LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Ceramide and Hexosylceramide Screen
Aplikace | 2019 | WatersInstrumentace
Plazmaticke a serove sfingolipidy, zejmena ceramidy a hexosylceramidy, hraji klicovou roli v bunecnych membranach a signalizaci, pritom jejich dysregulace souvisi s onemocnenimi jako Parkinsonova choroba ci rakovina. Presne stanovení techto lipidů muze prispet k lepsimu pochopeni biologickych procesu a vyuziti v klinicke diagnostice.
Cílem studie bylo vyvinout rychlou, vysoke propustnou a cenove efektivní LC-MS/MS metodu zalozenou na HILIC chromatografii pro cilene stanovení 24 ceramidu, 23 hexosylceramidu a sfingosinu v malém objemu plasmy a sera. Metoda ma zajistit robustní kvantifikaci s minimalizovanou potrebou stabilne izotopove oznacenych standardu a snadnou implementaci v laboratornich prostredich.
Vzorky byly pripravovany srazkou proteinu predchladeny isopropanolem v pomeru 1:5, po odstredivce byly supernatanty prevedeny do vial pro chromatografii. Separace probiha na BEH Amide kolone pri toku 0,6 mL/min a gradiencni mobile phase v osmiminutovem behu. Hmotnostni spektrometr pracuje v pozitivnim ESI rezimu v MRM modu s charakteristickym produktovým iontem m/z 264 pro dlouhy retezec baze.
Ultravykonný chromatograf ACQUITY UPLC I-Class
BEH Amide kolona 2.1×100 mm, 1.7 µm
Hmotnostni spektrometry Xevo TQ-S micro a Xevo TQ-XS
Software TargetLynx, Quanpedia a Skyline
Metoda umožnila trideni lipidovych trid do casovych oken 0.4 az 1.1 minuty, cime se snizuje riziko isomerních a isobarních interferenci. Kalibracni krivky pro deuterovane ceramidy pokryly ctyri logaritmicke rozsahy s koeficientem determinace R2 nad 0.95 a akceptovatelnymi CV pod 30 procent pri hranicich kvantifikace. Analýza 50 µL plazmy vykazala dobrou citlivost pro endogenni koncentrace.
Vyvinuta metoda poskytuje rychly, robustni a cenove efektivni pristup pro cilene kvantifikace ceramidu, hexosylceramidu a sfingosinu v plazme a seru. HILIC separace podle trid lipidů usnadnuje identifikaci a zkracuje dobu analyzy, soucasne snizuje naklady na standartni materialy, coz podporuje rozsahle lipidomicke studie i klinicke aplikace.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníKlinická analýza, Lipidomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Plazmaticke a serove sfingolipidy, zejmena ceramidy a hexosylceramidy, hraji klicovou roli v bunecnych membranach a signalizaci, pritom jejich dysregulace souvisi s onemocnenimi jako Parkinsonova choroba ci rakovina. Presne stanovení techto lipidů muze prispet k lepsimu pochopeni biologickych procesu a vyuziti v klinicke diagnostice.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo vyvinout rychlou, vysoke propustnou a cenove efektivní LC-MS/MS metodu zalozenou na HILIC chromatografii pro cilene stanovení 24 ceramidu, 23 hexosylceramidu a sfingosinu v malém objemu plasmy a sera. Metoda ma zajistit robustní kvantifikaci s minimalizovanou potrebou stabilne izotopove oznacenych standardu a snadnou implementaci v laboratornich prostredich.
Použitá metodika
Vzorky byly pripravovany srazkou proteinu predchladeny isopropanolem v pomeru 1:5, po odstredivce byly supernatanty prevedeny do vial pro chromatografii. Separace probiha na BEH Amide kolone pri toku 0,6 mL/min a gradiencni mobile phase v osmiminutovem behu. Hmotnostni spektrometr pracuje v pozitivnim ESI rezimu v MRM modu s charakteristickym produktovým iontem m/z 264 pro dlouhy retezec baze.
Použitá instrumentace
Ultravykonný chromatograf ACQUITY UPLC I-Class
BEH Amide kolona 2.1×100 mm, 1.7 µm
Hmotnostni spektrometry Xevo TQ-S micro a Xevo TQ-XS
Software TargetLynx, Quanpedia a Skyline
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda umožnila trideni lipidovych trid do casovych oken 0.4 az 1.1 minuty, cime se snizuje riziko isomerních a isobarních interferenci. Kalibracni krivky pro deuterovane ceramidy pokryly ctyri logaritmicke rozsahy s koeficientem determinace R2 nad 0.95 a akceptovatelnymi CV pod 30 procent pri hranicich kvantifikace. Analýza 50 µL plazmy vykazala dobrou citlivost pro endogenni koncentrace.
