Quantification and structural characterization of glycans and glycopeptides by TQMS: the energy-resolved oxonium ion monitoring (Erexim) platform
Postery | 2015 | ShimadzuInstrumentace
Glykanová analýza hraje klíčovou roli v biomedicíně, potravinářství a biotechnologiích pro charakterizaci glykoproteinů a jejich funkcí. Přesná kvantifikace a rozlišení strukturních izomerů glykosylovaných biomolekul je zásadní pro kontrolu kvality bioterapeutik, studium biologických procesů a vývoj nových diagnostických metod.
Cílem prezentovaného přístupu Erexim je sjednotit kvantitativní a strukturní analýzu glykanů a glykpeptidů na bázi triple kvadrupolového hmotnostního spektrometru (TQMS). Studie předkládá softwarové a instrumentální řešení, které kombinuje monitorování oxoniových iontů při různých energiích kolizí (CID) a vzájemné porovnání profilů, což umožňuje odlišit izobarické struktury i provést citlivou kvantifikaci.
Metoda vychází z následujících kroků:
Citlivost a linearita:
Strukturální elucidace:
Erexim platforma představuje univerzální nástroj pro přesnou kvantifikaci a detailní strukturální charakterizaci glykanů a glykopeptidů na běžně dostupném TQMS. Kombinace energie-resolvované fragmentace a MRM přechodů umožňuje rozlišení izobarů i v komplexních matricích s výbornou citlivostí a reprodukovatelností. Další rozvoj databází a softwaru podpoří širší využití v biomedicíně, farmaceutickém výzkumu i průmyslové analytice.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníProteomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Glykanová analýza hraje klíčovou roli v biomedicíně, potravinářství a biotechnologiích pro charakterizaci glykoproteinů a jejich funkcí. Přesná kvantifikace a rozlišení strukturních izomerů glykosylovaných biomolekul je zásadní pro kontrolu kvality bioterapeutik, studium biologických procesů a vývoj nových diagnostických metod.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem prezentovaného přístupu Erexim je sjednotit kvantitativní a strukturní analýzu glykanů a glykpeptidů na bázi triple kvadrupolového hmotnostního spektrometru (TQMS). Studie předkládá softwarové a instrumentální řešení, které kombinuje monitorování oxoniových iontů při různých energiích kolizí (CID) a vzájemné porovnání profilů, což umožňuje odlišit izobarické struktury i provést citlivou kvantifikaci.
Použitá metodika a instrumentace
Metoda vychází z následujících kroků:
- Derivatizace N-glykanů 2-aminopyridinem (PA) a příprava glykpeptidů z lidského IgG tryptickou digesí a SPE frakcionací.
- Separace na kolónách reverse-phase HPLC (Aeris Peptide 1.7 μ 150×2.1 mm), mobilní fáze 0,1 % kyseliny mravenčí ve vodě (A) a acetonitrilu (B), program gradientu 2–98 % B.
- Detekce na Shimadzu LCMS-8050: ultrarychlé skenování (30 000 u/s), polarity switching 5 ms, až 555 MRM přechodů/s.
- Erexim profil: série MRM přechodů sledovaných při různých hodnotách CE pro m/z 138 a další klíčové oxoniové ionty.
Hlavní výsledky a diskuse
Citlivost a linearita:
- Kvantifikace glykpeptidů z IgG pro rozsah 2–1000 ng vstupního proteinu ukázala vynikající linearitu (r2 = 0,9998) a reprodukovatelnost.
- Relativní složení glykosylovaných forem bylo při 2 ng vzorku stanovitelné s CV do 4,5 %, u 1000 ng pod 0,5 %.
Strukturální elucidace:
- Erexim profily dvou izobarických PA-glykanů se terminální kyselinou sialovou na větvích α1-6 vs. α1-3 prokázaly odlišné dráhy fragmentace oxoniových iontů (např. m/z 366, 657), což koresponduje s teoretickou labilitou vazeb.
Přínosy a praktické využití metody
- Integrované řešení pro kvantifikaci i strukturní diferenciaci glykanů a glykopeptidů bez nutnosti vysoce rozlišovacího analyzátoru.
