LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

BIOMINERALIZACE SRDEČNÍCH CHLOPNÍ

Vědecké články | 2013 | Chemické listyInstrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Klinická analýza
Výrobce
Thermo Fisher Scientific, Waters, Bruker

Souhrn

Význam tématu


Ve vyspělých zemích představuje aortální stenóza nejčastější operovanou srdeční vadu s náklady v řádu miliard dolarů ročně. Degenerativní kalcifikační procesy úzce souvisejí s tvorbou fosfátových usazenin v chlopenní tkáni, což vede k narušení normální hemodynamiky a postupnému selhání srdeční komory.

Cíle a přehled studie


Cílem práce bylo objasnit proteomické složení fosfatovaných aortálních chlopní pacientů s aortální stenózou. Autoři aplikovali metodu peptidového mapování spojenou s moderními LC-MS/MS technologiemi na pevné nerozpustné vzorky chlopenní tkáně, aby identifikovali proteiny podílející se na procesu biomineralizace.

Použitá metodika a instrumentace


Vzorky dvaceti patologicky postižených chlopní byly expedovány z kardiologické kliniky a skladovány při –20 °C. Pro proteolytickou analýzu bylo porovnáno dva přístupy:
  • Redukce disulfidických můstků (dithiotreitol), následná alkylace (jodacetamid) a štěpení trypsinem.
  • Štěpení trypsinem bez předchozího ošetření.
Výhodou přímého štěpení byla rychlost a vyšší podíl identifikovaných nerozpustných proteinů. Peptidové směsi byly čistěny ZipTip reverzní fází a analyzovány LC-MS/MS.

Použitá instrumentace


  • UPLC Acquity (Waters) s ESI-Q-TOF (Waters, UK)
  • UHPLC Dionex Ultimate3000 RSLC nano s ESI-Q-TOF Maxis Impact (Bruker Daltonics, Germany)
  • ZipTip C18 reverzní fáze (Millipore)
  • Software PLGS 2.3, Mascot 2.2.04, Data Analysis 4.1

Hlavní výsledky a diskuse


Celkem bylo identifikováno až 200 proteinů, z nichž ~30 % představovaly nekonvenční faktory biomineralizace. Mezi nejčastěji nalezené patřily:
  • Alkalická fosfatasa – klíčová v mineralizačních procesech
  • Osteopontin – vazba na hydroxyapatit a regulace krystalizace
  • Biglykan, mimekan a periostin – modulace extracelulární matrix a růst kostní hmoty
  • Proteoglykan 4 – zprostředkování ukládání minerálů v pojivové tkáni
Výsledky naznačují, že fosfátová mineralizace chlopní probíhá podobně jako osteogeneze, což otevírá cestu k novým diagnostickým a terapeutickým strategiím.

Přínosy a praktické využití metody


Metoda peptidového mapování na nerozpustných vzorcích:
  • Nevyžaduje demineralizaci ani komplexní chemickou úpravu.
  • Umožňuje identifikaci neznámých proteinů a rychlou proteomickou charakterizaci.
  • Je efektivní alternativou k imunohistochemii či gelové elektroforéze.

Budoucí trendy a možnosti využití


Dalšími kroky jsou kvantifikace klíčových proteinů (např. SRM/MRM), validace biomarkerů pro časné odhalení kalcifikace a vývoj personalizované medikace. Metodu lze rozšířit na jiné formy patologických kalcifikací a kombinovat s imaging mass spectrometry pro prostorovou lokalizaci minerálů.

Závěr


Peptidové mapování spojené s LC-MS/MS prokázalo vysokou účinnost při analýze minerálů aortálních chlopní. Identifikované proteiny odhalují podobnosti s kostním metabolismem a poskytují nové cíle pro diagnostiku i léčbu aortální stenózy.

