Analytické laboratoře dnes očekávají od svých dodavatelů/partnerů komplexní řešení, které zahrnuje nejen samotnou přístrojovou techniku, ale také odpovídající aplikační podporu. V oblasti kapalinové chromatografie jsme dlouhodobě schopni nabídnout široké spektrum instrumentace a odborného know-how, přesto zde až doposud chyběl jeden důležitý dílek celé skládačky – iontová chromatografie.Abychom našim zákazníkům mohli tyto požadavky pokrýt skutečně v plném rozsahu, rozšířili jsme portfolio Altium o <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=38&amp;distributorItems=37">iontovou chromatografii značky SHINE</a>. Tímto krokem reagujeme nejen na potřeby rutinních laboratoří, ale i na náročné aplikace, které vyžadují vysokou technickou úroveň, flexibilitu a spolehlivost.Iontová chromatografie nachází nejčastěji uplatnění v laboratořích, které se zabývají kvalitou vod — pitných, povrchových i odpadních. Je preferovanou metodou pro stanovení aniontů a kationtů díky nízkým detekčním limitům, vysoké přesnosti a reprodukovatelnosti, což je klíčové pro splnění legislativních norem i pro efektivní řízení procesů úpravy vod. Metoda se však osvědčuje i v jiných oblastech, například při kontrole surovin a výrobních procesů v chemickém průmyslu, ve farmaceutickém a potravinářském sektoru nebo při environmentálním monitoringu. Pro všechny tyto aplikační potřeby máme se značkou SHINE připravené komplexní řešení v podobě rozmanitého portfolia iontových chromatografů, které pokrývá jak rutinní analytické úlohy, tak pokročilejší technické požadavky moderních laboratoří.Portfolio iontové chromatografie SHINE je ve skutečnosti velmi široké a zahrnuje řadu konfigurací a přístrojových variant. Pro účely tohoto článku jsme však vybrali konkrétní systémy, o kterých jsme přesvědčeni, že právě tyto přístroje mají největší potenciál najít své uplatnění v běžné laboratorní praxi a dokážou nejlépe odpovědět na reálné požadavky analytických laboratoří.<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/2259">CIC-D120+</a> je základní model z řady SHINE iontových chromatografů. Jde o stabilní a spolehlivý systém, který je určený pro běžné iontové analýzy. Přístroj je vybaven kvalitním autosamplerem a neustále sleduje své klíčové části celé sestavy, aby výsledky byly co nejvíce opakovatelné a provoz co nejméně náchylný k neočekávaným výpadkům. Díky jednoduchému provozu a nižší náročnosti na údržbu je CIC-D120+ vhodnou volbou pro laboratoře hledající spolehlivý chromatograf pro každodenní použití.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Altium_Obr_1_Iontovy_chromatograf_SHINE_CIC_D120_41e498cebb.jpg" alt="Altium International: Obr. 1 Iontový chromatograf SHINE CIC-D120+" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Altium_Obr_1_Iontovy_chromatograf_SHINE_CIC_D120_41e498cebb.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="900"><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/2258">CIC-D160+</a> je technologicky pokročilejší model z řady SHINE, který je vybaven generátorem eluentu přímo v přístroji. Díky tomu si systém sám připravuje potřebnou mobilní fázi, což odstraňuje ruční manipulaci s reagenciemi a snižuje riziko chyb při přípravě analýzy. Tento koncept ocení zejména pracoviště, kde se často mění analytické metody nebo kde je kladen důraz na dlouhodobou stabilitu výsledků.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Altium_International_Obr_2_Iontovy_chromatograf_SHINE_CIC_D160_s_generatorem_eluentu_3caa1c3826.jpg" alt="Altium International: Obr. 2 Iontový chromatograf SHINE CIC-D160+ s generátorem eluentu." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Altium_International_Obr_2_Iontovy_chromatograf_SHINE_CIC_D160_s_generatorem_eluentu_3caa1c3826.jpg 174w," sizes="100vw" width="1233" height="1105"><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/2256">CIC-D300+</a> představuje pokročilý duální iontový chromatograf, který je navržen pro současnou a plně nezávislou analýzu aniontů a kationtů. Každý kanál pracuje autonomně, bez vzájemného ovlivnění, což umožňuje paralelní provoz dvou metod a výrazně zvyšuje analytickou kapacitu laboratoře. Tento přístup je přínosný zejména v provozech s vysokým počtem vzorků nebo tam, kde je požadována flexibilita při kombinaci různých typů analýz. Systém je vybaven integrovaným generátorem eluentu, který zajišťuje stabilní a reprodukovatelnou přípravu mobilní fáze bez nutnosti manuální manipulace s reagenciemi. V kombinaci s elektrolytickou supresí přispívá toto řešení k nízkému šumu základní linie a vysoké citlivosti detekce, což je důležité zejména při stanovení stopových koncentrací iontů.