BIOMINERALIZACE SRDEČNÍCH CHLOPNÍ
Vědecké články | 2013 | Chemické listyInstrumentace
Ve vyspělých zemích představuje aortální stenóza nejčastější operovanou srdeční vadu s náklady v řádu miliard dolarů ročně. Degenerativní kalcifikační procesy úzce souvisejí s tvorbou fosfátových usazenin v chlopenní tkáni, což vede k narušení normální hemodynamiky a postupnému selhání srdeční komory.
Cílem práce bylo objasnit proteomické složení fosfatovaných aortálních chlopní pacientů s aortální stenózou. Autoři aplikovali metodu peptidového mapování spojenou s moderními LC-MS/MS technologiemi na pevné nerozpustné vzorky chlopenní tkáně, aby identifikovali proteiny podílející se na procesu biomineralizace.
Vzorky dvaceti patologicky postižených chlopní byly expedovány z kardiologické kliniky a skladovány při –20 °C. Pro proteolytickou analýzu bylo porovnáno dva přístupy:
Celkem bylo identifikováno až 200 proteinů, z nichž ~30 % představovaly nekonvenční faktory biomineralizace. Mezi nejčastěji nalezené patřily:
Metoda peptidového mapování na nerozpustných vzorcích:
Dalšími kroky jsou kvantifikace klíčových proteinů (např. SRM/MRM), validace biomarkerů pro časné odhalení kalcifikace a vývoj personalizované medikace. Metodu lze rozšířit na jiné formy patologických kalcifikací a kombinovat s imaging mass spectrometry pro prostorovou lokalizaci minerálů.
Peptidové mapování spojené s LC-MS/MS prokázalo vysokou účinnost při analýze minerálů aortálních chlopní. Identifikované proteiny odhalují podobnosti s kostním metabolismem a poskytují nové cíle pro diagnostiku i léčbu aortální stenózy.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceThermo Fisher Scientific, Waters, Bruker
Souhrn
Význam tématu
Ve vyspělých zemích představuje aortální stenóza nejčastější operovanou srdeční vadu s náklady v řádu miliard dolarů ročně. Degenerativní kalcifikační procesy úzce souvisejí s tvorbou fosfátových usazenin v chlopenní tkáni, což vede k narušení normální hemodynamiky a postupnému selhání srdeční komory.
Cíle a přehled studie
Cílem práce bylo objasnit proteomické složení fosfatovaných aortálních chlopní pacientů s aortální stenózou. Autoři aplikovali metodu peptidového mapování spojenou s moderními LC-MS/MS technologiemi na pevné nerozpustné vzorky chlopenní tkáně, aby identifikovali proteiny podílející se na procesu biomineralizace.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky dvaceti patologicky postižených chlopní byly expedovány z kardiologické kliniky a skladovány při –20 °C. Pro proteolytickou analýzu bylo porovnáno dva přístupy:
- Redukce disulfidických můstků (dithiotreitol), následná alkylace (jodacetamid) a štěpení trypsinem.
- Štěpení trypsinem bez předchozího ošetření.
Použitá instrumentace
- UPLC Acquity (Waters) s ESI-Q-TOF (Waters, UK)
- UHPLC Dionex Ultimate3000 RSLC nano s ESI-Q-TOF Maxis Impact (Bruker Daltonics, Germany)
- ZipTip C18 reverzní fáze (Millipore)
- Software PLGS 2.3, Mascot 2.2.04, Data Analysis 4.1
Hlavní výsledky a diskuse
Celkem bylo identifikováno až 200 proteinů, z nichž ~30 % představovaly nekonvenční faktory biomineralizace. Mezi nejčastěji nalezené patřily:
- Alkalická fosfatasa – klíčová v mineralizačních procesech
- Osteopontin – vazba na hydroxyapatit a regulace krystalizace
- Biglykan, mimekan a periostin – modulace extracelulární matrix a růst kostní hmoty
- Proteoglykan 4 – zprostředkování ukládání minerálů v pojivové tkáni
Přínosy a praktické využití metody
Metoda peptidového mapování na nerozpustných vzorcích:
- Nevyžaduje demineralizaci ani komplexní chemickou úpravu.
- Umožňuje identifikaci neznámých proteinů a rychlou proteomickou charakterizaci.
- Je efektivní alternativou k imunohistochemii či gelové elektroforéze.
Budoucí trendy a možnosti využití
Dalšími kroky jsou kvantifikace klíčových proteinů (např. SRM/MRM), validace biomarkerů pro časné odhalení kalcifikace a vývoj personalizované medikace. Metodu lze rozšířit na jiné formy patologických kalcifikací a kombinovat s imaging mass spectrometry pro prostorovou lokalizaci minerálů.
Závěr
Peptidové mapování spojené s LC-MS/MS prokázalo vysokou účinnost při analýze minerálů aortálních chlopní. Identifikované proteiny odhalují podobnosti s kostním metabolismem a poskytují nové cíle pro diagnostiku i léčbu aortální stenózy.
Reference
- Čerbák R. Interv. Akut. Kardiol. 4, 203 (2005).
- Šteiner I., Krbal L., Dominik J. Čes.-Slov. Patol. 46, 33 (2010).
- Rajamannan N. M. Expert Rev. Cardiovasc. Ther. 2, 845 (2004).
