Glycopeptide Characterization for Various Monoclonal Antibodies Using the Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF
Aplikace | 2019 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Monoklonální protilátky a jejich deriváty patří mezi klíčové bioterapeutické molekuly s širokým použitím v medicíně. Proteinová glykosylace představuje jednu z nejvýznamnějších posttranslačních modifikací ovlivňujících biologickou aktivitu, imunogenicitu a stabilitu mAb. Detailní charakterizace glykanových forem je nezbytná pro zajištění kvality a účinnosti biofarmaceutik.
Studie demonstruje optimalizovaný LC/MS pracovní postup (úroveň 3) pro analýzu glykopeptidů z monoklonálních protilátek. Využívá Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF v kombinaci s automatizovaným vzorkovým zpracováním a softwarovou platformou pro identifikaci a relativní kvantifikaci glykokonjugátů.
Vzorky tří mAb (NISTmAb, Herceptin, CHO mAb1) byly redukovány, alkylovány a tráveny směsí Trypsin/Lys-C na platformě Agilent AssayMAP Bravo. Roztoky glykopeptidů byly separovány v reverzní fázi (RP-C18) a v HILIC (AdvanceBio Glycan Mapping) kolonně na LC systému Agilent 1290 Infinity II. Detekce proběhla na Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF s Dual Agilent Jet Stream zdrojem. Data byla zpracována v MassHunter BioConfirm 10.0 s funkcí Peptide Feature Extraction pro automatickou identifikaci a kvantifikaci.
HILIC kolona významně zlepšila retenci a rozlišení glykopeptidů oproti RP-C18, kde se glykokonjugáty elutovaly v úzkém čase na začátku gradientu. Šest nejabundantnějších glycopeptidů z místa N-glykozylace HC N300 bylo spolehlivě odděleno a kvantifikováno s vysokou reprodukovatelností (SD < 0,2 %). Porovnání tří mAb ukázalo rozdíly v distribuci G0F, G1F a G2F forem – např. Herceptin vykazoval vysoký podíl G0F (> 65 %), zatímco NISTmAb měl téměř vyrovnané G0F a G1F (~ 40 %).
Očekává se integrace umělé inteligence a pokročilé bioinformatiky pro rychlejší de novo identifikaci a predikci funkcí glykanů. Vývoj nových HILIC materiálů a kolaborace s multi-omics přístupy umožní hlubší porozumění struktuře a variability bioterapeutik. Vzrůstající tlak regulací povede k přísnější kvalitativní kontrole a validaci glykopeptidových metod.
Popsaný LC/MS workflow s HILIC separací a automatizovaným zpracováním poskytuje robustní nástroj pro komplexní glykopeptidovou analýzu monoklonálních protilátek. Metoda kombinuje vysokou citlivost, rozlišení a reprodukovatelnost, což zrychlí vývoj i rutinní kontrolu biopharmaceutik.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníFarmaceutická analýza
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Monoklonální protilátky a jejich deriváty patří mezi klíčové bioterapeutické molekuly s širokým použitím v medicíně. Proteinová glykosylace představuje jednu z nejvýznamnějších posttranslačních modifikací ovlivňujících biologickou aktivitu, imunogenicitu a stabilitu mAb. Detailní charakterizace glykanových forem je nezbytná pro zajištění kvality a účinnosti biofarmaceutik.
Cíle a přehled studie / článku
Studie demonstruje optimalizovaný LC/MS pracovní postup (úroveň 3) pro analýzu glykopeptidů z monoklonálních protilátek. Využívá Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF v kombinaci s automatizovaným vzorkovým zpracováním a softwarovou platformou pro identifikaci a relativní kvantifikaci glykokonjugátů.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky tří mAb (NISTmAb, Herceptin, CHO mAb1) byly redukovány, alkylovány a tráveny směsí Trypsin/Lys-C na platformě Agilent AssayMAP Bravo. Roztoky glykopeptidů byly separovány v reverzní fázi (RP-C18) a v HILIC (AdvanceBio Glycan Mapping) kolonně na LC systému Agilent 1290 Infinity II. Detekce proběhla na Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF s Dual Agilent Jet Stream zdrojem. Data byla zpracována v MassHunter BioConfirm 10.0 s funkcí Peptide Feature Extraction pro automatickou identifikaci a kvantifikaci.
Hlavní výsledky a diskuse
HILIC kolona významně zlepšila retenci a rozlišení glykopeptidů oproti RP-C18, kde se glykokonjugáty elutovaly v úzkém čase na začátku gradientu. Šest nejabundantnějších glycopeptidů z místa N-glykozylace HC N300 bylo spolehlivě odděleno a kvantifikováno s vysokou reprodukovatelností (SD < 0,2 %). Porovnání tří mAb ukázalo rozdíly v distribuci G0F, G1F a G2F forem – např. Herceptin vykazoval vysoký podíl G0F (> 65 %), zatímco NISTmAb měl téměř vyrovnané G0F a G1F (~ 40 %).
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a přesná identifikace glykopeptidů v rámci běžného peptide mappingu.
- Detailní kvantitativní profilování nejčastějších glykoform.
