An Improved Workflow for DESI Imaging Mass Spectrometry Incorporating Waters High Definition Imaging Software
Technické články | 2017 | WatersInstrumentace
Desorption Electrospray Ionization (DESI) imagingovou hmotnostní spektrometrií lze mapovat prostorové rozložení molekul ve vzorcích za atmosférických podmínek bez nutnosti rozsáhlé přípravy vzorků. Díky rozlišení okolo 50 µm a širokému rozsahu analyzovatelných sloučenin je metoda velmi významná v biomedicíně, farmaceutickém výzkumu i QA/QC.
Představené řešení integruje software Waters High Definition Imaging (HDI) s řízením instrumentů přes MassLynx. Cílem je poskytnout intuitivní rozhraní, umožnit sériové dávkové akvizice a automatizované zpracování dat, čímž se zkrátí doba přípravy experimentu a zvýší propustnost laboratoře.
Pracovní postup sestává z následujících kroků:
Nový workflow umožnil bezobslužné provedení sériových experimentů, včetně přepínání mezi negativním a pozitivním ionizačním režimem na stejné tkáňové sekci. Ukázalo se, že až šest experimentů lze spustit najednou a data zpracovat automaticky přes noc. Díky tomu lze rychle generovat obrazy distribuce molekul a provádět multivariační analýzu (PCA, OPLS-DA) pro odhalení rozdílů mezi vzorky.
Očekává se další rozšíření integrace MS-imagingu s pokročilou datovou analýzou založenou na strojovém učení, včetně real-time interpretace výsledků. Kombinace DESI s dalšími zobrazovacími modalitami a vývojem softwarových nástrojů povede k hlubší charakterizaci biologických vzorků.
Kombinace vylepšeného HDI softwaru a MassLynx umožňuje efektivní a plně automatizovaný workflow pro DESI zobrazovací hmotnostní spektrometrii, který šetří čas, zvyšuje reprodukovatelnost a usnadňuje datovou analýzu.
Jones E., Claude E. An Improved Workflow for DESI Imaging Mass Spectrometry Incorporating Waters High Definition Imaging Software. Waters Corporation Technology Brief, 2017.
Iontová mobilita, MS Imaging, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníVýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Desorption Electrospray Ionization (DESI) imagingovou hmotnostní spektrometrií lze mapovat prostorové rozložení molekul ve vzorcích za atmosférických podmínek bez nutnosti rozsáhlé přípravy vzorků. Díky rozlišení okolo 50 µm a širokému rozsahu analyzovatelných sloučenin je metoda velmi významná v biomedicíně, farmaceutickém výzkumu i QA/QC.
Cíle a přehled studie
Představené řešení integruje software Waters High Definition Imaging (HDI) s řízením instrumentů přes MassLynx. Cílem je poskytnout intuitivní rozhraní, umožnit sériové dávkové akvizice a automatizované zpracování dat, čímž se zkrátí doba přípravy experimentu a zvýší propustnost laboratoře.
Použitá metodika a instrumentace
Pracovní postup sestává z následujících kroků:
- Záznam optického obrazu vzorku (fotografie nebo sken) na skleněném podložním skle.
- Uložení podložky do držáku DESI nebo mikrotritické destičky.
- Ko-registrace optického obrazu v HDI pro přesné vymezení oblasti zájmu.
- Nastavení parametrů 2D pohybu desorption zdroje a automatický výpočet rychlosti skenování.
- Volba MS parametrů: experimentální režim (MS-Tof, MS/MS, IMS, HDMS^E), m/z rozsah, kolizní energie a polarita.
- Export definovaného experimentu do MassLynx sample listu pro plně automatizovanou akvizici.
- Zpracování surových dat v HDI s možností vizualizace iontových obrazů a integrace iontové mobility.
Hlavní výsledky a diskuse
Nový workflow umožnil bezobslužné provedení sériových experimentů, včetně přepínání mezi negativním a pozitivním ionizačním režimem na stejné tkáňové sekci. Ukázalo se, že až šest experimentů lze spustit najednou a data zpracovat automaticky přes noc. Díky tomu lze rychle generovat obrazy distribuce molekul a provádět multivariační analýzu (PCA, OPLS-DA) pro odhalení rozdílů mezi vzorky.
Přínosy a praktické využití metody
- Výrazné zkrácení doby přípravy a spuštění experimentu.
- Možnost dávkového zpracování více vzorků bez dohledu obsluhy.
- Automatizovaná vizualizace a analýza dat přímo v HDI.
- Zvýšení propustnosti a reprodukovatelnosti v laboratorním provozu.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se další rozšíření integrace MS-imagingu s pokročilou datovou analýzou založenou na strojovém učení, včetně real-time interpretace výsledků. Kombinace DESI s dalšími zobrazovacími modalitami a vývojem softwarových nástrojů povede k hlubší charakterizaci biologických vzorků.
Závěr
Kombinace vylepšeného HDI softwaru a MassLynx umožňuje efektivní a plně automatizovaný workflow pro DESI zobrazovací hmotnostní spektrometrii, který šetří čas, zvyšuje reprodukovatelnost a usnadňuje datovou analýzu.
Reference
Jones E., Claude E. An Improved Workflow for DESI Imaging Mass Spectrometry Incorporating Waters High Definition Imaging Software. Waters Corporation Technology Brief, 2017.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
Full Spectrum Molecular Imaging on the SYNAPT XS: Combined Imaging Techniques Yield Comprehensive Results
2021|Waters|Technické články
[ TECHNOLOGY BRIEF ] Full Spectrum Molecular Imaging on the SYNAPT XS: Combined Imaging Techniques Yield Comprehensive Results Emmanuelle Claude, Mark Towers, and Joanne Ballantyne Waters Corporation, Wilmslow, UK Features both fully integrated traditional MALDI and new and improved DESI…
Klíčová slova
imaging, imagingdesi, desisynapt, synaptmolecules, moleculesmolecular, molecularhdi, hdimaldi, maldispectrum, spectrumsmall, smalltechniques, techniquesfsmi, fsmicomplementary, complementarybrief, brieffull, fullsections
Pushing the Boundaries of DESI Imaging With High Spatial Resolution
2024|Waters|Aplikace
Application Note Pushing the Boundaries of DESI Imaging With High Spatial Resolution Mark Towers, Lisa Reid, Emrys Jones, Joanne Ballantyne Waters Corporation Abstract Utilizing a commercial DESI™ XS source with minor adjustments, here we demonstrate acquisition of DESI tissue images…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingboundaries, boundariespushing, pushingspatial, spatialresolution, resolutionhigh, highpixel, pixelimage, imagedefinition, definitionhdi, hdiroi, roimicroscope, microscoperescanned, rescannedsurvey
Full Spectrum Molecular Imaging on the SYNAPT XS: Combined imaging techniques yield comprehensive results
2020|Waters|Technické články
[ TECHNOLOGY BRIEF ] Full Spectrum Molecular Imaging on the SYNAPT XS: Combined imaging techniques yield comprehensive results Emmanuelle Claude, Mark Towers, and Joanne Ballantyne Waters Corporation, Wilmslow, UK The only HRMS platform to feature both fully integrated traditional MALDI…
Klíčová slova
imaging, imagingdesi, desisynapt, synaptmolecules, moleculesmolecular, molecularhdi, hdimaldi, maldispectrum, spectrumsmall, smalltechniques, techniquesfsmi, fsmicomplementary, complementarybrief, brieffull, fullsections