<div><div>Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR (ÚOCHB) vyvinuli průlomovou technologii pro efektivní vývoj aptamerů. Nová metoda propojuje několik biochemických a bioinformatických kroků a otevírá cestu k novým diagnostickým a terapeutickým aplikacím. Mezi ně patří například nositelné senzory schopné v reálném čase sledovat hladiny vybraných biomarkerů v těle a včas upozornit na blížící se zdravotní komplikace. Výsledky zveřejnil časopis Nature Communications.</div></div><div>Aptamery jsou krátké řetězce DNA nebo RNA, které dokážou velmi přesně rozeznat a navázat konkrétní cílovou molekulu. Podobně jako protilátky je lze využít k detekci nebo ovlivnění funkce těchto molekul. Na rozdíl od protilátek jsou však mnohem stabilnější, lze je vyrábět synteticky a přesně chemicky upravovat podle požadovaných vlastností. Díky tomu mohou získat vlastnosti, kterých nelze u protilátek dosáhnout.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_2_81e99b9900.jpg" alt="ÚOCHB: Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek: Chemicky upravený DNA aptamer navázaný na cílový protein." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_2_81e99b9900.jpg 228w," sizes="100vw" width="1343" height="916">S rostoucí poptávkou po přesných a rychlých diagnostických nástrojích jsou aptamery v mnoha případech vhodnější než samotné protilátky. Jejich vývojový proces je však experimentálně a časově náročný a vyžaduje experty z několika vědních oborů. Tým vědců z ÚOCHB vedený dr. Markem Ondrušem a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://hocek.group.uochb.cz/">prof. Michalem Hockem</a> nyní vyvinul technologii, která celý vývojový proces výrazně zkracuje.„Vývoj aptameru často připomíná hledání jehly v kupce sena. Ve směsi bilionů různých DNA sekvencí se snažíme najít jedinou, která se silně a specificky váže na cílovou molekulu. Náš nový přístup umožňuje nejdřív nalézt ‚aptamerové rodiny‘ – stovky sekvencí s jistou podobností a následně identifikovat člena rodiny, který vykazuje nejlepší experimentální vlastnosti. Tento prvek přispívá ke zkrácení vývoje z několika měsíců na dny,“ říká Marek Ondruš.<blockquote>Video: <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.youtube.com/watch?v=-aoGvOKqORo">Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek&nbsp;</a></blockquote>Výzkumníci zároveň rozšířili možnosti využití aptamerů. Jejich stavební bloky totiž chemicky upravují – připojují k nim nové funkční skupiny, které můžeme přirozeně najít například v aminokyselinách. Takto vzniklé molekuly kombinují výhody DNA i protilátek: pořadí jednotlivých stavebních bloků je dané pořadím písmen v DNA a díky rozmanitosti připojených chemických modifikací se výrazně rozšiřují možnosti aptameru rozpoznávat biologicky významné cíle a napodobovat interakce typické pro proteiny, které jsou základem mnoha biologických procesů.&nbsp;Potenciál nové metody ukázali vědci na lidském inzulinovém receptoru, klíčovém proteinu zapojeném do regulace hladiny cukru v krvi. Vyvinuli aptamer, který se na receptor specificky váže, a pomocí kryoelektronové mikroskopie detailně popsali molekulární mechanismus vzájemné vazby.„Ukázali jsme, že chemicky zavedené funkční skupiny mají zásadní význam nejen pro rozpoznání a vytvoření komplexu aptameru s proteinem, ale také pro stabilizaci samotné struktury DNA aptameru. Naše výsledky poskytují nový pohled na to, jak lze pomocí chemicky upravených nukleových kyselin napodobovat vlastnosti proteinů,“ shrnuje Marek Ondruš.Technologie by v budoucnu mohla doplnit nebo v některých aplikacích dokonce nahradit diagnostické nástroje založené na protilátkách. Výzkumníci spolupracují na dalším rozvoji technologie se společností <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://iocbtech.cz/">IOCB Tech</a>, která pomáhá přetavit objevy z ÚOCHB do praxe.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_9694c21671.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek: Dr. Marek Ondruš, první autor studie, a prof. Michal Hocek, vedoucí vědecké skupiny Bioorganická a medicinální chemie nukleových kyselin, ÚOCHB" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Nova_technologie_inovuje_vyvoj_aptameru_syntetickych_alternativ_protilatek_9694c21671.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><blockquote><h4>Původní článek</h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41467-026-73676-y">Expedient single-round selection of hyper-modified aptamer targeting insulin receptor from over-represented dually nucleobase-modified DNA libraries</a></h4>Pablo Alberto Franco-Urquijo, Marek Ondruš, Jaroslav Kurfürst, Jana Škerlová, Irena Selicharová, Lucie Mužíková Čechová, Hana Šváchová, Alena Semerádtová, Anatolij Filimoněnko, Adéla Fejfarová, Jiří Homola, Tomáš Kouba &amp; Michal HocekNat. Commun., 2026<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41467-026-73676-y">https://doi.org/10.1038/s41467-026-73676-y</a>&nbsp;<h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">CC-BY 4.0</a></h6></blockquote><h4>Abstrakt</h4>Objev funkčních nukleových kyselin z knihoven náhodných sekvencí se obvykle opírá o několik časově náročných iterativních kol in vitro selekce s nízkou mírou úspěšnosti. V této práci představujeme strategii selekce v jediném kole, která umožňuje rychlý screening několika nadreprezentovaných DNA knihoven s modifikovanými nukleobázemi a různých selekčních podmínek a dokáže identifikovat modifikované aptamery s vysokou afinitou. Dvojitá separace následovaná amplifikací eluovaných sekvencí, analýzou NGS a klastrováním umožňuje rychlou identifikaci kandidátních aptamerů. Screening modifikovaných DNA knihoven obsahujících modifikované adeninové a uracilové nukleotidy nesoucí hydrofobní aromatické fenylové a indolové skupiny vedl k vývoji aptameru, který se váže na lidský inzulinový receptor se subnanomolární afinitou a mimořádnou specificitou. Struktura stanovená kryoelektronovou mikroskopií odhaluje význam každé aromatické modifikace, a to buď při stabilizaci sekundární struktury, nebo při zprostředkování interakcí s povrchem proteinu. Tento přístup překonává hlavní omezení selekce aptamerů a má potenciál pro vysokokapacitní screening i urychlení vývoje aptamerů nové generace pro diagnostické nebo terapeutické aplikace.</div>

