Measuring the Interaction Between Thrombin-α and an Anti-Thrombin Antibody
Aplikace | 2023 | WatersInstrumentace
Studium interakcí mezi biomolekulami, konkrétně protilátek a antigenů, je klíčové pro vývoj terapeutik, diagnostiku a pochopení biochemických procesů v organismu. Metody, které nevyžadují označování ani fixaci molekul, umožňují studovat vazby v přirozeném stavu v roztoku, čímž poskytují přesnější informace o afinitě a struktuře komplexů.
Cílem studie bylo kvantifikovat interakci mezi lidským trombinem-α a myší monoklonální anti-trombinovou protilátkou. Automatizovaný přístup kompozičně gradientní MALS techniky (CG-MALS) byl použit pro stanovení disociační konstanty a vazebné stechiometrie bez nutnosti značení nebo imobilizace.
Pro experimenty byly použity:
Metodika sledovala samostatné gradienty obou proteinů pro vyloučení samoasociace a překryvný gradient pro heteroasociaci, přičemž se na každém kroku zastavil tok v MALS buňce a zaznamenala se hmotová střední molární hmotnost (Mw).
Samotrombin ani protilátka neprojevily tendenci ke samoasociaci. V průběhu kompozice závislého gradientu se však objevilo výrazné zvýšení světelného rozptylu, které dosáhlo maxima při poměru trombin:protilátka 2:1. Analýza dat v Calypso software ukázala, že pro jednu molekulu protilátky existují dvě ekvivalentní vazebná místa pro trombin. Stanovená disociační konstanta KD byla 8,8 ± 0,8 nM, což odpovídá publikovaným údajům z ELISA (15 nM).
Metoda CG-MALS dovoluje:
Tento přístup je zvláště užitečný při studiu multivalentních interakcí a složitých protein-proteinových sítí.
Vývoj CG-MALS se bude pravděpodobně zaměřovat na:
CG-MALS nabízí robustní, bezznačkové a neimobilizační řešení pro detailní charakterizaci biomolekulárních interakcí. Příklad měření trombin–anti-trombin potvrzuje schopnost metody přesně stanovit jak afinitu, tak stechiometrii komplexů v přirozeném prostředí roztoku.
GPC/SEC
ZaměřeníFarmaceutická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Studium interakcí mezi biomolekulami, konkrétně protilátek a antigenů, je klíčové pro vývoj terapeutik, diagnostiku a pochopení biochemických procesů v organismu. Metody, které nevyžadují označování ani fixaci molekul, umožňují studovat vazby v přirozeném stavu v roztoku, čímž poskytují přesnější informace o afinitě a struktuře komplexů.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo kvantifikovat interakci mezi lidským trombinem-α a myší monoklonální anti-trombinovou protilátkou. Automatizovaný přístup kompozičně gradientní MALS techniky (CG-MALS) byl použit pro stanovení disociační konstanty a vazebné stechiometrie bez nutnosti značení nebo imobilizace.
Použitá metodika a instrumentace
Pro experimenty byly použity:
- Calypso II kompoziční gradientní systém pro automatizované přidání roztoků
- Inline UV/Vis detektor koncentrace
- HELEOS MALS detektor (Wyatt Technology)
- Filtrace vzorků na 0,02 µm membránou Anotop
- Fosfátový pufr PBS (pH 7,4) s/bez NaN3 jako konzervantu
Metodika sledovala samostatné gradienty obou proteinů pro vyloučení samoasociace a překryvný gradient pro heteroasociaci, přičemž se na každém kroku zastavil tok v MALS buňce a zaznamenala se hmotová střední molární hmotnost (Mw).
Hlavní výsledky a diskuse
Samotrombin ani protilátka neprojevily tendenci ke samoasociaci. V průběhu kompozice závislého gradientu se však objevilo výrazné zvýšení světelného rozptylu, které dosáhlo maxima při poměru trombin:protilátka 2:1. Analýza dat v Calypso software ukázala, že pro jednu molekulu protilátky existují dvě ekvivalentní vazebná místa pro trombin. Stanovená disociační konstanta KD byla 8,8 ± 0,8 nM, což odpovídá publikovaným údajům z ELISA (15 nM).
