Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core nanoLC Column
Aplikace | 2012 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Chromatografická analýza oligosacharidů, konkrétně dextranové řady značené 2-aminobenzamidem (2-AB), je klíčová v glykomice a proteomice pro detailní charakterizaci struktur oligosacharidů a jejich izomerů. Díky vysoké polaritě sacharidů je nutné využívat techniky HILIC, které umožňují důkladné rozlišení monomerů a oligosacharidových větvení při zachování kompatibility s hmotnostní spektrometrií (MS).
Tato aplikace si klade za cíl demonstrovat jednoduchou a robustní metodu separace 2-AB značené dextranové řady na nanoLC kolonce Thermo Scientific Accucore 150-Amide-HILIC. Studie pojednává o optimalizaci chromatografických podmínek, hodnocení dělící schopnosti i reprodukovatelnosti a zajištění MS-kompatibility.
Pro separaci byl použit Thermo Scientific EASY 1000 nLC systém s UV detektorem Dionex VWD a topným modulem Hot Pocket. Kolonka Accucore 150-Amide-HILIC (2,6 µm, 150×0,075 mm, 150 Å) pracovala v režimu HILIC s mobilní fází A (98:2 acetonitril:voda) a B (2:98 acetonitril:voda). Gradient probíhal od 0 % do 50 % fáze B v průběhu 50 minut při průtoku 200 nL/min a teplotě kolonky 40 °C. Vzorek (1 µL) byl naložen při tlaku 280 bar. Detekce probíhala na UV 240 a 330 nm. Data byly zpracovány v Chromeleon CDS.
Chromatogram ukázal jasné rozlišení nejméně 18 homopolymerů dextranové řady. Průměrné faktory rozlišení (Rs) činily přibližně 10,22 pro prvních pět špiček, 4,30 pro špičky 6–10 a 2,91 pro špičky 11–18, což potvrzuje vysokou efektivitu HILIC na pevné jádro. Reprodukovatelnost retencí byla vynikající: %RSD časů retence pro 10 zástupných špiček se pohybovalo mezi 0,29 a 0,64 %. Nízké systémové protitlaky (cca 100 bar v místě maximálního gradientu) umožňují použití běžných nanoLC přístrojů bez nutnosti velmi vysokotlaké kontroly.
Další vývoj v oblasti HILIC nanoLC by mohl zahrnovat:
Použití nanoLC kolony Accucore 150-Amide-HILIC pro analýzu 2-AB značené dextranové řady poskytuje vynikající rozlišení a reprodukovatelnost v podmínkách kompatibilních s MS detekcí. Metoda je jednoduchá, robustní a vhodná pro různé aplikace v oblasti glykomiky a biomedicínského výzkumu.
Spotřební materiál, HPLC, LC kolony
ZaměřeníProteomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Chromatografická analýza oligosacharidů, konkrétně dextranové řady značené 2-aminobenzamidem (2-AB), je klíčová v glykomice a proteomice pro detailní charakterizaci struktur oligosacharidů a jejich izomerů. Díky vysoké polaritě sacharidů je nutné využívat techniky HILIC, které umožňují důkladné rozlišení monomerů a oligosacharidových větvení při zachování kompatibility s hmotnostní spektrometrií (MS).
Cíle a přehled studie
Tato aplikace si klade za cíl demonstrovat jednoduchou a robustní metodu separace 2-AB značené dextranové řady na nanoLC kolonce Thermo Scientific Accucore 150-Amide-HILIC. Studie pojednává o optimalizaci chromatografických podmínek, hodnocení dělící schopnosti i reprodukovatelnosti a zajištění MS-kompatibility.
Použitá metodika a instrumentace
Pro separaci byl použit Thermo Scientific EASY 1000 nLC systém s UV detektorem Dionex VWD a topným modulem Hot Pocket. Kolonka Accucore 150-Amide-HILIC (2,6 µm, 150×0,075 mm, 150 Å) pracovala v režimu HILIC s mobilní fází A (98:2 acetonitril:voda) a B (2:98 acetonitril:voda). Gradient probíhal od 0 % do 50 % fáze B v průběhu 50 minut při průtoku 200 nL/min a teplotě kolonky 40 °C. Vzorek (1 µL) byl naložen při tlaku 280 bar. Detekce probíhala na UV 240 a 330 nm. Data byly zpracovány v Chromeleon CDS.
