Expanding the Coverage of Metabolome Using Multiple Liquid Chromatography Modes
Postery | 2015 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Masově spektrometrická metabolomika vyžaduje široké rozlišení a detekci různorodých endogenních malých molekul. Kombinace různých chromatografických přístupů (reverzní fáze, HILIC, mixed-mode) rozšiřuje pokrytí metabolomu a zlepšuje citlivost i selektivitu měření.
Cílem bylo komplexně porovnat tři LC režimy (RPLC, HILIC, mixed-mode) při analýze panelu 300 endogenních metabolitů. Studie ilustrovala, které třídy sloučenin jsou optimálně separovány v každém režimu a jak vzájemně doplňují chromatografický profil.
Všechny experimenty probíhaly na systému Thermo Scientific Dionex UltiMate 3000 HPG LC v tandemu s hmotnostním spektrometrem Thermo Q Exactive Orbitrap. Data byla získaná v režimu full scan s pozitivně/negativním ESI přepínáním (70 000 FWHM) a cíleným MS/MS (35 000 FWHM).
Na RPLC byly metabolity rozděleny do tří kategorií: RP-Green (nepolární, symetrické špičky, dobrá retence), RP-Yellow (polární, rychlý eluce bez retence) a RP-Red (špatné chromatografické charakteristiky: dělení špiček, broadenování, slabý signál). HILIC a mixed-mode režimy kompenzovaly slabiny RPLC zejména u vysoce polárních a iontových metabolitů. Studie také ukázala význam volby vzorkovacího rozpouštědla (např. 50/50 MeOH/H2O vs. 10 % MeOH) pro optimalizaci tvaru špiček na různých kolonkách.
Komplexní porovnání RPLC, HILIC a mixed-mode LC na panelu 300 metabolitů potvrdilo, že kombinace více chromatografických módů zajišťuje optimální pokrytí širokého spektra chemických vlastností. Výběr vhodného rozpouštědla a kolony významně ovlivňuje chromatografickou kvalitu a detekční citlivost.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Masově spektrometrická metabolomika vyžaduje široké rozlišení a detekci různorodých endogenních malých molekul. Kombinace různých chromatografických přístupů (reverzní fáze, HILIC, mixed-mode) rozšiřuje pokrytí metabolomu a zlepšuje citlivost i selektivitu měření.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo komplexně porovnat tři LC režimy (RPLC, HILIC, mixed-mode) při analýze panelu 300 endogenních metabolitů. Studie ilustrovala, které třídy sloučenin jsou optimálně separovány v každém režimu a jak vzájemně doplňují chromatografický profil.
Použitá metodika a instrumentace
Všechny experimenty probíhaly na systému Thermo Scientific Dionex UltiMate 3000 HPG LC v tandemu s hmotnostním spektrometrem Thermo Q Exactive Orbitrap. Data byla získaná v režimu full scan s pozitivně/negativním ESI přepínáním (70 000 FWHM) a cíleným MS/MS (35 000 FWHM).
Použitá instrumentace
- LC systém: Thermo Dionex UltiMate 3000 HPG
- MS detektor: Thermo Q Exactive Orbitrap
- Kolony: Hypersil Gold C18 (150×2,1 mm, 1,9 µm), SeQuant ZIC-pHILIC (150×2,1 mm, 5 µm), Acclaim Trinity P1 (100×2,1 mm, 3 µm)
- Mobilní fáze: 0,1 % kyselina mravenčí v H2O/MeOH pro RPLC, 10 mM AcONH4 v H2O/ACN pro HILIC, variabilní poměry AcONH4 ve vodě/ACN pro mixed-mode
Hlavní výsledky a diskuse
Na RPLC byly metabolity rozděleny do tří kategorií: RP-Green (nepolární, symetrické špičky, dobrá retence), RP-Yellow (polární, rychlý eluce bez retence) a RP-Red (špatné chromatografické charakteristiky: dělení špiček, broadenování, slabý signál). HILIC a mixed-mode režimy kompenzovaly slabiny RPLC zejména u vysoce polárních a iontových metabolitů. Studie také ukázala význam volby vzorkovacího rozpouštědla (např. 50/50 MeOH/H2O vs. 10 % MeOH) pro optimalizaci tvaru špiček na různých kolonkách.