- Rosenhek R. et al. Circulation 110, 1291 (2004).
- Antonini Canterin F. et al. Ital. Heart J. 6, 119 (2005).
- Borer J. S. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 25, 476 (2005).
- Peltier M. et al. Arch. Mal. Coeur Vaiss. 97, 327 (2004).
- Fusaro M. et al. J. Endocrinol. Invest. 34, 317 (2011).
- Theuwissen E., Smit E., Vermeer C. Adv. Nutr. 3, 166 (2012).
- Brázda O. Medical Tribune 12, C7 (2008).
- Strunecká A., Patočka J., Limeback H. Klin. farmakol. a farmacie 19, 49 (2005).
- Strunecká A., Patočka J. In: Structure and Bonding. New Developments in Biological Aluminum Chemistry, vol.2, s.139, Springer-Verlag, Berlin (2003).
- Lehmann S. et al. Ann. Thorac. Surg. 88, 1476 (2009).
- Kadena J. et al. Cardiovasc. Pathol. 14, 80 (2005).
- Hynek R. et al. J. Surf. Anal. 17, 310 (2011).
- Hynek R. et al. Rapid Commun. Mass Spectrom. 18, 1896 (2004).
- Kuckova S. et al. Int. J. Mass Spectrom. 284, 42 (2009).
- Kučková Š. et al. J. Cultural Heritage 10, 244 (2009).
- Velčovská M. Bakalářská práce, VŠCHT Praha (2011).
- Zeman A. et al. GEOMED 2011, Bari, Italy, s.267.
- Biochemická cvičení, dostupné online http://biomikro.vscht.cz, staženo 2011.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
CHARAKTERIZACE PROTEOMU BAKTERIOFÁGA 812
2005|Bruker|Vědecké články
Chem. Listy 99, 962 − 966 (2005) Laboratorní přístroje a postupy základ pro porovnání standardního typu fága 812 s jeho mutanty a příbuznými fágy na úrovni proteinového komplementu genomu. K analýze proteinů fága 812 je použito jak kombinace jednorozměrné gelové…
Klíčová slova
byl, bylfága, fágafágů, fágůsekvence, sekvencelaboratorní, laboratornípostupy, postupypřístroje, přístrojetof, tofproteinů, proteinůpokrytí, pokrytíbyla, bylaproteiny, proteinypeptidovým, peptidovýmprovedena, provedenamaldi
IDENTIFIKACE PROTEINŮ KOMBINACÍ PEPTIDOVÉHO MAPOVÁNÍ A FRAGMENTACE SULFONOVANÝCH PEPTIDŮ
2004|SCIEX|Vědecké články
Chem. Listy 98, 264 − 267 (2004) Laboratorní přístroje a postupy reflectron, cit.5). Fragmentace peptidu na aminokyseliny nebývá úplná a výsledná spektra PSD jsou často velmi komplikovaná. V posledních letech byly vypracovány techniky, které problémy spojené s analýzou PSD překonávají.…
Klíčová slova
pro, procaf, cafmaldi, maldipeptidu, peptidubyla, bylapsd, psdpeptidů, peptidůpřístroje, přístrojesekvenování, sekvenováníidentifikace, identifikacelaboratorní, laboratornípostupy, postupybyly, bylyproteinů, proteinůettantm
INTEGROVANÁ ŘEŠENÍ PRO PROTEOMICKÉ PRACOVNÍ POSTUPY - SIGMA-ALDRICH
2005|Merck|Vědecké články
Chem. Listy 99, 906 − 914 (2005) Referáty INTEGROVANÁ ŘEŠENÍ PRO PROTEOMICKÉ PRACOVNÍ POSTUPY – SIGMA-ALDRICH KLAUS HERICK 1. Úvod SIGMA-ALDRICH Chemie GmbH, Eschenstr. 5, D-82024 Taufkirchen, Německo [email protected] Proteomické analýzy zahrnují mnoho stupňů od izolace buněčných komponent, přes elektroforetickou…
Klíčová slova
referáty, referátypro, prokatalogové, katalogovéproteoprep, proteoprepodstranění, odstraněníčíslo, čísloigg, iggpryskyřice, pryskyřicetrypsinem, trypsinemalbuminu, albuminuphos, phosproteinu, proteinuprot, protprotilátkách, protilátkáchexprese
PROTEOLYTICKÉ ENZYMY: VÝZNAM PRO PROTEOMIKU
2005||Vědecké články
Chem. Listy 99, 896 − 905 (2005) Referáty PROTEOLYTICKÉ ENZYMY: VÝZNAM PRO PROTEOMIKU TAŤÁNA ŠTOSOVÁa, JAN HAVLIŠb, RENÉ LENOBELc a MAREK ŠEBELAa běžnější strategie pro identifikaci proteinu vychází z jeho počátečního štěpení na peptidy, které se děje buď enzymovou nebo…
Klíčová slova
štěpení, štěpeníreferáty, referátyproteomice, proteomiceendopeptidasy, endopeptidasypeptidasy, peptidasyproteinů, proteinůnebo, neboenzym, enzymvzorku, vzorkuendoproteinasa, endoproteinasatrypsinu, trypsinutrypsinem, trypsinemproteinového, proteinovéhosrovnání, srovnáníenzymů