LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation

Aplikace | 2018 | WatersInstrumentace
Software, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Zaměření
Lipidomika
Výrobce
Waters

Souhrn

Význam tématu


Vývoj flexibilních a rychlých analytických metod pro cílenou kvantifikaci lipidů je klíčový pro pokrok v lipidomice. Lipidy hrají zásadní roli v energetickém metabolismu, strukturní integritě buněk a buněčné signalizaci, přičemž jejich dysregulace souvisí s řadou onemocnění, jako jsou rakovina, záněty a kardiovaskulární choroby.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem studie bylo vyvinout vysoce průtokovou, komplexní HILIC-based LC-MS/MS metodu (LipidQuan) pro rychlou chromatografickou separaci a cílenou kvantifikaci polárních i nepolárních lipidových tříd v lidské plazmě během 8 minut.

Použitá metodika a instrumentace


Vzorky plazmy byly připraveny precipitací proteinů studeným isopropanolem (1:5, 4 °C), následovanou vířením, chlazením a centrifugací. Chromatografie byla prováděna na systému ACQUITY UPLC I-Class s kolonkou BEH Amide (2,1×100 mm, 1,7 µm) v režimu HILIC. Detekce proběhla na hmotnostních spektrometrech Waters Xevo TQ-XS nebo Xevo TQ-S v režimech MRM s elektrosprejovou ionizací (ESI) v pozitivním i negativním módu. Softwarově byla data zpracována pomocí TargetLynx nebo Skyline a metodický soubor Quanpedia obsahoval 2041 MRM přechodů s retenčními časy.

Hlavní výsledky a diskuse


Metoda umožnila separaci 16 lipidových tříd v čase 8 minut. Z NIST Standard Reference Material® 1950 plazmy bylo detekováno a kvantifikováno 508 lipidových druhů (261 v pozitivním, 247 v negativním módu). Kalibrační křivky pro isotopické standardy měly linearitu přes 4 řády (průměrné korelační koeficienty >0,99 v + módu a >0,98 v – módu). Separace podle tříd minimalizovala izobarické interference a výrazně snížila počet nutných stabilně značených standardů.

Přínosy a praktické využití metody


  • Vysoká propustnost analytických sérií díky osmi minutovému běhu.
  • Komplexní pokrytí 16 lipidových tříd s rozlišením na třídě založeném HILIC.
  • Snížení nákladů na standardy díky společné separaci lipidů a jejich izotopických analogů.
  • Robustní nasazení bez manuálního zadávání metod díky Quanpedia method file.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Integrace plně automatizovaných pracovních postupů pro klinické a velkosériové studie.
  • Rozšíření databází MRM přechodů o nové lipidové molekuly a modifikace.
  • Kombinace lipidomických dat s dalšími omickými přístupy a pokročilou bioinformatikou.
  • Pokračující vývoj hmotnostních spektrometrů s vyšším rozlišením a citlivostí.

Závěr


Metoda LipidQuan představuje rychlou, robustní a cenově efektivní platformu pro cílenou kvantifikaci širokého spektra lipidů v plazmě. Díky chromatografii podle tříd a softwarové integraci Quanpedia se zjednodušuje validace a snižuje chybovost metodického nastavení.

Reference


  1. Quehenberger O., Dennis E.A.: The Human Plasma Lipidome. N. Engl. J. Med. 2011, 364:1812–1823.
  2. Líša M., Holčapek M.: High-Throughput and Comprehensive Lipidomic Analysis Using Ultrahigh-Performance Supercritical Fluid Chromatography Mass Spectrometry. Anal. Chem. 2015, 87(14):7187–7195.
  3. Grumbach E.S., Fountain K.J.: Comprehensive Guide to HILIC. Hydrophilic Interaction Chromatography. Waters Corporation 2010.
  4. Cífková E. et al.: Nontargeted Quantitation of Lipid Classes Using HILIC-ESI MS with Single Internal Standard and Response Factor Approach. Anal. Chem. 2012, 84(22):10064–10070.
  5. Sarafian M.H. et al.: Objective Set of Criteria for Optimization of Sample Preparation Procedures for UHT Untargeted Blood Plasma Lipid Profiling by UPLC-MS. Anal. Chem. 2014, 86(11):5766–5774.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation
Application Note LipidQuan for Comprehensive and HighThroughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation Giorgis Isaac, Nyasha Munjoma, Lee A. Gethings, Robert S. Plumb Waters Corporation For research use only. Not for use in diagnostic procedures. Abstract This application note describes a…
Klíčová slova
lipid, lipidclasses, classeshilic, hilicpolar, polarlipidquan, lipidquanacquity, acquitysil, silspecies, speciesuplc, uplccomprehensive, comprehensivequanpedia, quanpediaclass, classthroughput, throughputquantitation, quantitationmethod
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM)
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM) Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, Lee Gethings, and Robert Plumb Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ Rapid quantification of 106 choline Choline containing lipids,…
Klíčová slova
lipids, lipidsmrm, mrmmins, minslpc, lpcclass, classhilic, hilicisomeric, isomericsphingomyelin, sphingomyelintransitions, transitionstransition, transitionlipidquan, lipidquanisobaric, isobaricxevo, xevoquanpedia, quanpediaclasses
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PE, LPE, PG, and PI)
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PE, LPE, PG, and PI) Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, Lee Gethings, and Robert Plumb Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ INTRODUCTION Rapid quantification of 112 phospholipids…
Klíčová slova
mins, minsmrm, mrmlipidquan, lipidquanquanpedia, quanpediatransition, transitionacyl, acyltargetlynx, targetlynxphosphatidylethanolamine, phosphatidylethanolaminenote, noteapplication, applicationmembrane, membranexevo, xevoclass, classfragments, fragmentsfatty
LipidQuan: Quantifying the Lipidome of Transgenic Mice Tissue Extracts, a Rapid and Comprehensive Targeted Approach
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: Quantifying the Lipidome of Transgenic Mice Tissue Extracts, a Rapid and Comprehensive Targeted Approach Nyasha Munjoma, 1 Giorgis Isaac, 1 Lee A. Gethings,1 Caitlyn Da Costa,1 Robert S. Plumb,1 Amanda D.V. MacCannell, 2 and Lee…
Klíčová slova
trangenic, trangeniclipidquan, lipidquanmouse, mouseconc, conclipids, lipidstargetlynx, targetlynxapplication, applicationallowed, alloweduplc, uplcnote, notelpe, lpeacquity, acquitystd, stdlpc, lpcmurine
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.