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Altium_International_Obr_3_Dualni_iontovy_chromatograf_SHINE_CIC_D300_8edd2a84b6.jpg" alt="Altium International: Obr. 3 Duální iontový chromatograf SHINE CIC-D300+" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Altium_International_Obr_3_Dualni_iontovy_chromatograf_SHINE_CIC_D300_8edd2a84b6.jpg 245w," sizes="100vw" width="2000" height="1127"> <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/2255">CIC-D3200</a> je automatizovaný spalovací IC systém, který je navržen pro stanovení celkového obsahu halogenů, zejména celkového organicky vázaného fluoru (AOF). Právě tento parametr získává v souvislosti s regulací PFAS látek stále větší význam, protože poskytuje celkový přehled o fluorované zátěži vzorku bez ohledu na konkrétní chemickou strukturu jednotlivých sloučenin. Systém kombinuje řízené vysokoteplotní spalování s následnou iontovou chromatografií a umožňuje plně automatizovaný a reprodukovatelný postup i pro náročné pevné matrice.Díky programovatelné spalovací peci s vícestupňovým ohřevem, automatickému dávkování vzorků a možnosti přímého propojení s IC systémy SHINE představuje CIC-D3200 efektivní řešení pro laboratoře, které se zabývají PFAS screeningem,AOF analýzami a environmentálním monitoringem v souladu s aktuálními i připravovanými legislativními požadavky.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Altium_Obr_4_Automatizovany_spalovaci_IC_system_SHINE_CIC_D3200_8fefd16a74.jpg" alt="Altium International: Obr. 4 Automatizovaný spalovací IC systém SHINE CIC-D3200." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Altium_Obr_4_Automatizovany_spalovaci_IC_system_SHINE_CIC_D3200_8fefd16a74.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="630"> Kromě samotných přístrojů nabízí SHINE také vlastní portfolio iontově-chromatografických kolon a supresorů, které jsou navrženy tak, aby byly kompatibilní i s dalšími zavedenými IC systémy na trhu. Laboratořím to dává větší flexibilitu při volbě spotřebního materiálu a zároveň usnadňuje případný přechod z jiných platforem. Právě zde hrají důležitou roli také aplikační listy SHINE, které slouží jako praktická metodická opora při nastavování separací, volbě vhodné kolony nebo optimalizaci podmínek na novém systému.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Altium_Obr_5_Kolony_a_supresory_SHINE_407a9fa4ce.jpg" alt="Altium International: Obr. 5 Kolony a supresory SHINE." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Altium_Obr_5_Kolony_a_supresory_SHINE_407a9fa4ce.jpg 245w," sizes="100vw" width="1043" height="471"><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products?category=48&amp;distributorItems=37&amp;search=SHINE">Kolony a supresory SHINE</a> přitom představují ekonomicky velmi zajímavou alternativu ke spotřebnímu materiálu tradičních výrobců, aniž by bylo nutné slevovat z požadavků na separační výkon, stabilitu nebo reprodukovatelnost měření. Pro řadu laboratoří tak mohou být nejen technickým, ale i provozně efektivním řešením.Rozšířením našeho portfolia o iontovou chromatografii SHINE tak reagujeme na současné potřeby analytických laboratoří, které stále častěji hledají partnera schopného nabídnout ucelené řešení zahrnující přístrojovou techniku, spotřební materiál i aplikační podporu.Naším cílem je stát se pro Vás právě takovým partnerem – tedy firmou, která propojuje odpovídající technologii s odborným zázemím a praktickými zkušenostmi z laboratorní praxe.<blockquote><h5>Pro další informace kontaktujte:&nbsp;</h5><ul><li>Jan Kovář - Produktový specialista (HPLC, LC/MSD)</li><li>Tel.: 607 081 917</li><li>E-mail: jan.kovar@altium.net&nbsp;</li></ul></blockquote>

