Routine Comprehensive Tissue Imaging on the Xevo™ G3 QTof Mass Spectrometer Using a DESI™ XS Source
Aplikace | 2024 | WatersInstrumentace
Zobrazování rozložení molekul ve tkáních pomocí hmotnostní spektrometrie (MS Imaging) poskytuje cenné informace o lokalizaci a hladinách lipidů a dalších biomolekul. Rychlost sběru dat u procházení (scan speed) je často kompromisem mezi kvalitou signálu a časovou náročností analýzy. Optimalizace této metody umožňuje urychlit experimenty bez ztráty analytických informací, což je klíčové pro rutinní aplikace v preklinickém výzkumu i kvalitativní kontrole.
Cílem této studie bylo ověřit, zda zvýšením rychlosti skenování při DESI-MS Imaging na platformě Xevo G3 QTof nedojde k významnému zhoršení kvality dat. Autoři zkoumali vliv rychlosti 5, 10 a 20 snímků za sekundu na intenzity signálů, rozlišení, mass accuracy a schopnost rozlišit strukturální segmenty v myší mozkové tkáni.
Vzorky:
MS podmínky:
Scan speed:
Softwarové zpracování:
1. Segmentace
2. Korelace spekter
3. Normalizace a PCA
4. Mass accuracy a rozlišení
Rychlé MS Imaging na Xevo G3 QTof s DESI XS umožňuje:
Očekává se další integrace víceúrovňových dat (MS/MS, SONAR) pro prohloubenou charakterizaci molekulních interakcí. Vývoj rychlejších zdrojů iontů, pokročilých algoritmů strojového učení a automatizace zpracování dat umožní ještě vyšší propustnost a detailnější prostorové mapování metabolitů a lipidů.
Studie prokázala, že zvýšením rychlosti skenování na platformě Xevo G3 QTof s DESI XS lze významně urychlit MS Imaging bez ztráty kvality dat. Metoda je vhodná pro rutinní aplikace i výzkumné projekty vyžadující vysokou citlivost a přesnost.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, MS Imaging
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Zobrazování rozložení molekul ve tkáních pomocí hmotnostní spektrometrie (MS Imaging) poskytuje cenné informace o lokalizaci a hladinách lipidů a dalších biomolekul. Rychlost sběru dat u procházení (scan speed) je často kompromisem mezi kvalitou signálu a časovou náročností analýzy. Optimalizace této metody umožňuje urychlit experimenty bez ztráty analytických informací, což je klíčové pro rutinní aplikace v preklinickém výzkumu i kvalitativní kontrole.
Cíle a přehled studie
Cílem této studie bylo ověřit, zda zvýšením rychlosti skenování při DESI-MS Imaging na platformě Xevo G3 QTof nedojde k významnému zhoršení kvality dat. Autoři zkoumali vliv rychlosti 5, 10 a 20 snímků za sekundu na intenzity signálů, rozlišení, mass accuracy a schopnost rozlišit strukturální segmenty v myší mozkové tkáni.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky:
- Řez myšího mozku tloušťky 18 µm na sklíčkách bez další úpravy
MS podmínky:
- Spektrometr: Xevo G3 QTof (Waters)
- Ionizační zdroj: DESI XS s vyhřívanou transferní linií
- Ionizace aniontová, napětí kapiláry 0,6 kV, proud N₂ 15 psi
- Rozpouštědlo: 98 % methanol, 2 % voda, 2 µL/min
- Teplota zdroje 150 °C, transferní linka 450 °C
- Rozlišení ~30 000 FWHM, mass accuracy <2 ppm
Scan speed:
- 5, 10 a 20 snímků/s (ekvivalent 1000, 500 a 250 µm/s)
Softwarové zpracování:
- MassLynx™ pro převod dat
- High-Definition™ Imaging (HDI™) pro vizualizaci
- MSI segmentation MicroApp s UMAP a HDBSCAN pro segmentaci
- Statistická analýza v EZinfo (PCA, korelační koeficienty R²)
Hlavní výsledky a diskuse
1. Segmentace
- Strukturální segmenty v mozku se při 5, 10 i 20 snímcích/s vizuálně nelišily, biologická variabilita mezi po sobě jdoucími řezy byla menší než vliv rychlosti sběru.
2. Korelace spekter
- Korelační koeficient R² mezi daty různých rychlostí překročil 0,95, což ukazuje na velmi dobrou shodu špičkových profilů.
3. Normalizace a PCA
- TIC normalizace kompenzovala pokles intenzity signálu při vyšší rychlosti.
