in Plasma and Serum Samples by LC-MS/MS
Příručky | 2020 | WatersInstrumentace
Analýza lipidů v biologických kapalinách je klíčová pro identifikaci biomarkerů, porozumění metabolickým procesům a klinické a průmyslové aplikace. Semi-kvantitativní lipidomika plazmy a séra umožňuje sledovat změny v profilech fosfolipidů a ceramidů u rozsáhlých kohort, podporuje výzkum nemocí a poskytuje cenná data pro QA/QC v laboratorní praxi.
Cílem dokumentu je představit doporučený protokol Waters pro přípravu vzorků, chromatografii HILIC a analýzu pomocí UPLC-MS/MS. Popisuje postup přípravy interních standardů, kalibrační křivky, QC vzorků, extrakci proteinů z plazmy/séra a nastavení přístrojů pro semi-kvantitativní analýzu polarních lipidů.
Pro separaci se používá gradientní HILIC chromatografie s mobile phases: A (95:5 ACN/H₂O, 10 mM NH₄OAc) a B (50:50 ACN/H₂O, 10 mM NH₄OAc). Vzorky podléhají precipitaci proteinů isopropanolem (1:5 v/v), po odstředění jsou supernatanty přeneseny do vialů. Interní standard SPLASH LIPIDOMIX se připravuje ve třech ředěních a používá se pro kalibrační křivku (9 bodů) a QC (HQC, MQC, LQC). MS/MS detekce probíhá v režimech ESI pozitivním i negativním, s optimalizovanými zdrojovými a kolizními parametry a MRM přechody z TargetLynx/Quanpedia.
Metoda dosahuje lineárních odezev (R² > 0,95) pro většinu polarních lipidů (PC, PE, PG, PI, LPC, LPE, DG, TG, SM). Ne-polarní lipidy a cholesterolové estery se elují ve frontě rozpouštědla a slouží jen pro monitorování. QC kritéria (±30 % vůči HQC) jsou plněna s > 67 % průchodností. Doporučuje se dávkovat dávky po maximálně 1500 vzorcích s pravidelným zařazováním kalibračních křivek a QC injekcí.
Protokol umožňuje vysoce reprodukovatelnou, semi-kvantitativní analýzu lipidů ve velkých studiích a v laboratorní praxi. Jednoduchá protein-precipitace, standardizované mobile phases a interní standardy zajišťují konzistenci dat, vhodnost pro kohortové studie, klinické aplikace a QA/QC laboratoře.
Další rozvoj metodiky může zahrnovat automatizaci přípravy vzorků, rozšíření škály analyzovaných lipidů (non-polar lipidy, volné mastné kyseliny) a integraci s víceúrovňovou analýzou (proteomika, metabolomika). Využití pokročilého softwaru pro zpracování dat (TargetLynx, AI-podpora) a cloudové databáze lipidových profilů posílí klinickou i výzkumnou interpretaci výsledků.
Watersův LipidQuan protokol poskytuje robustní workflow pro semi-kvantitativní analýzu polarních lipidů v plazmě a séru. Díky standardizaci přípravy vzorků a nastavení LC-MS/MS lze dosáhnout vysoké reproducibility a spolehlivosti výsledků v rozsáhlých studiích.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníKlinická analýza, Lipidomika
VýrobceWaters
Souhrn
LipidQuan Method Reference Guide: Analýza lipidů v plazmě a séru pomocí LC-MS/MS
Význam tématu
Analýza lipidů v biologických kapalinách je klíčová pro identifikaci biomarkerů, porozumění metabolickým procesům a klinické a průmyslové aplikace. Semi-kvantitativní lipidomika plazmy a séra umožňuje sledovat změny v profilech fosfolipidů a ceramidů u rozsáhlých kohort, podporuje výzkum nemocí a poskytuje cenná data pro QA/QC v laboratorní praxi.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem dokumentu je představit doporučený protokol Waters pro přípravu vzorků, chromatografii HILIC a analýzu pomocí UPLC-MS/MS. Popisuje postup přípravy interních standardů, kalibrační křivky, QC vzorků, extrakci proteinů z plazmy/séra a nastavení přístrojů pro semi-kvantitativní analýzu polarních lipidů.
Použitá instrumentace
- Waters UPLC ACQUITY I-Class s BEH Amide 2.1×100 mm, 1.7 µm kolona
- Waters Xevo TQ-XS nebo TQ-S/MS s dvojím zdrojem (ESI)
- Pipety (10 µL, 200 µL, 1000 µL), centrifuga, chlazený mixer, autosampler s chlazením
Použitá metodika
Pro separaci se používá gradientní HILIC chromatografie s mobile phases: A (95:5 ACN/H₂O, 10 mM NH₄OAc) a B (50:50 ACN/H₂O, 10 mM NH₄OAc). Vzorky podléhají precipitaci proteinů isopropanolem (1:5 v/v), po odstředění jsou supernatanty přeneseny do vialů. Interní standard SPLASH LIPIDOMIX se připravuje ve třech ředěních a používá se pro kalibrační křivku (9 bodů) a QC (HQC, MQC, LQC). MS/MS detekce probíhá v režimech ESI pozitivním i negativním, s optimalizovanými zdrojovými a kolizními parametry a MRM přechody z TargetLynx/Quanpedia.