Nová kapitola iontové chromatografie SHINE v portfoliu Altium

&nbsp;„Pokud viru vezmeme ‚nejlepší mutace‘, můžeme ho oslabit,“ říká biochemik Jiří Zahradník, který vede virologickou laboratoř v <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/309">BIOCEVu</a>. Zkušenosti z prestižního Weizmannova institutu v Izraeli přetavil do výzkumu, jehož cílem je předpovídat mutace virů ještě dřív, než se objeví v populaci – a možná tak jednou pomoci zastavit další pandemii dřív, než vůbec začne.Když se Jiří Zahradník v roce 2018 vydal na prestižní Weizmannův institut věd v izraelském Rechovotu, zaměřoval se na výzkum proteinových interakcí – tedy na to, jak spolu jednotlivé bílkoviny v buňkách „mluví“ a jak jejich vzájemné vazby ovlivňují životní procesy. V době, kdy rozvíjel metody in vitro evoluce a proteinového inženýrství, však svět zasáhla pandemie covidu-19. „Ze dne na den jsem musel odložit svůj původní výzkum a přejít na covidový,“ vzpomíná Zahradník. „Naštěstí se ukázalo, že nástroje, které jsem vyvíjel pro studium evoluce proteinů, se dají výborně použít i při zkoumání evoluce virů.“Tím se jeho práce přirozeně posunula směrem, který určil i jeho současné zaměření. Dnes vede laboratoř v BIOCEVu, společném výzkumném centru Univerzity Karlovy a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/10">Akademie věd ČR</a>, kde se jeho tým patřící k 1. lékařské fakultě UK věnuje vývoji a využití moderních evolučních metod a metod proteinového inženýrství ke studiu biologických jevů, které klasické postupy strukturní biologie nedokážou dobře zachytit. Výzkum je založen na vytváření alternativ k přirozeným proteinům – takových, které se lépe chovají v laboratorních podmínkách a umožňují detailněji zkoumat jejich vlastnosti i vzájemné interakce.<h4>Kultura spolupráce</h4>Zkušenosti z Izraele, kde podle něj panuje mimořádně otevřená a kooperativní vědecká kultura, si přivezl i do Česka. „Stačilo zvednout telefon a během pár hodin jsem měl potřebné vzorky. Všichni vědci tam přesně vědí, kdo na čem pracuje, a spolupráce je naprostou samozřejmostí,“ říká. Právě tento přístup se snaží přenést i do českého prostředí – do týmu, který propojuje biochemii, virologii a evoluční biologii a který dnes patří k nejzajímavějším pracovištím v oblasti molekulární virologie v Česku.Izrael je pro vědce v mnoha ohledech zemí zaslíbenou – špičkové zázemí, otevřená spolupráce, rychlost, s jakou se projekty rozbíhají. Ale i ráj má své limity. Na otázku, proč se po několika letech rozhodl vrátit do Česka, odpovídá bez váhání: „Moje partnerka tehdy řekla jasně, že v Izraeli žít nechce. A zpětně musím uznat, že měla pravdu. Naše životní podmínky jsou tady nesrovnatelně lepší.“Podle něj máme v Česku tendenci své prostředí podceňovat. „Máme pocit, že nic nefunguje a všechno je špatně, ale z mé zkušenosti to nemůže být dál od pravdy. Už jenom taková zdánlivá drobnost, jako je teplotní komfort v budovách, je u nás úplně jinde než třeba ve Španělsku, Británii, Americe, Izraeli nebo Japonsku, kde jsem nějakou dobu pobýval. A to nemluvím o zdravotní péči v Izraeli – měl jsem luxusní, velmi drahé pojištění, ale dostat se ke kvalitnímu ošetření byl obrovský problém. Často jsem musel doplácet částky, o kterých se nám tady ani nezdá.“Po návratu do Česka navázal na výzkum, který rozvíjel už na Weizmannově institutu. Na 1. LF UK bylo tehdy otevřené výběrové řízení, kam se přihlásil a uspěl. Nová pozice spadala pod Národní institut virologie a bakteriologie (NIVB), takže přirozeně pokračoval ve studiu viru SARS-CoV-2 a dalších respiračních patogenů. Součástí grantu, který získal, bylo i otevření nové laboratoře – moderního pracoviště s nejvyšším stupněm biologické bezpečnosti, tzv. BSL-3, kterou vybudovali s lékařkou a vědkyní Zorou Mělkovou a také ve spolupráci s Přírodovědeckou fakultou UK a docentkou Ruth Tachezy, koordinátorkou NIVB na Univerzitě Karlově.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"><h4>Za dveřmi laboratoře, odkud nic nesmí ven</h4>Virologická laboratoř kategorie BSL-3 patří mezi ta nejbezpečnější zařízení pro práci s infekčními viry. Před každým, kdo chce dovnitř, stojí několik vrstev ochrany – od speciálního obleku a dýchací masky až po dvojí rukavice a systém přechodových místností s postupně se snižujícím tlakem. Veškeré pokusy se odehrávají v uzavřených laminárních boxech, odkud se žádný vzorek nesmí dostat mimo kontrolované prostředí. Použité materiály putují do průtahového autoklávu, kde projdou dekontaminací při vysokém tlaku a teplotě. Vzduch i voda se filtrují přes vícestupňové systémy, takže laboratoř zůstává uzavřeným ekosystémem.„Běžně pracujeme se SARS-CoV-2 nebo HIV. Máme ale i rukavicový box pro práci s ještě nebezpečnějšími původci onemocnění,“ říká Jiří Zahradník. Přístup sem mají jen vyškolení pracovníci. Každý nováček musí projít odborným školením, testem a zpočátku může pracovat jen pod dohledem zkušenějšího kolegy. V laboratoři může být maximálně šest lidí, obvykle ve dvojicích – kvůli bezpečnosti i přehledu. Mimo pracovní dobu a přítomnost personálu svítí na stropě germicidní lampy, které sterilizují prostor ultrafialovým světlem. Když je potřeba důkladnější čištění, laboratoř se uzavře a zaplní parami peroxidu vodíku. „Používáme osmiprocentní roztok, a to by vám klidně vybělilo tričko,“ směje se Jiří Zahradník.