Determination of Tryptophan Using AAA-Direct
Aplikace | 2001 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Určení tryptofanu (Trp) je klíčové pro kvantifikaci bílkovin, peptidů a monitorování buněčných kultur. Trp je při běžné kyselé hydrolýze náchylný k degradaci, a proto jsou vyvíjeny postupy pro jeho zachování a přesné stanovení. AAA-Direct umožňuje rychlou, citlivou analýzu Trp s minimální přípravou vzorku a bez derivatizace.
Cílem bylo vyvinout izokratickou metodu AAA-Direct pro rychlé oddělení a přímou detekci Trp pomocí aniontové výměnné chromatografie (AminoPac PA10) a integrované pulzní amperometrie (IPAD). Dvě varianty metody (Method 1 a Method 2) optimalizují dobu běhu a citlivost, přičemž obě umožňují uniknout rušivým koelonujícím složkám.
Hydrolýza:
Obě metody vykázaly lineární odezvu až do 100–200 µM (Metoda 1) a 200–500 µM (Metoda 2). Lower Limit of Detection (LOD) ~0,12–0,14 µM (1,2–1,4 pmol/inj.), LOQ ~0,41–0,46 µM. Reprodukovatelnost 2,4 % RSD (144 injekcí, 80 h) u Metody 1. Rychlosti běhu: 18,3 min (Metoda 1), 9,5 min (Metoda 2).
Hydrolýza v přítomnosti inertního plynu (argon) zvýšila maximální zisk Trp z BSA na ~120 % (2 h), poté degradace stoupala. U peptidu LH-RH byla maximální rec. ~45 % (90 min) z důvodu nižší koncentrace ochraňujících aminokyselin.
V komplexních matricích (glukóza, YPD výživa, E. coli kulturální supernatant) byla obnova 99 –110 % a nebyly zjištěny rušivé koelonizace.
Vyšší automatizace hydrolýzy ve vakuu s plastovými trubicemi odolnými vůči alkalii. Kombinace s kvantitativními hmotnostními metodami pro potvrzení produktů degradace Trp. Rozšíření pro simultánní stanovení derivátů Trp v bioprocesních odběrech a biofarmaceutických přípravcích.
Izokratické metody AAA-Direct nabízejí rychlou, spolehlivou a vysoce citlivou analýzu tryptofanu v různých typech vzorků. Díky přímé detekci IPAD a optimalizovaným elučním podmínkám je možné provádět vysoce propustné analýzy bez náročné chemické úpravy.
1. Matsubara H., Sasaki R.M. High Recovery of Tryptophan from Acid Hydrolysates of Proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1969;35:175–181.
2. Bozzini M.L., Bello R., Cagle N., Yamane D., Dupont D. Tryptophan Recovery from Autohydrolyzed Samples Using Dodecanethiol. Appl. Biosci. Res. News 1991.
3. Moore S., Stein W.H. Chromatographic Determination of Amino Acids by the Use of Automatic Recording Equipment. Methods Enzymol. 1963;6:819–831.
4. Hugli T.E., Moore S. Determination of the Tryptophan Content of Proteins by Ion Exchange Chromatography of Alkaline Hydrolysates. J. Biol. Chem. 1972;247:2828–2834.
5. Simpson R.J., Neuberger M.R., Liu T.-Y. Complete Amino Acid Analysis of Proteins from a Single Hydrolysate. J. Biol. Chem. 1976;251:1936–1940.
6. Clarke A.P., Jandik P., Rocklin R.D., Liu Y., Avdalovic N. An Integrated Amperometry Waveform for Direct, Sensitive Detection of Amino Acids and Amino Sugars Following Anion-Exchange Chromatography. Anal. Chem. 1999;71:2774–2781.
7. Jandik P., Clarke A.P., Avdalovic N., Andersen D.C., Cacia J. Analyzing Mixtures of Amino Acids and Carbohydrates Using Bi-Modal Integrated Amperometric Detection. J. Chromatogr. B 1999;732:193–201.
8. Dionex Corporation. Installation Instructions and Troubleshooting Guide for the AAA-Direct Amino Acid Analysis System. Doc. No. 031481, Rev. 03, 2000.
