V rámci jednoho projektu lze v Mass Profiler Professional kombinovat data ze všech typů hmotnostních analyzátorů (LC/MS, GC/MS, CE/MS a ICP/MS), takže Mass Profiler Professional představuje unikátní platformu využitelnou v celé řadě disciplín jako je metabolomika, proteomika, lipidomika, analýza potravin, environmentální chemie, forenzní chemie a toxikologie, petrochemie apod.
Kromě předběžného zpracování dat (normalizace, transformace rozsahu), obsahuje Mass Profiler Professional řadu statistických nástrojů pro neřízené i řízené techniky strukturního rozpoznávání. Mass Profiler Professional je úzce provázaný s Agilent MassHunter a Agilent OpenLAB ChemStation, dohromady tak tvoří silný nástroj pro zjištění statisticky významných rozdílů mezi skupinami vzorků, hledání skrytých vztahů mezi vzorky a proměnnými nebo tvorbu modelů pro klasifikaci neznámých vzorků.
Pro snadnější a rychlejší analýzu může uživatel použít předdefinovaných kroků pro rychlou základní analýzu. Nemusíte být statistik, abyste dosáhli prvotřídních výsledků.