<p><strong>Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR pronikají do detailů genové transkripce. Popsali dosud neznámý molekulární mechanismus, kterým může začínat přepis genetické informace z deoxyribonukleové kyseliny (DNA) do ribonukleové kyseliny (RNA). Zaměřili se na zvláštní molekuly nazývané alarmony, které se vyskytují v buňkách napříč organismy a jejichž hladina se často zvyšuje při buněčném stresu. Výsledky výzkumu zveřejnil prestižní vědecký časopis </strong><i><strong>Nature Chemical Biology</strong></i><strong>.</strong></p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Hana Cahová, vedoucí vědecké skupiny Chemická biologie nukleových kyselin." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"></p><div><p>RNA molekuly mohou nést na jednom konci různé chemické modifikace, označované jako tzv. „čepičky“. U eukaryotních organismů, kam patří i lidské buňky, je nejznámější čepička, která se podílí na stabilitě RNA a regulaci jejího dalšího osudu. V posledních letech se však ukazuje, že existují i alternativní, nekanonické RNA čepičky, jejichž vznik a mechanismus připojení k RNA se zatím vymyká lidským znalostem. Mezi ně patří například tzv. alarmonové čepičky, tvořené molekulami dinukleosidpolyfosfátu, alarmonů, které chrání buněčnou RNA ve chvílích, kdy je buňka v ohrožení.</p><p>Tým <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cahova.group.uochb.cz/cs"><strong>Dr. Hany Cahové</strong></a> se ve své studii zaměřil na RNA polymerázu z bakterií a sledoval, jakým způsobem může tento enzym zahájit transkripci za využití dinukleosidpolyfosfátů (NpNs) místo běžných stavebních bloků RNA. Vědci vůbec poprvé popsali na atomární úrovni, jak může vznikat RNA s alarmonovou čepičkou přímo při zahájení přepisu genu. Navíc pozorovali, že se Np<sub>n</sub>Ns vážou jiným typem párování, než je obvyklé.</p><p>Na práci se zásadně podílely <strong>Valentina Serianni z týmu Hany Cahové</strong>, která prokázala schopnost dinukleosidpolyfosfátů zahajovat přepis genu, a<strong> Jana Škerlová</strong>, která se zaměřila na strukturální analýzu RNA polymerázy a na základě dat z kryogenní elektronové mikroskopie ukázala, jak se molekuly dinukleosidpolyfosfátů váží do aktivního místa RNA polymerázy, tedy do srdce enzymu, kde se genetická informace přepisuje. Jejich studie pomáhá odhalovat procesy, které provázejí přepis genetické informace z DNA do RNA.</p><p>Hana Cahová k tomu dodává: <i>„Popisujeme něco, co se v buňkách skutečně děje a co nyní dokážeme pozorovat přímo na úrovni jednotlivých molekul. Získáváme tak odpovědi na zásadní otázky týkající se buněčných procesů, například jak se buňky přizpůsobují stresu. Právě RNA totiž přenáší kaskádu informací, které stojí za jakoukoli buněčnou reakcí, např. na stav ohrožení způsobený nedostatkem živin či teplotním šokem.“</i></p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Tomáš Kouba, vedoucí core facillity skupiny Kryogenní elektronová mikroskopie." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"></p><div><p>Klíčovou roli v projektu sehrála kryogenní elektronová mikroskopie (cryo-EM), kterou ved<strong>l Dr. Tomáš Kouba</strong>, jeden z autorů článku. <i>„Kryoelektronová mikroskopie umožňuje zmrazit biologické molekuly skoro v jejich přirozené formě a následné získat trojrozměrnou strukturu takových molekul. Díky tomu můžeme nahlédnout přímo do aktivního centra enzymů a sledovat jejich fungování až na atomární úrovni,“ </i>vysvětluje Tomáš Kouba.</p><p>ÚOCHB vloni otevřel nové<strong> </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cryoem.group.uochb.cz/cs"><strong>centrum cryo-EM</strong></a>, které je v českém prostředí unikátní. Špičkové kryogenní elektronové mikroskopy našly zázemí ve speciálně navržené budově a umožňují studium biologických procesů s mimořádnou strukturální přesností.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg" alt="ÚOCHB: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Tato práce ukazuje, jak malé molekuly NpnN pomáhají bakteriím zahájit přepis genetické informace. Detailní zobrazení pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhaluje, jak se vážou na genetickou šablonu a fungují jako nekanonické „čepičky“ RNA." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg 245w," sizes="100vw" width="2000" height="1077"></p><blockquote><h4><strong>Původní článek</strong></h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41589-025-02134-5#citeas"><strong>Molekulární vhled do 5′ zakončení RNA pomocí Np</strong><i><strong><sub>n</sub></strong></i><strong>Ns zprostředkovaného bakteriální RNA polymerázou</strong></a></h4><p>Valentina M. Serianni, Jana Škerlová, Anna Knopp Dubánková, Anton Škríba, Hana Šváchová, Tereza Vučková, Anatolij Filimoněnko, Milan Fábry, Pavlína Řezáčová, Tomáš Kouba &amp; Hana Cahova&nbsp;</p><p><strong>Nat. Chem. Biol.</strong> <strong>21</strong> (2026)</p><p><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5">https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5</a></p><h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/"><strong>CC-BY 4.0</strong></a></h6></blockquote><h4><strong>Abstrakt</strong></h4><p>RNA zakončená dinukleosidovými polyfosfáty byla u bakterií i eukaryot objevena teprve nedávno. Pravděpodobný mechanismus tohoto specifického typu zakončení RNA spočívá v přímém začlenění dinukleosidových polyfosfátů RNA polymerázou jako nekanonických iniciačních nukleotidů. Dosud však nebylo známo, jakým způsobem se tyto sloučeniny vážou do aktivního místa RNA polymerázy během zahájení transkripce. V této práci jsme in vitro studovali iniciaci transkripce za použití série DNA templátů v kombinaci s dinukleosidovými polyfosfáty a modelovou RNA polymerázou z bakterie <i>Thermus thermophilus</i>. Zjistili jsme, že místo zahájení transkripce se může lišit v závislosti na kompatibilitě konkrétního templátu a použitého dinukleosidového polyfosfátu. Struktury iniciačních transkripčních komplexů s dinukleosidovými polyfosfáty získané pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhalily, že obě nukleové báze v molekule mohou párovat s DNA templátem. První kódovaný nukleotid se páruje kanonickým Watsonovým–Crickovým způsobem, zatímco druhá nukleová báze se váže nekanonicky prostřednictvím reverzního Watsonova–Crickova párování. Tato práce tak poskytuje strukturní vysvětlení mechanismu, kterým dinukleosidové polyfosfáty zahajují transkripci RNA.</p></div></div>

Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace

<p>🎤 <strong>Přednášející: Michal Belianský</strong></p><h3><strong>VIZE 2025: Empower Method Validation Manager</strong></h3><h4><strong>Empower Method Validation Manager (MVM): moderní přístup k validaci chromatografických metod</strong></h4><p>Validace analytických metod je klíčovým požadavkem regulovaných laboratoří v oblasti farmacie, biotechnologií i kontroly kvality. Software <strong>Empower Method Validation Manager (MVM)</strong> od společnosti Waters představuje komplexní nástroj, který umožňuje provádět validaci chromatografických metod systematicky a plně v souladu s požadavky lékopisů a regulačních autorit.</p><p>MVM je rozšířením chromatografického datového systému <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/627"><strong>Empower</strong></a>, díky čemuž propojuje vývoj, validaci, zpracování dat i reporting do jednoho uceleného workflow.</p><h4><strong>Automatizované výpočty a System Suitability</strong></h4><p>Jednou z hlavních výhod Empower MVM je využití <strong>automaticky generovaných chromatografických parametrů</strong>, jako jsou:</p><ul><li>rozlišení (Resolution),</li><li>faktor symetrie a tailing,</li><li>počet teoretických pater (Plate Count),</li><li>výška a šířka píku,</li><li>poměr signál/šum (S/N).</li></ul><p>Tyto parametry jsou vyhodnocovány v souladu s požadavky <strong>USP, EP i JP</strong> a mohou být přímo použity v rámci testů <strong>System Suitability</strong>, čímž se minimalizuje riziko manuálních chyb a zvyšuje konzistence výsledků.</p><h4><strong>Podpora chemických struktur a specifických aplikací</strong></h4><p>Empower MVM nabízí také rozšíření <strong>Chemical Structures</strong>, které je integrováno ve spolupráci s ACD/Labs. Díky tomu lze přímo v prostředí Empoweru:</p><ul><li>kreslit a upravovat chemické struktury,</li><li>vytvářet knihovny sloučenin,</li><li>vkládat struktury do tabulek komponent a zahrnovat je do reportů.</li></ul><p>Další specializovaná rozšíření pokrývají například:</p><ul><li><strong>Dissolution</strong> – automatizované vyhodnocení disolučních testů včetně výpočtů f1, f2 a Q faktoru,</li><li><strong>GPC/SEC pro polymerní analýzu</strong> – výpočty molekulových hmotností (Mw, Mn, Mp, Mz) a kombinaci dat z RI a LS detektorů,</li><li><strong>Sample Weight Importer</strong> – přímý přenos hmotností ze vah do Empoweru s plnou auditní stopou.</li></ul><h4><strong>Validace metod krok za krokem v MVM</strong></h4><p>Empower Method Validation Manager strukturuje validaci do tří hlavních fází:</p><ol><li><strong>Validation Protocol</strong><br>Definice validačních požadavků, akceptačních kritérií, typů testů a schvalovacích procesů.</li><li><strong>Validation Study</strong><br>Řízení celé validační studie v jednom projektu – akvizice dat, jejich zpracování, statistické výpočty a průběžné hodnocení souladu s kritérii.</li><li><strong>Reporting</strong><br>Automatizovaná tvorba validačních reportů z předdefinovaných šablon, včetně elektronických podpisů a plné sledovatelnosti změn.</li></ol><p>Software podporuje všechny klíčové validační testy, jako jsou linearita, přesnost, správnost, specificita, LOD/LOQ, opakovatelnost, mezilehlá přesnost, robustnost či stabilita metody</p><h4><strong>Integrace, migrace dat a monitoring systémů</strong></h4><p>Součástí ekosystému Empoweru jsou i nástroje pro <strong>migraci dat z jiných CDS</strong> (např. Agilent ChemStation/OpenLab, Thermo Chromeleon, MassLynx) pomocí modulu <strong>Waters Data Converter</strong>.</p><p>Díky platformě <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/1544"><strong>waters_connect</strong></a><strong> System Monitoring</strong> mají uživatelé přehled o stovkách chromatografických a LC-MS systémů, mohou sledovat jejich stav v reálném čase, dostávat automatické notifikace a efektivně plánovat využití přístrojů, což významně zvyšuje produktivitu laboratoře.</p><h4><strong>Závěr</strong></h4><p>Empower Method Validation Manager představuje robustní a regulatorně připravené řešení pro validaci chromatografických metod od A do Z. Automatizace výpočtů, jednotné řízení validačních studií, pokročilé reportingové nástroje a hluboká integrace s CDS Empower činí z MVM silný nástroj pro laboratoře, které kladou důraz na kvalitu dat, efektivitu práce a plnou shodu s regulačními požadavky.</p>

