LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PE, LPE, PG, and PI)
Aplikace | 2019 | WatersInstrumentace
Glycerofosfolipidy jako PE, PG, PI a jejich lyzoderiváty hrají zásadní roli ve struktuře biologických membrán a signalizaci. Přesná kvantifikace těchto lipidů je klíčová pro výzkum metabolických a neurodegenerativních onemocnění. Moderní lipidomické metody čelí výzvám v podobě izomerických a izobarických interferencí.
Studie představuje platformu LipidQuan založenou na HILIC-LC-MS/MS pro cílenou vysokoprůchodovou analýzu 112 fosfolipidů (11 LPE, 47 PE, 21 PG, 33 PI) v lidské plasmě. Cílem je dosáhnout rychlé, citlivé a specifické kvantifikace v osmiminutovém běhu.
Vzorky: lidská plazma s přídavkem stabilně značených standardů v řadě koncentrací. Extrakce: precipitace bílkovin isopropanolem (1:5), následuje vícenásobné chladicí kroky a centrifugace. Chromatografie: HILIC na ACQUITY UPLC I-Class s kolonkou BEH Amide (2,1×100 mm, 1,7 µm), gradientní eluce v čase 8 min. MS detekce: Xevo TQ-XS, TQ-S a TQ-S micro, ESI v pozitivním i negativním módu, akvizice v MRM. Data zpracována v TargetLynx a Skyline.
LipidQuan metodika umožnila chromatografické oddělení tříd lipidů (PG po 1,21 min, PE 1,62 min, LPE 2,34 min, PI 2,40 min) a spolehlivou detekci 112 cílových lipidů ve čtyřech řádech dynamického rozsahu. Použití jediného stabilně značeného standardu na třídu výrazně snížilo náklady. Metoda prokázala linearitu R2 >0,95 a meziopakovatelné CV <30 %.
Platforma LipidQuan představuje robustní, rychlou a nákladově efektivní workflow pro cílenou kvantifikaci fosfolipidů v biologických vzorcích. Díky HILIC separaci, MRM detekci a optimalizovanému použití stabilně značených standardů je metoda ideální pro výzkum i rutinní QA/QC laboratorní provoz.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníKlinická analýza, Lipidomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Glycerofosfolipidy jako PE, PG, PI a jejich lyzoderiváty hrají zásadní roli ve struktuře biologických membrán a signalizaci. Přesná kvantifikace těchto lipidů je klíčová pro výzkum metabolických a neurodegenerativních onemocnění. Moderní lipidomické metody čelí výzvám v podobě izomerických a izobarických interferencí.
Cíle a přehled studie
Studie představuje platformu LipidQuan založenou na HILIC-LC-MS/MS pro cílenou vysokoprůchodovou analýzu 112 fosfolipidů (11 LPE, 47 PE, 21 PG, 33 PI) v lidské plasmě. Cílem je dosáhnout rychlé, citlivé a specifické kvantifikace v osmiminutovém běhu.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky: lidská plazma s přídavkem stabilně značených standardů v řadě koncentrací. Extrakce: precipitace bílkovin isopropanolem (1:5), následuje vícenásobné chladicí kroky a centrifugace. Chromatografie: HILIC na ACQUITY UPLC I-Class s kolonkou BEH Amide (2,1×100 mm, 1,7 µm), gradientní eluce v čase 8 min. MS detekce: Xevo TQ-XS, TQ-S a TQ-S micro, ESI v pozitivním i negativním módu, akvizice v MRM. Data zpracována v TargetLynx a Skyline.