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda dosahuje lineárních odezev (R² > 0,95) pro většinu polarních lipidů (PC, PE, PG, PI, LPC, LPE, DG, TG, SM). Ne-polarní lipidy a cholesterolové estery se elují ve frontě rozpouštědla a slouží jen pro monitorování. QC kritéria (±30 % vůči HQC) jsou plněna s > 67 % průchodností. Doporučuje se dávkovat dávky po maximálně 1500 vzorcích s pravidelným zařazováním kalibračních křivek a QC injekcí.
Přínosy a praktické využití metody
Protokol umožňuje vysoce reprodukovatelnou, semi-kvantitativní analýzu lipidů ve velkých studiích a v laboratorní praxi. Jednoduchá protein-precipitace, standardizované mobile phases a interní standardy zajišťují konzistenci dat, vhodnost pro kohortové studie, klinické aplikace a QA/QC laboratoře.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj metodiky může zahrnovat automatizaci přípravy vzorků, rozšíření škály analyzovaných lipidů (non-polar lipidy, volné mastné kyseliny) a integraci s víceúrovňovou analýzou (proteomika, metabolomika). Využití pokročilého softwaru pro zpracování dat (TargetLynx, AI-podpora) a cloudové databáze lipidových profilů posílí klinickou i výzkumnou interpretaci výsledků.
Závěr
Watersův LipidQuan protokol poskytuje robustní workflow pro semi-kvantitativní analýzu polarních lipidů v plazmě a séru. Díky standardizaci přípravy vzorků a nastavení LC-MS/MS lze dosáhnout vysoké reproducibility a spolehlivosti výsledků v rozsáhlých studiích.
Reference
- Broadhurst D, Goodacre R, Reinke SN et al. Metabolomics. 14(6):72. 2018.
- Sarafian MH, Gaudin M, Lewis MR, Martin F-PJ, Holmes E, Nicholson JK, Dumas ME. Anal. Chem. 86(12):5766–5774. 2014.
- Waters Corporation. Cleaning the sample cone and gas cone. Video tutorial. 2020.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation
2018|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation Giorgis Isaac, 1 Nyasha Munjoma, 2 Lee Gethings, 2 and Rob Plumb 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA; 2 Waters Corporation, Wilmslow, UK 1 APPLICATION BENEFITS…
Klíčová slova
lipid, lipidlipidquan, lipidquanhilic, hilicsil, silclasses, classesthroughput, throughputquantitation, quantitationcomprehensive, comprehensivelpc, lpcquanpedia, quanpediapolar, polarspecies, speciesclass, classlpe, lpemethod
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PE, LPE, PG, and PI)
2019|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PE, LPE, PG, and PI) Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, Lee Gethings, and Robert Plumb Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ INTRODUCTION Rapid quantification of 112 phospholipids…
Klíčová slova
mins, minsmrm, mrmlipidquan, lipidquanquanpedia, quanpediatransition, transitionacyl, acyltargetlynx, targetlynxphosphatidylethanolamine, phosphatidylethanolaminenote, noteapplication, applicationmembrane, membranexevo, xevoclass, classfragments, fragmentsfatty
LipidQuan: Quantifying the Lipidome of Transgenic Mice Tissue Extracts, a Rapid and Comprehensive Targeted Approach
2020|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: Quantifying the Lipidome of Transgenic Mice Tissue Extracts, a Rapid and Comprehensive Targeted Approach Nyasha Munjoma, 1 Giorgis Isaac, 1 Lee A. Gethings,1 Caitlyn Da Costa,1 Robert S. Plumb,1 Amanda D.V. MacCannell, 2 and Lee…
Klíčová slova
trangenic, trangeniclipidquan, lipidquanmouse, mouseconc, conclipids, lipidstargetlynx, targetlynxapplication, applicationallowed, alloweduplc, uplcnote, notelpe, lpeacquity, acquitystd, stdlpc, lpcmurine
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM)
2018|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM) Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, Lee Gethings, and Robert Plumb Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ Rapid quantification of 106 choline Choline containing lipids,…
Klíčová slova
lipids, lipidsmrm, mrmmins, minslpc, lpcclass, classhilic, hilicisomeric, isomericsphingomyelin, sphingomyelintransitions, transitionstransition, transitionlipidquan, lipidquanisobaric, isobaricxevo, xevoquanpedia, quanpediaclasses