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="548"><h4>Kreativita potřebuje prostor</h4>Úspěch jeho výzkumu stojí nejen na moderním vybavení a schopném týmu, ale i na mezinárodních kontaktech, které si přivezl ze zahraničí. „Byly to právě vazby z mého dřívějšího působení na Weizmannově institutu a z koronavirového výzkumu. Díky nim jsme se mohli rychle zapojit do mezinárodních projektů a splnit pro začínající laboratoř nelehké cíle, které grant vyžadoval. Navazovali jsme na výzkum, který už běžel, věděli jsme, jaké otázky jsou aktuální a co můžeme ostatním týmům nabídnout,“ popisuje.Jedním z problémů, s nimiž se laboratoř potýká, je ale samotné umístění BIOCEVu ve Vestci-Jesenici u Prahy. „Studenti sem moc nechtějí. Říkají, že je to daleko, i když je to pořád v rámci Prahy, mnozí to berou jako komplikaci,“ přiznává. I pro něj osobně je to velký kontrast oproti Weizmannovu institutu. „To je úplně jiný svět, tamní kampus působí jako botanická zahrada – zelený, otevřený prostor, kde se věda dělá v prostředí, které samo podporuje kreativitu,“ přibližuje atmosféru místa, kde se vědci běžně setkávají venku, sedí na trávě, diskutují a vyměňují si nápady.„Izraelci si moc dobře uvědomují, že věda není továrna. Není to přímý, rutinní proces. Spousta důležitých myšlenek vzniká právě z neformálních rozhovorů mezi lidmi, kteří si šli jen na chvíli odpočinout od práce,“ podotýká s tím, že podobnou kulturu se snaží vytvářet i v BIOCEVu. „Díky univerzitě a menším grantům na udržitelnost se nám podařilo založit komunitní zahrádku. Výrazně nás v tom podpořil náš přednosta docent Jakoubek. Má správný drive a možná i trochu rebelský přístup. Takže jsme si v tomhle dobře rozuměli,“ směje se Zahradník.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"><h4>Úspěchy i překážku výzkumu</h4>Jinak byl ovšem jeho návrat na UK obrovskou logistickou a organizační výzvou. Díky grantu NIVB, pak Primus a nyní také Junior Star se ale všechny plány podařilo splnit. Teď stojí před další velkou výzvou. Připravuje žádost o ERC Consolidator Grant, v jejichž získávání se Univerzitě Karlově v poslední době daří. Jeden z nich nedávno směřoval i do BIOCEVu. „Respektive pro kolegyni, doktorku Galisovou, která ovšem na univerzitě nezůstane. Zčásti z osobních důvodů, ale také kvůli nedostatečné institucionální podpoře se rozhodla převést svůj ERC grant na univerzitu ve Freiburgu,“ upřesňuje Zahradník, který považuje tento případ za symptom širšího problému.„Když jsem se na to díval, téměř třetina všech ERC grantů z UK nakonec odchází jinam. To je, upřímně řečeno, poměrně alarmující a měla by to být pro univerzitní vedení jasná zpětná vazba, že by to chtělo nějakou systémovou změnu. Část úspěšných projektů dokonce nekončí ani v zahraničí, ale přechází na AV ČR. Jednoduše tam, kde mají lepší podmínky pro výzkum. Takže to není o odchodu ze země, ale o hledání funkčního prostředí,“ argumentuje vědec.Sám se potýká s podobným problémem. „Letos mi končí jeden z grantů a tím mi vypadnou z rozpočtu zhruba čtyři miliony korun. I když mám momentálně dva velké projekty – operační program Jan Amos Komenský pro mezisektorový výzkum a Junior Star – vznikne mi výrazný finanční propad. A zatím nevím, jak ho pokrýt,“ přiznává otevřeně. Na univerzitě podle něj totiž neexistuje možnost střádat si prostředky nebo pravidla pro situace, kdy vypadne grantové financování.<h4>Predikovat další pandemii</h4>Když se řeč vrátí k samotnému výzkumu, viditelně se nadchne. „V rámci grantu Junior Star pokračujeme dál – a je to opravdu fascinující. O SARS-CoV-2 dnes víme víc než o jakémkoli jiném viru. Je to nejstudovanější patogen v historii. A my jsme se rozhodli jít o krok dál. Snažíme zjistit, jestli bychom pomocí našich metod dokázali předpovědět mutace, které by mohly umožnit přenos nového koronaviru ze zvířat na člověka,“ popisuje. Zjednodušeně řečeno, jejich cílem je zmapovat, jak by mohl vzniknout další pandemický virus, a to ještě dřív, než k tomu vůbec dojde. Mají v plánu vytvořit mapu rizikových mutací – tedy takových, které by mohly představovat hrozbu pro člověka.Na rozdíl od výzkumníků, kteří sbírají vzorky v terénu, má Zahradníkův tým výhodu v laboratorním modelování. „Jsme schopni analyzovat desítky až stovky tisíc různých mutací, včetně těch, které zatím v přírodě nikdo nepozoroval. Můžeme tak modelovat scénáře, které teprve mohou nastat,“ pokračuje Zahradník. Právě díky tomu se k nim sekvence varianty Omikron dostala už druhý den po jejím objevení. Okamžitě ji začali zkoumat a byli mezi prvními, kdo popsal její základní vlastnosti.„Umíme predikovat mutace, které mají tzv. high fitness – tedy takové, které viru přinášejí výhodu,“ vysvětluje. „Pokud bychom dokázali tyto mutace zohlednit při vývoji vakcín, mohli bychom viru vlastně zabránit, aby si je vůbec ‚vybral‘. Místo abychom jen reagovali na nové varianty, mohli bychom aktivně ovlivňovat evoluční směr viru. To by mohlo zásadně změnit způsob, jak přemýšlíme o vakcínách i prevenci budoucích pandemií,“ shrnuje biochemik.<blockquote><h5>RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D.</h5>Působí na 1. lékařské fakultě UK a pracovišti BIOCEV, kde vede laboratoř umožňující bezpečnou práci s vysoce infekčními viry. Pro svůj výzkum virových hrozeb získal grant Junior Star. Předtím působil na Weizmannově institutu věd v Izraeli, kde byl oceněn cenou za vynikající vědecké výsledky. Výzkumně se věnuje evoluci a adaptaci koronavirů, zejména jejich receptorových domén (RBD) a mechanismů, jimiž se přizpůsobují lidským buňkám. Cílem jeho výzkumu je porozumět tomu, jak a proč některé viry překračují bariéry, a přispět tak k prevenci budoucích pandemií. Sleduje i mutace, které mohou zvýšit infekčnost či přenos mezi druhy.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"></blockquote>