Přínosy a praktické využití metody
- Vysoka propustnost s celkovou dobou analyzy osmi minut
- Snížení nakladu na standardy diky tridnimu separacnimu pristupu
- Snadna nasaditelnost v ruznych laboratoriich a minimalizace rizika chybných nastaveni
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozsireni metodiky na dalsi kategorie lipidových analyz
- Integrace do klinickych lipidomickych studii a vyvoje biomarkeru
- Automatizace pripravy vzorku a pokrocile datove analyzy lipidomickych profilu
Závěr
Vyvinuta metoda poskytuje rychly, robustni a cenove efektivni pristup pro cilene kvantifikace ceramidu, hexosylceramidu a sfingosinu v plazme a seru. HILIC separace podle trid lipidů usnadnuje identifikaci a zkracuje dobu analyzy, soucasne snizuje naklady na standartni materialy, coz podporuje rozsahle lipidomicke studie i klinicke aplikace.
Reference
- Merrill AH Jr. Sphingolipid and Glycosphingolipid Metabolic Pathways in the Era of Sphingolipidomics. Chem Rev. 2011;111(10):6387-6422.
- Bieberich E. Ceramide Signaling in Cancer and Stem Cells. Future Lipidol. 2008;3(3):273-300.
- Kosinska MK et al. Sphingolipids in Human Synovial Fluid – A Lipidomic Study. PLoS ONE. 2014;9(3):e91769.
- Ogretmen B. Sphingolipid Metabolism in Cancer Signalling and Therapy. Nat Rev Cancer. 2018;18:33-50.
- Mielke MM et al. Plasma Ceramide and Glucosylceramide Metabolism Is Altered in Sporadic Parkinsons Disease and Associated with Cognitive Impairment: A Pilot Study. PLoS ONE. 2013;8(9):e73094.
- Cifkova E et al. Nontargeted Quantitation of Lipid Classes Using Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography–Electrospray Ionization Mass Spectrometry. Anal Chem. 2012;84(22):10064-10070.
- Pulfer M, Murphy RC. Electrospray Mass Spectrometry of Phospholipids. Mass Spectrom Rev. 2003;22(5):332-364.
- Munjoma N, Isaac G, Gethings L, Plumb R. LipidQuan: HILIC-based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen. Waters Application Note. 2019.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM)
2018|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PC, LPC, SM) Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, Lee Gethings, and Robert Plumb Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ Rapid quantification of 106 choline Choline containing lipids,…
Klíčová slova
lipids, lipidsmrm, mrmmins, minslpc, lpcclass, classhilic, hilicisomeric, isomericsphingomyelin, sphingomyelintransitions, transitionstransition, transitionlipidquan, lipidquanisobaric, isobaricxevo, xevoquanpedia, quanpediaclasses
LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation
2018|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan for Comprehensive and High-Throughput HILIC-based LC-MS/MS Targeted Lipid Quantitation Giorgis Isaac, 1 Nyasha Munjoma, 2 Lee Gethings, 2 and Rob Plumb 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA; 2 Waters Corporation, Wilmslow, UK 1 APPLICATION BENEFITS…
Klíčová slova
lipid, lipidlipidquan, lipidquanhilic, hilicsil, silclasses, classesthroughput, throughputquantitation, quantitationcomprehensive, comprehensivelpc, lpcquanpedia, quanpediapolar, polarspecies, speciesclass, classlpe, lpemethod
LipidQuan: A Rapid and Comprehensive Targeted Approach Investigating the Lipidome of Bladder Cancer Subjects
2020|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: A Rapid and Comprehensive Targeted Approach Investigating the Lipidome of Bladder Cancer Subjects Nyasha Munjoma, 1 Giorgis Isaac, 2 Lee A. Gethings,1 and Robert S. Plumb 2 1 Waters Corporation, Wilmslow, UK 2 Waters Corporation,…
Klíčová slova
bladder, bladdercancer, cancerlipid, lipidtargetlynx, targetlynxtoml, tomllipids, lipidsuplc, uplcacquity, acquityplasma, plasmaapplication, applicationstd, stdtargeted, targetedconc, concsubjects, subjectsclass
LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PE, LPE, PG, and PI)
2019|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] LipidQuan: HILIC-Based LC-MS/MS High-Throughput Targeted Phospholipids Screen (PE, LPE, PG, and PI) Nyasha Munjoma, Giorgis Isaac, Lee Gethings, and Robert Plumb Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ INTRODUCTION Rapid quantification of 112 phospholipids…
Klíčová slova
mins, minsmrm, mrmlipidquan, lipidquanquanpedia, quanpediatransition, transitionacyl, acyltargetlynx, targetlynxphosphatidylethanolamine, phosphatidylethanolaminenote, noteapplication, applicationmembrane, membranexevo, xevoclass, classfragments, fragmentsfatty