Rapid Metabolite Tof Screening, Structure Elucidation and Clearance Estimates Using Informatics-HRMS Approaches
Postery | 2013 | WatersInstrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Rychlé a spolehlivé screenování metabolitů je klíčové pro vývoj nových léčiv a jejich farmakokinetické hodnocení. Integrace vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (HRMS) s pokročilou informatikou umožňuje komplexní identifikaci, kvantifikaci a odhad clearance metabolitů napříč různými druhy a podmínkami.Cíle a přehled studie / článku
Cílem prezentované studie bylo demonstrovat ucelené reportování identifikace a kvantifikace metabolitů fáze I a II za použití dat z HRMS QTof spektrometru. Konkrétně byly analyzovány modelové sloučeniny glyburid, buspiron, clozapin a verapamil v různých biologických matricích a mezi druhy.Použitá metodika a instrumentace
Analytická procedura zahrnovala in vitro inkubaci testovaných sloučenin s jaterními mikrosomy člověka, potkana, psa a opice, v přítomnosti nebo nepřítomnosti GSH pro zachycení reaktivních aduktů. Po ukončení reakce acetonitrilem a odsražení proteinů centrifugací byl vzorek injektován na kromatografickou sestavu:- UPLC: Acquity I-Class s kolonkou BEH C18 (1.7 µm, 2.1 × 100 mm), gradient 5–60 % acetonitril/8 min, tok 0.6 ml/min, teplota 60 °C
- MS: Xevo G2-S QTof v režimu MSE, ESI+, rozlišení 32 500, nízká CE 2 V, vysoká CE ramp 10–30 V, scan time 0.1 s
- Software: UNIFI pro akvizici dat, dekonvoluci nabíjecích stavů a zpracování výsledků
Hlavní výsledky a diskuse
- Glyburid: identifikace oxidačních metabolitů, zobrazení heatmapy struktur, binárního grafu a chromatogramu všech detekovaných a +O subsetu
- Buspiron: přehledná tabulka metabolitů fáze I, chromatogramy všech forrmací, subset +O2 a detailní prekurzorová a fragmentační spektra pro vybrané metabolity
- Clozapin: detekce metabolitů fáze I i II včetně GSH aduktů, trendová srovnání koncentrací jednotlivých aduktů pomocí překrytých liniových grafů
- Verapamil: mapování fragmentace, sledování změn koncentrace mezi druhy a v čase prezentované jako sloupcové grafy, podpora výpočtu clearance v externích programech
Přínosy a praktické využití metody
Použitá platforma umožňuje simultánní vyhodnocení metabolického profilu napříč druhy a proměnnými, zjednodušuje workflow identifikace a kyvantifikace metabolitů a nabízí možnost automatizovaného výpočtu clearance a dalších DMPK parametrů.Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj směřuje k širší automatizaci zpracování multivariačních dat, integraci in silico predikce metabolitů, rozšíření aplikace na další biologické matrixy a vylepšenou vizualizaci trendů v reálném čase.Závěr
Studie ukazuje efektivitu využití HRMS QTof spolu s pokročilou informatikou pro komplexní screening metabolitů, jejich strukturové vysvětlení i odhad clearance. Navržená platforma představuje robustní DMPK nástroj vhodný pro preklinický vývoj léčiv.Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Direct Detection of Glutathione Conjugates in Human Liver Microsomes Using ACQUIT Y UPLC I-Class, Xevo G2-S QTof, and UNIFI
2013|Waters|Aplikace
Direct Detection of Glutathione Conjugates in Human Liver Microsomes Using ACQUITY UPLC I-Class, Xevo G2-S QTof, and UNIFI Yun W. Alelyunas, Mark D. Wrona, and Paul D. Rainville Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L I C AT…
Klíčová slova
clozapine, clozapinegsh, gshadducts, adductsunifi, unifiglutathione, glutathionemetabolites, metabolitesreactive, reactivecharge, chargegeneric, genericuplc, uplcacquity, acquitydeconvolution, deconvolutiondetection, detectionconjugates, conjugatesstate
APPLICATION SOLUTIONS FOR METABOLITE IDENTIFICATION
2005|Waters|Příručky
A P P LICAT ION SOLUT IONS FO R M ETABOLIT E IDENT IFICAT ION A P P L I C AT I O N S O L U T I O N S F O R M E TA…
Klíčová slova
synapt, synaptuplc, uplcmetabolite, metabolitemetabolynx, metabolynxwaters, watersmassfragment, massfragmenthdms, hdmsmetabolites, metabolitesdrug, drugetabolite, etabolitedata, datafragment, fragmentgsh, gshvivo, vivoacquity
Detection and identification of isotope-labeled glutathionetrapped reactive drug metabolites
2024|Thermo Fisher Scientific|Technické články
Technical note | 003277 Software Detection and identification of isotope-labeled glutathionetrapped reactive drug metabolites A streamlined solution using the Orbitrap Exploris 240 MS and Compound Discoverer software Authors Application benefits Zhixin Miao1, Allison Schmittou1, John Ulrich1, • Accomplish high-throughput metabolites…
Klíčová slova
gsh, gshnode, nodemetabolites, metaboliteslabeled, labeledtrapped, trappedclozapine, clozapinescoring, scoringreactive, reactivecompounds, compoundspattern, patternisotope, isotopeconjugates, conjugatesfragmentation, fragmentationexpected, expectedstructure
Effect of MS Scan Speed on UPLC Peak Separation and Metabolite Identification: Time-of-Flight HRMS vs. Orbitrap
2013|Waters|Aplikace
Effect of MS Scan Speed on UPLC Peak Separation and Metabolite Identification: Time-of-Flight HRMS vs. Orbitrap Yun W. Alelyunas, Mark D. Wrona, Kevin Cook, Stephen McDonald, Paul D. Rainville Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L I C…
Klíčová slova
metabolite, metaboliteglyburide, glyburidescanning, scanningscan, scanresolution, resolutionmetabolites, metabolitesmicrosomal, microsomalhrms, hrmsuplc, uplcincubate, incubatenegatives, negativesslower, slowerequally, equallyfast, fastspeeds