Zahradník: Chceme být vždy krok před virem

<h4>S potěšením oznamujeme, že je nyní dostupná nová verze <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/305">Clarity Chromatografického Softwaru</a> 10.1.2!</h4>Tato menší aktualizace rozšiřuje portfolio systému Clarity o nové moduly pro řízení přístrojů.<h5>Nově přidané moduly pro řízení přístrojů</h5><ul><li>pomocné moduly Ecom</li><li>ICF moduly pro HTA</li><li>čerpadlo Spark</li></ul><h5>Aktualizované moduly pro řízení přístrojů</h5><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/168">Ecom</a> HPLC</li><li>Knauer HPLC</li><li>Spark ICF moduly</li><li>YoungIn Chromass HPLC</li></ul><blockquote>Úplný seznam změn naleznete v dokumentu <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.dataapex.com/version_history?product=1">Changelogu</a>. Pro více informací o nových funkcích v systému Clarity doporučujeme přehled novinek verze 10.1.Software Clarity dokáže <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.dataapex.com/controls">řídit více než 1000 přístrojů</a>; jejich seznam je k dispozici online.</blockquote><h3>Podporované přístroje v Clarity (DataApex) – rychlý přehled</h3>Chromatografický software Clarity podporuje široké spektrum chromatografů a periferních zařízení prostřednictvím digitálního řízení (DD) a analogového sběru dat (A/D) pomocí modulu Colibrick.<h4>Plynové chromatografy (GC)</h4>Digitální integrace přes LAN/RS232 (mnohé přes ICF):<ul><li>Agilent: 5890, 6890, 7890, 8860, 8890, Intuvo 9000</li><li>Shimadzu: GC-2010/2014, Nexis GC-2030</li><li>Thermo Fisher: TRACE 1300/1310</li><li>PerkinElmer: Clarus 400–690</li></ul>Další podporované značky: Dani, Ellutia, Young In Chromass, Apix, Fuli, GOW-MAC (vybrané modely)<blockquote>Poznámka: Většina systémů Agilent 6890–8890 a Intuvo využívá LAN – ICF.</blockquote><h4>HPLC systémy</h4>Plné řízení systému nebo jednotlivých modulů:<ul><li>Agilent 1100–1290 Infinity II (ICF)</li><li>Shimadzu LC-10/20 a Nexera LC-40</li><li>PerkinElmer Flexar / NexSAR</li><li>Knauer Azura / BlueShadow / Smartline</li><li>Hitachi Chromaster / Primaide</li><li>Young In Chromass ChroZen</li><li>Sykam S500–S600, Watrex Streamline, Hanon LC7000–7300</li></ul><h4>HPLC moduly (čerpadla, detektory, termostaty kolon, frakční kolektory)</h4><ul><li>Čerpadla: Agilent 1100–1290, Knauer, Shimadzu, PerkinElmer, Sykam, SSI, Ecom</li><li>Detektory: VWD, DAD (PDA), RID, FLD, ELSD (Agilent, Shimadzu, Knauer, PerkinElmer, Young In Chromass, Ecom aj.)</li><li>Termostaty kolon: Agilent G1316x / G7116x, Shimadzu CTO-20/30/40, Knauer CT2.1, PerkinElmer Flexar</li><li>Frakční kolektory: Knauer FC 6.1, Teledyne FOXY, Ecom ECF 2096, Waters Fraction Collector II</li></ul><h4>Autosamplery</h4><ul><li>Agilent GC ALS (7673/7683/7693/8697), HPLC ALS moduly (G1313A–G7167C)</li><li>Shimadzu AOC-20 / AOC-5000+, SIL-10 / SIL-20 / SIL-40</li><li>CTC Analytics PAL, HTA autosamplery, Spark Alias/UHPLC, Knauer AS 6.1L</li><li>PerkinElmer Flexar / NexSAR</li></ul><h4>Další zařízení</h4><ul><li>GC×GC modulátory (např. GC×GC modulátor Univerzity Karlovy)</li><li>Ventily a přepínací moduly (Agilent, Knauer, Shimadzu, VICI-Valco)</li><li>Odplyňovače, průtokoměry, řídicí jednotky, rozhraní</li><li>LC-MS / GC-MS: Advion Expression CMS, Microsaic 4500 MiD, Markes BenchTOF aj.</li><li>Váhy (EA rozšíření): Mettler Toledo, Sartorius</li></ul><h4>Analogový sběr dat (Colibrick)</h4>Podpora A/D pro starší nebo analogové přístroje:<ul><li>GC: Agilent 5880/4890A, Varian 3xxx/3800/3900, PerkinElmer Clarus, Thermo TRACE, Shimadzu GC-14/9A, Scion 43x/45x/83xx/85xx aj.</li><li>HPLC detektory: Waters 2487/2489, ESA Corona, Hitachi L-series, JASCO FP/UV, Ecom LCD a další</li><li>Elementární a aminokyselinové analyzátory: Carlo Erba/Costech ECS, Biochrom 20/30+</li></ul>

DataApex Clarity chromatografický software verze 10.1.2 je nyní k dispozici!

Osobnosti

Věda a výzkum

Software

Článek

Produkt

Video

Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.

DataApex

Je autorizovaným distributorem společnosti Agilent Technologies pro Českou republiku v oblastech chromatografie (GC, HPLC, UHPLC, kapilární elektroforéza) a hmotnostní spektrometrie (GC/MS, LC/MS, CE/MS), disolučních aparátů, molekulární (UV-Vis, UV-Vis-NIR, fluorescence, FTIR analyzátory a mikroskopy) a atomové spektroskopie (ICP-OES, ICP-MS, AAS), a v neposlední řadě také v oblasti molekulární biologie a genomiky (analýza nukleových kyselin a proteinů, microarray skenery a skla, PCR & RT-PCR, qPCR, řešení pro NGS, reagencie pro mutagenezi a klonování, sondy FISH a další).

Altium International

Reportáže, rozhovory, zprávy o vědeckých projektech a studentských akcích ... Jsme online informační bránou Univerzity Karlovy.

Forum: magazín Univerzity Karlovy

Agilent Technologies

Technology Networks

Phenomenex

SelectScience

C&EN

SCIEX

Evosep Biosystems

Oligonucleotides (oligos) have become fast-growing modalities in recent years. Along with the development of these candidates has come the increased need for robust analytical methods and easy-to-use data analysis workflows to characterize them. Critical quality attributes of oligos include their mass, purity, and sequence – each of which can be difficult, time consuming, and tedious. As such, software that supports these efforts can be of great value.
In this work, we present novel, automated, and integrated software to support these workflows using LC HRAM MS instruments. Purity and sequencing data are presented for a multitude of oligos including antisense, aptamer, and long synthetic samples.
Key Learning Objectives:
<ul>
<li>Techniques for analyzing the critical quality attributes (CQAs) of oligos — including their mass, purity, and sequence</li>
<li>How novel, automated, and integrated software can facilitate the analysis of oligo CQAs using LC–HRAM MS instruments.</li>
<li>Purity and sequencing data for a multitude of oligos including antisense, aptamer, and long synthetic samples</li>
</ul>
Who Should Attend:
<ul>
<li>Researchers analyzing the critical quality attributes (CQAs) of oligos — including their mass, purity, and sequence</li>
<li>Chromatographers</li>
<li>Researchers interested in using LC–HRAM MS instruments for determination of oligo mass, purity and sequence</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Peter Rye (Application Engineer Pre Sales, Agilent Technologies)
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Melissa O&#39;Meara (Forensic Science Consultant, C&amp;EN Media Group)
</blockquote>

C&EN: Recent Advances in Oligo Purity and Sequence Determination by LCMS

Recent Advances in Oligo Purity and Sequence Determination by LCMS

In this work, we present novel, automated, and integrated software to support oligos workflows using LC HRAM MS instruments.