Waters VIZE 2025: Empower Method Validation Manager

<p><strong>V týdnu od 9. února na Vás čekají v oblasti kapalné fáze a především HPLC a LC/MS následující webináře.</strong></p><blockquote><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.lcms.cz/webinars"><strong>👉 DETAILY A REGISTRACE V SEKCI WEBINÁŘE</strong></a></h4></blockquote><blockquote><p><strong>👉 Vyhledávejte a filtrujte v největší globální databázi</strong> s více než <strong>5 000 GC, HPLC, MS a spektroskopickými webináři.</strong></p></blockquote><h5><strong>1. </strong><span><strong>SelectScience</strong></span><strong>: High-throughput stability screening strategies for antibody formulation</strong></h5><ul><li>Út, 10. 2. 2026 17:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5807">Registrace</a></li></ul><p>Webinář představuje využití vysokokapacitních technik DLS/SLS a rychlého DSC screeningu pro urychlení hodnocení stability vysoce koncentrovaných protilátkových formulací.</p><h5><strong>2. </strong><span><strong>Phenomenex</strong></span><strong>: Big Scale, Big Wins: Prep Chromatography Explained</strong></h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 10:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5793">Registrace</a></li></ul><p>Praktický přehled přenosu analytických metod do preparativní HPLC, včetně limitů preparativních kolon a klíčových aspektů farmaceutických aplikací.</p><h5><strong>3. </strong><span><strong>ALS Czech Republic</strong></span><strong>: PFAS in Food &amp; Food Contact Material</strong></h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 15:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5816">Registrace</a></li></ul><p>Webinář přináší přehled regulací EU a USA, analytických výzev a osvědčených strategií testování PFAS v potravinách a materiálech pro styk s potravinami.</p><h5><strong>4. </strong><span><strong>New Food magazine</strong></span><strong>: The Science of Next-Gen Ingredients: Fermentation, Formulation and Function</strong></h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 16:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5720">Registrace</a></li></ul><p>Pohled na fermentační inovace nové generace a jejich roli při vývoji funkčních potravinářských ingrediencí se zlepšenou chutí, funkčností a stabilitou.</p><h5><strong>5. </strong><span><strong>SCIEX</strong></span><strong>: Accurate Mass Fundamentals – Interpreting and Applying Your Data</strong></h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 19:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5772">Registrace</a></li></ul><p>Třetí díl série zaměřený na interpretaci přesné hmotnosti, potvrzení identity sloučenin a řešení problematických HRMS výsledků v praxi.</p><h5><strong>6. </strong><span><strong>Agilent Technologies</strong></span><strong>: Process Analytical Techniques: Online HPLC for Real Time Monitoring and Control of Bioprocesses</strong></h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 06:30 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5834">Registrace</a></li></ul><p>Webinář ukazuje využití online PAT HPLC pro téměř reálné monitorování kritických kvalitativních atributů v bioprocesní výrobě.</p><h5><strong>7. </strong><span><strong>Thermo Fisher Scientific</strong></span><strong>: Introducing the Orbitrap Excedion Pro Hybrid MS</strong></h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 11:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5889">Registrace</a></li></ul><p>Představení nové generace Orbitrap MS s rozšířeným hmotnostním rozsahem, ETD/EThcD fragmentací a robustními workflow pro charakterizaci proteinů.</p><h5><strong>8. </strong><span><strong>Waters Corporation</strong></span><strong>: Planning Your NuGenesis Upgrade: Insights and Best Practices for a Smooth Transition</strong></h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 19:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5833">Registrace</a></li></ul><p>Doporučení pro upgrade softwaru NuGenesis, přechod na Windows 11 a využití nových dashboardů pro přehled dat v reálném čase.</p><h5><strong>9. </strong><span><strong>Thermo Fisher Scientific</strong></span><strong>: Comprehensive Analytical Strategies for Peptides Therapeutics and GLP-1 Agonist</strong></h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 19:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5814">Registrace</a></li></ul><p>Komplexní přehled analytických strategií pro peptidová terapeutika a GLP-1 agonisty, zahrnující vývoj metod, kontrolu kvality a LC-MS workflow.</p><h5><strong>10. </strong><span><strong>Agilent Technologies</strong></span><strong>: Moving from R&amp;D and Limited QC on a UV-Vis-NIR Instrument to Large Scale QC Using an Autosampler</strong></h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 20:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/2104">Registrace</a></li></ul><p>Webinář se zaměřuje na rozšíření UV-Vis-NIR analýzy z výzkumu do rutinní kontroly kvality pomocí autosampleru.</p><h5><strong>11. </strong><span><strong>Agilent Technologies</strong></span><strong>: LC Method Transfer: Hidden Challenges &amp; Absolute Solution</strong></h5><ul><li>Pá, 13. 2. 2026 06:30 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5787">Registrace</a></li></ul><p>Detailní rozbor skrytých úskalí přenosu LC metod mezi systémy a strategií, jak zajistit robustní a reprodukovatelné výsledky.</p><h5><strong>12. </strong><span><strong>Altium International</strong></span><strong> (HPST): Příprava vzorků pro analýzu vitamínů rozpustných v tucích – tipy a aplikace</strong></h5><ul><li>Pá, 13. 2. 2026 10:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5891">Registrace</a></li></ul><p>Praktické tipy pro přípravu vzorků vitamínů rozpustných v tucích v komplexních lipidových matricích se zaměřením na kvalitu a spolehlivost dat.</p>