- PCA ukázala, že rozlišování ROI závisí spíše na biologii vzorku než na rychlosti sběru.
4. Mass accuracy a rozlišení
- Mass error pro klíčové lipidy (PS(40:6), PS(38:4), PE(p38:4)) se pohyboval mezi −1,35 a 1,19 ppm pro všechny rychlosti.
- Mass resolution u testovaného iontu m/z 750,5 zůstalo konzistentně vysoké bez významného poklesu při 20 snímcích/s.
Přínosy a praktické využití metody
Rychlé MS Imaging na Xevo G3 QTof s DESI XS umožňuje:
- Snížit dobu analýzy celých tkání, aniž by utrpěla kvalita dat.
- Provádět rutinní a vysokopropustné experimenty v preklinických studiích.
- Zachovat vysokou citlivost, rozlišení i přesnost měření.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se další integrace víceúrovňových dat (MS/MS, SONAR) pro prohloubenou charakterizaci molekulních interakcí. Vývoj rychlejších zdrojů iontů, pokročilých algoritmů strojového učení a automatizace zpracování dat umožní ještě vyšší propustnost a detailnější prostorové mapování metabolitů a lipidů.
Závěr
Studie prokázala, že zvýšením rychlosti skenování na platformě Xevo G3 QTof s DESI XS lze významně urychlit MS Imaging bez ztráty kvality dat. Metoda je vhodná pro rutinní aplikace i výzkumné projekty vyžadující vysokou citlivost a přesnost.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
ROUTINE COMPREHENSIVE TISSUE IMAGING ON THE XEVO G3 QTOF MASS SPECTROMETER USING DESI XS
2023|Waters|Postery
ROUTINE COMPREHENSIVE TISSUE IMAGING ON THE XEVO G3 QTOF MASS SPECTROMETER USING DESI XS Authors Lisa Reid, Mark Towers, Joanne Ballantyne Affiliations Waters Corporation, Wilmslow UK INTRODUCTION In this poster we investigate the use of the Xevo G3 QTof mass…
Klíčová slova
acquisition, acquisitiontissue, tissuedata, datasegmentation, segmentationregions, regionsstructures, structuressprayer, sprayerdiffering, differingwithin, withintissues, tissueshbdscan, hbdscanpca, pcaimaging, imagingspeed, speedeach
Pushing the Boundaries of DESI Imaging With High Spatial Resolution
2024|Waters|Aplikace
Application Note Pushing the Boundaries of DESI Imaging With High Spatial Resolution Mark Towers, Lisa Reid, Emrys Jones, Joanne Ballantyne Waters Corporation Abstract Utilizing a commercial DESI™ XS source with minor adjustments, here we demonstrate acquisition of DESI tissue images…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingboundaries, boundariespushing, pushingspatial, spatialresolution, resolutionhigh, highpixel, pixelimage, imagedefinition, definitionhdi, hdiroi, roimicroscope, microscoperescanned, rescannedsurvey
Robust Large Image Acquisition at High Spatial Resolution Using the DESI™ XS Source Coupled to a Xevo™ G3 QTof Mass Spectrometer
2024|Waters|Aplikace
Application Note Robust Large Image Acquisition at High Spatial Resolution Using the DESI™ XS Source Coupled to a Xevo™ G3 QTof Mass Spectrometer Mark Towers, Lisa Reid, Joanne Ballantyne Waters Corporation Abstract Demonstrating the suitability of the Xevo G3 QTof…
Klíčová slova
qtof, qtofspectrometer, spectrometerdesi, desimass, massprivacy, privacyimage, imagecomfortably, comfortablyhdi, hdismoothly, smoothlyacquires, acquireslengthy, lengthylarge, largesized, sizedpolicy, policyspatial
Targeted MS Imaging Solution with DESI XS and XEVO TQ Absolute
2023|Waters|Brožury a specifikace
Targeted MS Imaging Solution with DESI XS and XEVO TQ Absolute MS Imaging has evolved. Harness Absolute confidence with Absolute sensitivity. TM TQ ABSOLUTE [ TAGETED MS IMAGING ] Targeted MS Imaging for sensitive, selective and fast molecular visualization Combine…
Klíčová slova
imaging, imagingtageted, tagetedtargeted, targeteddesi, desimsi, msiabsolute, absolutexevo, xevomicroapps, microappsvisualization, visualizationsustainability, sustainabilitydiscovery, discoveryspatial, spatialinaccessible, inaccessiblewaters, watershdi