Advances in Oligo Purity and Sequence Determination by LCMS

If you are new to our technology or just getting started this event is for you. We will introduce the basics of the Evosep One technology and include hot-from-the-lab data from our users. Nicolai Bache, Head of Applications at Evosep, will host the event, bringing you up to speed with the latest additions to the Evosep One technology.
The Evosep One is a plug-and-play standardized platform designed for robustness and high throughput. It has been designed specifically to address and eliminate the prevalent challenges associated with throughput and robustness of nano-flow LC-MS workflows while maintaining sufficient sensitivity and resolving power for clinical applications.
The Evosep One technology is centered around the Evotip and integrates sample preparation with LC-MS. The Evotip is essentially a disposable trap column in a pipette tip format with a small plug of C18 stationary phase at the bottom of the tip. The Evotips are used to desalt and clean up the samples prior to LC-MS analysis, however, the traditional subsequent steps of eluting, drying down, re-suspending the samples from tips are completely omitted and instead the tips are loaded directly into Evosep One for analysis.
The system uses four low-pressure syringe pumps in parallel to elute samples from the Evotip with a chromatographic gradient. The resulting gradient with the pre-separated sample is moved into a storage loop, that is then switched in-line with a single high-pressure pump and an analytical separation column for focusing. With this simplified workflow on pre-set gradients, the Evosep One offers a throughput from 30 to 300 samples per day.
<h5>1. A beginner’s guide to the Evosep One</h5>
<ul>
<li>Presenter: Nicolai Bache (Head of applications at Evosep)</li>
</ul>
The Evosep One technology is centered around the Evotip and integrates sample preparation with LC-MS. The Evotip is essentially a disposable trap column in a pipette tip format with a small plug of C18 stationary phase at the bottom of the tip. The Evotips are used to desalt and clean up the samples prior to LC-MS analysis, however, the traditional subsequent steps of eluting, drying down, re-suspending the samples from tips are completely omitted and instead the tips are loaded directly into Evosep One for analysis.
<h5>2. To be announced</h5>
<ul>
<li>Presenter: Anh Reynolds (Associate Scientist at BMS)</li>
</ul>
<h5>3. Clinical proteomics in the fast lane – Combination of robust LC, timsTOF based IMS-MS and GPU powered data processing</h5>
<ul>
<li>Presenter: Allan Stensballe (Industrial PHD at Aalborg University)</li>
</ul>
Mass spectrometrists who have been in the proteomics field long enough to be users of both early gel-free and gel-based strategies have learned to appreciate robust and fast analysis pipelines. As clinical proteomics projects now increasingly moves towards larger cohort studies and integration in multiOmics projects the stability and reproducibility of LC-MS to data analysis is imperative. In this talk I will highlight our experiences, project examples and thoughts on use of clinically optimized and standardized workflows.

A beginner’s guide to Evosep

The Evosep One is a plug-and-play standardized platform designed for robustness and high throughput.

Join us on 18 &amp; 19 January for two half days of virtual presentations as we help you to navigate the every day challenges faced with the analysis of oligonucleotides. Presented by experts in the industry and the Agilent biopharma team, these short talks are designed to educate and provide insight from basic oligonucleotide assessment, through to the more advanced applications. Q&amp;A sessions will follow each presentation to give you the opportunity to engage with our speakers.
The agenda will cover these topics below and more!
<ul>
<li>Introduction to Oligonucleotide Therapeutics</li>
<li>Analytical &amp; Purification Methods</li>
<li>Workflows for Oligonucleotide CQAs</li>
<li>Practical Tips &amp; Tricks for Preparative HPLC</li>
<li>Analysis of mRNA 5&#39; Capping and Poly-A Tailing by High Resolution LC/MS</li>
</ul>
<h3>Agenda Day 1</h3>
<h5>10:00  Welcome to Agilent Oligo Insight Days</h5>
<h5>10:10 Introduction to Oligonucleotide Therapeutics</h5>
<h5>10:45 Oligonucleotide Analytical and Purification Methods</h5>
<h5>11:25 Workflows for Analysis of Oligonucleotide CQAs</h5>
<h5>12:05 Oligonucleotide Analysis - Tips &amp; Tricks: Putting it all into Practice</h5>

Agilent Technologies: Agilent Oligonucleotide Insight Days

Agilent Oligonucleotide Insight Days (Day 1)