- Informace o lokalizaci N-glykozylace v peptidové sekvenci.
- Vysoká automatizace vzorkového zpracování a analýzy usnadňuje standardizaci QC procesů.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se integrace umělé inteligence a pokročilé bioinformatiky pro rychlejší de novo identifikaci a predikci funkcí glykanů. Vývoj nových HILIC materiálů a kolaborace s multi-omics přístupy umožní hlubší porozumění struktuře a variability bioterapeutik. Vzrůstající tlak regulací povede k přísnější kvalitativní kontrole a validaci glykopeptidových metod.
Závěr
Popsaný LC/MS workflow s HILIC separací a automatizovaným zpracováním poskytuje robustní nástroj pro komplexní glykopeptidovou analýzu monoklonálních protilátek. Metoda kombinuje vysokou citlivost, rozlišení a reprodukovatelnost, což zrychlí vývoj i rutinní kontrolu biopharmaceutik.
Reference
- Rademacher TW, Williams P, Dwek RA. Agalactosyl glycoforms of IgG autoantibodies are pathogenic. Proc Natl Acad Sci U S A. 1994;91:6123–6127.
- Precise Characterization of Intact Monoclonal Antibodies by the Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF. Agilent Technologies; 5991-7813EN.
- Making Peptide Mapping Routine with the Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF. Agilent Technologies; 5991-7815EN.
- Dong Q et al. In-Depth Characterization and Spectral Library Building of Glycopeptides in the Tryptic Digest of a Monoclonal Antibody Using 1D and 2D LC-MS/MS. J Proteome Res. 2016;15:1472–1486.
- A Comprehensive Approach for Monoclonal Antibody N-linked Glycan Analysis from Sample Preparation to Data Analysis. Agilent Technologies; 5991-8550EN.
- Automation for LC/MS Sample Preparation High Throughput In-Solution Digestion and Peptide Cleanup Enabled by the Agilent AssayMAP Bravo Platform. Agilent Technologies; 5991-2957EN.
- Highly Confident Peptide Mapping of Protein Digests Using Agilent LC/QTOFs. Agilent Technologies; 5991-8552EN.
Podobná PDF
Glycan Analysis - Agilent BioHPLC Columns Application Compendium
2020|Agilent Technologies|Příručky
Agilent-NISTmAb Glycan Analysis Agilent BioHPLC Columns Application Compendium Contents Agilent-NISTmAb Standard (P/N 5191-5744; 5191-5745) was aliquoted from NISTmAb RM 8671 batch. Quality control (QC) testing is performed using Agilent LC-MS system. QC batch release test includes aggregate profile, charge variants…
Klíčová slova
glycan, glycanpage, pagecontents, contentsback, backglycans, glycansadvancebio, advancebiomab, mabinstantpc, instantpcmapping, mappingfld, fldmonoclonal, monoclonaleluent, eluentagilent, agilenthilic, hilicfluorescence
Agilent BioHPLC Columns - Characterization of NIST Monoclonal Antibody Critical Quality Attributes - Application Compendium
2019|Agilent Technologies|Příručky
Agilent BioHPLC Columns Characterization of NIST Monoclonal Antibody Critical Quality Attributes Application Compendium Contents Agilent-NISTmAb Standard (P/N 5191-5744; 5191-5745) was aliquoted from NISTmAb RM 8671 batch. Quality control (QC) testing is performed using Agilent LC-MS system. QC batch release test…
Klíčová slova
mab, mabglycan, glycanadvancebio, advancebiocounts, countsmapping, mappingpeptide, peptideagilent, agilentmonoclonal, monoclonalglycans, glycansmin, mincolumn, columnmass, massprotein, proteinnistmab, nistmabassaymap
Profiling Glycosylation of Monoclonal Antibodies at Three Levels Using the Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q‑TOF
2018|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Biotherapeutics and Biosimilars Profiling Glycosylation of Monoclonal Antibodies at Three Levels Using the Agilent 6545XT AdvanceBio LC/Q‑TOF Author Introduction David L. Wong Agilent Technologies, Inc. Santa Clara, CA, USA Monoclonal antibodies (mAbs) and their derivatives represent a very…
Klíčová slova
glycan, glycanglycoforms, glycoformsmab, mabnistmab, nistmabquantitation, quantitationintact, intactglycans, glycansagilent, agilentassaymap, assaymapadvancebio, advancebiomapping, mappingbioconfirm, bioconfirmbravo, bravocounts, countsdeconvoluted
Automated Workflow for Monoclonal Antibody N-Linked Glycan Analysis
2021|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Biopharma/Pharma Automated Workflow for Monoclonal Antibody N-Linked Glycan Analysis Authors Shuai Wu, Zach Van Den Heuvel, Steve Murphy, and Aled Jones Agilent Technologies, Inc. Abstract This application note describes an automated workflow for the release, labeling, and cleanup…
Klíčová slova
glycan, glycaninstantpc, instantpcmab, mabglycans, glycansglykoprep, glykoprepherceptin, herceptincounts, countssilumab, silumablabeled, labeledcho, chofld, fldagilent, agilentrituximab, rituximabassaymap, assaymapigg