Hlavní výsledky a diskuse
LipidQuan metodika umožnila chromatografické oddělení tříd lipidů (PG po 1,21 min, PE 1,62 min, LPE 2,34 min, PI 2,40 min) a spolehlivou detekci 112 cílových lipidů ve čtyřech řádech dynamického rozsahu. Použití jediného stabilně značeného standardu na třídu výrazně snížilo náklady. Metoda prokázala linearitu R2 >0,95 a meziopakovatelné CV <30 %.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá analýza až 112 fosfolipidů v rámci jediné osmiminutové sekvence
- Minimalizace izomerických a izobarických interferencí díky HILIC separaci
- Snížení nákladů na standardy díky použití jednoho značeného standardu na třídu
- Jednoduchý přenos metody mezi laboratořemi s hotovou Quanpedia metodou
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření aplikace na další lipidové třídy a malé molekuly
- Integrace s vysokorozlišovacími a iontově mobilními technikami
- Automatizace přípravy vzorků a zpracování dat pomocí pokročilých bioinformatických nástrojů
- Multiomické přístupy spojující lipidomiku s proteomikou a metabolomikou
Závěr
Platforma LipidQuan představuje robustní, rychlou a nákladově efektivní workflow pro cílenou kvantifikaci fosfolipidů v biologických vzorcích. Díky HILIC separaci, MRM detekci a optimalizovanému použití stabilně značených standardů je metoda ideální pro výzkum i rutinní QA/QC laboratorní provoz.
Reference
- Calzada E, Onguka O, Claypool SM. Phosphatidylethanolamine Metabolism in Health and Disease. International Review of Cell and Molecular Biology 321:29–88, 2016
- Tracey TJ, Steyn FJ, Wolvetang EJ, Ngo ST. Neuronal Lipid Metabolism: Multiple Pathways Driving Functional Outcomes in Health and Disease. Frontiers in Molecular Neuroscience 11:10, 2018
- Cifkova E, Holcapek M, Lisa M, Ovcacikova M, Lycka A, Lynen F, Sandra P. Nontargeted Quantitation of Lipid Classes Using Hydrophilic Interaction LC-ESI MS with Single Internal Standard and Response Factor Approach. Analytical Chemistry 84(22):10064–10070, 2012
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM)
2018|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM) Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, Lee Gethings, and Robert Plumb Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ Rapid quantification of 106 choline Choline containing lipids,…
Klíčová slova
lipids, lipidsmrm, mrmmins, minslpc, lpcclass, classhilic, hilicisomeric, isomericsphingomyelin, sphingomyelintransitions, transitionstransition, transitionlipidquan, lipidquanisobaric, isobaricxevo, xevoquanpedia, quanpediaclasses
LipidQuan: Quantifying the Lipidome of Transgenic Mice Tissue Extracts, a Rapid and Comprehensive Targeted Approach
2020|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: Quantifying the Lipidome of Transgenic Mice Tissue Extracts, a Rapid and Comprehensive Targeted Approach Nyasha Munjoma, 1 Giorgis Isaac, 1 Lee A. Gethings,1 Caitlyn Da Costa,1 Robert S. Plumb,1 Amanda D.V. MacCannell, 2 and Lee…
Klíčová slova
trangenic, trangeniclipidquan, lipidquanmouse, mouseconc, conclipids, lipidstargetlynx, targetlynxapplication, applicationallowed, alloweduplc, uplcnote, notelpe, lpeacquity, acquitystd, stdlpc, lpcmurine
LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation
2018|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation Giorgis Isaac, 1 Nyasha Munjoma, 2 Lee Gethings, 2 and Rob Plumb 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA; 2 Waters Corporation, Wilmslow, UK 1 APPLICATION BENEFITS…
Klíčová slova
lipid, lipidlipidquan, lipidquanhilic, hilicsil, silclasses, classesthroughput, throughputquantitation, quantitationcomprehensive, comprehensivelpc, lpcquanpedia, quanpediapolar, polarspecies, speciesclass, classlpe, lpemethod
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Ceramide and Hexosylceramide Screen
2019|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Ceramide and Hexosylceramide Screen Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, and Lee Gethings Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ Rapid quantification of 24 ceramides, Sphingolipids (SLs) are a class of lipid…
Klíčová slova
sil, siltargetlynx, targetlynxlipid, lipidxevo, xevohexcer, hexcermrm, mrmclass, classlipidquan, lipidquancer, cerlipids, lipidsplasma, plasmahilic, hilicmins, minsuplc, uplcacquity