Webináře LabRulezLCMS týden 07/2026

Webináře

Přednáška

Věda a výzkum

Video

Článek

Produkt

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Vše ze světa analytické chemie na jednom místě. Propojujeme lidi při řešení jejich problémů. U nás naleznete všechny potřebné informace snadno, rychle a přehledně. Přestaňte hledat a začněte nacházet.

LabRulez

Firmu Waters založil v roce 1958 pan James Waters. Od té doby se společnost Waters specializuje na kapalinovou chromatografii a hmotnostní spektrometrii. Divize TA Instruments působí na poli termální analýzy. V České republice je Waters zastoupen přímou pobočkou, která sídlí v Praze.

Waters Gesellschaft

Tosoh Bioscience

Axcend

The Analytical Scientist

Phenomenex

Thermo Fisher Scientific

Shimadzu Corporation

Waters Corporation

<p><strong>Interactions of analytes with metal surfaces in high-performance liquid chromatography (HPLC) instruments and columns have been reported to cause deleterious effects ranging from peak tailing to a complete loss of the analyte signal. These effects are due to the adsorption of certain analytes on the metal oxide layer on the surface of the metal components.</strong></p>
<p>We have developed a novel surface modification technology and applied it to the metal components in ultra HPLC (UHPLC) instruments and columns to mitigate these interactions. A hybrid organic−inorganic surface, based on an ethylene-bridged siloxane chemistry, was developed for use with reversed-phase and hydrophilic interaction chromatography. We have characterized the performance of UHPLC instruments and columns that incorporate this surface technology and compared the results with those obtained using their conventional counterparts. </p>
<p>We demonstrate improved performance when using the hybrid surface technology for separations of various small molecules as well as nucleotides, phosphopeptides, and oligonucleotides. The hybrid surface technology was found to result in higher and more consistent analyte peak areas and improved peak shape, particularly when using low analyte mass loads and acidic mobile phases. Reduced abundances of iron adducts in the mass spectrum of a peptide were also observed when using UHPLC systems and columns that incorporate hybrid surface technology. These results suggest that this technology will be particularly beneficial in UHPLC/mass spectrometry investigations of metal-sensitive analytes.</p>
<p>Join this session to:</p>
<ul>
<li><strong>Learn about non-specific adsorption and the challenges it can cause</strong></li>
<li><strong>Learn about current workarounds that scientists currently use to mitigate non-specific adsorption</strong></li>
<li><strong>Learn about MaxPeak HPS technology and how this prevent non-specific adsorption across many different workflows</strong></li>
</ul>
<blockquote>
<p><strong>Presenter:</strong> Kim Haynes (Director of Chemistry Marketing and Product Management , Waters Corporation)</p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>Kim Haynes is a Director of Chemistry Marketing and Product Management in the Consumables and Lab Automation Group at Waters Corporation.<br/>Kim manages MaxPeak High Performance Surface Technologies as well as a variety of other programs. Prior to this position, she has worked with Waters Corporation as a chemistry sales specialist and a business development manager.</p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>During her 23 years at Waters, Kim has focused on helping scientists and colleagues understand chromatographic separations and sample preparation. Before joining Waters Corporation, Kim worked as an analytical chemist at Bacardi Martini. She holds a BS in Chemistry from Ohio University.</p>
</blockquote>


