In-Depth Versatile Characterization of Aspartic Acid Isomers via a Cyclic Ion Mobility Mass Spectrometry (cIMS)
Postery | 2021 | Waters | ASMSInstrumentace
Proteinová izomerizace, zejména přeměna z residue kyseliny asparagové (Asp) na isoasparagovou (isoAsp), může výrazně ovlivnit biologickou aktivitu, stabilitu a bezpečnost bioterapeutik. Vysoce citlivé a selektivní analytické metody pro rozlišení těchto isomerů jsou proto nezbytné při vývoji a kontrole kvality biologických léčiv.
Cílem práce bylo ukázat schopnost cyklické iontové mobilní spektrometrie (cIMS) ve spojení s hmotnostní spektrometrií (MS) rozlišit a charakterizovat isomery Asp a isoAsp v peptidových modelech relevantních pro bioterapeutika. Studie prezentuje separaci isobarických izomerů beta-amyloidu 1–16 a tryptického peptidu z části těžkého řetězce monoklonální protilátky trastuzumabu (TmAb HC T12).
Další směřování výzkumu bude zahrnovat rozšíření metody na komplexnější proteomické vzorky, optimalizaci počtu průchodů cIMS pro rychlé analýzy a integraci s dalšími technikami (např. top-down MS) za účelem detailního zkoumání posttranslačních modifikací.
Cyklická iontová mobilní spektrometrie v kombinaci s hmotnostní spektrometrií prokázala vysokou univerzálnost při separaci a charakterizaci Asp vs isoAsp isomerů v peptidových modelech. Metoda nabízí novou úroveň rozlišení konformačních rozdílů a umožňuje cílenou IMSn fragmentaci pro přesné lokalizace izomerizace.
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníFarmaceutická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Proteinová izomerizace, zejména přeměna z residue kyseliny asparagové (Asp) na isoasparagovou (isoAsp), může výrazně ovlivnit biologickou aktivitu, stabilitu a bezpečnost bioterapeutik. Vysoce citlivé a selektivní analytické metody pro rozlišení těchto isomerů jsou proto nezbytné při vývoji a kontrole kvality biologických léčiv.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem práce bylo ukázat schopnost cyklické iontové mobilní spektrometrie (cIMS) ve spojení s hmotnostní spektrometrií (MS) rozlišit a charakterizovat isomery Asp a isoAsp v peptidových modelech relevantních pro bioterapeutika. Studie prezentuje separaci isobarických izomerů beta-amyloidu 1–16 a tryptického peptidu z části těžkého řetězce monoklonální protilátky trastuzumabu (TmAb HC T12).
Použitá metodika a instrumentace
- Vzorky: syntetické peptidy beta-amyloid 1–16 a TmAb HC T12 obsahující Asp/isoAsp (0,5 µM v 10 mM acetátu amonného); redukovaný, alkylovaný a trypticky štěpený TmAb.
- Chromatografie: ACQUITY H-Class LC pro oddělení tryptických štěpků.
- cIMS systém: SELECT SERIES Cyclic IMS pro vícenásobné průchody a iontovou mobilitu s možností „slicing“ a opětovné injekce pro IMSn.
- Detekce: HDMSE (DIA s iontovou mobilitou) a cílené HDMS/MS (CID, ECD).
Hlavní výsledky a diskuse
- Single-pass IMS nedokázalo rozlišit Asp/isoAsp izomery, zatímco po 15–20 průchodech cIMS byla dosažena baseline separace.
- Metoda „slicing“ umožnila selekci iónů po první separaci, jejich opětovné vložení a generování fragmentů (IMSn), čímž se odhalila odlišná konformace peptidových fragmentů b7 a y10 pro Asp vs isoAsp.
- ECD fragmentace následovaná IMS ukázala rozdíly v driftovém čase a m/z pro štěpné ionty, což potvrdilo lokalizaci izomerizace na sedmém zbytku.
- Online LC–HDMSE a cílené HDMS/MS poskytly komplementární informaci pro analýzu TmAb digestu a srovnání s referenčními stanovami.
Přínosy a praktické využití metody
- Vysoká selektivita a citlivost rozlišení isobarických peptidových izomerů.
- Možnost lokalizovat místo izomerizace přímo na úrovni fragmentů.
