Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column
Aplikace | 2012 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Separace a charakterizace glykanů patří mezi klíčové úlohy v oblasti glykomiky, proteomiky a biologického výzkumu. Glykanové struktury, včetně oligosacharidů a polysacharidů, slouží jako biomolekulární „otisky prstů“ na povrchu bílkovin a buněk a jsou často spojeny s detekcí onemocnění, jako je rakovina. Díky své vysoké polarity však glykanové fragmenty představují výzvu pro tradiční chromatografické techniky. Hydrofobní fází reverzní chromatografie není dostatečně retenční a iontová výměna nefunguje bez ionizovatelných skupin. HILIC (Hydrophilic Interaction Chromatography) se jeví jako ideální metoda pro efektivní retenci a rozlišení těchto vysoce polárních biomolekul.
Cílem aplikace bylo demonstrovat jednoduchou, opakovatelnou a vysoce účinnou separaci dextranové žebříku značené fluorescenčním barvivem 2-aminobenzamid (2-AB) na kolóně Accucore 150-Amide-HILIC se solidním jádrem. Studie se zaměřila na dosažení vysoké rozlišovací schopnosti, nízkého provozního tlaku a robustnosti metody vhodné pro konvenční vysokotlaké HPLC systémy.
Připraven byl pufr 50 mM amonného formiátu upravený na pH 4.5 formiovou kyselinou. Mobilní fáze A byla čistý acetonitril, mobilní fáze B 50 mM amonný formiát pH 4.5. Gradientní eluce probíhala od 20 % B do 50 % B během 40 min, poté 5 min izokraticky a návrat na počáteční podmínky do 50 min.
Při injekci 2 µL bylo na chromatogramu rozlišeno nejméně 11 homopolymerů dextranové žebříku se středními rozlišovacími faktory Rs ≈ 9.97 (prvních 5 piků) a Rs ≈ 3.39 (píky 6–10, vypočteno dle Evropského farmakopejního vzorce). Trojité replikáty prokázaly vysokou opakovatelnost s relativními odchylkami %RSD pod 0.5 % pro retenční časy všech identifikovaných látek. Při zvýšení objemu injekce na 5 µL se počet detekovaných homopolymerů rozšířil až na 21, což potvrzuje schopnost kolony rozlišit i vyšší řády sacharidových oligomerů.
Metoda nabízí jednoduché a robustní rozlišení glykanových oligomerů s vynikajícími separačními parametry při tlacích kompatibilních s konvenčními HPLC systémy. Otevřená aplikace HILIC s amido-fází umožňuje snadné zařazení do rutinních laboratoří pro glykanovou analýzu, kontrolu kvality potravin, léků a biologických vzorků.
Další rozvoj lze očekávat v kombinaci HILIC s hmotnostní spektrometrií pro detailní strukturální charakterizaci glykanů. Rozšíření metodiky na komplexní biologické vzorky, multiplexní analýzy glykopeptidů a high-throughput screening představuje perspektivní směr pro farmaceutický výzkum, klinickou diagnostiku a biofarmaceutický průmysl.
Accucore 150-Amide-HILIC kolona se solidním jádrem poskytuje vysoce účinnou, reprodukovatelnou a nízkotlakou separaci 2-AB značené dextranové žebříku. Metoda umožňuje detekci minimálně 21 glykanových homopolymerů při vysoké rozlišovací schopnosti a je snadno implementovatelná do běžných HPLC laboratoří.
V textu nebyly uvedeny explicitní literární citace.
Spotřební materiál, HPLC, LC kolony
ZaměřeníProteomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Separace a charakterizace glykanů patří mezi klíčové úlohy v oblasti glykomiky, proteomiky a biologického výzkumu. Glykanové struktury, včetně oligosacharidů a polysacharidů, slouží jako biomolekulární „otisky prstů“ na povrchu bílkovin a buněk a jsou často spojeny s detekcí onemocnění, jako je rakovina. Díky své vysoké polarity však glykanové fragmenty představují výzvu pro tradiční chromatografické techniky. Hydrofobní fází reverzní chromatografie není dostatečně retenční a iontová výměna nefunguje bez ionizovatelných skupin. HILIC (Hydrophilic Interaction Chromatography) se jeví jako ideální metoda pro efektivní retenci a rozlišení těchto vysoce polárních biomolekul.
Cíle a přehled studie
Cílem aplikace bylo demonstrovat jednoduchou, opakovatelnou a vysoce účinnou separaci dextranové žebříku značené fluorescenčním barvivem 2-aminobenzamid (2-AB) na kolóně Accucore 150-Amide-HILIC se solidním jádrem. Studie se zaměřila na dosažení vysoké rozlišovací schopnosti, nízkého provozního tlaku a robustnosti metody vhodné pro konvenční vysokotlaké HPLC systémy.