The Analytical Scientist: Increasing method reproducibility by eliminating unwanted analyze surfaced interactions

Increasing method reproducibility by eliminating unwanted analyze surfaced interactions

Performance when using the hybrid surface technology for separations of various small molecules as well as nucleotides, phosphopeptides, and oligonucleotides. 

Reproducibility & eliminating unwanted surfaced interactions

<p><strong>WEOF is back for 2023, and this time we will do it 100% virtually to allow even more people to participate. But don&#39;t expect to see only some presentations! We have put together for you an interesting agenda with Live Demos, customer talks, and the chance to ask our experts your questions. It will be a great opportunity to learn more about the advancements in oligonucleotide analysis and about the analytical challenges and successes of your peers.</strong></p>
<ul>
<li>Join our virtual Live Demos</li>
<li>Hear from other scientists like you about their approaches and experiences</li>
<li>Stay up to date with the latest analytical developments for nucleic acids</li>
</ul>
<p>The agenda will be a mix of talks from the scientific community and Waters presentations. We will discuss current analytical needs and show some Live Demos of LC/MS solutions and software:</p>
<h3><strong>AGENDA</strong></h3>
<h5><strong>10:00 Welcome and Short Introduction</strong></h5>
<ul>
<li><strong>Speaker:</strong> David Muñoz (Waters Corporation)</li>
</ul>
<h5><strong>10:05 Waters Live Demo: Impurity Analysis by LC/MS</strong></h5>
<ul>
<li><strong>Speaker:</strong> Emma L Harry (Waters Corporation)</li>
</ul>
<h5><strong>10:25 Customer Talk: Cytiva Sweden AB</strong></h5>
<h5><strong>Analysis of Oligonucleotides using BioAccord LC-MS</strong></h5>
<ul>
<li><strong>Speaker:</strong> Filip Bergqvist (Senior Scientist)</li>
</ul>
<p>Topic: intact analysis of oligonucleotides, specifically development/performance with IP-RPC</p>
<h5><strong>10:40 Customer Talk: BioNTech Manufacturing GmbH</strong></h5>
<h5><strong>QC Analytics for mRNA therapies</strong></h5>
<ul>
<li><strong>Speaker:</strong> Jonas Sander</li>
</ul>
<p>Topic: How BioNTech has masterdto set up QC analytics for mRNQ therapies and the added value of Waters solutions</p>
<h5><strong>10:55 MaxPeak Premier Technology for Oligonucleotide Analysis</strong></h5>
<ul>
<li><strong>Speaker:</strong> Ali Tiss (Waters Corporation)</li>
</ul>
<h5><strong>11:10 Waters Live Demo: Software</strong></h5>
<h5><strong>CONFIRM &amp; INTACT app</strong></h5>
<ul>
<li><strong>Speaker:</strong> Chris Knowles (Waters Corporation)</li>
</ul>
<h5><strong>11:30 Q&amp;A with Waters</strong></h5>
<p>You ask - our application chemists answer</p>
<h5><strong>11:45 Closing</strong></h5>
<h4><strong>INVITED GUEST SPEAKER</strong></h4>
<h5><strong>Filip Bergqvist</strong> (Senior Scientist, Cytiva Sweden AB)</h5>
<p>Filip is leading bioanalytical activities to support product development and application work for bioprocessing. His main expertise is LC-MS, where he is developing methods for characterization of proteins and nucleic acid therapeutics. </p>
<h5><strong>Dr. Jonas Sander</strong> (BioNTech Manufacturing GmbH)</h5>
<p>(further info will follow soon)</p>
<h4><strong>YOUR WATERS HOSTS</strong></h4>
<h5><strong>David Muñoz</strong> (Principal Biopharma Market Development Manager, Waters Corporation)</h5>
<p>David will be your host for this event. He completed his PhD in Biochemistry at Nottingham Trent University, focused on the effects of toxins on glioma cells. After this he joined Lonza to work as a research and development scientist using different analytical techniques to characterize antibodies and proteins. Later he worked for Thermo Fisher Scientific as applications specialist and Biopharma Expert, and as business development manager in two CDMOs,  focusing on antibodies and viral vector projects. David joined Waters in June 2022 as principal biopharma market development manager.   </p>
<h5><strong>Emma L Harry</strong> (European Applications Laboratory Team Manager, Waters Corporation)</h5>
<p>Emma completed her PhD in Analytical Chemistry at Loughborough University, focused on the development of ion mobility mass spectrometry for complex mixtures.</p>
<p>After her post doctoral research at University of Leicester and having worked as analytical scientist at Hall Analytical, using a variety of analytical techniques, Emma joined Waters in June 2019 as a senior applications chemist in the Demo lab in Wilmslow. In 2021 she was promoted to European applications lab manager.</p>
<h5><strong>Chris Knowles</strong> (Senior Applications Scientist, Waters Corporation)</h5>
<p>Chris is currently working as a Principal Domain Specialist (Applications science) at Waters, having been with the company for 5 years.  He works with the Waters informatics teams to help deliver the waters_connect software applications. His focus has been on the CONFIRM Sequence application.  His background is in Bioprocessing, having worked at FUJIFILM Diasynth Biotechnologies for 3 years as a principal scientist in Mammalian cell culture, following completion of a PhD in mammalian cell line engineering at the University of Aberdeen in 2016.</p>
<h5><strong>Ali Tiss</strong> (Sales Specialist Biopharma Chemistry, Europe South, Waters Corporation)</h5>
<p>Ali completed his Ph.D. in biochemistry and structural biology at the Mediterranean University (CNRS, Marseille, France), where he contributed to the R&amp;D of the anti-obesity drug, Xenical®, developed by Roche Ltd. Then, he spent about 20 years of academic research (France, UK, Kuwait) in biochemistry, liquid chromatography, mass-spectrometry, and proteomics, focusing on detecting and characterizing biomarkers related to human diseases (cancer, diabetes, obesity). Ali joined Waters in October 2021 as a BioPharma and New Modalities Specialist in Chemistry for Southern Europe.</p>