- Aplikovatelnost pro kontrolu kvality a stability bioterapeutik, kde izomerizace může ovlivnit účinnost a imunogenicitu.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další směřování výzkumu bude zahrnovat rozšíření metody na komplexnější proteomické vzorky, optimalizaci počtu průchodů cIMS pro rychlé analýzy a integraci s dalšími technikami (např. top-down MS) za účelem detailního zkoumání posttranslačních modifikací.
Závěr
Cyklická iontová mobilní spektrometrie v kombinaci s hmotnostní spektrometrií prokázala vysokou univerzálnost při separaci a charakterizaci Asp vs isoAsp isomerů v peptidových modelech. Metoda nabízí novou úroveň rozlišení konformačních rozdílů a umožňuje cílenou IMSn fragmentaci pro přesné lokalizace izomerizace.
Reference
- Zheng, X; Chem Commun (Camb). 2017. 53(56):7913–7916.
- Yang, H; J Proteome Res. 2009. 8(10):4615–4621.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
INVESTIGATING PRIMARY AND HIGHER-ORDER PROTEIN STRUCTURE ANALYSIS USING A NOVEL CYCLIC ION MOBILITY ENABLED QTOF PLATFORM
2019|Waters|Postery
INVESTIGATING PRIMARY AND HIGHER-ORDER PROTEIN STRUCTURE ANALYSIS USING A NOVEL CYCLIC ION MOBILITY ENABLED QTOF PLATFORM Scott J. Berger1, Dale A. Cooper-Shepherd2 , Martin Palmer2, LeRoy B Martin1, Henry Shion1, and James I. Langridge2, 1 Waters Corporation, Milford, MA, 01757…
Klíčová slova
ims, imscycles, cyclescyclic, cyclictiime, tiimeintensity, intensitypanel, panelmobility, mobilityarrival, arrivalpeptide, peptideenabled, enablednovel, novelcycle, cycleqtof, qtofunfolding, unfoldingion
Deep Characterization of Aspartic Acid Isomerism Using High-Resolution Cyclic™ Ion Mobility and Electron-Capture Dissociation
2026|Waters|Aplikace
Application Note Deep Characterization of Aspartic Acid Isomerism Using High-Resolution Cyclic™ Ion Mobility and Electron-Capture Dissociation Samantha Ippoliti, Brad Williams, Dale Cooper-Shepherd Waters Corporation, United States Published on January 06, 2026 Application Brief This is an Application Brief and does…
Klíčová slova
electroncapture, electroncaptureisomerism, isomerismcyclic, cyclicmobility, mobilityaspartic, asparticdeep, deepdissociation, dissociationcharacterization, characterizationresolution, resolutionion, ionacid, acidhigh, highisoasp, isoaspusing, usingasp
ICRS: CHARACTERISATION OF DELTA-8 THC DISTILLATES USING HIGH RESOLUTION MASS SPECTROMETRY (HRMS) AND CYCLIC ION MOBILITY SPECTROMETRY COUPLED WITH HRMS
2022|Waters|Postery
CHARACTERISATION OF DELTA-8 THC DISTILLATES USING HIGH RESOLUTION MASS SPECTROMETRY (HRMS) AND CYCLIC ION MOBILITY SPECTROMETRY COUPLED WITH HRMS Marian Twohig1, Andy Baker2, Douglas Stevens1, Andrew Aubin3, and Christopher J. Hudalla3 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA; 2Waters Corporation, Pleasanton,…
Klíčová slova
cbl, cblmobility, mobilitycyclic, cyclicabs, abscim, cimcid, cidspectrum, spectrumunknown, unknownpasses, passesims, imsuplc, uplccomponent, componentqtof, qtofhrms, hrmsspectra
ICRS: CHARACTERISATION OF DELTA-8 THC DISTILLATES USING HIGH RESOLUTION MASS SPECTROMETRY (HRMS) AND CYCLIC ION MOBILITY SPECTROMETRY COUPLED WITH HRMS
2022|Waters|Postery
CHARACTERISATION OF DELTA-8 THC DISTILLATES USING HIGH RESOLUTION MASS SPECTROMETRY (HRMS) AND CYCLIC ION MOBILITY SPECTROMETRY COUPLED WITH HRMS Marian Twohig1, Andy Baker2, Douglas Stevens1, Andrew Aubin3, and Christopher J. Hudalla3 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA; 2Waters Corporation, Pleasanton,…
Klíčová slova
cbl, cblmobility, mobilityabs, abscyclic, cycliccim, cimcid, cidspectrum, spectrumpasses, passesunknown, unknownims, imsuplc, uplccomponent, componentqtof, qtofhrms, hrmsspectra