<div><div>Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR (ÚOCHB) vyvinuli průlomovou technologii pro efektivní vývoj aptamerů. Nová metoda propojuje několik biochemických a bioinformatických kroků a otevírá cestu k novým diagnostickým a terapeutickým aplikacím. Mezi ně patří například nositelné senzory schopné v reálném čase sledovat hladiny vybraných biomarkerů v těle a včas upozornit na blížící se zdravotní komplikace. Výsledky zveřejnil časopis Nature Communications.</div></div><div>Aptamery jsou krátké řetězce DNA nebo RNA, které dokážou velmi přesně rozeznat a navázat konkrétní cílovou molekulu. Podobně jako protilátky je lze využít k detekci nebo ovlivnění funkce těchto molekul. Na rozdíl od protilátek jsou však mnohem stabilnější, lze je vyrábět synteticky a přesně chemicky upravovat podle požadovaných vlastností. Díky tomu mohou získat vlastnosti, kterých nelze u protilátek dosáhnout.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_2_81e99b9900.jpg" alt="ÚOCHB: Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek: Chemicky upravený DNA aptamer navázaný na cílový protein." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_2_81e99b9900.jpg 228w," sizes="100vw" width="1343" height="916">S rostoucí poptávkou po přesných a rychlých diagnostických nástrojích jsou aptamery v mnoha případech vhodnější než samotné protilátky. Jejich vývojový proces je však experimentálně a časově náročný a vyžaduje experty z několika vědních oborů. Tým vědců z ÚOCHB vedený dr. Markem Ondrušem a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://hocek.group.uochb.cz/">prof. Michalem Hockem</a> nyní vyvinul technologii, která celý vývojový proces výrazně zkracuje.„Vývoj aptameru často připomíná hledání jehly v kupce sena. Ve směsi bilionů různých DNA sekvencí se snažíme najít jedinou, která se silně a specificky váže na cílovou molekulu. Náš nový přístup umožňuje nejdřív nalézt ‚aptamerové rodiny‘ – stovky sekvencí s jistou podobností a následně identifikovat člena rodiny, který vykazuje nejlepší experimentální vlastnosti. Tento prvek přispívá ke zkrácení vývoje z několika měsíců na dny,“ říká Marek Ondruš.<blockquote>Video: <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.youtube.com/watch?v=-aoGvOKqORo">Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek&nbsp;</a></blockquote>Výzkumníci zároveň rozšířili možnosti využití aptamerů. Jejich stavební bloky totiž chemicky upravují – připojují k nim nové funkční skupiny, které můžeme přirozeně najít například v aminokyselinách. Takto vzniklé molekuly kombinují výhody DNA i protilátek: pořadí jednotlivých stavebních bloků je dané pořadím písmen v DNA a díky rozmanitosti připojených chemických modifikací se výrazně rozšiřují možnosti aptameru rozpoznávat biologicky významné cíle a napodobovat interakce typické pro proteiny, které jsou základem mnoha biologických procesů.&nbsp;Potenciál nové metody ukázali vědci na lidském inzulinovém receptoru, klíčovém proteinu zapojeném do regulace hladiny cukru v krvi. Vyvinuli aptamer, který se na receptor specificky váže, a pomocí kryoelektronové mikroskopie detailně popsali molekulární mechanismus vzájemné vazby.„Ukázali jsme, že chemicky zavedené funkční skupiny mají zásadní význam nejen pro rozpoznání a vytvoření komplexu aptameru s proteinem, ale také pro stabilizaci samotné struktury DNA aptameru. Naše výsledky poskytují nový pohled na to, jak lze pomocí chemicky upravených nukleových kyselin napodobovat vlastnosti proteinů,“ shrnuje Marek Ondruš.Technologie by v budoucnu mohla doplnit nebo v některých aplikacích dokonce nahradit diagnostické nástroje založené na protilátkách. Výzkumníci spolupracují na dalším rozvoji technologie se společností <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://iocbtech.cz/">IOCB Tech</a>, která pomáhá přetavit objevy z ÚOCHB do praxe.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_9694c21671.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek: Dr. Marek Ondruš, první autor studie, a prof. Michal Hocek, vedoucí vědecké skupiny Bioorganická a medicinální chemie nukleových kyselin, ÚOCHB" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_9694c21671.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><blockquote><h4>Původní článek</h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41467-026-73676-y">Expedient single-round selection of hyper-modified aptamer targeting insulin receptor from over-represented dually nucleobase-modified DNA libraries</a></h4>Pablo Alberto Franco-Urquijo, Marek Ondruš, Jaroslav Kurfürst, Jana Škerlová, Irena Selicharová, Lucie Mužíková Čechová, Hana Šváchová, Alena Semerádtová, Anatolij Filimoněnko, Adéla Fejfarová, Jiří Homola, Tomáš Kouba &amp; Michal HocekNat. Commun., 2026<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41467-026-73676-y">https://doi.org/10.1038/s41467-026-73676-y</a>&nbsp;<h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">CC-BY 4.0</a></h6></blockquote><h4>Abstrakt</h4>Objev funkčních nukleových kyselin z knihoven náhodných sekvencí se obvykle opírá o několik časově náročných iterativních kol in vitro selekce s nízkou mírou úspěšnosti. V této práci představujeme strategii selekce v jediném kole, která umožňuje rychlý screening několika nadreprezentovaných DNA knihoven s modifikovanými nukleobázemi a různých selekčních podmínek a dokáže identifikovat modifikované aptamery s vysokou afinitou. Dvojitá separace následovaná amplifikací eluovaných sekvencí, analýzou NGS a klastrováním umožňuje rychlou identifikaci kandidátních aptamerů. Screening modifikovaných DNA knihoven obsahujících modifikované adeninové a uracilové nukleotidy nesoucí hydrofobní aromatické fenylové a indolové skupiny vedl k vývoji aptameru, který se váže na lidský inzulinový receptor se subnanomolární afinitou a mimořádnou specificitou. Struktura stanovená kryoelektronovou mikroskopií odhaluje význam každé aromatické modifikace, a to buď při stabilizaci sekundární struktury, nebo při zprostředkování interakcí s povrchem proteinu. Tento přístup překonává hlavní omezení selekce aptamerů a má potenciál pro vysokokapacitní screening i urychlení vývoje aptamerů nové generace pro diagnostické nebo terapeutické aplikace.</div>

Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek

<div><div>Nadace Experientia podpoří tříletým start-up grantem vycházející hvězdu organické chemie Petru Vojáčkovou. Mladí talentovaní vědci Tereza Edlová a Ladislav Prener vycestují na zahraniční stáže.</div></div><div><div><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/start-up-granty/vyvijime-nove-strategie-pro-stavbu-molekul">Petra Vojáčková </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.uni-muenster.de/en/">University of Münster</a>&nbsp;založí svoji výzkumnou skupinu na <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.muni.cz/">Masarykově univerzitě</a> v Brně, kterou od ledna 2027 podpoří start-up grant Nadace Experientia ve výši 6 600 000 Kč. Se svým týmem bude vyvíjet nové strategie pro stavbu molekul tak, aby vznikala výhradně jejich žádoucí zrcadlová podoba.<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/zahranicni-staze/chceme-zefektivnit-vyzkum-v-oblasti-novych-materialu-i-leciv">Tereza Edlová </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.vscht.cz">VŠCHT Praha</a> díky stipendiu ve výši 1 260 000 Kč vycestuje na roční stáž na britskou <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.manchester.ac.uk">University of Manchester</a> do skupiny prof. Igora Larrosy, kde se bude věnovat projektu, který může zefektivnit výzkum v oblasti materiálů i léčiv.<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/zahranicni-staze/nase-metoda-by-mohla-urychlit-vyvoj-novych-leku">Ladislav Prener </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.uochb.cz/cs">ÚOCHB AV ČR</a> získal stipendium ve výši 1 200 000 Kč a zamíří na německou <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.rwth-aachen.de/cms/~a/root/?lidx=1">RWTH Aachen University</a> do skupiny prof. Leonoriho. Na své roční stáži bude vyvíjet metodu, která by mohla urychlit vývoj nových léků.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Nadace_Experientia_Nadace_Experientia_zna_drzitelku_start_up_grantu_a_stipendisty_pro_rok_2026_c96fdf9a4f.jpg" alt="Nadace Experientia: Nadace Experientia zná držitelku start-up grantu a stipendisty pro rok 2026" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Nadace_Experientia_Nadace_Experientia_zna_drzitelku_start_up_grantu_a_stipendisty_pro_rok_2026_c96fdf9a4f.jpg 234w," sizes="100vw" width="600" height="400"><blockquote>Nadace Experientia od roku 2012 podpořila už 27 nadějných mladých vědkyň a vědců, kteří díky stipendiu dostali šanci vycestovat na roční stáž na špičková zahraniční vědecká pracoviště. Díky programu start-up grantů si mohlo dalších 6 mladých vědkyň a vědců založit po návratu ze zahraničí vlastní výzkumnou skupinu v ČR. Celkem už na podporu mladých vědkyň a vědců vyčlenila Nadace Experientia více než 73 milionů korun.</blockquote></div></div>