Waters Corporation: Waters European Oligonucleotides Forum 2023

Waters European Oligonucleotides Forum 2023

We have put together for you an interesting agenda with Live Demos, customer talks, and the chance to ask our experts your questions. 

<p><strong>Axcend Focus LC Free Webinar</strong></p>


What's New in HPLC?

Axcend Focus LC Free Webinar by Axcend team.

<p><strong>This meeting covers the latest trends and techniques to meet current water and environmental testing demands for emerging contaminants and evolving regulations. Our guest speakers from the water industry and environmental research and testing laboratories will share their expertise on their latest work, analytical workflows, and automation.</strong></p>
<p>Join us and discover valuable insights to maximise testing productivity and instrument uptime, simplify workflows and standardise data workup.</p>
<h3><strong>June 28 (Day 2) – Evolving regulations</strong></h3>
<p>This session will explore disinfection by-products, haloacetic acids, heavy metals, volatiles/semi-volatiles analysis.</p>
<p>Attend the whole day or selected presentations only.</p>
<h5><strong>10:00</strong> Online access opens (Streaming begins 09:30 BST/10:30 CEST)</h5>
<h5><strong>10:30 Opening of the event, welcome and introduction</strong></h5>
<ul>
<li>Presenter: Ed George (Thermo Fisher Scientific)</li>
</ul>
<h5><strong>10:50 Beyond compliance - use of the Orbitrap Exploris 120 HRAM-LC-MS for the monitoring of catchments</strong></h5>
<ul>
<li>Presenter: Mark Collins (Northern Ireland Water)</li>
</ul>
<h5><strong>11:20 Utilizing IC-MS/MS for the analysis of halo acetic acids and disinfection by products in drinking water</strong></h5>
<ul>
<li>Presenter: Chris Pegg (Anglian Water)</li>
</ul>
<h5><strong>11:50 GC-MS analysis of environmental samples using automated sample preparation</strong></h5>
<ul>
<li>Presenter: John Quick (ALS Environmental Ltd.)</li>
</ul>
<h5><strong>12:20</strong> Break</h5>
<h5><strong>12:40 Development of an ion chromatography method with EC and MS detection for the analysis of bromide and the disinfection by products bromate, chlorate and chlorite</strong></h5>
<ul>
<li>Presenter: Joseph Scott (Affinity Water)</li>
</ul>
<h5><strong>13:10 High throughput nutrients analysis - developing methodologies for environmental and wastewater matrices</strong></h5>
<ul>
<li>Presenter: Red Godwin (Thermo Fisher Scientific)</li>
</ul>
<h5><strong>13:40 Performing the analysis of trace metals in environmental samples via ICP and ICP-MS</strong></h5>
<ul>
<li>Presenter: Trudy McMurray (Northern Ireland Environment Agency)</li>
</ul>
<h5><strong>14:15</strong> Closing of the live streaming event</h5>


Thermo Scientific: Water & Environmental Analysis User Meeting - Day 2

Water & Environmental Analysis User Meeting - Day 2

Streaming live from our Demo Centre in Hemel Hempstead | Join the complete event or the presentations of your choice only.