Přínosy a praktické využití metody
- Efektivní rozšíření metabolitického pokrytí díky vzájemné doplňkovosti tří režimů
- Zvýšení reprodukovatelnosti a citlivosti analýzy polaritě specifických sloučenin
- Možnost tvorby univerzálních protokolů pro rutinní aplikace v QA/QC a výzkumu
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace ultrarychlých gradientů a nano-LC pro zvýšení průchodnosti a citlivosti
- Rozvoj multidimenzionálních LC–MS metod s paralelní detekcí
- Využití pokročilých algoritmů pro automatizovanou kategorizaci retence a tvaru špiček
- Propojování s ostatními omickými technologiemi pro holistické mapování metabolického stavu
Závěr
Komplexní porovnání RPLC, HILIC a mixed-mode LC na panelu 300 metabolitů potvrdilo, že kombinace více chromatografických módů zajišťuje optimální pokrytí širokého spektra chemických vlastností. Výběr vhodného rozpouštědla a kolony významně ovlivňuje chromatografickou kvalitu a detekční citlivost.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Pathway Targeted Metabolomic Analysis in Oral Cancer Cells Using High Performance Ion Chromatography Coupling to a New HR/AM Orbitrap Mass Spectrometry
2014|Thermo Fisher Scientific|Postery
Pathway Targeted Metabolomic Analysis in Oral Cancer Cells Using High Performance Ion Chromatography Coupling to a New HR/AM Orbitrap Mass Spectrometry Junhua Wang,1 Terri Christison,1 Krista Backiel, 2 Grace Ji, 3 Shen Hu, 3 Linda Lopez,1 Yingying Huang1 1 Thermo…
Klíčová slova
cancer, cancerexactive, exactivetargeted, targetedcsc, csclysates, lysatesnontargeted, nontargetedaxp, axpcells, cellstca, tcahpic, hpicthermo, thermogroundin, groundinmass, masssimilar, similarinvasive
HILIC Chromatography: When and How?
2022|Agilent Technologies|Prezentace
HILIC Chromatography: When and How? Golnar Javadi Applications Engineer LC Columns and Consumables Technical Support January 25, 2022 Agenda 1 What is HILIC and when should you consider it? 2 HILIC method development • • 3 Tips and tricks for…
Klíčová slova
hilic, hilicyes, yesmobile, mobilephase, phaseinfinitylab, infinitylabyour, yourcolumn, columnconsider, considerrplc, rplcbest, bestsolubility, solubilitywhen, whensolvent, solventanalytes, analytesretain
Fast Analysis of Therapeutic Monoclonal Antibodies, Fragments, and Oxidation Variants Using a Super-Macro Porous Reversed-Phase Column Coupled with an Orbitrap Mass Spectrometer
2015|Thermo Fisher Scientific|Postery
Poster Note 643 98 Fast Analysis of Therapeutic Monoclonal Antibodies, Fragments, and Oxidation Variants Using a Super-Macro Porous Reversed-Phase Coupled with anFragments, FastAnalysis Analysis of Therapeutic TherapeuticColumn Monoclonal Antibodies, Fast of Monoclonal Antibodies, Fragments, a Orbitrap Mass Spectrometer Column Coupled…
Klíčová slova
oxidized, oxidizedscfc, scfcherceptin, herceptinmab, mabides, idesmabfragments, mabfragmentsfigure, figurefragments, fragmentsabundance, abundancedtt, dttrelative, relativeerml, ermlrapidseparation, rapidseparationrceptin, rceptinmabpac
Characterization of Monoclonal Antibodies Oxidation Variants Using Middle-down Approach and Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry
2015|Thermo Fisher Scientific|Postery
There is a growing trend to obtain intact mass information as well as the glycan profile in the QC of mAbs using high resolution mass spectrometers. The most commonly employed LC/MS method is to desalt mAbs via reverse phase liquid…
Klíčová slova
trastuzumab, trastuzumabscfc, scfcoxidized, oxidizedmab, mabfigure, figureides, idesdeuterium, deuteriumfragments, fragmentsmabpac, mabpacoxidation, oxidationtic, ticfab, fabdtt, dttpapain, papainerml