CONFIDENT O-GLYCOSYLATION SITE IDENTIFICATION USING A CYCLIC ION MOBILITY– MASS SPECTROMETER EQUIPPED WITH ECD FUNCTIONALITY
Postery | 2022 | Waters | ASMSInstrumentace
Stanovení přesných míst O glykosylace přispívá k validaci kvality a konzistentnímu výrobnímu procesu proteinových terapeutik, jako je etanercept
Prozkoumána byla především schopnost IMSn slicing a multi-pass IMS před ECD fragmentací izolovat a rozlišit izobarické glykopeptidy
Kombinace s vysokorozlišovacími hmotovými spektrometry a automatizovaným zpracováním dat otevře nové možnosti v glykoproteomice a vývoji biosimilars
Přesné lokalizace glykozylovaných zbytků zvyšují spolehlivost charakterizace bioterapeutik a přispívají k lepší kontrole kvality
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníProteomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Analýza O glykosylace proteinů je klíčová pro charakterizaci bioterapeutik, protože glykosylace ovlivňuje stabilitu, biologickou aktivitu a imunogenicitu léčivStanovení přesných míst O glykosylace přispívá k validaci kvality a konzistentnímu výrobnímu procesu proteinových terapeutik, jako je etanercept
Cíle a přehled studie
Studie demonstruje využití cyklického iontového mobilního spektrometru vybaveného buňkou pro electron capture dissociation k jednoznačné lokalizaci O glykosylace v peptidových fragmentech etanerceptu (Enbrel)Prozkoumána byla především schopnost IMSn slicing a multi-pass IMS před ECD fragmentací izolovat a rozlišit izobarické glykopeptidy
Použitá metodika a instrumentace
- Vzorky: trypsinový digest etanerceptu, koncentrace 2 až 4 µM pro infusion a LC-MS
- Spektrometr: SELECT SERIES Cyclic IMS s post IMS ExD buňkou (eMSion)
- Separace iontovou mobilitou: multi-pass IMS a IMSn slicing k rozlišení a izolaci před fragmentací
- Fragmentace: electron capture dissociation zachovává glykosidické vazby a umožňuje lokalizaci zbytků
- Chromatografie: ACQUITY I Class UPLC se CSH C18 kolonkou, gradient 1–35 % B za 25 minut při 60 °C
- Zpracování dat: ExDViewer BETA pro semiautomatickou anotaci spekter
Hlavní výsledky a diskuse
- Multi-pass IMS před ECD fragmentací umožnilo oddělit více izobarických forem glykosylovaných peptidů
- IMSn slicing zvýšilo selektivitu izolace minoritních komponent a odhalilo vzácné glykoformy
- Identifikováno bylo 11 O glykosidačních míst v etanerceptu, včetně pozičních izomer
- LC HDMSE ECD spojilo chromatografickou separaci s iontovou mobilitou a ECD, což vedlo k jednoznačnému přiřazení glykanů k peptidovým zbytkům
Přínosy a praktické využití metody
- Vysoká důvěra v lokalizaci O glykosylace u komplexních bioterapeutik
- Schopnost rozlišit poziční izomery bez potřeby chemické derivatizace
- Podpora QA/QC procesů pro validaci konzistence výrobních šarží
Budoucí trendy a možnosti využití
Rozvoj pokročilé iontové mobility a ECD bude dále umožňovat analýzu dalších labile posttranslačních modifikacíKombinace s vysokorozlišovacími hmotovými spektrometry a automatizovaným zpracováním dat otevře nové možnosti v glykoproteomice a vývoji biosimilars
Závěr
Implementace cyklické iontové mobility s electron capture dissociation významně rozšiřuje schopnosti detailní analýzy O glykosylacePřesné lokalizace glykozylovaných zbytků zvyšují spolehlivost charakterizace bioterapeutik a přispívají k lepší kontrole kvality
Reference
- S Ippoliti D Cooper Shepherd Q Yu J I Langridge Confident O glycosylation Site Identification for ENBREL etanercept Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System Application Note 720007458EN
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Confident O-glycosylation Site Identification for ENBREL (etanercept) Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System
2022|Waters|Aplikace
Application Note Confident O-glycosylation Site Identification for ENBREL (etanercept) Using the ECD Functionality of SELECT SERIES Cyclic IMS System Samantha Ippoliti, Dale Cooper-Shepherd, Ying Qing Yu, James I. Langridge Waters Corporation This is an Application Brief and does not contain…
Klíčová slova
etanercept, etanerceptenbrel, enbrelglycosylation, glycosylationims, imsecd, ecdcyclic, cyclicconfident, confidentsite, sitefunctionality, functionalityselect, selectseries, seriesidentification, identificationusing, usingsystem, systemfragmentation
In-Depth Versatile Characterization of Aspartic Acid Isomers via a Cyclic Ion Mobility Mass Spectrometry (cIMS)
2021|Waters|Postery
In-Depth Versatile Characterization of Aspartic Acid Isomers via a Cyclic Ion Mobility Mass Spectrometry (cIMS) Samantha Ippoliti1; Brad J. Williams1, Dale Cooper-Shepherd2, Ying Qing Yu1, Weibin Chen1, Barbara Sullivan1, James I. Langridge2 1Waters Corporation, Milford, MA, USA; 2Waters Corporation, Wilmslow,…
Klíčová slova
asp, aspcims, cimsisoasp, isoaspmobility, mobilitytmab, tmabims, imscyclic, cyclicspecies, speciesvia, viahdms, hdmspeptides, peptidesaspartic, asparticion, ionbiotherapeutic, biotherapeutictryptic
Electron Capture Dissociation in Combination With High Performance Cyclic Ion Mobility Separation for Detailed Protein Studies
2024|Waters|Aplikace
Application Note Electron Capture Dissociation in Combination With High Performance Cyclic Ion Mobility Separation for Detailed Protein Studies Dale Cooper-Shepherd Waters Corporation This is an Application Brief and does not contain a detailed Experimental section. Abstract Electron capture dissociation (ECD)…
Klíčová slova
mobility, mobilitycyclic, cyclicdissociation, dissociationcapture, captureprotein, proteinelectron, electronstudies, studiesdetailed, detailedcombination, combinationseparation, separationecd, ecdion, ionions, ionsperformance, performancehigh
Comprehending COVID-19: Structural Characterization of the Glycan Assemblies of O-linked Glycopeptides Using Cyclic Ion Mobility
2021|Waters|Aplikace
Application Note Comprehending COVID-19: Structural Characterization of the Glycan Assemblies of O-linked Glycopeptides Using Cyclic Ion Mobility Lindsay Morrison Waters Corporation, Georgetown University Medical Center, Lombardi Comprehensive Cancer Center For research use only. Not for use in diagnostic procedures. Save…
Klíčová slova
cyclic, cyclicims, imsfurin, furinglycan, glycanlinked, linkedmobility, mobilitycleavage, cleavageglycosylation, glycosylationselect, selectglycopeptides, glycopeptidesseries, seriesspike, spikesite, sitetri, triefforts