Standardized Targeted Metabolomics Using the BIOCRATES MxP Quant 500 Kit on the ACQUITY UPLC I-Class PLUS and Xevo TQ-XS Mass Spectrometer
Aplikace | 2020 | WatersInstrumentace
Metabolomika nabývá v biomedicínském výzkumu a průmyslové analytice zásadního významu pro pochopení fyziologických a patologických procesů. Standardizace a automatizace analýzy remediuje variability mezi laboratořemi a zkracuje čas potřebný k získání reprodukovatelných dat.
Cílem bylo ověřit výkonnost komerčně dostupné sady BIOCRATES MxP Quant 500 pro kvantitativní stanovení až 630 metabolitů a lipidů v 10µl vzorku lidské plazmy na platformě Waters ACQUITY UPLC I-Class PLUS spojené s Xevo TQ-XS. Studie zahrnovala optimalizaci instrumentálních podmínek, validaci analytických parametrů a porovnání s předchozí generací hmotnostního spektrometru Xevo TQ-S.
Vzorky (plazma, sérum, tkáň, fekální homogenát) byly připraveny na patentované 96-jamkové filtraci, derivatizovány PITC a extrahovány metanolickým extrakčním činidlem. Analýza probíhala v režimu UHPLC-ESI-MS/MS (13 tříd malých molekul) a FIA-MS/MS (12 lipidových tříd a hexózy) v režimu MRM.
Optimalizace vedla k analýze 7min běhu LC a 4min FIA, což odpovídá ~36h pro 96 jamkovou desku. Validace dle EMA/FDA ukázala pro 7bodovou kalibraci přesnost 85–115 % a opakovatelnost CV<15 % pro všechny stanovené analyty. U lipidu byly dosaženy výsledky „relativní kvantifikace“ s CV<15 % a přesností 80–120 %. Při analýze referenčního materiálu NIST SRM1950 bylo opět dosaženo přesností mezi 85–115 %, potvrzující mezinárodní srovnatelnost výsledků. Systém Xevo TQ-XS oproti TQ-S dokázal detekovat asi o 20 dalších metabolitů a poskytl širší dynamický rozsah.
Standardizovaná sada umožňuje vysokopropustnou, reprodukovatelnou multianalyzovou kvantifikaci s minimální spotřebou vzorku. Je vhodná pro klinické a preklinické studie, průmyslovou QA/QC, výzkum mikrobiomu a srovnávací studie mezi laboratořemi.
Očekává se rozšíření metodiky na nové biologické matice, zdokonalení vysokorychlostních chromatografických technik a hlubší integrace s bioinformatickými nástroji, včetně strojového učení pro rychlou interpretaci metabolomických dat.
Sada BIOCRATES MxP Quant 500 na platformě UPLC-Xevo TQ-XS poskytuje robustní, standardizovaný workflow pro cílenou metabolomiku a lipidomiku, s vynikající přesností, opakovatelností a možností mezi-laboratorní srovnatelnosti výsledků.
Příprava vzorků, Spotřební materiál, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Metabolomika nabývá v biomedicínském výzkumu a průmyslové analytice zásadního významu pro pochopení fyziologických a patologických procesů. Standardizace a automatizace analýzy remediuje variability mezi laboratořemi a zkracuje čas potřebný k získání reprodukovatelných dat.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem bylo ověřit výkonnost komerčně dostupné sady BIOCRATES MxP Quant 500 pro kvantitativní stanovení až 630 metabolitů a lipidů v 10µl vzorku lidské plazmy na platformě Waters ACQUITY UPLC I-Class PLUS spojené s Xevo TQ-XS. Studie zahrnovala optimalizaci instrumentálních podmínek, validaci analytických parametrů a porovnání s předchozí generací hmotnostního spektrometru Xevo TQ-S.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky (plazma, sérum, tkáň, fekální homogenát) byly připraveny na patentované 96-jamkové filtraci, derivatizovány PITC a extrahovány metanolickým extrakčním činidlem. Analýza probíhala v režimu UHPLC-ESI-MS/MS (13 tříd malých molekul) a FIA-MS/MS (12 lipidových tříd a hexózy) v režimu MRM.
