A HILIC Method for the Analysis of Bovine Fetuin Glycans
Aplikace | 2013 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Analýza glycokonjugátů, zejména glykanů navázaných na proteiny, je zásadní pro pochopení biologických funkcí buněk a identifikaci biomarkerů spojených s onemocněními, jako je rakovina. Bovine fetuin, bohatý na oligosacharidy, slouží jako modelová látka pro vývoj a optimalizaci analytických metod v oblasti glykomiky. Účinná separace strukturálních izomerů a rozvětvených glykanů umožňuje detailní charakterizaci jejich role v biologických procesech.
Cílem práce je demonstrovat výkon HILIC analytické metody s použitím kolony Accucore 150-Amide-HILIC pro separaci 2-aminobenzamidově (2AB) značených glycans bovinního fetuinu. Studie ukazuje, že optimalizovaný gradient a pevné jádro částic zajišťují vysokou účinnost separace za tlakových podmínek kompatibilních s konvenčními HPLC systémy.
Pro separaci byla použita:
Metoda umožnila rozlišení osmi selektivních píků odpovídajících různým strukturálním variantám fetuinu. Chromatogram vykazuje symetrické tvary píků a baseline separaci izomerů (např. A3G3S2 vs. A3G2S3). Backpressure dosáhlo maximálně 300 bar, což potvrzuje kompatibilitu se standardními instrumenty.
Metoda je:
Další vývoj se zaměří na integraci HILIC separace s hmotnostní spektrometrií pro strukturu detailní charakterizaci glykanů, rozšíření metody na komplexní glykomické studie v biomedicíně a automatizaci přípravy vzorků pro vysokopropustné analýzy.
Popsaná HILIC metoda s kolonnou Accucore 150-Amide-HILIC poskytuje efektivní a reprodukovatelnou separaci 2AB značených glycans bovinního fetuinu. Vysoká účinnost, nízký backpressure a schopnost rozlišit strukturální izomery činí tuto metodu vhodnou pro rutinní i pokročilé glykomické aplikace.
HPLC
ZaměřeníProteomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Analýza glycokonjugátů, zejména glykanů navázaných na proteiny, je zásadní pro pochopení biologických funkcí buněk a identifikaci biomarkerů spojených s onemocněními, jako je rakovina. Bovine fetuin, bohatý na oligosacharidy, slouží jako modelová látka pro vývoj a optimalizaci analytických metod v oblasti glykomiky. Účinná separace strukturálních izomerů a rozvětvených glykanů umožňuje detailní charakterizaci jejich role v biologických procesech.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem práce je demonstrovat výkon HILIC analytické metody s použitím kolony Accucore 150-Amide-HILIC pro separaci 2-aminobenzamidově (2AB) značených glycans bovinního fetuinu. Studie ukazuje, že optimalizovaný gradient a pevné jádro částic zajišťují vysokou účinnost separace za tlakových podmínek kompatibilních s konvenčními HPLC systémy.
Použitá metodika a instrumentace
Pro separaci byla použita:
- HPLC systém Thermo Scientific Dionex UltiMate 3000 RSLC se fluorescence detektorem (FLD), excitace 330 nm, emise 420 nm
- Kolona Accucore 150-Amide-HILIC, 2.6 µm, 100×2.1 mm
- Mobilní fáze A: acetonitril; B: 50 mM amonný formiát pH 4.4
- Gradient: 20→40→50 % B v čase 0–26–27 min při průtoku 1.0 mL/min, teplota kolony 60 °C
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda umožnila rozlišení osmi selektivních píků odpovídajících různým strukturálním variantám fetuinu. Chromatogram vykazuje symetrické tvary píků a baseline separaci izomerů (např. A3G3S2 vs. A3G2S3). Backpressure dosáhlo maximálně 300 bar, což potvrzuje kompatibilitu se standardními instrumenty.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda je:
- vysokorychlá a robustní díky Core Enhanced Technology™
- schopná rozlišit i velmi podobné glykanové struktury
- kompatibilní se stávajícími HPLC systémy bez nutnosti modifikací
Budoucí trendy a možnosti využití
Další vývoj se zaměří na integraci HILIC separace s hmotnostní spektrometrií pro strukturu detailní charakterizaci glykanů, rozšíření metody na komplexní glykomické studie v biomedicíně a automatizaci přípravy vzorků pro vysokopropustné analýzy.
Závěr
Popsaná HILIC metoda s kolonnou Accucore 150-Amide-HILIC poskytuje efektivní a reprodukovatelnou separaci 2AB značených glycans bovinního fetuinu. Vysoká účinnost, nízký backpressure a schopnost rozlišit strukturální izomery činí tuto metodu vhodnou pro rutinní i pokročilé glykomické aplikace.
Reference
- [1] Thermo Scientific. GlycanPac AXH-1 Product Specification, 2013.
Podobná PDF
Analysis of Human IgG Glycans on a Solid Core Amide HILIC Stationary Phase
2013|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Daniel Spencer1, Joanna Freeke2, and Valeria Barattini2 1 Ludger Ltd, Oxford, UK; 2Thermo Fisher Scientific, Runcorn, UK Appli cat i on N ote 2 0 7 0 3 Analysis of Human IgG Glycans on a Solid Core Amide HILIC Stationary…
Klíčová slova
glycans, glycansigg, iggfisher, fisherhilic, hilicbranching, branchingcore, corehplc, hplcgrade, gradescientific, scientifichuman, humanglycan, glycanstructural, structuraltechnologytm, technologytmseparation, separationnumber
Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column
2012|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Valeria Barattini, Kim Phipps, Joanna Freeke, Thermo Fisher Scientific, Runcorn, Cheshire, UK Appli c at i on N ot e 2 0 5 9 3 Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column Key Words Accucore…
Klíčová slova
counts, countsminutes, minutesfisher, fisherdextran, dextrancore, corehilic, hilichplc, hplcgrade, gradescientific, scientificglycans, glycansseparation, separationrsd, rsdchromatography, chromatographytechnologytm, technologytmaccucoretm
Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column
2012|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Valeria Barattini, Kim Phipps, Joanna Freeke, Thermo Fisher Scientific, Runcorn, Cheshire, UK Appli c at i on N ot e 2 0 5 9 3 Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column Key Words Accucore…
Klíčová slova
counts, countsminutes, minutesfisher, fisherdextran, dextranhilic, hiliccore, corehplc, hplcgrade, gradescientific, scientificglycans, glycansseparation, separationchromatography, chromatographyrsd, rsdtechnologytm, technologytmaccucoretm
UHPLC Analysis of 2-Aminobenzamide- Labeled Glycans with the Vanquish Flex System
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Alexandra Manka and Mauro De Pra Thermo Fisher Scientific, Germering, Germany Key Words Biosimilars, Biotherapeutics, Bovine Fetuin, Fluorescence Detector, Glycan Analysis, IgG Goal To demonstrate successful separation and detection of 2-aminobenzamide (2-AB)-labeled complex glycan libraries on a Thermo Scientific™ Vanquish™…
Klíčová slova
glycans, glycansvanquish, vanquishhighpower, highpowerfluorescence, fluorescenceprecision, precisionflex, flexretention, retentionrsd, rsdlabeled, labeledbiantennary, biantennaryglycan, glycanfetuin, fetuindetection, detectiondetector, detectorproteins