Taking A Deeper Dive into Oligonucleotide Analysis

Join us on 18 &amp; 19 January for two half days of virtual presentations as we help you to navigate the every day challenges faced with the analysis of oligonucleotides. Presented by experts in the industry and the Agilent biopharma team, these short talks are designed to educate and provide insight from basic oligonucleotide assessment, through to the more advanced applications. Q&amp;A sessions will follow each presentation to give you the opportunity to engage with our speakers.
The agenda will cover these topics below and more!
<ul>
<li>Introduction to Oligonucleotide Therapeutics</li>
<li>Analytical &amp; Purification Methods</li>
<li>Workflows for Oligonucleotide CQAs</li>
<li>Practical Tips &amp; Tricks for Preparative HPLC</li>
<li>Analysis of mRNA 5&#39; Capping and Poly-A Tailing by High Resolution LC/MS</li>
</ul>
<h3>Agenda Day 1</h3>
<h5>10:00  Welcome to Agilent Oligo Insight Days</h5>
<h5>10:10  A Beginners Guide to LC/MS for the Analysis of Oligonucleotides</h5>
<h5>10:45 Analysis of mRNA 5&#39; Capping and Poly-A Tailing by High-Resolution LC/MS</h5>
<h5>11:20 Nucleic Acids Therapeutics Delivery by LNPs: Fundamentals and Characterizations</h5>
<h5>12:05 Oligonucleotide Purification - Tips and Tricks How to Scale Up!</h5>

Agilent Oligonucleotide Insight Days (Day 2)

Oligonucleotides have grown to represent an increasingly important class of therapeutic modalities. During development of new chemical entities, it is critical to both determine sequences, and identify process impurities and degradation pathways using LC/MS. These tasks are further complicated by severe data analysis challenges, requiring significant time for execution by expert level users. The main reason for these challenges is due to the lack of automation, with users often relying on manual processing with user-generated spreadsheets. Agilent BioConfirm 12.0 has been expanded to contain oligonucleotide analysis capabilities, and examples from work at Arrowhead Pharmaceuticals will be presented in this webinar, showing expedited accurate mass LC/MS analyses.
Key learning objectives
<ul>
<li>Gain background knowledge on oligonucleotide therapeutics, focusing mostly on siRNA</li>
<li>Understand the importance of structure characterization and impurity identification, as well as the current challenges with existing software platforms</li>
<li>Learn from a practical demonstration about a case where LC/MS analyses have been undertaken to confirm the molecular sequence, as well as to understand process impurities and degradants</li>
</ul>
Who should attend?
<ul>
<li>QA/QC laboratories</li>
<li>Biopharma analytical development scientists</li>
<li>Biopharma process development scientists</li>
<li>CDMO labs</li>
<li>Diagnostic development labs</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Leo Joyce (PhD) (Senior Chemist, Arrowhead Pharmaceuticals)
</blockquote>
<blockquote>
Leo A. Joyce graduated with a BS in Chemistry from the University of Wisconsin-Madison in 2007. He went on to earn his PhD in Organic Chemistry from the University of Texas in 2012, developing optical sensors with Professor Eric Anslyn. From there Joyce went to work in industry, spending seven years in the Analytical R&amp;D organization at Merck in Rahway, NJ. In 2019, he returned to Wisconsin, where he leads a team of Analytical scientists at Arrowhead Pharmaceuticals. He was recently named an Industrial Early Career Investigator by the American Chemical Society and has over 45 peer-reviewed publications.
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Blake Forman (Editorial Assistant, SelectScience)
</blockquote>
<blockquote>
Blake studied chemistry at the University of Surrey, UK, and further went on to study a master’s in chemistry at the University of Southampton, UK. Blake has previously worked in the Medicines and Healthcare Products Regulatory Agency (MHRA) lab at LGC and as a technical sales specialist for Waters. As a member of the Editorial team, he now plays an integral role in shaping the content on SelectScience.
</blockquote>

SelectScience: Analysis of oligonucleotides by accurate mass LC/MS: Sequencing and impurity analysis to support development at Arrowhead Pharmaceuticals

Analysis of oligonucleotides by accurate mass LC/MS: Sequencing and impurity analysis to support development at Arrowhead Pharmaceuticals

A case where LC/MS oligonucleotides analyses have been undertaken to confirm the molecular sequence, as well as to understand process impurities and degradants

Analysis of oligonucleotides by accurate mass LC/MS

Let your polar pesticides be our problem!
Polar pesticides, the most widely used group of agrochemicals in the world, are few of the most challenging compounds to be determined by analytical methods. So, laboratories, tasked with detecting and characterizing polar pesticides in diverse samples, had to work with complex individual or group methods with time-consuming derivatizations.
This is exactly what we aim to address through this exclusive Deminar “Let’s Talk Polar Pesticides”.
During this Deminar, our speakers will take you through the various aspects of the Polar pesticides problem, from regulatory guidelines to workflow solutions, live from Agilent Lab.
The topics address the following aspects for the Analysis of Polar Pesticides in Food:
<ul>
<li>FSSAI/EU guidelines and DG/SANTE</li>
<li>Specific analytical challenges to the analysis of Polar pesticides</li>
<li>Detailed workflow solution using Agilent LC-MS/MS</li>
<li>Sensitivity and matrix-based linearity in accordance with EU norms</li>
<li>Virtual Demo from Agilent Lab including actual sample preparation (with recovery experiments at LOQ level) and the final data as acquired in Agilent COE on actual samples</li>
</ul>
What You will Learn
<ul>
<li>LCMS based analysis of Polar Pesticides without derivatization.</li>
<li>Learn how to adreess peak tailing and sensitivity issue</li>
<li>Analysis of difficult food matrices such as cereals and tea.</li>
</ul>
Who should attend?
Lab directors, managers and mass spectrometry analysts performing small molecule analysis in food 
<blockquote>
Presenter: Vikrant Goel (Application Scientist, Agilent Technologies)
</blockquote>
<blockquote>
Vikrant comes with an extensive 19 years of experience working in QA/QC, R&amp;D and Analytical roles and an expert in various LCMS technologies. His solution-based approach has been well accepted among LCMS fraternity from Pharma and Applied market segments, since 2004. He holds an M.tech in Biotechnology, PG Dip in Bioinformatics &amp; B. Pharm. He joined Agilent in 2010, as a Product specialist for LC/MS, after having worked with ILS Bioservices &amp; LabIndia Instruments. His passion towards solution, brought him back to the Application role, 6 years ago.
</blockquote>

Agilent Technologies: Let's Talk Polar Pesticides

Let's Talk Polar Pesticides

Our speakers will take you through the various aspects of the Polar pesticides problem, from regulatory guidelines to workflow solutions, live from Agilent Lab.