Hlavní výsledky a diskuse
Chromatogram ukázal jasné rozlišení nejméně 18 homopolymerů dextranové řady. Průměrné faktory rozlišení (Rs) činily přibližně 10,22 pro prvních pět špiček, 4,30 pro špičky 6–10 a 2,91 pro špičky 11–18, což potvrzuje vysokou efektivitu HILIC na pevné jádro. Reprodukovatelnost retencí byla vynikající: %RSD časů retence pro 10 zástupných špiček se pohybovalo mezi 0,29 a 0,64 %. Nízké systémové protitlaky (cca 100 bar v místě maximálního gradientu) umožňují použití běžných nanoLC přístrojů bez nutnosti velmi vysokotlaké kontroly.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a robustní separace oligosacharidů s vysokým rozlišením izomerů.
- Kompatibilita s MS detekcí pro detailní strukturální analýzy a kvantifikaci.
- Nízké provozní protitlaky snižují požadavky na hardware.
- Vhodnost pro glykoanalýzy v biomedicíně, farmaceutickém výzkumu i QA/QC laboratořích.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další vývoj v oblasti HILIC nanoLC by mohl zahrnovat:
- Integraci s pokročilou MS/MS technologií pro přesnější určení větvení a modifikací oligosacharidů.
- Automatizované workflow a vysokoprůchodové platformy pro glykomické studie komplexních biologických vzorků.
- Optimalizaci povlaků pevných jader pro ještě vyšší účinnost a méně závislé na pH gradienty.
Závěr
Použití nanoLC kolony Accucore 150-Amide-HILIC pro analýzu 2-AB značené dextranové řady poskytuje vynikající rozlišení a reprodukovatelnost v podmínkách kompatibilních s MS detekcí. Metoda je jednoduchá, robustní a vhodná pro různé aplikace v oblasti glykomiky a biomedicínského výzkumu.
Reference
- Freeke J., Barattini V. Analysis of 2-aminobenzamide labeled dextran ladder on a solid core nanoLC column. Application Note 20597, Thermo Fisher Scientific, 2012.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column
2012|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Valeria Barattini, Kim Phipps, Joanna Freeke, Thermo Fisher Scientific, Runcorn, Cheshire, UK Appli c at i on N ot e 2 0 5 9 3 Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column Key Words Accucore…
Klíčová slova
counts, countsminutes, minutesfisher, fisherdextran, dextrancore, corehilic, hilichplc, hplcgrade, gradescientific, scientificglycans, glycansseparation, separationrsd, rsdchromatography, chromatographytechnologytm, technologytmaccucoretm
Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column
2012|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Valeria Barattini, Kim Phipps, Joanna Freeke, Thermo Fisher Scientific, Runcorn, Cheshire, UK Appli c at i on N ot e 2 0 5 9 3 Analysis of 2-aminobenzamide Labeled Dextran Ladder on a Solid Core HPLC Column Key Words Accucore…
Klíčová slova
counts, countsminutes, minutesfisher, fisherdextran, dextranhilic, hiliccore, corehplc, hplcgrade, gradescientific, scientificglycans, glycansseparation, separationrsd, rsdchromatography, chromatographytechnologytm, technologytmaccucoretm
A HILIC Method for the Analysis of Bovine Fetuin Glycans
2013|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Daniel Spencer1, Joanna Freeke2, and Valeria Barattini2 Ludger Ltd, Oxford, UK; 2Thermo Fisher Scientific, Runcorn, UK 1 Appli cat i on N ote 2 0 7 0 2 A HILIC Method for the Analysis of Bovine Fetuin Glycans Key Words…
Klíčová slova
glycans, glycansfetuin, fetuinbovine, bovinefisher, fisherscientific, scientificionizable, ionizablehplc, hplcgrade, gradeseparation, separationcore, corehilic, hilicgroups, groupsretention, retentionnumber, numberbranching
Analysis of Human IgG Glycans on a Solid Core Amide HILIC Stationary Phase
2013|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Daniel Spencer1, Joanna Freeke2, and Valeria Barattini2 1 Ludger Ltd, Oxford, UK; 2Thermo Fisher Scientific, Runcorn, UK Appli cat i on N ote 2 0 7 0 3 Analysis of Human IgG Glycans on a Solid Core Amide HILIC Stationary…
Klíčová slova
glycans, glycansigg, iggfisher, fisherhilic, hilicbranching, branchingcore, corehplc, hplcgrade, gradescientific, scientifichuman, humanglycan, glycanstructural, structuraltechnologytm, technologytmseparation, separationnumber