<p><strong>As a continuation of our Chromatography of Bioseparations 101 series, we bring to you 2 NEW SESSIONS in our Chromatography of Bioseparations 102 webinar series!  Join us live for our new parts 6 and 7.  If you haven&#39;t had an opportunity to register for Parts 1-5, feel free to regster and listen to them on-demand now.</strong></p>
<p>These new webinars will focus on the analytical separation of biomolecules such as peptides and amino acids.</p>
<p>Reverse-phase chromatography is the predominant technique used for the analyses and or purification of chemically synthesized peptides or peptides generated by the enzymatic digestion of proteins (i.e., peptide mapping). It is advantageous to have a simplified step-by-step approach to develop a method that can be applied to chemically synthesized peptides or protein digests.</p>
<p>Amino acid analysis is required in several different areas of research and is a fundamental tool in various product analytical activities.  Due to the varied properties of amino acids (i.e., acidic, basic, etc.), the separation and detection represents an analytical challenge and depending on throughput, sample preparation can be laborious.  </p>
<p>Who should attend?</p>
<ul>
<li><strong>Those interested in a refresher on foundational principles and tips of reverse phase separations of peptides.</strong></li>
<li><strong>Those interested in  how to select columns and mobile phases that are optimal for peptide and amino acid workflows.</strong></li>
<li><strong>Those looking for an overview of industry advancements and new offerings.</strong></li>
</ul>
<h3><strong>PART 7 | June 27th, 2023 | 10:30AM – 12:00PM EDT</strong></h3>
<h3><strong>UNDERSTANDING AMINO ACID ANALYSIS FOR PROTEIN HYDROLYSATES AND CELL CULTURE MEDIA</strong></h3>
<ul>
<li><strong>Understand the challenges of sample preparation, separation, and detection of amino acids in different matrices.</strong></li>
<li><strong>Review analytical techniques that addresses the challenges of amino acid analysis.</strong></li>
</ul>
<blockquote>
<p><strong>Presenter:</strong> Paula Phenix (Principal Product Manager – Consumables and Lab Automation, Waters Corporation)</p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>Paula is a Principal Marketing Manager at Waters with a focus on Waters products for amino acid and glycan analysis. Prior to her current role in the Chemistry and Lab Automation Group, she was the Product Marketing Manager for Specialty LC and SFC Systems in the Instruments group. Before joining Waters, she held product management, marketing and sales roles for several companies (Life Technologies, Promega, MilliporeSigma) in the molecular biology, immunology, cell culture and single-use bioprocessing areas. Paula graduated from the University of Delaware with a Bachelor’s Degree in Biology and from Johns Hopkins University with a Masters Degree in Business.</p>
</blockquote>


UNDERSTANDING AMINO ACID ANALYSIS FOR PROTEIN HYDROLYSATES AND CELL CULTURE MEDIA

Understand the challenges of sample preparation, separation, and detection of amino acids in different matrices.

UNDERSTANDING AMINO ACID ANALYSIS

<p><strong>Purification is critical to many scientific workflows. Compounds of interest are rarely found to be the right purity in their native state.  Join Waters and Virscidian for this 6-part webinar series to learn the basics of purification and application of purification principles for more advanced workflows.</strong></p>
<h3><strong>PART 3  | Things to Consider When Configuring Purification Systems and Informatics</strong></h3>
<p>Preparative chromatography is a separation technique where one or more peaks are collected for use in another experiment or process.</p>
<p>In this module, we will discuss the various hardware options available, from pumps and injectors through detection techniques to fraction collection. We’ll also touch on some of the software options available and look at different schemes for triggering fraction collection. </p>
<p>Learning Objectives:  </p>
<ul>
<li><strong>Understand various instrument configuration and the impact on purification</strong></li>
<li><strong>Optimize system performance</strong></li>
</ul>
<blockquote>
<p><strong>Presenter:</strong>  Darcy Shave (Senior Product Manager, Waters Corporation)</p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>Darcy Shave is currently aprincipalproduct manager in the Integrated Systems group atWaters Corporation (Milford, MA, USA), responsible for the purification and hardwareautomation products. Darcy has been with Waters for over 20 years, starting as anapplications chemist in the purification group. From there, he moved into a variety ofbusiness development roles before becoming a product manager for purification softwareabout 10 years ago and more recently for the entire purification portfolio.​</p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>He has a degree in Agricultural Chemistry from the University of Saskatchewan and workedin value added processing of natural products before joining Waters.</p>
</blockquote>


Waters Corporation: Things to Consider When Configuring Purification Systems and Informatics

Things to Consider When Configuring Purification Systems and Informatics

We will discuss the various hardware options available, from pumps and injectors through detection techniques to fraction collection.