<ul>
<li>Receive a demonstration of how non-denaturing SEC-Native MS can be leveraged to streamline mAb characterization, including methods for the digestion of mAbs
</li>
<li>Listen in to a column selection discussion, which includes pore volume and column dimensions to ensure monomer and aggregate resolution, and optimize mobile phases for complex characterizations
</li>
<li>Learn about SEC combined with nHRMS, and how to select a SEC column
</li>
</ul>
Who Should Attend:
Any scientists wanting to learn how to combine their size exclusion chromatography and High-resolution Mass Spec for improvements in their mAb characertizations. 
<blockquote>
Presenter: Lorne Nelson (Senior Scientist - Field Applications, Phenomenex)
</blockquote>

Phenomenex: SEC-nHRMS for the Characterization of mAbs

SEC-nHRMS for the Characterization of mAbs

Receive a demonstration of how non-denaturing SEC-Native MS can be leveraged to streamline mAb characterization, including methods for the digestion of mAbs

Sepsis is a growing global challenge due to factors such as high mortality rate and the increasing prevalence of antimicrobial resistance.
<h4>A single and rapid Zeno SWATH DIA proteomic analysis for concomitant identification and antibiotic resistance profiling of micro-organisms from positive blood cultures</h4>
<ul>
<li>Presenter: Iulia MACAVEI, PhD (student in Analytical Chemistry, Biological Analysis and Mass Spectrometry, University of lyon)</li>
</ul>
Today, approximately 1.3 million people die each year worldwide from bacterial antimicrobial resistance (AMR). AMR is of great concern in the context of bloodstream infections (BSIs) when it evolves into sepsis. If MALDI-TOF has markedly shortened the delay of the pathogen identification step, AMR evaluation is still based on growth tests in the presence of antibiotics. With the aim of streamlining this turnaround time to less than 90min from a positive blood culture, the LC/Zeno SWATH DIA sensitivity and specificity performances were evaluated to concomitantly provide the identity and antibiotic resistance profile of etiological agents related to BSIs based on peptide surrogates.
<h4>Plasma proteomic landscape and patient heterogeneity in sepsis revealed by high-throughput mass spectrometry</h4>
<ul>
<li>Presenter: Dr. Yuxin Mi (Researcher at Wellcome Centre for Human Genetics, University of Oxford)</li>
</ul>
Incomplete knowledge of the sepsis plasma proteome has limited our understanding of pathophysiology in the heterogeneous syndrome of sepsis. Here we apply high-throughput liquid chromatography – tandem mass spectrometry to delineate the plasma proteome for sepsis and comparator groups, involving 2622 samples in a single batch. We show how this scale of data can establish shared and specific proteins, pathways and co-expression modules in sepsis, and be integrated with paired leukocyte transcriptomic data. This work reveals novel subphenotypes informative for the response state and differential outcome, highlighting opportunities for a systems-based precision medicine approach to sepsis.

SEPSIS

In this webinar we will uncover how our users combine technology with the Evosep One to further research into sepsis and its biomarkers.

Evosep SEPSIS

Design–build–test–learn (DBTL) cycles are commonly used in biotechnology and in natural product discovery as they provide a systemic and efficient framework for the metabolic engineering of microbes.
A novel platform that automates multiomics analyses of microbes could enable faster and better DBLT cycles for your research.
In this webinar, the development and validation of the high-throughput, automated platform using model microbial organisms is described, as well as the recent work in applying the platform to cell factory and natural products engineering.
Attend this webinar to:
<ul>
<li>Learn how automation can enable better and faster DBLT cycles in the life sciences</li>
<li>Evaluate the pros and cons of taking an automated and digital approach to life science workflows</li>
<li>Discover the next frontiers of technology that will have an impact in biotechnology</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Dr. Douglas McCloskey (Independent Consultant )
</blockquote>

Technology Networks: Advances in Multiomics Screening of Microbes in Biotechnology

Advances in Multiomics Screening of Microbes in Biotechnology

In this webinar, the development and validation of the high-throughput, automated platform using model microbial organisms is described.

Multiomics Screening of Microbes in Biotechnology

The ZenoTOF 7600 system was ranked the most innovative technology by The Analytical Scientist for its ability to help scientists address analytical challenges across many markets. Zeno trap coupled with electron activated dissociation (EAD) fragmentation technology unlocks sensitivity gains allowing you to uncover new information for certainty in your results to make better-informed decisions, faster.
Highlights of this technology:
<ul>
<li>Drive new limits of quantification achievable with accurate mass</li>
<li>Detect up to 20x more ions in every experiment</li>
<li>Deliver high depth of coverage on low abundance species, quickly and robustly with Zeno SWATH data-independent acquisition (DIA)</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Bhavya Shukla (Sales Development Manager, SCIEX)
</blockquote>
<blockquote>
Bhavya Shukla, Sales Development Manager at SCIEX has more than 8 years of experience in the analytical industry. He pursued his post-graduation in chemical engineering from the Institute of Chemical Technology Mumbai. His major role is to support LCMS users by providing them optimal solutions through a keen understanding of their needs.
</blockquote>

SCIEX: Leveraging the power of Zeno trap and EAD

Leveraging the power of Zeno trap and EAD

Zeno trap coupled with electron activated dissociation (EAD) fragmentation technology unlocks sensitivity gains allowing you to uncover new information

LCMS webináře se zaměřením na LC/MS - strana 92