Nová technologie inovuje vývoj aptamerů, syntetických alternativ protilátek

<div><div>Nadace Experientia podpoří tříletým start-up grantem vycházející hvězdu organické chemie Petru Vojáčkovou. Mladí talentovaní vědci Tereza Edlová a Ladislav Prener vycestují na zahraniční stáže.</div></div><div><div><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/start-up-granty/vyvijime-nove-strategie-pro-stavbu-molekul">Petra Vojáčková </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.uni-muenster.de/en/">University of Münster</a>&nbsp;založí svoji výzkumnou skupinu na <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.muni.cz/">Masarykově univerzitě</a> v Brně, kterou od ledna 2027 podpoří start-up grant Nadace Experientia ve výši 6 600 000 Kč. Se svým týmem bude vyvíjet nové strategie pro stavbu molekul tak, aby vznikala výhradně jejich žádoucí zrcadlová podoba.<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/zahranicni-staze/chceme-zefektivnit-vyzkum-v-oblasti-novych-materialu-i-leciv">Tereza Edlová </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.vscht.cz">VŠCHT Praha</a> díky stipendiu ve výši 1 260 000 Kč vycestuje na roční stáž na britskou <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.manchester.ac.uk">University of Manchester</a> do skupiny prof. Igora Larrosy, kde se bude věnovat projektu, který může zefektivnit výzkum v oblasti materiálů i léčiv.<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.experientia.cz/zahranicni-staze/nase-metoda-by-mohla-urychlit-vyvoj-novych-leku">Ladislav Prener </a>z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.uochb.cz/cs">ÚOCHB AV ČR</a> získal stipendium ve výši 1 200 000 Kč a zamíří na německou <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.rwth-aachen.de/cms/~a/root/?lidx=1">RWTH Aachen University</a> do skupiny prof. Leonoriho. Na své roční stáži bude vyvíjet metodu, která by mohla urychlit vývoj nových léků.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Nadace_Experientia_Nadace_Experientia_zna_drzitelku_start_up_grantu_a_stipendisty_pro_rok_2026_c96fdf9a4f.jpg" alt="Nadace Experientia: Nadace Experientia zná držitelku start-up grantu a stipendisty pro rok 2026" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Nadace_Experientia_Nadace_Experientia_zna_drzitelku_start_up_grantu_a_stipendisty_pro_rok_2026_c96fdf9a4f.jpg 234w," sizes="100vw" width="600" height="400"><blockquote>Nadace Experientia od roku 2012 podpořila už 27 nadějných mladých vědkyň a vědců, kteří díky stipendiu dostali šanci vycestovat na roční stáž na špičková zahraniční vědecká pracoviště. Díky programu start-up grantů si mohlo dalších 6 mladých vědkyň a vědců založit po návratu ze zahraničí vlastní výzkumnou skupinu v ČR. Celkem už na podporu mladých vědkyň a vědců vyčlenila Nadace Experientia více než 73 milionů korun.</blockquote></div></div>