Použitá instrumentace
- HPLC systém Thermo Scientific Dionex Ultimate 3000 RSLC s fluorescenčním detektorem FLD (excitační vlnová délka 330 nm, emisní vlnová délka 420 nm)
- Kolona Accucore 150-Amide-HILIC, 2.6 µm, 100 × 2.1 mm
- Chromeleon Chromatography Data System v7.0
Použitá metodika
Připraven byl pufr 50 mM amonného formiátu upravený na pH 4.5 formiovou kyselinou. Mobilní fáze A byla čistý acetonitril, mobilní fáze B 50 mM amonný formiát pH 4.5. Gradientní eluce probíhala od 20 % B do 50 % B během 40 min, poté 5 min izokraticky a návrat na počáteční podmínky do 50 min.
- Průtok: 0.5 mL/min
- Teplota kolony: 60 °C
- Objem injekce: 2–5 µL (oplach 80:20 acetonitril:voda)
- Zpětný tlak: cca 110 bar na začátku, 160 bar v gradientním maximu
Hlavní výsledky a diskuse
Při injekci 2 µL bylo na chromatogramu rozlišeno nejméně 11 homopolymerů dextranové žebříku se středními rozlišovacími faktory Rs ≈ 9.97 (prvních 5 piků) a Rs ≈ 3.39 (píky 6–10, vypočteno dle Evropského farmakopejního vzorce). Trojité replikáty prokázaly vysokou opakovatelnost s relativními odchylkami %RSD pod 0.5 % pro retenční časy všech identifikovaných látek. Při zvýšení objemu injekce na 5 µL se počet detekovaných homopolymerů rozšířil až na 21, což potvrzuje schopnost kolony rozlišit i vyšší řády sacharidových oligomerů.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda nabízí jednoduché a robustní rozlišení glykanových oligomerů s vynikajícími separačními parametry při tlacích kompatibilních s konvenčními HPLC systémy. Otevřená aplikace HILIC s amido-fází umožňuje snadné zařazení do rutinních laboratoří pro glykanovou analýzu, kontrolu kvality potravin, léků a biologických vzorků.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj lze očekávat v kombinaci HILIC s hmotnostní spektrometrií pro detailní strukturální charakterizaci glykanů. Rozšíření metodiky na komplexní biologické vzorky, multiplexní analýzy glykopeptidů a high-throughput screening představuje perspektivní směr pro farmaceutický výzkum, klinickou diagnostiku a biofarmaceutický průmysl.
Závěr
Accucore 150-Amide-HILIC kolona se solidním jádrem poskytuje vysoce účinnou, reprodukovatelnou a nízkotlakou separaci 2-AB značené dextranové žebříku. Metoda umožňuje detekci minimálně 21 glykanových homopolymerů při vysoké rozlišovací schopnosti a je snadno implementovatelná do běžných HPLC laboratoří.
Reference
V textu nebyly uvedeny explicitní literární citace.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column
2012|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Valeria Barattini, Kim Phipps, Joanna Freeke, Thermo Fisher Scientific, Runcorn, Cheshire, UK Appli c at i on N ot e 2 0 5 9 3 Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column Key Words Accucore…
Klíčová slova
counts, countsminutes, minutesfisher, fisherdextran, dextranhilic, hiliccore, corehplc, hplcgrade, gradescientific, scientificglycans, glycansseparation, separationrsd, rsdchromatography, chromatographytechnologytm, technologytmaccucoretm
BioLC columns and accessories (Chromatography consumables catalog)
2022|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
Chromatography consumables Connected chromatography solutions Chromatography consumables catalog Comprehensive products to support your chromatography workflows Sample preparation solutions Sample handling solutions Low-flow LC columns and accessories BioLC columns and accessories LC columns and accessories GC columns and accessories • EASY-Spray™…
Klíčová slova
columns, columnsbiolc, biolcmabpac, mabpacaccesories, accesoriessize, sizephase, phasemobile, mobilereading, readingcolumn, columnbuffer, buffervariant, variantpore, porehplc, hplcmab, mablength
Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core nanoLC Column
2012|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Joanna Freeke, Valeria Barattini, Thermo Fisher Scientific, Runcorn, Cheshire, UK Appli cat i on N ote 2 0 5 9 7 Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core nanoLC Column Key Words Accucore 150-Amide-HILIC, HILIC, glycomics, proteomics,…
Klíčová slova
dextran, dextranscientific, scientificcore, corehilic, hilicglycans, glycansminutes, minutesfeatures, featuresseparation, separationthermo, thermohplc, hplcdionex, dionextechnologytm, technologytmprobed, probedfisher, fishergroups
BioLC columns and accessories
2024|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
BioLC columns Connected chromatography solutions BioLC columns and accessories Introduction Your complete tool kit Thermo Fisher Scientific has innovative Thermo Scientific™ BioLC columns for each step of your therapeutic protein characterization, no matter how challenging your separation. Here is just…
Klíčová slova
biolc, biolcaccesories, accesoriesmobile, mobilephase, phasereading, readingcolumn, columngradient, gradientcolumns, columnssize, sizelinks, linksvariants, variantsparticle, particlemabpac, mabpaclength, lengthformat