A RAPID ACQUISITION AND EXTRACTION TOOL FOR PROCESSING OF DESI SCREENING APPLICATION DATA

Význam tématu

DESI (Desorption Electrospray Ionization) umožňuje rychlou analýzu vzorků přímo z povrchu a je široce využívána pro imaging i vysokopropustné screeningové aplikace. Implementace kontinuálního získávání dat zvyšuje produktivitu v oblastech, jako je profilování lipidů, screening léčiv, monitorování buněčných kultur či sledování průběhu reakcí.

Cíle a přehled studie / článku

Cílem studie bylo vyvinout uživatelsky přívětivou aplikaci (Chrom Splitter) pro segmentaci souvislých raw dat z DESI analýzy do samostatných souborů jednotlivých vzorků. To umožňuje zachování rychlého získávání dat beze ztráty času při následné zpracovatelské části.

Použitá metodika a instrumentace

Vzorky (1–2 µL) byly naneseny na PTFE jamky na podložkách a analyzovány jako jednorázový průlet plochou pomocí DESI XS zdroje na:

• standardním QToF hmotnostním spektrometru
• iontovou mobilitou vybaveném Q-ToF
• vysokorozlišovacím (>200 000 FWHM) multi-reflektorovém Q-ToF

Segmentace dat ve Chrom Splitteru probíhá na základě: TIC, XIC pro definovaný m/z rozsah nebo souhrnného iontového signálu cílových hmotností, včetně volitelného vyhlazování.

Hlavní výsledky a diskuse

Bylo úspěšně extrahováno 11 vzorků z jednoho průletu s reproducibilní detekcí spotů a vyloučením redundantních skenů, což vedlo k menšímu objemu dat. Segmentované soubory zachovávají kolizní průřezy, fragmentační data i driftový čas. Ve spolupráci s MassLynx, Progenesis QI, UNIFI, Skyline a DriftScope byla prokázána kompatibilita napříč platformami pro různé analytické workflow.

Přínosy a praktické využití metody

Metoda citelně zkracuje čas potřebný pro dělení a přípravu dat, přičemž udržuje kompletní metadata. Umožňuje efektivní vysokopropustný screening (knihovny léčiv, QC, bioreaktory) a snadnou integraci do stávajících softwarových balíků.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se rozšíření o automatizované workflow a cloudové zpracování, integrace umělé inteligence pro detekci vzorků, real-time segmentaci během akvizice a aplikaci na další techniky přímé infuze a zobrazovací hmotnostní spektrometrie.

Závěr

Aplikace Chrom Splitter efektivně spojuje výkonné kontinuální získávání dat metodou DESI s jednoduchou segmentací a přímým exportem samostatných raw souborů, čímž zrychluje a zjednodušuje workflow v analytické chemii.

Reference

• Brendan MacLean et al. Bioinformatics. 2010