9. Hirayama K., Akashi S., Furuya M., Fukuhara K. Rapid Confirmation and Revision of the Primary Structure of Bovine Serum Albumin by ESIMS and Frit-FAB LC/MS. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1990;173:639–646.
HPLC
ZaměřeníPotraviny a zemědělství, Klinická analýza
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Určení tryptofanu (Trp) je klíčové pro kvantifikaci bílkovin, peptidů a monitorování buněčných kultur. Trp je při běžné kyselé hydrolýze náchylný k degradaci, a proto jsou vyvíjeny postupy pro jeho zachování a přesné stanovení. AAA-Direct umožňuje rychlou, citlivou analýzu Trp s minimální přípravou vzorku a bez derivatizace.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo vyvinout izokratickou metodu AAA-Direct pro rychlé oddělení a přímou detekci Trp pomocí aniontové výměnné chromatografie (AminoPac PA10) a integrované pulzní amperometrie (IPAD). Dvě varianty metody (Method 1 a Method 2) optimalizují dobu běhu a citlivost, přičemž obě umožňují uniknout rušivým koelonujícím složkám.
Použitá metodika a instrumentace
Hydrolýza:
- 4 M NaOH, 110 °C, inertní plyn (argon nebo dusík) v hlavním prostoru
- Vzorky: volný Trp, peptid LH-RH, BSA, fermentační močovina
- AminoPac PA10 Analytical + Guard kolony (2 × 250 a 2 × 50 mm)
- Dionex BioLC systém: GP50 pumpa, EO1 organizér eluční složky, AS50 autosampler, ED50 detektor s AAA-Certified Gold Cell
- Eluenty: 250 mM NaOH, 1 M NaOAc, kombinace 1 M NaOAc/50 mM NaOH
- Detekce: integrovaná pulzní amperometrie, standardní pH–Ag/AgCl referenční elektroda
Hlavní výsledky a diskuse
Obě metody vykázaly lineární odezvu až do 100–200 µM (Metoda 1) a 200–500 µM (Metoda 2). Lower Limit of Detection (LOD) ~0,12–0,14 µM (1,2–1,4 pmol/inj.), LOQ ~0,41–0,46 µM. Reprodukovatelnost 2,4 % RSD (144 injekcí, 80 h) u Metody 1. Rychlosti běhu: 18,3 min (Metoda 1), 9,5 min (Metoda 2).
Hydrolýza v přítomnosti inertního plynu (argon) zvýšila maximální zisk Trp z BSA na ~120 % (2 h), poté degradace stoupala. U peptidu LH-RH byla maximální rec. ~45 % (90 min) z důvodu nižší koncentrace ochraňujících aminokyselin.
V komplexních matricích (glukóza, YPD výživa, E. coli kulturální supernatant) byla obnova 99 –110 % a nebyly zjištěny rušivé koelonizace.
Přínosy a praktické využití metody
- Snížení práce spojené s derivatizací Trp
- Minimalizace přípravy vzorku – přímé injekce
- Rychlý monitoring fermentací a buněčných kultur
- Pozorování uvolnění a spotřeby Trp v reálném čase pro optimalizaci výrobních procesů
Budoucí trendy a možnosti využití
Vyšší automatizace hydrolýzy ve vakuu s plastovými trubicemi odolnými vůči alkalii. Kombinace s kvantitativními hmotnostními metodami pro potvrzení produktů degradace Trp. Rozšíření pro simultánní stanovení derivátů Trp v bioprocesních odběrech a biofarmaceutických přípravcích.
Závěr
Izokratické metody AAA-Direct nabízejí rychlou, spolehlivou a vysoce citlivou analýzu tryptofanu v různých typech vzorků. Díky přímé detekci IPAD a optimalizovaným elučním podmínkám je možné provádět vysoce propustné analýzy bez náročné chemické úpravy.
Reference
1. Matsubara H., Sasaki R.M. High Recovery of Tryptophan from Acid Hydrolysates of Proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1969;35:175–181.
2. Bozzini M.L., Bello R., Cagle N., Yamane D., Dupont D. Tryptophan Recovery from Autohydrolyzed Samples Using Dodecanethiol. Appl. Biosci. Res. News 1991.