When Configuring Purification Systems and Informatics

<p><strong>This webinar introduces an analytical method that utilizes ion-exchange chromatography to separate and analyze oligonucleotides of different lengths. The primary focus is on eliminating impurities that are produced during the synthesis process.</strong></p>
<p>The method incorporates an inert ultra-high-performance liquid chromatography system, liquid chromatography-tandem mass spectrometry, and automated data analysis software. These components work together to facilitate efficient oligonucleotide development and quality control. The results emphasize the challenges associated with metal-based methods and propose a metal-free approach for precise quantification. Additionally, a high-resolution ion-pair reversed-phase LC-MS system is presented for accurate separation and mass analysis of oligonucleotides. The developed method also offers sensitive, precise, and reproducible results, making it an invaluable tool for various scientific fields, including therapeutic oligonucleotide-based drug development and quality control.</p>
<blockquote>
<p><strong>Speaker: Mridul Mandal, Ph.D.</strong></p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>Marketing Manager, Shimadzu Scientific Instruments<br/>Mridul Mandal, Ph.D. is currently working as a market manager -pharma/biopharma at Shimadzu Scientific Instruments. Before entering this position, he held numerous roles in academia and pharma CRO for over 12 years. He has published over 30 peer-reviewed publications and book chapters on mass spectrometry, chromatography, and other instrumentation in biomedical science</p>
</blockquote>


Shimadzu: Oligonucleotide Analysis by LC and LC-MS

Oligonucleotide Analysis by LC and LC-MS

This webinar introduces an analytical method that utilizes ion-exchange chromatography to separate and analyze oligonucleotides of different lengths.

<p><strong>On December 1, 2022 a harmonized standard for General Chapter 621 Chromatography was released. This standard incorporates the USP with 2.2.46. Chromatographic Separation Techniques European Pharmacopoeia (EuPh) and 2.01 Liquid Chromatography Japanese Pharmacopeia (JP) texts. Harmonization of these regulatory guidance provides increased method flexibility through the employment of modernized of chromatographic tools without the need for full monograph re-validation.</strong></p>
<p>The extent to which the various parameters of a compendial chromatographic test may be adjusted without fundamentally modifying the pharmacopeial analytical procedures is defined in U.S. Pharmacopeia (USP) General Chapter 621 Chromatography.</p>
<p>In this presentation, we combine the gradient method adjustments described in this chapter to achieve both column and system modernization for the USP monograph separation of antiviral drug abacavir sulfate. </p>
<h5>Key Learning Objectives:</h5>
<ul>
<li><strong>Learn how to modernize the HPLC column and reduce operation costs using the USP 621 allowable adjustments</strong></li>
<li><strong>Learn how to modernize the LC platform and further reduce operation costs using the USP 621 allowable adjustments</strong></li>
<li><strong>Leverage Empower CDS fields to apply the updated chromatography reporting calculations</strong></li>
</ul>
<h5>Who Should Attend:</h5>
<ul>
<li>Scientists and lab managers involved with compendial methods with a drive towards modernization, productivity and compliance.</li>
</ul>
<blockquote>
<p><strong>Presenter:</strong> Catharine Layton (Principal Scientist, Scientific Operations, Waters Corporation)</p>
</blockquote>


Waters Corporation: Modernizing LC Methods as per Harmonized USP Chapter 621

Modernizing LC Methods as per Harmonized USP Chapter 621

We combine the gradient method adjustments described in this chapter to achieve both column and system modernization for the USP monograph.

<p>Key Learning Points:</p>
<ul>
<li><p><strong>Gain a comprehensive understanding of solvent miscibility and recognize its significance</strong></p>
</li>
<li><p><strong>Develop an in-depth comprehension of how to properly solvent switch a column, and the potential consequences associated with incorrect procedures</strong></p>
</li>
<li><p><strong>Familiarize yourself with a standardized protocol for transitioning an LC column from one solvent system to another, ensuring a seamless solvent switch</strong></p>
</li>
</ul>
<p>Who Should Attend:</p>
<p>Any LC users looking to utilize different modes of separation and are required to switch a column that is shipped with an immiscible solvent to the one method requires</p>
<blockquote>
<p><strong>Presenter:</strong> Genevieve Hodson (Technical Support, Phenomenex)</p>
</blockquote>


Phonomenex: How to Solvent Switch Successfully

How to Solvent Switch Successfully

Gain a comprehensive understanding of solvent miscibility and recognize its significance.

<p><strong>Christian Rohrer, Director of Sales &amp; Support – EMEA at Tosoh Bioscience GmbH, will present the next edition of Tosoh Tuesday, a webinar series held by Chromatography Experts.</strong></p>
<p>The talk introduced various chromatographic methods applied in protein purification such as protein A and L affinity chromatography for antibody-derived molecules, chelate affinity for proteins expressed with His-tag, and ion exchange as a versatile first step for protein purification.</p>
<blockquote>
<p><strong>Presenter:</strong> Christian Rohrer (Director of Sales &amp; Support)</p>
</blockquote>


Tosoh Bioscience: Tosoh Tuesday - Unlocking the Secrets of Recombinant Protein Purification: A Beginner's Guide

LCMS webináře se zaměřením na HPLC - strana 34