CE/MS/MS as an Orthogonal Technique for Sensitive and Easy Quantification of Peptides in Complex Matrixes
Aplikace | 2014 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Ortogonální rozdělení peptidů pomocí CE/MS/MS zlepšuje schopnost detekce a kvantifikace ve složitých matricích. Metoda nachází uplatnění v proteomice, farmaceutickém vývoji, QA/QC a biomedicínském výzkumu díky vysoké citlivosti a minimálnímu objemu vzorku.
Cílem studie bylo demonstrovat využití Agilent capillary electrophoresis 7100 společně s Agilent 6490 Triple Quadrupole MS a Agilent Jet Stream sprayerem pro přesnou kvantifikaci dvou peptidů human serum albuminu (HSA) v matrici tryptického digestu E. coli.
Metoda dosáhla LOD 2,3 amol a LOQ 23,5 amol pro oba peptidy v širokém lineárním rozsahu 0,002–20 pmol/μL (R² > 0,999). Obě složené peptidy byly separovány za méně než 4 min s mobilitou na 3,8 a 3,9 min. V komplexní matrici tryptického digestu E. coli zůstala citlivost zachována na 2,3 amol. Navíc bylo prokázáno sledování až 60 MRM přechodů tryptických peptidů BSA v jednom běhu.
Dynamická metoda MRM (DMRM) umožní lepší kvalitu dat a širší rozsah monitorovaných přechodů. Rozšíření na glykopeptidy, metabolity nebo další biomolekuly a integrace s vysokopropustnými proteomickými platformami otevírá nové směry v bioanalytice.
Implementace CE/MS/MS s Agilent Jet Stream sprayerem a MassHunter softwarem poskytuje vysoce citlivou a selektivní kvantifikaci peptidů v náročných matricích. Metoda nabízí rychlé, reprodukovatelné a ortogonální řešení pro cílenou analýzu biomolekul.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ, Kapilární elektroforéza
ZaměřeníProteomika
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Ortogonální rozdělení peptidů pomocí CE/MS/MS zlepšuje schopnost detekce a kvantifikace ve složitých matricích. Metoda nachází uplatnění v proteomice, farmaceutickém vývoji, QA/QC a biomedicínském výzkumu díky vysoké citlivosti a minimálnímu objemu vzorku.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo demonstrovat využití Agilent capillary electrophoresis 7100 společně s Agilent 6490 Triple Quadrupole MS a Agilent Jet Stream sprayerem pro přesnou kvantifikaci dvou peptidů human serum albuminu (HSA) v matrici tryptického digestu E. coli.
Použitá metodika a instrumentace
- CE podmínky: kapilára 60 cm × 50 μm id, 1 M kyselina octová pH 2,3, napětí 30 kV, teplota 20 °C, injekce 10 s při 50 mbar.
- MS podmínky: Agilent 6490 Triple Q, AJS pozitivní ionizace, MRM, suchý plyn 11 L/min při 200 °C, nábojová tekutina methanol:voda (1:1) s 0,5 % kyseliny octové, proud 8 μL/min.
- Software: MassHunter Acquisition B.05.01 pro řízení CE a MS, Peptide Optimizer pro volbu MRM přechodů, Quantitative Software pro tvorbu kalibračních křivek.
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda dosáhla LOD 2,3 amol a LOQ 23,5 amol pro oba peptidy v širokém lineárním rozsahu 0,002–20 pmol/μL (R² > 0,999). Obě složené peptidy byly separovány za méně než 4 min s mobilitou na 3,8 a 3,9 min. V komplexní matrici tryptického digestu E. coli zůstala citlivost zachována na 2,3 amol. Navíc bylo prokázáno sledování až 60 MRM přechodů tryptických peptidů BSA v jednom běhu.
Přínosy a praktické využití metody
- Vyšší selektivita díky ortogonální separaci.
- Extrémní citlivost v attomolovém rozsahu.
- Rychlý analytický běh (<35 min) a nízký odběr vzorku.
- Možnost snadného přepnutí mezi CE/MS a LC/MS konfiguracemi.
Budoucí trendy a možnosti využití
Dynamická metoda MRM (DMRM) umožní lepší kvalitu dat a širší rozsah monitorovaných přechodů. Rozšíření na glykopeptidy, metabolity nebo další biomolekuly a integrace s vysokopropustnými proteomickými platformami otevírá nové směry v bioanalytice.
