LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

CONFIDENT O-GLYCOSYLATION SITE IDENTIFICATION USING A CYCLIC ION MOBILITY– MASS SPECTROMETER EQUIPPED WITH ECD FUNCTIONALITY

Postery | 2022 | Waters | ASMSInstrumentace
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Waters

Souhrn

Význam tématu

Analýza O glykosylace proteinů je klíčová pro charakterizaci bioterapeutik, protože glykosylace ovlivňuje stabilitu, biologickou aktivitu a imunogenicitu léčiv
Stanovení přesných míst O glykosylace přispívá k validaci kvality a konzistentnímu výrobnímu procesu proteinových terapeutik, jako je etanercept

Cíle a přehled studie

Studie demonstruje využití cyklického iontového mobilního spektrometru vybaveného buňkou pro electron capture dissociation k jednoznačné lokalizaci O glykosylace v peptidových fragmentech etanerceptu (Enbrel)
Prozkoumána byla především schopnost IMSn slicing a multi-pass IMS před ECD fragmentací izolovat a rozlišit izobarické glykopeptidy

Použitá metodika a instrumentace

  • Vzorky: trypsinový digest etanerceptu, koncentrace 2 až 4 µM pro infusion a LC-MS
  • Spektrometr: SELECT SERIES Cyclic IMS s post IMS ExD buňkou (eMSion)
  • Separace iontovou mobilitou: multi-pass IMS a IMSn slicing k rozlišení a izolaci před fragmentací
  • Fragmentace: electron capture dissociation zachovává glykosidické vazby a umožňuje lokalizaci zbytků
  • Chromatografie: ACQUITY I Class UPLC se CSH C18 kolonkou, gradient 1–35 % B za 25 minut při 60 °C
  • Zpracování dat: ExDViewer BETA pro semiautomatickou anotaci spekter

Hlavní výsledky a diskuse

  • Multi-pass IMS před ECD fragmentací umožnilo oddělit více izobarických forem glykosylovaných peptidů
  • IMSn slicing zvýšilo selektivitu izolace minoritních komponent a odhalilo vzácné glykoformy
  • Identifikováno bylo 11 O glykosidačních míst v etanerceptu, včetně pozičních izomer
  • LC HDMSE ECD spojilo chromatografickou separaci s iontovou mobilitou a ECD, což vedlo k jednoznačnému přiřazení glykanů k peptidovým zbytkům

Přínosy a praktické využití metody

  • Vysoká důvěra v lokalizaci O glykosylace u komplexních bioterapeutik
  • Schopnost rozlišit poziční izomery bez potřeby chemické derivatizace
  • Podpora QA/QC procesů pro validaci konzistence výrobních šarží

Budoucí trendy a možnosti využití

Rozvoj pokročilé iontové mobility a ECD bude dále umožňovat analýzu dalších labile posttranslačních modifikací
Kombinace s vysokorozlišovacími hmotovými spektrometry a automatizovaným zpracováním dat otevře nové možnosti v glykoproteomice a vývoji biosimilars

Závěr

Implementace cyklické iontové mobility s electron capture dissociation významně rozšiřuje schopnosti detailní analýzy O glykosylace
Přesné lokalizace glykozylovaných zbytků zvyšují spolehlivost charakterizace bioterapeutik a přispívají k lepší kontrole kvality

Reference

  1. S Ippoliti D Cooper Shepherd Q Yu J I Langridge Confident O glycosylation Site Identification for ENBREL etanercept Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System Application Note 720007458EN

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Confident O-glycosylation Site Identification for ENBREL (etanercept) Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System
Application Note Confident O-glycosylation Site Identification for ENBREL (etanercept) Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System Samantha Ippoliti, Dale Cooper-Shepherd, Ying Qing Yu, James I. Langridge Waters Corporation This is an Application Brief and does not contain…
Klíčová slova
etanercept, etanerceptenbrel, enbrelglycosylation, glycosylationims, imsecd, ecdcyclic, cyclicconfident, confidentsite, sitefunctionality, functionalityselect, selectseries, seriesidentification, identificationusing, usingsystem, systemfragmentation
In-Depth Versatile Characterization of Aspartic Acid Isomers via a Cyclic Ion Mobility Mass Spectrometry (cIMS)
In-Depth Versatile Characterization of Aspartic Acid Isomers via a Cyclic Ion Mobility Mass Spectrometry (cIMS) Samantha Ippoliti1; Brad J. Williams1, Dale Cooper-Shepherd2, Ying Qing Yu1, Weibin Chen1, Barbara Sullivan1, James I. Langridge2 1Waters Corporation, Milford, MA, USA; 2Waters Corporation, Wilmslow,…
Klíčová slova
asp, aspcims, cimsisoasp, isoaspmobility, mobilitytmab, tmabims, imscyclic, cyclicspecies, speciesvia, viahdms, hdmspeptides, peptidesaspartic, asparticion, ionbiotherapeutic, biotherapeutictryptic
Electron Capture Dissociation in Combination With High Performance Cyclic Ion Mobility Separation for Detailed Protein Studies
Application Note Electron Capture Dissociation in Combination With High Performance Cyclic Ion Mobility Separation for Detailed Protein Studies Dale Cooper-Shepherd Waters Corporation This is an Application Brief and does not contain a detailed Experimental section. Abstract Electron capture dissociation (ECD)…
Klíčová slova
mobility, mobilitycyclic, cyclicdissociation, dissociationcapture, captureprotein, proteinelectron, electronstudies, studiesdetailed, detailedcombination, combinationseparation, separationecd, ecdion, ionions, ionsperformance, performancehigh
Comprehending COVID-19: Structural Characterization of the Glycan Assemblies of O-linked Glycopeptides Using Cyclic Ion Mobility
Application Note Comprehending COVID-19: Structural Characterization of the Glycan Assemblies of O-linked Glycopeptides Using Cyclic Ion Mobility Lindsay Morrison Waters Corporation, Georgetown University Medical Center, Lombardi Comprehensive Cancer Center For research use only. Not for use in diagnostic procedures. Save…
Klíčová slova
cyclic, cyclicims, imsfurin, furinglycan, glycanlinked, linkedmobility, mobilitycleavage, cleavageglycosylation, glycosylationselect, selectglycopeptides, glycopeptidesseries, seriesspike, spikesite, sitetri, triefforts
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.