Nadace Experientia zná držitelku start-up grantu a stipendisty pro rok 2026

V týdnu od 29. června na Vás čekají v oblasti kapalné fáze a především HPLC a LC/MS následující webináře.<blockquote><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.lcms.cz/webinars">👉 DETAILY A REGISTRACE V SEKCI WEBINÁŘE</a></h4></blockquote><blockquote>👉 Vyhledávejte a filtrujte v největší globální databázi s více než 5 500 GC, HPLC, MS a spektroskopickými webináři.</blockquote><h5>1. Thermo Fisher Scientific: Insights from an IC Specialist: To Be Suppressed or Not Suppressed?</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 09:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6310">Registrace</a></li></ul>Zjistěte, jak technologie supresorů ovlivňuje citlivost, selektivitu, spolehlivost i nároky na údržbu v iontové chromatografii. Webinář představí výhody i omezení potlačené a nepotlačené vodivostní detekce a nabídne praktické tipy pro řešení běžných problémů.<h5>2. SCIEX: Advancing Proteomics with ZenoTOF: From Single-Cell Analysis to Plasma Biomarker Discovery</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 11:30 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6311">Registrace</a></li></ul>Objevte možnosti hmotnostní spektrometrie ZenoTOF pro proteomiku jednotlivých buněk i analýzu plazmatických biomarkerů. Přednáška ukáže, jak vysoké rozlišení a citlivost urychlují biologický výzkum a objevování nových biomarkerů.<h5>3. Agilent Technologies: Measuring Diverse Samples with UV/VIS Spectrometers and Integrating Spheres</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 20:30 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6052">Registrace</a></li></ul>Naučte se správně měřit difúzní transmitanci a reflektanci pomocí UV/VIS spektrometrů s integrační koulí. Webinář představí praktické využití systému Cary 60 při analýze široké škály materiálů.<h5>4. Waters Corporation: Informatics Series #33: Tips, Tricks and Best Practices</h5><ul><li>Čt, 2.7.2026 11:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6315">Registrace</a></li></ul>Interaktivní lekce zaměřená na software Empower představí užitečné funkce, klávesové zkratky a osvědčené pracovní postupy, které pomohou zrychlit každodenní práci a zvýšit efektivitu zpracování chromatografických dat.<h5>5. Waters Corporation: Unlocking Therapeutic Peptide Characterisation (GLP-1RAs) with Cyclic IMS</h5><ul><li>Čt, 2.7.2026 15:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6313">Registrace</a></li></ul>Zjistěte, jak cyklická iontová mobilita rozšiřuje možnosti charakterizace terapeutických peptidů a analogů GLP-1. Webinář ukáže přínosy této technologie pro vývoj léčiv, kontrolu kvality i regulatorní dokumentaci.<h5>6. Agilent Technologies: Spectral Flow Cytometry Masterclass – Session 1</h5><ul><li>Pá, 3.7.2026 07:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6316">Registrace</a></li></ul>První část odborné série představí principy spektrální průtokové cytometrie, návrh experimentů a praktické aplikace v imunologii, onkologii i výzkumu vakcín.

Webináře LabRulezLCMS týden 27/2026

Webináře

Popularizace

Věda a výzkum

Video

Článek

Podporujeme mladé vědkyně a vědce z oboru organické, bioorganické a medicinální chemie na zahraničních stážích i zde v ČR díky tzv. start-up grantům Nadace Experientia.

Nadace Experientia

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Vše ze světa analytické chemie na jednom místě. Propojujeme lidi při řešení jejich problémů. U nás naleznete všechny potřebné informace snadno, rychle a přehledně. Přestaňte hledat a začněte nacházet.

LabRulez

Agilent Technologies

If you want to treat yourself to good chromatography understanding your method goals or priorities is a key part but there are other things to consider as well.
Things like:
<ul>
<li>Column choice and characteristics
</li>
<li>Method parameters like temperature
</li>
<li>Mobile phase choice
</li>
<li>Your sample and its characteristics
</li>
<li>Potential limitations of your instrument
</li>
</ul>
We’ll discuss tricks to help identify what you should look at more closely and tips to help optimize your results.
<blockquote>
Presenter: Rita Steed (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Rita Steed began supporting the LC column line for Agilent in 1999. As a Chromatography Specialist (first with Chromatography, Inc., then directly for Agilent), Rita worked on-site with researchers in Pharmaceutical and other industries presenting technical seminars and assisting researchers with troubleshooting and method development. Rita has over 20 years of Chromatography experience in the Biotechnology, Chemical, and Pharmaceutical industries. She has held positions in Research, Sales, and Technical Service. Rita has earned degrees in Microbiology and Life Sciences/Biochemistry. In her current position, she is an inside Application Engineer supporting LC columns.
</blockquote>

Agilent Technologies: Treat Yourself to Good Chromatography: Helpful Tricks

Treat Yourself to Good Chromatography: Helpful Tricks

Tricks to help identify what you should look at more closely and tips to help optimize your results.