Nadace Experientia zná držitelku start-up grantu a stipendisty pro rok 2026

V týdnu od 29. června na Vás čekají v oblasti kapalné fáze a především HPLC a LC/MS následující webináře.<blockquote><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.lcms.cz/webinars">👉 DETAILY A REGISTRACE V SEKCI WEBINÁŘE</a></h4></blockquote><blockquote>👉 Vyhledávejte a filtrujte v největší globální databázi s více než 5 500 GC, HPLC, MS a spektroskopickými webináři.</blockquote><h5>1. Thermo Fisher Scientific: Insights from an IC Specialist: To Be Suppressed or Not Suppressed?</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 09:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6310">Registrace</a></li></ul>Zjistěte, jak technologie supresorů ovlivňuje citlivost, selektivitu, spolehlivost i nároky na údržbu v iontové chromatografii. Webinář představí výhody i omezení potlačené a nepotlačené vodivostní detekce a nabídne praktické tipy pro řešení běžných problémů.<h5>2. SCIEX: Advancing Proteomics with ZenoTOF: From Single-Cell Analysis to Plasma Biomarker Discovery</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 11:30 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6311">Registrace</a></li></ul>Objevte možnosti hmotnostní spektrometrie ZenoTOF pro proteomiku jednotlivých buněk i analýzu plazmatických biomarkerů. Přednáška ukáže, jak vysoké rozlišení a citlivost urychlují biologický výzkum a objevování nových biomarkerů.<h5>3. Agilent Technologies: Measuring Diverse Samples with UV/VIS Spectrometers and Integrating Spheres</h5><ul><li>Út, 30.6.2026 20:30 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6052">Registrace</a></li></ul>Naučte se správně měřit difúzní transmitanci a reflektanci pomocí UV/VIS spektrometrů s integrační koulí. Webinář představí praktické využití systému Cary 60 při analýze široké škály materiálů.<h5>4. Waters Corporation: Informatics Series #33: Tips, Tricks and Best Practices</h5><ul><li>Čt, 2.7.2026 11:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6315">Registrace</a></li></ul>Interaktivní lekce zaměřená na software Empower představí užitečné funkce, klávesové zkratky a osvědčené pracovní postupy, které pomohou zrychlit každodenní práci a zvýšit efektivitu zpracování chromatografických dat.<h5>5. Waters Corporation: Unlocking Therapeutic Peptide Characterisation (GLP-1RAs) with Cyclic IMS</h5><ul><li>Čt, 2.7.2026 15:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6313">Registrace</a></li></ul>Zjistěte, jak cyklická iontová mobilita rozšiřuje možnosti charakterizace terapeutických peptidů a analogů GLP-1. Webinář ukáže přínosy této technologie pro vývoj léčiv, kontrolu kvality i regulatorní dokumentaci.<h5>6. Agilent Technologies: Spectral Flow Cytometry Masterclass – Session 1</h5><ul><li>Pá, 3.7.2026 07:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6316">Registrace</a></li></ul>První část odborné série představí principy spektrální průtokové cytometrie, návrh experimentů a praktické aplikace v imunologii, onkologii i výzkumu vakcín.

Webináře LabRulezLCMS týden 27/2026

Webináře

Popularizace

Věda a výzkum

Video

Článek

Podporujeme mladé vědkyně a vědce z oboru organické, bioorganické a medicinální chemie na zahraničních stážích i zde v ČR díky tzv. start-up grantům Nadace Experientia.