3. Moore S., Stein W.H. Chromatographic Determination of Amino Acids by the Use of Automatic Recording Equipment. Methods Enzymol. 1963;6:819–831.
4. Hugli T.E., Moore S. Determination of the Tryptophan Content of Proteins by Ion Exchange Chromatography of Alkaline Hydrolysates. J. Biol. Chem. 1972;247:2828–2834.
5. Simpson R.J., Neuberger M.R., Liu T.-Y. Complete Amino Acid Analysis of Proteins from a Single Hydrolysate. J. Biol. Chem. 1976;251:1936–1940.
6. Clarke A.P., Jandik P., Rocklin R.D., Liu Y., Avdalovic N. An Integrated Amperometry Waveform for Direct, Sensitive Detection of Amino Acids and Amino Sugars Following Anion-Exchange Chromatography. Anal. Chem. 1999;71:2774–2781.
7. Jandik P., Clarke A.P., Avdalovic N., Andersen D.C., Cacia J. Analyzing Mixtures of Amino Acids and Carbohydrates Using Bi-Modal Integrated Amperometric Detection. J. Chromatogr. B 1999;732:193–201.
8. Dionex Corporation. Installation Instructions and Troubleshooting Guide for the AAA-Direct Amino Acid Analysis System. Doc. No. 031481, Rev. 03, 2000.
9. Hirayama K., Akashi S., Furuya M., Fukuhara K. Rapid Confirmation and Revision of the Primary Structure of Bovine Serum Albumin by ESIMS and Frit-FAB LC/MS. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1990;173:639–646.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Determination of the Amino Acid Content of Peptidesby AAA-Direct
2001|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Technical Note 50 Determination of the Amino Acid Content of Peptides by AAA-Direct INTRODUCTION EQUIPMENT ™ The AAA-Direct system separates amino acids on a high performance anion-exchange column and directly detects them by integrated amperometry.1, 2 AAA-Direct has advantages over…
Klíčová slova
amino, aminohydrolysis, hydrolysisaaa, aaaacid, acidmsh, mshacids, acidstrp, trpreplicate, replicateblanks, blankspeptide, peptidetyr, tyrarg, argser, sergly, glydirect
Determination of Protein Concentrations Using AAA-Direct
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 163 Determination of Protein Concentrations Using AAA-Direct™ INTRODUCTION Dye-binding assays such as bicinchoninic acid (BCA), Lowry, and Bradford (Coomassie) are the most common methods to determine total protein. The BCA assay depends on Cu (II) reduction to Cu…
Klíčová slova
aaa, aaaprotein, proteinamino, aminohydrolysate, hydrolysatebsa, bsadirect, directundiluted, undilutedconcentrations, concentrationsacid, acidconcentration, concentrationwater, wateracids, acidshydrolysis, hydrolysistotal, totaldetermination
Identification of a Hydroxylysine-Containing Peptide Using AAA-Direct
2003|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 130 Identification of a Hydroxylysine-Containing Peptide Using AAA-Direct™ INTRODUCTION One type of protein microheterogeneity is a result of the posttranslational modification of lysine (Lys) to hydroxylysine (Hyl). This modification normally occurs in collagen and a few other proteins…
Klíčová slova
amino, aminopeptide, peptideaaa, aaahydroxylysine, hydroxylysineacid, acidmole, molehyl, hylfractions, fractionsdirect, directexchange, exchangeminutes, minutescation, cationlys, lyspeptides, peptidescystine
Amino Acid Analysis - Application Notebook
2018|Waters|Příručky
[ APPLICATION NOTEBOOK ] Amino Acid Analysis Application Notebook [ CONTENTS ] [ INTRODUCTION ] Waters UPLC Amino Acid Analysis Solution................................................................................9 UPLC Amino Acid Analysis Solution............................................................................................... 11 Enhancement of the UPLC Amino Acid Analysis Solution with Flexible Detector Options......................................................................................................... 15…
Klíčová slova
amino, aminoacid, acidasp, aspuplc, uplcala, alalys, lysleu, leutyr, tyrgly, glyser, serarg, argthr, thrglu, gluile, ilecys