- Rychlá analýza desítek glykanových forem s vysokou citlivostí a opakovatelností, vhodné pro high-throughput screening a QA/QC procesy.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření databáze Erexim profilů na stovky glykanových standardů pro automatizovanou identifikaci neznámých vzorků.
- Integrace s online separačními technikami (UHPLC, capLC) a vyhodnocovacími AI algoritmy pro zrychlení datové analýzy.
- Potenciální aplikace v glyko-proteomice, vývoji bioterapeutik a monitoringu posttranslačních modifikací v klinických studiích.
Závěr
Erexim platforma představuje univerzální nástroj pro přesnou kvantifikaci a detailní strukturální charakterizaci glykanů a glykopeptidů na běžně dostupném TQMS. Kombinace energie-resolvované fragmentace a MRM přechodů umožňuje rozlišení izobarů i v komplexních matricích s výbornou citlivostí a reprodukovatelností. Další rozvoj databází a softwaru podpoří širší využití v biomedicíně, farmaceutickém výzkumu i průmyslové analytice.
Reference
- Toyama A. a kol. Quantification and structural characterization of glycans and glycopeptides by TQMS: the energy-resolved oxonium ion monitoring (Erexim) platform. ASMS 2015, MP686.
- Shimadzu Corporation. LCMS-8050 Technical Overview. First Edition, June 2015.
Podobná PDF
Software Platform for Glycan Quantification and Qualification by LCMS-8060/8050 - Erexim Application Suite
2015|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E294 Software Platform for Glycan Quantification and Qualification by LCMS-8060/8050 Erexim Application Suite Simplifies Glycan Heterogeneity Analysis at Individual Glycosylation Sites Analysis of N-linked glycans are most frequently performed be performed at the glycopeptide level using enzymatic by first detaching…
Klíčová slova
erexim, ereximglycan, glycanstructure, structureglycans, glycansmrm, mrmsuite, suitemaker, makerlaunch, launchdata, dataprofile, profilestdev, stdevdatabase, databaseabundance, abundanceheterogeneity, heterogeneitycustomizable
Shimadzu Solutions for Biopharmaceutical - Application Notebook
2018|Shimadzu|Příručky
C10G-E054 Solutions for Biopharmaceutical Application Notebook First Edition: December, 2017 © Shimadzu Corporation, 2017 Solutions for Biopharmaceutical Index Application Notebook Bioanalysis LCMS Bioanalysis of Antibody Drugs Using Fab-Selective Proteolysis nSMOL - Trastuzumab analysis nSMOL, which enables selective proteolysis of the…
Klíčová slova
acid, acidamino, aminoantibody, antibodyglycan, glycannsmol, nsmolerexim, ereximstructure, structurenews, newsaggregates, aggregatesanalysis, analysismrm, mrmnucleic, nucleicglycans, glycanssizer, sizerconfirmation
Comprehending COVID-19: Structural Characterization of the Glycan Assemblies of O-linked Glycopeptides Using Cyclic Ion Mobility
2021|Waters|Aplikace
Application Note Comprehending COVID-19: Structural Characterization of the Glycan Assemblies of O-linked Glycopeptides Using Cyclic Ion Mobility Lindsay Morrison Waters Corporation, Georgetown University Medical Center, Lombardi Comprehensive Cancer Center For research use only. Not for use in diagnostic procedures. Save…
Klíčová slova
cyclic, cyclicims, imsfurin, furinglycan, glycanlinked, linkedmobility, mobilitycleavage, cleavageglycosylation, glycosylationselect, selectglycopeptides, glycopeptidesseries, seriesspike, spikesite, siteefforts, effortstri
Waters Application Notes - Glycans
2016|Waters|Příručky
Waters Application Notes Glycans There are a variety of complementary techniques practiced to get the complete story about a glycoprotein. Each technique varies in complexity and provides a different layer of information. Method complexity This application notebook highlights a body…
Klíčová slova
glycan, glycanrapifluor, rapifluorglycans, glycanshilic, hilicuplc, uplcacquity, acquityamide, amideglycoworks, glycoworksflr, flrreleased, releasedunifi, unifilabeled, labeledseparations, separationsglycosylation, glycosylationbeh