Verification of Quantitativity and Confirmation of Molecular Weight of Oligonucleotide therapeutics Using LCMS™-8060
Aplikace | 2020 | ShimadzuInstrumentace
Analýza oligonukleotidových terapeutik pomocí LC–MS je klíčová pro kontrolu kvality a potvrzení molekulové hmotnosti těchto syntetických léčiv. Přesná kvantifikace a ověření integrity sekvence napomáhá zajištění bezpečnosti a účinnosti terapie.
Cílem studie bylo demonstrovat metodiku stanovení 20 nukleotidů dlouhého 2'-MOE modifikovaného oligonukleotidu v rozsahu 1–300 ng/mL za použití LCMS-8060 a současně potvrdit jeho molekulovou hmotnost dekonvolucí multivalentních iontů.
Pro separaci byla využita vysokotlaká kapalinová chromatografie Nexera s C18 kolonou (50×2,1 mm, 2,5 μm). Mobilní fáze A obsahovala 50 mmol/L HFIP a 10 mmol/L DIPEA, fáze B acetonitril, gradient 5–15 % B v čase 0–3 min, tok 0,2 mL/min při 60 °C. Injekční objem činil 2 μL.
Detektor LCMS-8060 pracoval v negativním ESI režimu: full scan m/z 500–2000 a MRM přenos m/z 803,5 > 95,0. Parametry ionizačního zdroje: napětí –4 kV, teploty DL 300 °C, heat block 450 °C, interface 250 °C; plynné toky: nebulizace 3 L/min, sušení 8 L/min, ohřev 12 L/min. Software LabSolutions LCMS zajišťoval dekonvoluci multivalentních iontů.
V MRM režimu byla potvrzena lineární kalibrační křivka v rozsahu 1–300 ng/mL s koeficientem determinace R2 = 0,998. Scan režim odhalil šestinásobné až osmínásobné nabití molekuly. Dekonvoluční analýza vyústila v experimentální molekulovou hmotnost 6436,37, což je v souladu s teoretickou hodnotou 6436,39.
Očekává se rozšíření MRM metodiky na multiplexní stanovení různých modifikovaných oligonukleotidů a integrace s automatizovanou datovou analýzou. Další rozvoj softwarových dekonvolučních nástrojů umožní rychlejší a přesnější validaci komplexních biologických léků.
Metoda LC–MS s využitím LCMS-8060 a dekonvoluce multivalentních iontů poskytuje spolehlivou kvantifikaci a potvrzení molekulové hmotnosti 2'-MOE modifikovaných oligonukleotidů v širokém dynamickém rozsahu.
1. Shimadzu Corporation: Application Note C231, First Edition Oct. 2020.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Analýza oligonukleotidových terapeutik pomocí LC–MS je klíčová pro kontrolu kvality a potvrzení molekulové hmotnosti těchto syntetických léčiv. Přesná kvantifikace a ověření integrity sekvence napomáhá zajištění bezpečnosti a účinnosti terapie.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo demonstrovat metodiku stanovení 20 nukleotidů dlouhého 2'-MOE modifikovaného oligonukleotidu v rozsahu 1–300 ng/mL za použití LCMS-8060 a současně potvrdit jeho molekulovou hmotnost dekonvolucí multivalentních iontů.
Použitá metodika a instrumentace
Pro separaci byla využita vysokotlaká kapalinová chromatografie Nexera s C18 kolonou (50×2,1 mm, 2,5 μm). Mobilní fáze A obsahovala 50 mmol/L HFIP a 10 mmol/L DIPEA, fáze B acetonitril, gradient 5–15 % B v čase 0–3 min, tok 0,2 mL/min při 60 °C. Injekční objem činil 2 μL.
Detektor LCMS-8060 pracoval v negativním ESI režimu: full scan m/z 500–2000 a MRM přenos m/z 803,5 > 95,0. Parametry ionizačního zdroje: napětí –4 kV, teploty DL 300 °C, heat block 450 °C, interface 250 °C; plynné toky: nebulizace 3 L/min, sušení 8 L/min, ohřev 12 L/min. Software LabSolutions LCMS zajišťoval dekonvoluci multivalentních iontů.