Troubleshooting an HPLC system can be a daunting task. In this seminar we will:
<ul>
<li>Look at how to isolate the problem
</li>
<li>Discuss the most common column problems and their solutions including:
<ul>
<li>Pressure
</li>
<li>Peak Shape
</li>
<li>Retention
</li>
</ul>
</li>
</ul>
We will also look at examples where you may think it’s your column but it’s actually related to your instrument such as:
<ul>
<li>Dwell volume</li>
<li>Extra Column Volume</li>
<li>Detector Response Rate</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Rita Steed (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Rita Steed began supporting the LC column line for Agilent in 1999. As a Chromatography Specialist (first with Chromatography, Inc., then directly for Agilent), Rita worked on-site with researchers in Pharmaceutical and other industries presenting technical seminars and assisting researchers with troubleshooting and method development. Rita has over 20 years of Chromatography experience in the Biotechnology, Chemical, and Pharmaceutical industries. She has held positions in Research, Sales, and Technical Service. Rita has earned degrees in Microbiology and Life Sciences/Biochemistry. In her current position, she is an inside Application Engineer supporting LC columns.
</blockquote>

Agilent Technologies: LC Column Troubleshooting – Isolating the Source of the Problem

LC Column Troubleshooting – Isolating the Source of the Problem

Isolating the Source of the Problem

If you’re doing food testing and want to find ways to do more with less while getting consistent accurate results this seminar is for you.
We will walk through a sample application – multi-residue pesticides in fish using LC/MS – from sample prep to data analysis, and point out tips for saving both time and money and improving results. Key topics covered will be column selection, tips for extending column life and “just enough” sample prep solutions that reduce time spent on sample prep.
<blockquote>
Presenter: Mark Powell (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Mark Powell is an Applications Engineer located at Agilent’s Little Falls site in Wilmington, DE. Before joining Agilent in 2011, Mark worked in the pharmaceutical industry synthesizing, purifying and analyzing drug candidates. He provides applications assistance and technical support for Agilent’s HPLC columns and consumables.
</blockquote>

Agilent Technologies: New:Troublefree Food Testing - Technologies to Improve Uptime and Productivity

Troublefree Food Testing - Technologies to Improve Uptime and Productivity

Sample application – multi-residue pesticides in fish using LC/MS.

Technologies to Improve Uptime and Productivity

Very polar compounds have poor retention in reversed phase and can be challenging to separate.
In this talk, we will discuss changes to your reversed phase conditions that can help. We’ll also look at the benefits of choosing a more polar stationary phase.
If that doesn’t work you may need to explore other types of chromatography.
Some of those options are:
<ul>
<li>HILIC
</li>
<li>Ion Pair
</li>
<li>Normal Phase
</li>
</ul>
Advantages and disadvantages of these options will be discussed.
<blockquote>
Presenter: Mark Powell (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Mark Powell is an Applications Engineer located at Agilent’s Little Falls site in Wilmington, DE. Before joining Agilent in 2011, Mark worked in the pharmaceutical industry synthesizing, purifying and analyzing drug candidates. He provides applications assistance and technical support for Agilent’s HPLC columns and consumables.
</blockquote>

Agilent Technologies: Too Polar for Reversed Phase - What do you do?

Too Polar for Reversed Phase - What do you do?

Changes to your reversed phase conditions that can help.

The technique of Gel Permeation Chromatography is conceptually simple: It is a separation based on size where no enthalpic interactions are observed.
In practice, GPC is often much more involved yielding involved method development and data that can be difficult to interpret. Though GPC can seem mystifying at times 90% of the success is achieved by using the proper columns for your application.
During this e-seminar we will discuss what is new in GPC column technology, different types of stationary phases, and how to choose the best columns which yield:
<ul>
<li>Improved resolution
</li>
<li>Improved reproducibility
</li>
<li>Improved accuracy
</li>
<li>Improved analysis time
</li>
</ul>
The goal of the e-seminar is to illustrate how proper GPC column selection can make the difference between good and great chromatography.
<blockquote>
Presenter: Michael Kruger (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>

Agilent Technologies: Achieving Superior GPC Results Through the Correct Column Selection

Achieving Superior GPC Results Through the Correct Column Selection

What is new in GPC column technology, different types of stationary phases, and how to choose the best columns.

LCMS webináře se zaměřením na Tipy a Triky - strana 43