Přínosy a praktické využití metody
Metoda CG-MALS dovoluje:
- Netagované a neimobilizované měření vazeb v roztoku
- Současné kvantitativní stanovení afinity i stechiometrie komplexů
- Vyloučení vlivu značek či povrchového navázání
Tento přístup je zvláště užitečný při studiu multivalentních interakcí a složitých protein-proteinových sítí.
Budoucí trendy a možnosti využití
Vývoj CG-MALS se bude pravděpodobně zaměřovat na:
- Vyšší automatizaci a rychlost analýz
- Integraci kinetických měření vazeb
- Sledování vícekomponentních systémů a terapií kombinující různé protilátky
- Využití v potranslační farmacii a vývoji biosimilárních protilátek
Závěr
CG-MALS nabízí robustní, bezznačkové a neimobilizační řešení pro detailní charakterizaci biomolekulárních interakcí. Příklad měření trombin–anti-trombin potvrzuje schopnost metody přesně stanovit jak afinitu, tak stechiometrii komplexů v přirozeném prostředí roztoku.
Reference
- Some D., Kenrick S.: Characterization of Protein-Protein Interactions via Static and Dynamic Light Scattering. In Protein Interactions, Cai J. a Wang R.E. (ed.), InTech, 2012. DOI: 10.5772/37240.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Does Antithrombin III Block the Action of a Monoclonal Anti-Thrombin Antibody?
2013|Waters|Aplikace
Light Scattering for the Masses ® Does Antithrombin III Block the Action of a Monoclonal Anti-Thrombin Antibody? Summary Multi-angle light scattering (MALS) is a powerful tool for quantifying multiple types of protein-protein interactions. In a previous application note, we described…
Klíčová slova
thrombin, thrombinantithrombin, antithrombinscattering, scatteringantibody, antibodymals, malslight, lightiii, iiianti, antiaction, actionblock, blockmonoclonal, monoclonalmasses, massesdoes, doesbinding, bindingthr
A P P L I C AT I O N N O T E AN3008: Metacomplex Formation & Binding Affinity of Multivalent Binding Partners Sophia Kenrick, Ph.D. and Dan Some, Ph.D., Wyatt Technology Summary Multivalent binding plays a crucial role…
Klíčová slova
binding, bindingmultivalent, multivalentstoichiometries, stoichiometriesmals, malsscattering, scatteringcomplexes, complexescircles, circlesassociation, associationstreptavidin, streptavidinstoichiometry, stoichiometrybivalent, bivalentcomposition, compositionformation, formationcalypso, calypsohetero
AN3002: Understanding antibody and viral glycoprotein interactions using CG-MALS Kathryn M. Hastie, Ph.D., and Erica Ollmann Saphire, Ph.D., The Scripps Research Institute Summary Viral glycoproteins are often the only antigen found on the viral surface and, as such, are key…
Klíčová slova
vgp, vgpmals, malscalypso, calypsoigg, iggmolar, molardimers, dimersassociation, associationaffinity, affinitybind, bindminidawn, minidawnscattering, scatteringdimer, dimerequilibrium, equilibriumviral, viralconjugate
Binding Affinity and Stoichiometry of a Multivalent Protein-aptamer Association
2012|Waters|Aplikace
Light Scattering for the Masses ® Binding Affinity and Stoichiometry of a Multivalent Protein-aptamer Association Summary ecause proteins are often multimeric in their native state, the biomarker targets of many pharmaceuticals present multiple binding sites. In the case of monoclonal…
Klíčová slova
aptamer, aptamerstoichiometry, stoichiometryassociation, associationscattering, scatteringaffinity, affinitymultivalent, multivalentbinding, bindinglight, lighthetero, heteromasses, massesstreptavidin, streptavidinprotein, proteinmals, malsecause, ecausestreptavadin