- ULPC systém: ACQUITY UPLC I-Class PLUS s BIOCRATES MxP Quant 500 kolonkou
- Hmotový spektrometr: Waters Xevo TQ-XS
- Software: MassLynx v4.2, TargetLynx, MetIDQ s modulem MetaboINDICATOR
Hlavní výsledky a diskuse
Optimalizace vedla k analýze 7min běhu LC a 4min FIA, což odpovídá ~36h pro 96 jamkovou desku. Validace dle EMA/FDA ukázala pro 7bodovou kalibraci přesnost 85–115 % a opakovatelnost CV<15 % pro všechny stanovené analyty. U lipidu byly dosaženy výsledky „relativní kvantifikace“ s CV<15 % a přesností 80–120 %. Při analýze referenčního materiálu NIST SRM1950 bylo opět dosaženo přesností mezi 85–115 %, potvrzující mezinárodní srovnatelnost výsledků. Systém Xevo TQ-XS oproti TQ-S dokázal detekovat asi o 20 dalších metabolitů a poskytl širší dynamický rozsah.
Přínosy a praktické využití metody
Standardizovaná sada umožňuje vysokopropustnou, reprodukovatelnou multianalyzovou kvantifikaci s minimální spotřebou vzorku. Je vhodná pro klinické a preklinické studie, průmyslovou QA/QC, výzkum mikrobiomu a srovnávací studie mezi laboratořemi.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření metodiky na nové biologické matice, zdokonalení vysokorychlostních chromatografických technik a hlubší integrace s bioinformatickými nástroji, včetně strojového učení pro rychlou interpretaci metabolomických dat.
Závěr
Sada BIOCRATES MxP Quant 500 na platformě UPLC-Xevo TQ-XS poskytuje robustní, standardizovaný workflow pro cílenou metabolomiku a lipidomiku, s vynikající přesností, opakovatelností a možností mezi-laboratorní srovnatelnosti výsledků.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Targeted Lipidomic Analysis of Pediatric Leukemia Cells Using LC-MS/MS Triple Quadrupole
2023|Agilent Technologies|Postery
Poster Reprint ASMS 2023 Poster number WP 564 Targeted Lipidomic Analysis of Pediatric Leukemia Cells Using LC-MS/MS Triple Quadrupole Lihua Jiang1, Ruiqi Jian1, Hui Zhao2, Yanan Yang2 , Mark Sartain2 , Maya Kasowski3, Mike Snyder1 1Department USA 2Agilent 3School of…
Klíčová slova
glycerophospholipids, glycerophospholipidscer, cerleukemia, leukemiaplasmalogen, plasmalogenbone, bonepediatric, pediatricmarrow, marrowlipid, lipidcells, cellsubiquinone, ubiquinoneester, estercholesteryl, cholesteryllpc, lpclipidomic, lipidomicprogenitor
LC/MS Method for Comprehensive Analysis of Plasma Lipids
2018|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Lipidomics LC/MS Method for Comprehensive Analysis of Plasma Lipids Authors Tomas Cajka and Oliver Fiehn West Coast Metabolomics Center, University of California Davis, 451 Health Sciences Drive, Davis, CA 95616, USA Abstract This Application Note describes the analysis…
Klíčová slova
hac, hacajs, ajslipid, lipidlipids, lipidsmin, minnonesterified, nonesterifiedcuda, cudaistd, istdlipidomics, lipidomicscounts, countscontinued, continuedacquisition, acquisitionionization, ionizationmodifiers, modifiersagilent
Unraveling the Complexity of Lipidomes by Multiple Heart-Cutting Q-TOF LC/MS with the Agilent 1290 Infinity 2D-LC Solution
2019|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Biotherapeutics and Biosimilars Unraveling the Complexity of Lipidomes by Multiple Heart-Cutting Q-TOF LC/MS with the Agilent 1290 Infinity 2D-LC Solution Authors Gerd Vanhoenacker1, Ruben t’Kindt1,2, Frank David1, Pat Sandra1,2, and Koen Sandra1,2 1 Research Institute for Chromatography President…
Klíčová slova
counts, countsdimension, dimensionsputum, sputumrplc, rplclipid, lipidmin, minacquisition, acquisitionheart, hearthilic, hiliccutting, cuttingfirst, firstplasma, plasmaextracted, extractedlipids, lipidsidentity
A Comprehensive, Curated, High‑Throughput Method for the Detailed Analysis of the Plasma Lipidome
2021|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Metabolomics/ Clinical Research A Comprehensive, Curated, High‑Throughput Method for the Detailed Analysis of the Plasma Lipidome Authors Kevin Huynh, Natalie A. Mellett, Thy Duong, Anh Nguyen, Thomas G. Meikle, Corey Giles, and Peter J. Meikle Baker Heart and…
Klíčová slova
unit, unitfalse, falsepositive, positiveacylcarn, acylcarncer, cercompound, compoundlpc, lpcavanti, avantires, rescmpnd, cmpndistd, istdsim, simffa, ffatrue, truehexcer