Závěr
Implementace CE/MS/MS s Agilent Jet Stream sprayerem a MassHunter softwarem poskytuje vysoce citlivou a selektivní kvantifikaci peptidů v náročných matricích. Metoda nabízí rychlé, reprodukovatelné a ortogonální řešení pro cílenou analýzu biomolekul.
Reference
- Sun L. et al. Capillary zone electrophoresis-multiple reaction monitoring from 100 pg of RAW 264.7 cell lysate digest. Analyst. 2013;138:3181-3188.
- Glycopeptide Analysis of Antibodies by Capillary Electrophoresis and Q-TOF Mass Spectrometry. Agilent Technol. Publ. 5990-7138EN.
- Compatibility of Agilent Jet Stream thermal gradient focusing technology with CE/MS. Agilent Technol. Publ. 5990-9716EN.
- MacLean B. et al. Skyline: an open source document editor for creating and analyzing targeted proteomics experiments. Bioinformatics. 2010;26(7):966-968.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Targeted Peptide Quantification with Small Foot-print Capillary LC-MS/MS
2024|Agilent Technologies|Postery
Poster Reprint ASMS 2024 Poster number WP 587 Targeted Peptide Quantification with Small Foot-print Capillary LC-MS/MS Xiaoli Dong1; Matthew Morse2; Greg Ward2; Linfeng Wu1; Patrick Batoon1; Maozi Liu1 1Agilent Technologies, Inc., Santa Clara, CA; 2Axcend, Provo, UT Introduction Quantification of…
Klíčová slova
afteccvvasqlr, afteccvvasqlrlqdaeiar, lqdaeiarstd, stddpgvldr, dpgvldrllleyleek, llleyleekajs, ajscounts, countscapillary, capillaryesi, esiacquisition, acquisitionflow, flowultivo, ultivomin, minfmol, fmolpeptide
A GENERIC KIT-BASED APPROACH FOR LC-MS/MS QUANTIFICATION OF URINARY ALBUMIN FOR CLINICAL RESEARCH
2017|Waters|Postery
A GENERIC KIT-BASED APPROACH FOR LC-MS/MS QUANTIFICATION OF URINARY ALBUMIN FOR CLINICAL RESEARCH Mary E. Lame, Caitlin M. Dunning, and Erin E. Chambers Waters Corporation 34 Maple Street Milford, MA 01757 DISCUSSION INTRODUCTION [M+2H]2+ VFDEFKPLVEEPQNLIK [M+3H]3+ AEFAEVSK [M+2H]2+ LCTVATLR [M+2H]2+…
Klíčová slova
fqnallvr, fqnallvrvfdefkplveepqnlik, vfdefkplveepqnliklvnevtefak, lvnevtefakylyeiar, ylyeiararea, areapeptide, peptideendogenous, endogenousalbumin, albuminlctvatlr, lctvatlrlvaasqaalgl, lvaasqaalglrpcfsalevdetyvpk, rpcfsalevdetyvpktyettlek, tyettlekgeneric, genericdlgeenfk, dlgeenfkaefaevsk
A Generic Kit-Based Approach for LC-MS/MS Quantification of Urinary Albumin for Clinical Research
2017|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] A Generic Kit-Based Approach for LC-MS/MS Quantification of Urinary Albumin for Clinical Research Mary Lame, Caitlin Dunning, and Erin Chambers Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS INTRODUCTION High analytical sensitivity LC-MS Albumin (~ MWT 66.5…
Klíčová slova
fqnallvr, fqnallvrvfdefkplveepqnlik, vfdefkplveepqnlikalbumin, albuminlvnevtefak, lvnevtefakylyeiar, ylyeiarurinary, urinarylvaasqaalgl, lvaasqaalgllctvatlr, lctvatlrrpcfsalevdetyvpk, rpcfsalevdetyvpktyettlek, tyettlekgeneric, genericdlgeenfk, dlgeenfkaefaevsk, aefaevskqtalvelvk, qtalvelvkarea
The Agilent 6495 Triple Quadrupole LC/MS: Peptide Quantitation Performance
2016|Agilent Technologies|Technické články
The Agilent 6495 Triple Quadrupole LC/MS: Peptide Quantitation Performance Technical Overview Introduction Sample complexity and the low concentration of certain biomarkers are the major challenges encountered when performing biomarker verification using multiple reaction monitoring (MRM)-based methods. For this reason, the…
Klíčová slova
contest, contestnanoflow, nanoflowpeptide, peptideflow, flowquantitation, quantitationplasma, plasmacounts, countsfmol, fmolquantitative, quantitativestd, stdperformance, performancemrm, mrmpeptides, peptidesamol, amolstandard