Nadace Experientia

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Vše ze světa analytické chemie na jednom místě. Propojujeme lidi při řešení jejich problémů. U nás naleznete všechny potřebné informace snadno, rychle a přehledně. Přestaňte hledat a začněte nacházet.

LabRulez

Metrohm

Agilent Technologies

How the chromatographic process works is not magic.
It is described by a few key parameters, such as resolution, retention factor, and selectivity. Understanding the equations that define these parameters can make them less intimidating.
In this talk we will discuss:
<ul>
<li>What they are and where they come from
</li>
<li>Their importance
</li>
<li>The effect they have on our chromatography
</li>
<li>When they don’t matter
</li>
</ul>
A better grasp of this key information helps make the separation work for us.
<blockquote>
Presenter: Bill Champion (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>

Agilent Technologies: Demystifying the Chromatographic Process

Demystifying the Chromatographic Process

How the chromatographic process works is not magic.

Developing reversed-phase chromatographic methods can often be both more efficient and made better by use of a systematic approach rather than a “random walk”.
Combining simple experimental design with chromatographic understanding can help us better understand how the chromatographic parameters affect the separation.
In this talk, we will discuss the use of simple experimental design to optimize our method development and how it can:
<ul>
<li>Help make the method more robust</li>
<li>Help us understand and predict chromatographic behavior</li>
<li>Make it possible to know which parameters are really important</li>
</ul>
Most of these experiments can be set up to run in a simple overnight sequence.
<blockquote>
Presenter: Bill Champion (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>

Agilent Technologies: Systematic Approach vs. Random Walk - Improving the Efficiency of Method Development and Optimization

Systematic Approach vs. Random Walk - Improving the Efficiency of Method Development and Optimization

Use of simple experimental design to optimize our method development.

HPLC Method Development and Optimization Basics

Whether you develop HPLC methods, run QC samples or perform contract analyses, longer analysis times cost more and FAST LC columns can help you reduce those costs.
In this seminar we will look at:
<ul>
<li>Easy-to-follow steps for converting existing methods
</li>
<li>Developing new, faster methods on existing equipment
</li>
<li>System improvements and adjustments, like flow path connections and detector acquisition rates that can help you get the best performance with your existing system.
</li>
</ul>
We’ll also discuss when and why to consider an enhanced UHPLC systems.
<blockquote>
Presenter: Rita Steed (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Rita Steed began supporting the LC column line for Agilent in 1999. As a Chromatography Specialist (first with Chromatography, Inc., then directly for Agilent), Rita worked on-site with researchers in Pharmaceutical and other industries presenting technical seminars and assisting researchers with troubleshooting and method development. Rita has over 20 years of Chromatography experience in the Biotechnology, Chemical, and Pharmaceutical industries. She has held positions in Research, Sales, and Technical Service. Rita has earned degrees in Microbiology and Life Sciences/Biochemistry. In her current position, she is an inside Application Engineer supporting LC columns.
</blockquote>

Agilent Technologies: High Resolution Fast LC - Easier Than You Think with Simple Changes

High Resolution Fast LC - Easier Than You Think with Simple Changes

Developing new, faster methods on existing HPLC equipment.

Easier Than You Think with Simple Changes

Operating an HPLC can be overwhelming to a new user.
There are many pitfalls or “gotchas”. Even the issue of what tubing and fittings are compatible and which are not can be a serious impediment to successfully operating the HPLC.
In this talk, we will discuss:
<ul>
<li>The importance of connections
</li>
<li>Mobile Phase considerations
<ul>
<li>Quality
</li>
<li>Preventing microbial growth
</li>
<li>Sample/solvent compatibility
</li>
</ul>
</li>
<li>Column Characteristics; Their importance and limitations
</li>
<li>The importance of sample prep
</li>
</ul>
Avoiding these pitfalls can help you achieve long-term, reliable results.
<blockquote>
Presenter: Rita Steed (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Rita Steed began supporting the LC column line for Agilent in 1999. As a Chromatography Specialist (first with Chromatography, Inc., then directly for Agilent), Rita worked on-site with researchers in Pharmaceutical and other industries presenting technical seminars and assisting researchers with troubleshooting and method development. Rita has over 20 years of Chromatography experience in the Biotechnology, Chemical, and Pharmaceutical industries. She has held positions in Research, Sales, and Technical Service. Rita has earned degrees in Microbiology and Life Sciences/Biochemistry. In her current position, she is an inside Application Engineer supporting LC columns.
</blockquote>

Agilent Technologies: New to HPLC? Tips for Avoiding Beginner Pitfalls

New to HPLC? Tips for Avoiding Beginner Pitfalls

What tubing and fittings are compatible and which are not can be a serious impediment to successfully operating the HPLC.

