BMSS: High Throughput HDMSE Blood Product Lipidomic Screening Using a DESI Inlet
Postery | 2022 | WatersInstrumentace
V oblasti biomedicínského výzkumu jsou lipidomické analýzy klíčové pro profilování krevních sér. Tradiční LC/MS přístupy jsou časově náročné a náchylné k chybám způsobeným dlouhými pořadími analýz. DESI-HDMSE jako rychlá alternativní metoda umožňuje přímou analýzu malých objemů vzorku s minimální přípravou a výrazně zkracuje dobu měření.
Vzorky séra (n=500) z HUSERMET studie byly extrahovány s isopropanolem a naneseny na teflonové body na skleněné podložce. Analýzu zajišťoval DESI-XS: kapilární napětí 0,6 kV, plyn 5 bar, mobilní fáze 98 % MeOH/2 % H₂O, průtok 2 µl/min a transfer line ohřátá na 300 °C.
Hmotnostní spektrum bylo získáno na SYNAPT G2-XS oa-QToF MS v režimu HDMSE s pozitivní i negativní ionizací. Data se zpracovávala pomocí MassLynx, DriftScope HDI, Progenesis QI a UNIFI.
Výsledky ukázaly stabilní a silné signály v pozitivním i negativním módu (mid e5 a mid e4). Analýza nepotvrdila významné efekty sušení („coffee ring“) díky volatilitě isopropanolu. Multivariační analýza v Progenesis QI odhalila rozdíly v lipidových profilech a umožnila identifikaci potenciálních biomarkerů s přesností lepší než ±3 ppm.
DESI-HDMSE představuje efektivní platformu pro vysokoprůchodové lipidomické screenování malých objemů séra. Metoda kombinuje rychlost, citlivost a přímou aplikaci s minimální přípravou vzorku a zachovává kompatibilitu s konvenčními LC/MS postupy.
MS Imaging, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníLipidomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
V oblasti biomedicínského výzkumu jsou lipidomické analýzy klíčové pro profilování krevních sér. Tradiční LC/MS přístupy jsou časově náročné a náchylné k chybám způsobeným dlouhými pořadími analýz. DESI-HDMSE jako rychlá alternativní metoda umožňuje přímou analýzu malých objemů vzorku s minimální přípravou a výrazně zkracuje dobu měření.
Cíle a přehled studie / článku
- Ověřit použitelnost DESI-HDMSE pro vysokoprůchodovou lipidomickou analýzu lidského séra.
- Porovnat rychlost a kvalitu dat oproti konvenčním LC/MS metodám.
- Vypracovat workflow pro předběžné screeningové hodnocení 500 vzorků ze studie HUSERMET.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky séra (n=500) z HUSERMET studie byly extrahovány s isopropanolem a naneseny na teflonové body na skleněné podložce. Analýzu zajišťoval DESI-XS: kapilární napětí 0,6 kV, plyn 5 bar, mobilní fáze 98 % MeOH/2 % H₂O, průtok 2 µl/min a transfer line ohřátá na 300 °C.
Hmotnostní spektrum bylo získáno na SYNAPT G2-XS oa-QToF MS v režimu HDMSE s pozitivní i negativní ionizací. Data se zpracovávala pomocí MassLynx, DriftScope HDI, Progenesis QI a UNIFI.
Hlavní výsledky a diskuse
Výsledky ukázaly stabilní a silné signály v pozitivním i negativním módu (mid e5 a mid e4). Analýza nepotvrdila významné efekty sušení („coffee ring“) díky volatilitě isopropanolu. Multivariační analýza v Progenesis QI odhalila rozdíly v lipidových profilech a umožnila identifikaci potenciálních biomarkerů s přesností lepší než ±3 ppm.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá analýza <15 s na vzorek a celkový čas <3 h pro 500 vzorků.
- Minimální příprava a zachování kompatibility se standardními LC/MS protokoly.
- Snížení rizika batch efektů a degradace vzorku.
- Možnost předběžného screeningu kontaminací a nesprávných vzorků.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace DESI-HDMSE do rutin QA/QC v klinických laboratořích.
- Rozšíření na jiné třídy biomolekul (metabolity, proteiny).
- Využití umělé inteligence pro automatickou identifikaci a kvantifikaci lipidů.
- Vývoj mobilních či miniaturizovaných DESI-MS systémů pro bodové aplikace.
Závěr
DESI-HDMSE představuje efektivní platformu pro vysokoprůchodové lipidomické screenování malých objemů séra. Metoda kombinuje rychlost, citlivost a přímou aplikaci s minimální přípravou vzorku a zachovává kompatibilitu s konvenčními LC/MS postupy.
Reference
- Nenalezena explicitní literatura v textu.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
A RAPID ACQUISITION AND EXTRACTION TOOL FOR PROCESSING OF DESI SCREENING APPLICATION DATA
2023|Waters|Postery
A RAPID ACQUISITION AND EXTRACTION TOOL FOR PROCESSING OF DESI SCREENING APPLICATION DATA Lisa Reid1, Mark Towers1, Richard Chapman2, Richard Daw2, Roy Goodacre3, Ian Wilson3 & Paul Richardson3 1: Waters Corporation, Stamford Avenue, Wilmslow, UK 2: Waters Corporation, Milford, MA,…
Klíčová slova
app, appchrom, chromdesi, desidata, datasplitter, splittercrashed, crashedsample, samplesegmentation, segmentationsegmented, segmentedprocessing, processingprocessed, processedfeasibility, feasibilityipa, ipasoftware, softwareformats
Data Independent HDMSE High Throughput Drug Library Screening Using the DESI XS Source
2021|Waters|Aplikace
Application Note Data Independent HDMSE High Throughput Drug Library Screening Using the DESI XS Source Lisa Reid, Mark Towers, Michael McCullagh, I.D. Wilson, Robert S. Plumb, Joanne Connolly Waters Corporation Abstract Desorption electrospray ionization (DESI) coupled to an ion mobility…
Klíčová slova
desi, desihdmse, hdmseindependent, independentlibrary, libraryscreening, screeningthroughput, throughputsource, sourcedrug, drughigh, highdata, datausing, usingfragmentation, fragmentationsynapt, synaptccs, ccsenergy
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
Metabolomics: LIPIDOMIC AND DESI IMAGING STUDY OF MOUSE LIVER DOSED WITH A TYROSINE KINASE INHIBITING DRUG
2022|Waters|Postery
LIPIDOMIC AND DESI IMAGING STUDY OF MOUSE LIVER DOSED WITH A TYROSINE KINASE INHIBITING DRUG Nyasha Munjoma 1 , Giorgis Isaac 2 , Mark Towers 1 , Emmanuelle Claude 1 , Ian D Wilson 3 , Lee A. Gethings 1…
Klíčová slova
desi, desiuntargeted, untargetedimaging, imaginggefitinib, gefitiniblipidomics, lipidomicsccs, ccstissue, tissuelipid, lipidkinase, kinasegefitnib, gefitnibpremier, premiertreated, treatedstatistical, statisticalomics, omicstyrosine