Hlavní výsledky a diskuse
V MRM režimu byla potvrzena lineární kalibrační křivka v rozsahu 1–300 ng/mL s koeficientem determinace R2 = 0,998. Scan režim odhalil šestinásobné až osmínásobné nabití molekuly. Dekonvoluční analýza vyústila v experimentální molekulovou hmotnost 6436,37, což je v souladu s teoretickou hodnotou 6436,39.
Přínosy a praktické využití metody
- Přesná kvantifikace oligonukleotidů v nízkých koncentracích.
- Rychlé potvrzení molekulové hmotnosti s minimální chybou.
- Využití v preklinických studiích a kvalitativní kontrole výroby terapeutik.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření MRM metodiky na multiplexní stanovení různých modifikovaných oligonukleotidů a integrace s automatizovanou datovou analýzou. Další rozvoj softwarových dekonvolučních nástrojů umožní rychlejší a přesnější validaci komplexních biologických léků.
Závěr
Metoda LC–MS s využitím LCMS-8060 a dekonvoluce multivalentních iontů poskytuje spolehlivou kvantifikaci a potvrzení molekulové hmotnosti 2'-MOE modifikovaných oligonukleotidů v širokém dynamickém rozsahu.
Reference
1. Shimadzu Corporation: Application Note C231, First Edition Oct. 2020.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Determination of Molecular Mass and Quantification of Oligonucleotide Therapeutics Using Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometer LCMS™-9030
2020|Shimadzu|Aplikace
Application News No. C215 LC-MS Determination of Molecular Mass and Quantification of Oligonucleotide Therapeutics Using Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometer LCMS™-9030 Overview Oligonucleotide therapeutics are synthetic oligonucleotides that demonstrate their medical efficacy through binding to target genes or target proteins…
Klíčová slova
oligonucleotide, oligonucleotidemass, masstherapeutics, therapeuticsusing, usingshimadzu, shimadzuqtof, qtofデコンボリューションスペクトル, デコンボリューションスペクトルcurve, curvedeconvolution, deconvolutionquadrupole, quadrupoleデフォルト, デフォルトflow, flownews, newscalibration, calibrationanalysis
Oligonucleotide Therapeutics Solution Guide
2025|Shimadzu|Příručky
C10G-E097 Oligonucleotide Therapeutics Solution Guide Types and Characteristics of Oligonucleotide Therapeutics Oligonucleotide therapeutics are nucleic acid polymers generally comprised of a few to several dozen bases However, it is a practical problem that oligonucleotide therapeutics are degraded and excreted rapidly…
Klíčová slova
excision, excisiondds, ddsunprotected, unprotectedcharacteristic, characteristicindex, indexoligomer, oligomerpharmacokinetics, pharmacokineticsquality, qualitycontrol, controlsynthesis, synthesisoligonucleotide, oligonucleotidepurification, purificationmodification, modificationanalysis, analysistorast
Analysis of Oligonucleotide Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer
2025|Shimadzu|Aplikace
High Performance Liquid Chromatograph Mass Spectrometer Application News Analysis of Oligonucleotide Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer Mizuki Hayakawa, Hiroyuki Niwa User Benefits Combination use of LCMS-2050 single quadrupole mass spectrometer and LabSolutions Insight Biologics provides comprehensive characterization of…
Klíčová slova
flp, flpimpurities, impuritiescomponent, componentinquiry, inquirybiologics, biologicspeak, peakmass, massoligonucleotide, oligonucleotidelabsolutions, labsolutionsinsight, insightrelated, relatedsimulated, simulatedarea, areanews, newsnexera
Quantitative Analysis and Determination of Molecular Weight of siRNA Type Oligonucleotides by LCMS™-8060
2020|Shimadzu|Aplikace
Application News No. C219 Liquid Chromatography Mass Spectrometry Quantitative Analysis and Determination of Molecular Weight of siRNA Type Oligonucleotides by LCMS™-8060 Introduction SIM Chromatogram Nucleic acid drugs are synthetic oligonucleotides which are designed to bond specifically with target…
Klíčová slova
oligo, oligonucleic, nucleiccurves, curvesfmol, fmolsirna, sirnaanalysis, analysissim, simdrugs, drugstype, typeweights, weightsoligonucleotides, oligonucleotidesorigin, originmolecular, molecularcalibration, calibrationarticle