Reference


  1. Čerbák R. Interv. Akut. Kardiol. 4, 203 (2005).
  2. Šteiner I., Krbal L., Dominik J. Čes.-Slov. Patol. 46, 33 (2010).
  3. Rajamannan N. M. Expert Rev. Cardiovasc. Ther. 2, 845 (2004).
  4. Rosenhek R. et al. Circulation 110, 1291 (2004).
  5. Antonini Canterin F. et al. Ital. Heart J. 6, 119 (2005).
  6. Borer J. S. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 25, 476 (2005).
  7. Peltier M. et al. Arch. Mal. Coeur Vaiss. 97, 327 (2004).
  8. Fusaro M. et al. J. Endocrinol. Invest. 34, 317 (2011).
  9. Theuwissen E., Smit E., Vermeer C. Adv. Nutr. 3, 166 (2012).
  10. Brázda O. Medical Tribune 12, C7 (2008).
  11. Strunecká A., Patočka J., Limeback H. Klin. farmakol. a farmacie 19, 49 (2005).
  12. Strunecká A., Patočka J. In: Structure and Bonding. New Developments in Biological Aluminum Chemistry, vol.2, s.139, Springer-Verlag, Berlin (2003).
  13. Lehmann S. et al. Ann. Thorac. Surg. 88, 1476 (2009).
  14. Kadena J. et al. Cardiovasc. Pathol. 14, 80 (2005).
  15. Hynek R. et al. J. Surf. Anal. 17, 310 (2011).
  16. Hynek R. et al. Rapid Commun. Mass Spectrom. 18, 1896 (2004).
  17. Kuckova S. et al. Int. J. Mass Spectrom. 284, 42 (2009).
  18. Kučková Š. et al. J. Cultural Heritage 10, 244 (2009).
  19. Velčovská M. Bakalářská práce, VŠCHT Praha (2011).
  20. Zeman A. et al. GEOMED 2011, Bari, Italy, s.267.
  21. Biochemická cvičení, dostupné online http://biomikro.vscht.cz, staženo 2011.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
CHARAKTERIZACE PROTEOMU BAKTERIOFÁGA 812
CHARAKTERIZACE PROTEOMU BAKTERIOFÁGA 812
2005|Bruker|Vědecké články
Chem. Listy 99, 962 − 966 (2005) Laboratorní přístroje a postupy základ pro porovnání standardního typu fága 812 s jeho mutanty a příbuznými fágy na úrovni proteinového komplementu genomu. K analýze proteinů fága 812 je použito jak kombinace jednorozměrné gelové…
Klíčová slova
byl, bylfága, fágafágů, fágůsekvence, sekvencelaboratorní, laboratornípostupy, postupypřístroje, přístrojetof, tofproteinů, proteinůpokrytí, pokrytíbyla, bylaproteiny, proteinypeptidovým, peptidovýmprovedena, provedenamaldi
IDENTIFIKACE PROTEINŮ KOMBINACÍ PEPTIDOVÉHO MAPOVÁNÍ A FRAGMENTACE SULFONOVANÝCH PEPTIDŮ
Chem. Listy 98, 264 − 267 (2004) Laboratorní přístroje a postupy reflectron, cit.5). Fragmentace peptidu na aminokyseliny nebývá úplná a výsledná spektra PSD jsou často velmi komplikovaná. V posledních letech byly vypracovány techniky, které problémy spojené s analýzou PSD překonávají.…
Klíčová slova
pro, procaf, cafmaldi, maldipeptidu, peptidubyla, bylapsd, psdpeptidů, peptidůpřístroje, přístrojesekvenování, sekvenováníidentifikace, identifikacelaboratorní, laboratornípostupy, postupybyly, bylyproteinů, proteinůettantm
INTEGROVANÁ ŘEŠENÍ PRO PROTEOMICKÉ PRACOVNÍ POSTUPY - SIGMA-ALDRICH
Chem. Listy 99, 906 − 914 (2005) Referáty INTEGROVANÁ ŘEŠENÍ PRO PROTEOMICKÉ PRACOVNÍ POSTUPY – SIGMA-ALDRICH KLAUS HERICK 1. Úvod SIGMA-ALDRICH Chemie GmbH, Eschenstr. 5, D-82024 Taufkirchen, Německo [email protected] Proteomické analýzy zahrnují mnoho stupňů od izolace buněčných komponent, přes elektroforetickou…
Klíčová slova
referáty, referátypro, prokatalogové, katalogovéproteoprep, proteoprepodstranění, odstraněníčíslo, čísloigg, iggpryskyřice, pryskyřicetrypsinem, trypsinemalbuminu, albuminuphos, phosproteinu, proteinuprot, protprotilátkách, protilátkáchexprese
PROTEOLYTICKÉ ENZYMY: VÝZNAM PRO PROTEOMIKU
Chem. Listy 99, 896 − 905 (2005) Referáty PROTEOLYTICKÉ ENZYMY: VÝZNAM PRO PROTEOMIKU TAŤÁNA ŠTOSOVÁa, JAN HAVLIŠb, RENÉ LENOBELc a MAREK ŠEBELAa běžnější strategie pro identifikaci proteinu vychází z jeho počátečního štěpení na peptidy, které se děje buď enzymovou nebo…
Klíčová slova
štěpení, štěpeníreferáty, referátyproteomice, proteomiceendopeptidasy, endopeptidasypeptidasy, peptidasyproteinů, proteinůnebo, neboenzym, enzymvzorku, vzorkuendoproteinasa, endoproteinasatrypsinu, trypsinutrypsinem, trypsinemproteinového, proteinovéhosrovnání, srovnáníenzymů
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.