LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Identification of a Hydroxylysine-Containing Peptide Using AAA-Direct

Aplikace | 2003 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
HPLC
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Thermo Fisher Scientific

Souhrn

Význam tématu


Peptidová mikroheterogenita způsobená posttranslačními modifikacemi, jako je hydroxylysin vzniklý hydroxylací lysinu, hraje klíčovou roli ve funkci extracelulárních proteinů včetně kolagenu a ovlivňuje vlastnosti biologických léčiv. Přesná identifikace a kvantifikace takových změn je nezbytná pro procesní vývoj, kontrolu kvality a zajištění bezpečnosti a účinnosti bioterapeutik.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem aplikacního sdělení bylo demonstrovat, že systém AAA-Direct™ je vhodný k detekci peptidů obsahujících hydroxylysin a ke srovnání čistoty dvou syntetických CD4 fragmentů odlišných jedinou posttranslační modifikací. Studie zahrnovala hydrolytickou přípravu vzorků, komparaci výsledků AAA-Direct s RP-HPLC a kationtovou chromatografií a ověření metod pro odstranění soli z peptidových frakcí.

Použitá metodika a instrumentace


Vzorky peptidů byly hydrolyzovány v 6 M HCl a analyzovány přímou injekcí (AAA-Direct™) s pulzní amperometrií detekce (ED50). Pro separaci nehydrolyzovaných frakcí peptidů byly využity:
  • Reverzní fáze RP-HPLC (Acclaim C18, 4,6×250 mm) s UV detekcí při 220 nm
  • Kationtová výměnná chromatografie (ProPac WCX-10, 4×250 mm) s UV detekcí při 210 nm
  • Aniontová výměnná chromatografie (IonPac AS14A, 3×150 mm) s konduktometrickou detekcí po potlačeném elučním proudu

Pro přípravu a desalinaci vzorků byly použity:
  • SpeedVac odparovací systém pro koncentrování vzorků
  • Biodialyser™ mikro­dialýza s MWCO 100 a 500 daltonů pro odstranění chloridů a fosfátů

Hlavní výsledky a diskuse


1. Separace aminokyselin pomocí AAA-Direct na kolonu AminoPac PA-10 rozlišila hydroxylysin od ostatních běžných aminokyselin.
2. Kompozice Lys-peptidu odpovídala teoretickému poměru aminokyselin. RP-HPLC i kationtová chromatografie prokázaly vysokou čistotu.
3. Hyl-peptid obsahoval nečekané nečistoty: RP-HPLC ukázala devět špiček, kationtová W CX-10 chromatografie dvanáct, přičemž dvě frakce odpovídaly výhradně požadovanému Hyl-peptidu (obsah 1 mol Hyl a 1 mol Lys).
4. Vysoký obsah solí v peptidových hydrolysátech posunoval retenční časy a komplikoval interpretaci.
5. Mikro­dialýza s 500 daltonovým MWCO dosáhla ~87 % odstranění NaCl a ~47 % odstranění fosfátu, bez interferencí v AAA-Direct chromatogramech.

Přínosy a praktické využití metody


AAA-Direct umožňuje rychlou, citlivou a kvantitativní analýzu posttranslačních modifikací připravených peptidů a proteinů. Kombinace s chromatografickými metodami pro separaci nehydrolyzovaných vzorků poskytuje komplexní přístup k identifikaci a kvantifikaci mikroheterogenity. Desalinační kroky zajišťují spolehlivost výsledků a validitu retencí při vysokém obsahu solí.

Budoucí trendy a možnosti využití


Možné směry dalšího rozvoje zahrnují:
  • Integraci AAA-Direct s hmotnostní spektrometrií pro identifikaci sekvenčních izomerů
  • Automatizované desalinační moduly a online dialýzu pro zvýšení reproducibility
  • Vývoj kolony pro selektivnější rozlišení epimerů D/L hydroxylysinu
  • Aplikaci metody v průmyslové výrobě bioterapeutik jako standardní součást QC

Závěr


Studie ukázala, že systém AAA-Direct v kombinaci s kationtovou a reverzní chromatografií dokáže spolehlivě identifikovat a kvantifikovat hydroxylysine-obsahující peptidy a odhalit nečistoty v syntetických fragmentech. Mikro­dialýza se osvědčila jako efektivní metoda pro odstranění solí a zajištění přesnosti analýzy.

Reference


  1. Kivirikko K I, Myllyla R, Pihlajaniemi T. Posttranslational Modifications of Proteins; CRC Press; 1992.
  2. Molony M S, Quan C, Mulkerrin M G, Harris R J. Anal Biochem. 1998;258:136–137.
  3. Molony M S, Wu S L, Keyt L K, Harris R J. Techniques in Protein Chemistry VI; Academic Press; 1995:91–98.
  4. Dionex Corp. AAA-Direct Amino Acid Analysis Installation and Troubleshooting Guide; 2003.
  5. Dionex Corp. Technical Note 50 Determination of Amino Acid Content by AAA-Direct; 2003.
  6. Snyder L R, Kirkland J J, Glajch J L. Practical HPLC Method Development, 2nd ed.; Wiley; 1997.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Determination of the Amino Acid Content of Peptidesby AAA-Direct
Technical Note 50 Determination of the Amino Acid Content of Peptides by AAA-Direct INTRODUCTION EQUIPMENT ™ The AAA-Direct system separates amino acids on a high performance anion-exchange column and directly detects them by integrated amperometry.1, 2 AAA-Direct has advantages over…
Klíčová slova
amino, aminohydrolysis, hydrolysisaaa, aaaacid, acidmsh, mshacids, acidstrp, trpreplicate, replicateblanks, blankspeptide, peptidetyr, tyrarg, argser, sergly, glydirect
Determination of Amino Acids in Cell Cultures and Fermentation Broths
Application Note 150 Determination of Amino Acids in Cell Cultures and Fermentation Broths INTRODUCTION Cell cultures and fermentation broths are used in the manufacture of biotherapeutics and many other biological materials produced using recombinant genetic technology. Broths are also used…
Klíčová slova
amino, aminobroths, brothsfermentation, fermentationacids, acidsbroth, brothsigma, sigmanaoh, naohcarbohydrates, carbohydratescultures, culturesaaa, aaaypd, ypdmedia, mediachemical, chemicalcell, cellculture
Determination of Protein Concentrations Using AAA-Direct
Determination of Protein Concentrations Using AAA-Direct
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 163 Determination of Protein Concentrations Using AAA-Direct™ INTRODUCTION Dye-binding assays such as bicinchoninic acid (BCA), Lowry, and Bradford (Coomassie) are the most common methods to determine total protein. The BCA assay depends on Cu (II) reduction to Cu…
Klíčová slova
aaa, aaaprotein, proteinamino, aminohydrolysate, hydrolysatebsa, bsadirect, directundiluted, undilutedconcentrations, concentrationsacid, acidconcentration, concentrationwater, wateracids, acidshydrolysis, hydrolysistotal, totaldetermination
Screening of Sample Matrices and Individual Matrix Ingredients for Suitability in AAA-Direct™
Technical Note 55 Screening of Sample Matrices and Individual Matrix Ingredients for Suitability in AAA-Direct™ INTRODUCTION All chromatographic techniques are susceptible to chemical interferences. Problems associated with chemical interferences include coelution with analytes, column contamination, shifts in retention times, and…
Klíčová slova
aaa, aaaamino, aminodirect, directethanol, ethanolmatrix, matrixingredients, ingredientsstandards, standardsscreening, screeningaspartate, aspartateeffects, effectsglutamate, glutamatepercent, percentlysine, lysinepeak, peakcystine
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.