GPC/SEC, Gel Permeation Chromatography or Size Exclusion Chromatography, is a non-interactive chromatographic technique that separates analytes based on their size in solution.
It is often used in laboratories for determination of a polymers&#39; molecular weight distribution but has many other uses.
In this talk we will:
<ul>
<li>Review GPC theory
</li>
<li>Discuss why molecular weight distribution is important
</li>
<li>Look at the different types of columns and their uses
</li>
<li>Cover key column selection criteria
</li>
<li>Show how key parameters like concentration, particle size, and injection volume can affect your separation
</li>
</ul>
We will also look at examples of common mistakes and pitfalls relating to solvent choice, calibration standards, and combining columns in series.
<blockquote>
Presenter: Jean Lane (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Jean has been employed with Agilent since Nov 2010 in technical and applications support and has a primary role supporting Agilent’s full line of LC columns and consumables, which also includes support for Agilent’s GPC/SEC product line. She came to Agilent thru acquisition of Varian and the former Polymer Laboratories. Jean has 20 plus years of technical and applications support for both HPLC and GPC consumable products. In addition to practical chromatography experience in the laboratory, she has had many, many years in her technical role involving customer support providing assistance and troubleshooting for customer chromatography issues.
</blockquote>

Agilent Technologies: Gel Permeation Chromatography Basics and Beyond

Gel Permeation Chromatography Basics and Beyond

GPC/SEC, Gel Permeation Chromatography or Size Exclusion Chromatography.

Karl Fischer (KF) titration is an industry standard method for measuring water content in all types of substances.
However, for various reasons some substances are not suitable for a direct Karl Fischer titration:
<ul>
<li>They release their water only slowly
</li>
<li>The water is released at high temperature only
</li>
<li>The substances are poorly soluble in KF solvents
</li>
<li>They undergo side reactions with KF reagents
</li>
<li>They contaminate the titration cell or the electrodes
</li>
</ul>
By using the KF oven technique, the above-mentioned problems can be avoided. This makes the KF oven technique a perfect solution for the analysis of difficult samples.
By viewing this webinar you will learn…
<ul>
<li>how to analyse difficult samples
</li>
<li>how to properly prepare your titration system with KF oven
</li>
<li>how to prepare your sample
</li>
<li>how to select the optimal heating temperature
</li>
<li>which reagents and which water standards you should use to obtain accurate results
</li>
</ul>
After viewing this webinar you will know how to perform accurate titrations using the Karl Fischer oven technique. Additionally, the speakers will reveal tips and tricks to help you in the daily routine. The webinar will finish with live Q&amp;A session.
<blockquote>
Presenter: Michael Margreth (Senior Product Specialist Titration, Metrohm International Headquarters, Switzerland)
</blockquote>
<blockquote>
Michael Margreth studied chemistry at the University of Applied Science in Muttenz, Switzerland. He joined Metrohm in 2005 as an application specialist and gained titration experience in the application laboratory. Since 2008 he mainly focuses on Karl Fischer titration and the determination of water.
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Agnieszka Kossakowska (HYDRANAL Marketing Specialist, Honeywell Research Chemicals)
</blockquote>
<blockquote>
Agnieszka Kossakowska joined Honeywell in March 2016 as a marketing specialist providing technical support and onsite seminars for Honeywell’s Hydranal™ reagents for Karl Fischer titration. Agnieszka has more than 10 years of experience in analytical chemistry and conducts training across Europe, Middle East &amp; Africa, Latin America and Asia.
</blockquote>

Metrohm: Tips and tricks to analyze difficult samples using the Karl Fischer oven technique

LCMS webináře se zaměřením na Akademie/Principy - strana 42