LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Phospholipid Profiling Method in Human Plasma Using the Shim-pack Scepter Claris C18

Aplikace | 2025 | ShimadzuInstrumentace
Spotřební materiál, LC kolony, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Zaměření
Klinická analýza, Lipidomika
Výrobce
Shimadzu

Souhrn

Význam tématu


Analýza fosfolipidů v lidském plazmatickém vzorku je klíčová pro identifikaci biomarkerů a studium patofyziologických procesů. Přesné kvantitativní profilování komplexních lipidových směsí přispívá k lepšímu porozumění buněčných mechanismů a umožňuje monitorovat metabolické změny spojené s onemocněními.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem prezentované práce je popsat vývoj a validaci rychlé a spolehlivé metody pro kvantitativní profilování fosfolipidů v lidské plazmě. Metoda využívá Shim-pack Scepter Claris C18 kolonu v kombinaci s LCMS-8060RX trojúhelníkovým kvadrupólovým hmotnostním spektrometrem a knihovnu MRM přechodů pro cílenou analýzu 162 fosfolipidů během 20minutového cyklu chromatografie.

Použitá instrumentace


  • UHPLC: Nexera ultra vysokotlaký kapalinový chromatograf (Shimadzu)
  • Kolona: Shim-pack Scepter Claris C18, 2.1 × 100 mm, 1.9 μm, teplota 50 °C
  • Hmotnostní spektrometr: LCMS-8060RX s dvojím ionizačním režimem ESI (pozitivní/negativní)
  • Mobilní fáze A: 20 mM dusičnan amonný ve vodě; fáze B: acetonitril/2-propanol (1:1)
  • Metoda MRM: knihovna 1969 přechodů, zkušebně redukovaná na 721 a následně na 399 přechodů pro optimalizaci doby sledování a opakovatelnosti.

Hlavní výsledky a diskuse


Po extrakci vzorku metanol-formiátem a centrifugaci byla analyzována 162 fosfolipidních složek. Snížení počtu MRM přechodů z 721 na 399 umožnilo navýšit čas sledování na 4 ms/přechod a zkrátit cyklus na 20 minut. Výsledkem bylo dosažení CV ≤ 20 % pro 91 % analyzovaných sloučenin (148 z 162), oproti 64 % při původním nastavení. Tato úprava potvrdila, že optimalizace počtu a doby sledování MRM přechodů významně zvyšuje spolehlivost kvantifikace.

Přínosy a praktické využití metody


  • Rychlá analýza 162 fosfolipidů v plazmě bez nutnosti použití externích standardů díky rozšířené MRM knihovně.
  • Vysoká opakovatelnost kvantitativních dat (CV ≤ 20 % pro většinu sloučenin).
  • Možnost přizpůsobení metody pro různé biologické vzorky a monitorování biologických markerů v klinických a výzkumných aplikacích.

Budoucí trendy a možnosti využití


Očekává se rozšíření MRM knihoven o další lipidové třídy a využití strojového učení pro automatizovanou interpretaci dat. Dále se plánuje integrace s iontovou mobilitou pro lepší rozlišení izomerů a nasazení ve velkokapacitním screeningu metabolomických změn.

Závěr


Vyvinutá metoda kombinuje rychlou chromatografii na Shim-pack Scepter Claris C18 a cílenou MRM analýzu na LCMS-8060RX. Optimalizace počtu přechodů a času sledování významně zlepšila opakovatelnost a umožnila kvantitativní profilování 162 fosfolipidů v lidské plazmě během 20 minut.

Reference


  1. Shimadzu Review 77 (3-4), 125-134 (2020)
  2. Japan Patent Registration No. 6611009

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Development of an MRM based phospholipid profiling method in human plasma using an inert C18 column
ThP 449 Development of an MRM based phospholipid profiling method in human plasma using an inert C18 column Masaki Yamada, Naoko Nagano, Yohei Arao, Yutaka Umakoshi Shimadzu Corporation. 1, Nishinokyo-Kuwabaracho Nakagyo-ku, Kyoto 604–8511, Japan 4-2. Phospholipids in human plasma 1.…
Klíčová slova
lpc, lpclpe, lpephospholipids, phospholipidslpi, lpigas, gasflow, flowaffiliated, affiliatedscepter, scepterplasma, plasmaultra, ultraname, namefast, fastattractive, attractivespectrometer, spectrometerbiomarker
IMSC: Identification of Phospholipid Species Implicated in Dementia by Untargeted LC/HRMS and Data Dependent MS/MS
Results: Fatty acids comprising the molecular phospholipid species were unambiguously identified. ne Proteome Discoverer software is a node-based workflow engine and study management 55 platform for analysis of mass spectrometry-based proteomics datasets. The latest released version 2.1 fully supports isotopically-labeled…
Klíčová slova
hcd, hcdspecies, speciescid, cidlipid, lipidyes, yeshco, hcoandand, andandphospholipids, phospholipidsdementia, dementiappm, ppmidentification, identificationlipids, lipidsfigure, figurepcpc, pcpclipidsearch
A Comprehensive, Curated, High‑Throughput Method for the Detailed Analysis of the Plasma Lipidome
Application Note Metabolomics/ Clinical Research A Comprehensive, Curated, High‑Throughput Method for the Detailed Analysis of the Plasma Lipidome Authors Kevin Huynh, Natalie A. Mellett, Thy Duong, Anh Nguyen, Thomas G. Meikle, Corey Giles, and Peter J. Meikle Baker Heart and…
Klíčová slova
unit, unitfalse, falsepositive, positiveacylcarn, acylcarncer, cercompound, compoundlpc, lpcavanti, avantires, rescmpnd, cmpndistd, istdsim, simffa, ffatrue, truehexcer
Targeted Lipidomic Analysis of Pediatric Leukemia Cells Using LC-MS/MS Triple Quadrupole
Poster Reprint ASMS 2023 Poster number WP 564 Targeted Lipidomic Analysis of Pediatric Leukemia Cells Using LC-MS/MS Triple Quadrupole Lihua Jiang1, Ruiqi Jian1, Hui Zhao2, Yanan Yang2 , Mark Sartain2 , Maya Kasowski3, Mike Snyder1 1Department USA 2Agilent 3School of…
Klíčová slova
glycerophospholipids, glycerophospholipidscer, cerleukemia, leukemiaplasmalogen, plasmalogenbone, bonepediatric, pediatricmarrow, marrowlipid, lipidcells, cellsubiquinone, ubiquinoneester, estercholesteryl, cholesteryllpc, lpclipidomic, lipidomicprogenitor
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.